MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009513	AAG	2	6	44463	44468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543285
1002	NC_009513	TCA	2	6	44509	44514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543285
1003	NC_009513	CTG	2	6	44540	44545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543285
1004	NC_009513	GTT	2	6	44560	44565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543285
1005	NC_009513	CCT	2	6	44606	44611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_009513	TCA	2	6	44709	44714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543286
1007	NC_009513	CAT	2	6	44715	44720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543286
1008	NC_009513	CCA	2	6	44733	44738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543286
1009	NC_009513	AAG	2	6	44762	44767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543286
1010	NC_009513	ATC	2	6	44827	44832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543286
1011	NC_009513	TTC	2	6	44869	44874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543286
1012	NC_009513	CAG	2	6	44979	44984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543286
1013	NC_009513	TCA	2	6	44991	44996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543286
1014	NC_009513	AAC	2	6	45058	45063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543286
1015	NC_009513	GCTT	2	8	45068	45075	0 %	50 %	25 %	25 %	148543286
1016	NC_009513	TTC	2	6	45082	45087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543286
1017	NC_009513	AAG	2	6	45169	45174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543286
1018	NC_009513	CCG	2	6	45188	45193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543286
1019	NC_009513	AAT	2	6	45208	45213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543286
1020	NC_009513	TGG	2	6	45284	45289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543286
1021	NC_009513	GAC	2	6	45379	45384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543286
1022	NC_009513	TAC	2	6	45498	45503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543286
1023	NC_009513	TCAA	2	8	45554	45561	50 %	25 %	0 %	25 %	148543286
1024	NC_009513	TGA	2	6	45573	45578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543286
1025	NC_009513	TCA	2	6	45642	45647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543286
1026	NC_009513	TCC	2	6	45666	45671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148543287
1027	NC_009513	TTA	2	6	45672	45677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543287
1028	NC_009513	TGG	2	6	45724	45729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543287
1029	NC_009513	GCC	2	6	45755	45760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148543287
1030	NC_009513	AAG	2	6	45768	45773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543287
1031	NC_009513	TCA	2	6	45831	45836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543287
1032	NC_009513	AAC	2	6	45923	45928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543287
1033	NC_009513	TCG	2	6	45935	45940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543287
1034	NC_009513	GCT	2	6	45972	45977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543287
1035	NC_009513	AGC	2	6	46031	46036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543287
1036	NC_009513	TCA	2	6	46072	46077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543287
1037	NC_009513	GTAA	2	8	46289	46296	50 %	25 %	25 %	0 %	148543287
1038	NC_009513	GTTGG	2	10	46302	46311	0 %	40 %	60 %	0 %	148543287
1039	NC_009513	TTC	2	6	46349	46354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543287
1040	NC_009513	ATC	2	6	46391	46396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543287
1041	NC_009513	CCA	2	6	46425	46430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543287
1042	NC_009513	TAA	2	6	46498	46503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543287
1043	NC_009513	TAG	2	6	46504	46509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543287
1044	NC_009513	T	6	6	46560	46565	0 %	100 %	0 %	0 %	148543287
1045	NC_009513	ATG	2	6	46737	46742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543287
1046	NC_009513	GAGT	2	8	46789	46796	25 %	25 %	50 %	0 %	148543287
1047	NC_009513	ATT	2	6	46805	46810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543287
1048	NC_009513	GAC	2	6	46816	46821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543287
1049	NC_009513	T	6	6	46832	46837	0 %	100 %	0 %	0 %	148543287
1050	NC_009513	TCC	2	6	46857	46862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_009513	TA	3	6	46863	46868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_009513	AAG	2	6	46890	46895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_009513	CTT	2	6	46926	46931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_009513	CTG	2	6	47008	47013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_009513	AGA	2	6	47041	47046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_009513	ATC	2	6	47079	47084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_009513	TCC	2	6	47091	47096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_009513	ATT	2	6	47110	47115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_009513	AAT	2	6	47116	47121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_009513	TTGA	2	8	47151	47158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_009513	ATTA	2	8	47167	47174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_009513	ATT	2	6	47179	47184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_009513	ATA	2	6	47205	47210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_009513	ATT	2	6	47230	47235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_009513	ATTTA	2	10	47243	47252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_009513	ATTTA	2	10	47255	47264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_009513	T	8	8	47275	47282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_009513	T	6	6	47284	47289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_009513	T	6	6	47296	47301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_009513	ATA	2	6	47326	47331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_009513	ATT	2	6	47376	47381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_009513	CAAGA	2	10	47522	47531	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1073	NC_009513	AGA	2	6	47557	47562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_009513	AGG	2	6	47602	47607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_009513	AAAAT	2	10	47658	47667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_009513	GAG	2	6	47681	47686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_009513	ATGA	2	8	47732	47739	50 %	25 %	25 %	0 %	148543288
1078	NC_009513	AGA	2	6	47824	47829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1079	NC_009513	CAA	2	6	47879	47884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543288
1080	NC_009513	AAG	2	6	47958	47963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1081	NC_009513	CGG	2	6	48035	48040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543288
1082	NC_009513	AAC	2	6	48047	48052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543288
1083	NC_009513	CTG	2	6	48087	48092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1084	NC_009513	TTG	2	6	48093	48098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543288
1085	NC_009513	GCT	2	6	48137	48142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1086	NC_009513	CAAGGA	2	12	48145	48156	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	148543288
1087	NC_009513	GAA	2	6	48215	48220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1088	NC_009513	GTTG	2	8	48232	48239	0 %	50 %	50 %	0 %	148543288
1089	NC_009513	AAG	2	6	48248	48253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1090	NC_009513	ATC	2	6	48263	48268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543288
1091	NC_009513	CTT	2	6	48271	48276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543288
1092	NC_009513	ATT	2	6	48293	48298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543288
1093	NC_009513	ATT	2	6	48347	48352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543288
1094	NC_009513	GTG	2	6	48369	48374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543288
1095	NC_009513	ACT	2	6	48395	48400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543288
1096	NC_009513	TAT	2	6	48421	48426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543288
1097	NC_009513	TGC	2	6	48433	48438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1098	NC_009513	CGG	2	6	48446	48451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543288
1099	NC_009513	CTGTTA	2	12	48459	48470	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	148543288
1100	NC_009513	CAAG	2	8	48477	48484	50 %	0 %	25 %	25 %	148543288
1101	NC_009513	CAC	2	6	48533	48538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543288
1102	NC_009513	GCT	2	6	48569	48574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1103	NC_009513	GCT	2	6	48647	48652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1104	NC_009513	AGC	2	6	48658	48663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1105	NC_009513	AGA	2	6	48712	48717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1106	NC_009513	AAG	2	6	48719	48724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1107	NC_009513	GCT	2	6	48734	48739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1108	NC_009513	AAGA	2	8	48740	48747	75 %	0 %	25 %	0 %	148543288
1109	NC_009513	GAA	2	6	48793	48798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1110	NC_009513	AGA	2	6	48844	48849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1111	NC_009513	AAGGT	2	10	48945	48954	40 %	20 %	40 %	0 %	148543288
1112	NC_009513	TCG	2	6	48997	49002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1113	NC_009513	ATT	2	6	49130	49135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543288
1114	NC_009513	GAT	2	6	49180	49185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543288
1115	NC_009513	CTG	2	6	49194	49199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1116	NC_009513	TCG	2	6	49246	49251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
1117	NC_009513	ATT	2	6	49265	49270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543288
1118	NC_009513	CTT	2	6	49271	49276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543288
1119	NC_009513	TGA	2	6	49330	49335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543288
1120	NC_009513	GAA	2	6	49454	49459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
1121	NC_009513	TTAA	2	8	49463	49470	50 %	50 %	0 %	0 %	148543288
1122	NC_009513	ACT	2	6	49478	49483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543288
1123	NC_009513	TTG	2	6	49521	49526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543288
1124	NC_009513	TGCT	2	8	49575	49582	0 %	50 %	25 %	25 %	148543288
1125	NC_009513	AAG	2	6	49604	49609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543288
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1127	NC_009513	TCG	2	6	49693	49698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543288
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1252	NC_009513	GGA	2	6	54471	54476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1481	NC_009513	TTGT	2	8	64751	64758	0 %	75 %	25 %	0 %	148543294
1482	NC_009513	TGA	2	6	64761	64766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543294
1483	NC_009513	AATTT	2	10	64802	64811	40 %	60 %	0 %	0 %	148543294
1484	NC_009513	TTAA	2	8	64852	64859	50 %	50 %	0 %	0 %	148543294
1485	NC_009513	AAG	2	6	64862	64867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543294
1486	NC_009513	AGA	2	6	64929	64934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543294
1487	NC_009513	TTG	2	6	64946	64951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543294
1488	NC_009513	AAAT	2	8	64958	64965	75 %	25 %	0 %	0 %	148543294
1489	NC_009513	ATT	2	6	64988	64993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1490	NC_009513	CT	3	6	65004	65009	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1491	NC_009513	TTG	2	6	65051	65056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543295
1492	NC_009513	GCA	2	6	65326	65331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543295
1493	NC_009513	TTG	2	6	65363	65368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543295
1494	NC_009513	G	6	6	65371	65376	0 %	0 %	100 %	0 %	148543295
1495	NC_009513	TTC	2	6	65405	65410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543295
1496	NC_009513	CTTG	2	8	65448	65455	0 %	50 %	25 %	25 %	148543295
1497	NC_009513	ATG	2	6	65480	65485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543295
1498	NC_009513	CTG	2	6	65513	65518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543295
1499	NC_009513	CAA	2	6	65554	65559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543295
1500	NC_009513	TGA	2	6	65573	65578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543295

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