MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009513	GTT	2	6	23634	23639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543264
502	NC_009513	CTT	2	6	23643	23648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543264
503	NC_009513	TTCAT	2	10	23655	23664	20 %	60 %	0 %	20 %	148543264
504	NC_009513	CACGA	2	10	23701	23710	40 %	0 %	20 %	40 %	148543264
505	NC_009513	AAT	2	6	23718	23723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543264
506	NC_009513	CAA	2	6	23733	23738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543264
507	NC_009513	CAAT	2	8	23748	23755	50 %	25 %	0 %	25 %	148543264
508	NC_009513	TAATT	2	10	23834	23843	40 %	60 %	0 %	0 %	148543264
509	NC_009513	A	7	7	23852	23858	100 %	0 %	0 %	0 %	148543264
510	NC_009513	TGT	2	6	23891	23896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543264
511	NC_009513	CAAA	2	8	23897	23904	75 %	0 %	0 %	25 %	148543264
512	NC_009513	CGG	2	6	23937	23942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543264
513	NC_009513	TACT	2	8	24078	24085	25 %	50 %	0 %	25 %	148543264
514	NC_009513	ACC	2	6	24091	24096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543264
515	NC_009513	GT	3	6	24103	24108	0 %	50 %	50 %	0 %	148543264
516	NC_009513	GGATC	2	10	24167	24176	20 %	20 %	40 %	20 %	148543264
517	NC_009513	ATT	2	6	24192	24197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543264
518	NC_009513	ATG	2	6	24213	24218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543264
519	NC_009513	TGA	2	6	24295	24300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543264
520	NC_009513	AC	3	6	24311	24316	50 %	0 %	0 %	50 %	148543264
521	NC_009513	TCG	2	6	24371	24376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543264
522	NC_009513	CAA	2	6	24445	24450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543264
523	NC_009513	TAA	2	6	24473	24478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543264
524	NC_009513	GAC	2	6	24482	24487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543264
525	NC_009513	ATG	2	6	24517	24522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543264
526	NC_009513	GTGA	2	8	24525	24532	25 %	25 %	50 %	0 %	148543264
527	NC_009513	GTC	2	6	24538	24543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543264
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529	NC_009513	TGT	2	6	24809	24814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543264
530	NC_009513	AGG	2	6	24883	24888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148543264
531	NC_009513	GAAT	2	8	24895	24902	50 %	25 %	25 %	0 %	148543265
532	NC_009513	TTG	2	6	24955	24960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543265
533	NC_009513	TAA	2	6	25073	25078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543265
534	NC_009513	GCA	2	6	25079	25084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543265
535	NC_009513	ATATT	2	10	25091	25100	40 %	60 %	0 %	0 %	148543265
536	NC_009513	GAAA	2	8	25105	25112	75 %	0 %	25 %	0 %	148543265
537	NC_009513	TCT	2	6	25113	25118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543265
538	NC_009513	TTC	2	6	25175	25180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543265
539	NC_009513	TAA	2	6	25229	25234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543265
540	NC_009513	A	6	6	25259	25264	100 %	0 %	0 %	0 %	148543265
541	NC_009513	ATG	2	6	25372	25377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543265
542	NC_009513	ACTT	2	8	25431	25438	25 %	50 %	0 %	25 %	148543265
543	NC_009513	TAA	2	6	25526	25531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543265
544	NC_009513	GGT	2	6	25543	25548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543265
545	NC_009513	ACT	3	9	25578	25586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543265
546	NC_009513	GAT	2	6	25587	25592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543265
547	NC_009513	CAA	2	6	25653	25658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543265
548	NC_009513	ATA	2	6	25729	25734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543265
549	NC_009513	GAG	2	6	25742	25747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009513	ACC	2	6	25836	25841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543266
551	NC_009513	GAA	2	6	25891	25896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543266
552	NC_009513	GATC	2	8	25901	25908	25 %	25 %	25 %	25 %	148543266
553	NC_009513	TGGTGT	2	12	25963	25974	0 %	50 %	50 %	0 %	148543266
554	NC_009513	ATGGA	2	10	25989	25998	40 %	20 %	40 %	0 %	148543266
555	NC_009513	GGCA	2	8	26022	26029	25 %	0 %	50 %	25 %	148543266
556	NC_009513	ATT	2	6	26072	26077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543266
557	NC_009513	ATG	2	6	26136	26141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543266
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559	NC_009513	AAT	2	6	26174	26179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543266
560	NC_009513	TAT	2	6	26191	26196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543266
561	NC_009513	GAA	2	6	26357	26362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543266
562	NC_009513	TGA	2	6	26376	26381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543266
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564	NC_009513	AAC	2	6	26435	26440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543266
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578	NC_009513	TAA	2	6	26847	26852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543267
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580	NC_009513	GTT	2	6	26911	26916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543267
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594	NC_009513	AATT	2	8	27465	27472	50 %	50 %	0 %	0 %	148543267
595	NC_009513	ATT	2	6	27553	27558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543267
596	NC_009513	TTAA	2	8	27565	27572	50 %	50 %	0 %	0 %	148543267
597	NC_009513	TGG	2	6	27611	27616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543267
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601	NC_009513	ATG	2	6	27743	27748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543267
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606	NC_009513	CAA	2	6	27922	27927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543267
607	NC_009513	ATA	2	6	27929	27934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543267
608	NC_009513	TTG	2	6	28043	28048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009513	TTAA	2	8	28116	28123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009513	TGG	2	6	28157	28162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009513	AAT	2	6	28171	28176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543268
612	NC_009513	GTA	2	6	28216	28221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543268
613	NC_009513	AGA	2	6	28230	28235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543268
614	NC_009513	AGA	2	6	28251	28256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543268
615	NC_009513	ATT	2	6	28356	28361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543268
616	NC_009513	ACTTGA	2	12	28380	28391	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	148543268
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618	NC_009513	TAT	2	6	28434	28439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543268
619	NC_009513	ATG	2	6	28445	28450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543268
620	NC_009513	GAC	2	6	28515	28520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543268
621	NC_009513	ATT	2	6	28555	28560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543268
622	NC_009513	GCG	2	6	28615	28620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543268
623	NC_009513	GGC	2	6	28626	28631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543268
624	NC_009513	CCA	2	6	28650	28655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543268
625	NC_009513	TTAA	2	8	28662	28669	50 %	50 %	0 %	0 %	148543268
626	NC_009513	A	7	7	28668	28674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009513	GTA	2	6	28800	28805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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629	NC_009513	TTG	2	6	29008	29013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543269
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