MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri DSM 20016 chromosome

Total Repeats: 44176

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_009513	ATT	2	6	229022	229027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
5003	NC_009513	T	6	6	229102	229107	0 %	100 %	0 %	0 %	148543432
5004	NC_009513	TTAGT	2	10	229110	229119	20 %	60 %	20 %	0 %	148543432
5005	NC_009513	ATT	2	6	229163	229168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
5006	NC_009513	TTGT	2	8	229175	229182	0 %	75 %	25 %	0 %	148543432
5007	NC_009513	CAA	2	6	229209	229214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543432
5008	NC_009513	TAC	2	6	229216	229221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148543432
5009	NC_009513	ATT	2	6	229222	229227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
5010	NC_009513	ATT	2	6	229255	229260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
5011	NC_009513	ATT	2	6	229298	229303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
5012	NC_009513	TTA	2	6	229311	229316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
5013	NC_009513	TATT	2	8	229322	229329	25 %	75 %	0 %	0 %	148543432
5014	NC_009513	ATT	2	6	229376	229381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543432
5015	NC_009513	TAA	2	6	229389	229394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543432
5016	NC_009513	GAAA	2	8	229412	229419	75 %	0 %	25 %	0 %	148543432
5017	NC_009513	AGC	2	6	229420	229425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543432
5018	NC_009513	TTA	2	6	229449	229454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_009513	AAAAT	2	10	229477	229486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_009513	TTG	2	6	229505	229510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_009513	TGT	2	6	229527	229532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543433
5022	NC_009513	CTT	2	6	229558	229563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543433
5023	NC_009513	TTG	2	6	229576	229581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543433
5024	NC_009513	AAT	2	6	229625	229630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148543433
5025	NC_009513	ATG	2	6	229676	229681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543433
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5028	NC_009513	AT	3	6	229770	229775	50 %	50 %	0 %	0 %	148543433
5029	NC_009513	TC	3	6	229791	229796	0 %	50 %	0 %	50 %	148543433
5030	NC_009513	TAT	3	9	229801	229809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543433
5031	NC_009513	TCT	2	6	229816	229821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_009513	ATT	2	6	229834	229839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543434
5033	NC_009513	A	6	6	229917	229922	100 %	0 %	0 %	0 %	148543434
5034	NC_009513	ATG	2	6	229930	229935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543434
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5037	NC_009513	GGC	2	6	230022	230027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148543434
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5040	NC_009513	TTA	2	6	230127	230132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543434
5041	NC_009513	TTG	2	6	230179	230184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543434
5042	NC_009513	CTG	2	6	230277	230282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543434
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5044	NC_009513	GTT	2	6	230396	230401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543434
5045	NC_009513	TTGA	2	8	230432	230439	25 %	50 %	25 %	0 %	148543434
5046	NC_009513	TAA	2	6	230532	230537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_009513	ATT	3	9	230558	230566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_009513	A	6	6	230611	230616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_009513	TCTT	2	8	230646	230653	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_009513	TAAT	2	8	230654	230661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_009513	TAAA	2	8	230663	230670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_009513	AGA	2	6	230682	230687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_009513	AGG	2	6	230752	230757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5058	NC_009513	TGC	2	6	230964	230969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543435
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5090	NC_009513	ATTG	2	8	231939	231946	25 %	50 %	25 %	0 %	148543435
5091	NC_009513	TGTT	2	8	231953	231960	0 %	75 %	25 %	0 %	148543435
5092	NC_009513	CGT	3	9	231982	231990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543435
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5099	NC_009513	TGC	2	6	232273	232278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543436
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5102	NC_009513	TTGC	2	8	232361	232368	0 %	50 %	25 %	25 %	148543436
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5105	NC_009513	AGC	2	6	232480	232485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543436
5106	NC_009513	ATT	2	6	232577	232582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543436
5107	NC_009513	AT	3	6	232612	232617	50 %	50 %	0 %	0 %	148543436
5108	NC_009513	GTA	2	6	232721	232726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543436
5109	NC_009513	TTG	2	6	232782	232787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148543436
5110	NC_009513	TGC	2	6	232809	232814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148543436
5111	NC_009513	TGA	2	6	232960	232965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543436
5112	NC_009513	GGAC	2	8	232982	232989	25 %	0 %	50 %	25 %	148543436
5113	NC_009513	TGG	2	6	232997	233002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543436
5114	NC_009513	GCCA	2	8	233119	233126	25 %	0 %	25 %	50 %	148543436
5115	NC_009513	GCA	2	6	233162	233167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543436
5116	NC_009513	A	6	6	233231	233236	100 %	0 %	0 %	0 %	148543436
5117	NC_009513	TGG	2	6	233308	233313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148543436
5118	NC_009513	CAA	2	6	233358	233363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543436
5119	NC_009513	TTC	2	6	233424	233429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148543436
5120	NC_009513	ACC	2	6	233437	233442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543436
5121	NC_009513	TTA	2	6	233448	233453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543436
5122	NC_009513	GAT	2	6	233482	233487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148543436
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5124	NC_009513	AGA	2	6	233542	233547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543436
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5237	NC_009513	TAG	2	6	238952	238957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5245	NC_009513	A	6	6	239338	239343	100 %	0 %	0 %	0 %	148543441
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5488	NC_009513	AGT	2	6	250287	250292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5489	NC_009513	TAAC	2	8	250323	250330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5490	NC_009513	ATT	2	6	250334	250339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5491	NC_009513	AGG	2	6	250348	250353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5493	NC_009513	AC	3	6	250494	250499	50 %	0 %	0 %	50 %	148543452
5494	NC_009513	CAA	2	6	250510	250515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148543452
5495	NC_009513	AGC	2	6	250574	250579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148543452
5496	NC_009513	AAG	2	6	250632	250637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148543452
5497	NC_009513	TA	4	8	250784	250791	50 %	50 %	0 %	0 %	148543452
5498	NC_009513	A	6	6	250822	250827	100 %	0 %	0 %	0 %	148543452
5499	NC_009513	ACC	2	6	250838	250843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148543452
5500	NC_009513	ATT	2	6	250852	250857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148543452

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