MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Listeria welshimeri serovar 6b str. SLCC5334 chromosome

Total Repeats: 1186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008555	AACAAA	2	12	1030	1041	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116871423
2	NC_008555	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008555	TATGGG	2	12	3674	3685	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116871425
4	NC_008555	GAAATT	2	12	6230	6241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871428
5	NC_008555	TTTGAT	2	12	6602	6613	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116871428
6	NC_008555	TCGTAC	2	12	6619	6630	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116871428
7	NC_008555	TTATAT	2	12	7636	7647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871428
8	NC_008555	TGAAGA	2	12	9548	9559	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116871429
9	NC_008555	TTAATG	2	12	10347	10358	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116871429
10	NC_008555	ATGAAA	2	12	10447	10458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871429
11	NC_008555	CTTGCA	2	12	14167	14178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116871434
12	NC_008555	GAAAAT	2	12	14713	14724	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871434
13	NC_008555	TACTGG	2	12	19145	19156	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116871437
14	NC_008555	ATTTTC	2	12	19876	19887	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116871438
15	NC_008555	TGAAAG	2	12	22335	22346	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116871442
16	NC_008555	AGTGAT	2	12	24074	24085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871444
17	NC_008555	ATTGAA	2	12	25731	25742	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871445
18	NC_008555	TCAAAA	2	12	36592	36603	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116871458
19	NC_008555	ATGTTA	2	12	37073	37084	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008555	ACAGTG	2	12	38179	38190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116871461
21	NC_008555	AGTTTA	2	12	40874	40885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116871464
22	NC_008555	AGGTAA	2	12	43060	43071	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116871466
23	NC_008555	GCGGAG	2	12	47602	47613	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116871470
24	NC_008555	AAGTAA	2	12	57162	57173	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871475
25	NC_008555	AAAAGG	2	12	57359	57370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116871476
26	NC_008555	TAAATT	2	12	59839	59850	50 %	50 %	0 %	0 %	116871478
27	NC_008555	ATGTAT	2	12	63052	63063	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116871483
28	NC_008555	TTTTAT	2	12	67557	67568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008555	TTACAA	2	12	69452	69463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116871492
30	NC_008555	ATAGAA	2	12	76026	76037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008555	TTAAAT	2	12	77165	77176	50 %	50 %	0 %	0 %	116871499
32	NC_008555	CTTTTT	2	12	78380	78391	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116871501
33	NC_008555	AATATA	2	12	78872	78883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871501
34	NC_008555	TGTTAC	2	12	80791	80802	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116871502
35	NC_008555	TACTTT	2	12	81064	81075	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116871502
36	NC_008555	GAAGCA	2	12	84260	84271	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116871502
37	NC_008555	AAAAGT	2	12	85915	85926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871502
38	NC_008555	GCAATT	2	12	88771	88782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116871505
39	NC_008555	CGCTTG	2	12	89543	89554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871506
40	NC_008555	TTATTT	2	12	92261	92272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116871509
41	NC_008555	GAAAAT	2	12	99839	99850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008555	ACATCT	2	12	100274	100285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008555	TAAAAT	2	12	102412	102423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116871519
44	NC_008555	CAAAAT	2	12	102553	102564	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116871519
45	NC_008555	AGTTTT	2	12	110908	110919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116871529
46	NC_008555	TTTAAT	2	12	111713	111724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116871530
47	NC_008555	CATTAC	2	12	112712	112723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871532
48	NC_008555	CCATTA	2	12	112777	112788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871532
49	NC_008555	ACCATT	2	12	112797	112808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871532
50	NC_008555	CTTTTT	2	12	113072	113083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116871532
51	NC_008555	ATCTGT	2	12	113418	113429	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116871532
52	NC_008555	TAGAAA	2	12	115455	115466	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871533
53	NC_008555	GCTAGA	2	12	116305	116316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116871534
54	NC_008555	GGATGT	2	12	117645	117656	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116871535
55	NC_008555	AGGTTC	2	12	118509	118520	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116871537
56	NC_008555	CAGGTT	2	12	120071	120082	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008555	TTAAAG	2	12	122179	122190	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871540
58	NC_008555	GAAAAA	2	12	122685	122696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116871541
59	NC_008555	TGATAC	2	12	124395	124406	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116871543
60	NC_008555	GATCAT	2	12	128913	128924	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116871549
61	NC_008555	TGAAAC	2	12	131351	131362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116871552
62	NC_008555	AAACAC	2	12	131669	131680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008555	GAACGT	2	12	134538	134549	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116871554
64	NC_008555	TGAAAA	2	12	137359	137370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871557
65	NC_008555	CAAAAA	2	12	140435	140446	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116871559
66	NC_008555	AGATGG	2	12	140967	140978	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116871560
67	NC_008555	TTTTCA	2	12	144316	144327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116871562
68	NC_008555	GTAAAA	2	12	146295	146306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871564
69	NC_008555	TTTTAT	2	12	148342	148353	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116871568
70	NC_008555	AAGCAA	2	12	152779	152790	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116871573
71	NC_008555	TTATGG	2	12	154103	154114	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116871573
72	NC_008555	GAAGTT	2	12	154179	154190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871573
73	NC_008555	TTATAT	2	12	154634	154645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008555	CTCCAA	2	12	155393	155404	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116871574
75	NC_008555	CATTGA	2	12	158803	158814	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116871578
76	NC_008555	GAAAAT	2	12	159137	159148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871579
77	NC_008555	TTCTTT	2	12	170970	170981	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116871592
78	NC_008555	CCAGAA	2	12	172715	172726	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116871593
79	NC_008555	TTTATC	2	12	173298	173309	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116871594
80	NC_008555	AATTGT	2	12	174565	174576	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116871596
81	NC_008555	CGCTTG	2	12	177961	177972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116871597
82	NC_008555	TATTCT	2	12	178093	178104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116871597
83	NC_008555	CTTGCT	2	12	178683	178694	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116871597
84	NC_008555	TGTTGG	2	12	178964	178975	0 %	50 %	50 %	0 %	116871597
85	NC_008555	AGCTTT	2	12	179156	179167	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116871597
86	NC_008555	ACAAGT	2	12	180110	180121	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116871600
87	NC_008555	TGTCGG	2	12	184034	184045	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116871603
88	NC_008555	GCAGAA	2	12	187062	187073	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116871605
89	NC_008555	ATAAAA	2	12	190369	190380	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116871610
90	NC_008555	GAACCA	2	12	191586	191597	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116871611
91	NC_008555	ATTCAA	2	12	193872	193883	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008555	AAGGAA	2	12	195443	195454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008555	TAGGCG	2	12	197096	197107	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008555	ATTCAA	2	12	199895	199906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008555	AAGGAA	2	12	201466	201477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008555	TAGGCG	2	12	203119	203130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_008555	ACTGAA	2	12	206622	206633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116871615
98	NC_008555	CAGAAA	2	12	208487	208498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116871616
99	NC_008555	ACTTAC	2	12	209972	209983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116871617
100	NC_008555	AAGTGG	2	12	218227	218238	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116871625
101	NC_008555	TTATAT	2	12	219251	219262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008555	ACAGTA	2	12	219580	219591	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116871628
103	NC_008555	AAAACA	2	12	219954	219965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	116871629
104	NC_008555	AGTTGA	2	12	220298	220309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116871629
105	NC_008555	CTGTAG	2	12	223081	223092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116871634
106	NC_008555	TTATTT	2	12	224232	224243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116871636
107	NC_008555	TGAATC	2	12	229967	229978	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116871642
108	NC_008555	AGACTT	2	12	235255	235266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116871646
109	NC_008555	AAGAAA	2	12	237950	237961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116871647
110	NC_008555	TACAAG	2	12	253870	253881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116871658
111	NC_008555	CAATTA	2	12	255883	255894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116871659
112	NC_008555	ATCAAT	2	12	267036	267047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116871666
113	NC_008555	AAAGTA	2	12	268172	268183	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116871668
114	NC_008555	TATGAA	2	12	268919	268930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871668
115	NC_008555	ATTGAA	2	12	270036	270047	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871669
116	NC_008555	TCACCA	2	12	271392	271403	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	116871671
117	NC_008555	ACGTTG	2	12	272940	272951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116871672
118	NC_008555	GTTAAA	2	12	278610	278621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116871677
119	NC_008555	AAATAA	2	12	283690	283701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116871682
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231	NC_008555	GACGGC	2	12	532575	532586	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116871914
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233	NC_008555	TGTCCA	2	12	542725	542736	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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236	NC_008555	TTTTTC	2	12	547891	547902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116871931
237	NC_008555	TCTGTT	2	12	549461	549472	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116871933
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346	NC_008555	AGTAAA	2	12	828486	828497	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_008555	TAAATA	2	12	1107057	1107068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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