MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 chromosome

Total Repeats: 1567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008531	TCATT	2	10	75	84	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008531	ATTTA	2	10	549	558	40 %	60 %	0 %	0 %	116617175
3	NC_008531	TCTGG	2	10	768	777	0 %	40 %	40 %	20 %	116617175
4	NC_008531	TTACC	2	10	1895	1904	20 %	40 %	0 %	40 %	116617176
5	NC_008531	AAACA	2	10	2869	2878	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008531	ATCGT	2	10	10240	10249	20 %	40 %	20 %	20 %	116617182
7	NC_008531	TGATG	2	10	10341	10350	20 %	40 %	40 %	0 %	116617182
8	NC_008531	GTAGG	2	10	12244	12253	20 %	20 %	60 %	0 %	116617184
9	NC_008531	ATACC	2	10	13980	13989	40 %	20 %	0 %	40 %	116617185
10	NC_008531	TTGGT	2	10	21300	21309	0 %	60 %	40 %	0 %	116617192
11	NC_008531	AGCGA	2	10	22356	22365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008531	TACCA	2	10	23157	23166	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008531	TCGTG	2	10	23743	23752	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008531	GTTAA	2	10	24592	24601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008531	CTAGT	2	10	26750	26759	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008531	GAGAT	2	10	27381	27390	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008531	GTGTC	2	10	27604	27613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008531	TAAAA	2	10	31737	31746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008531	TTACT	2	10	32501	32510	20 %	60 %	0 %	20 %	116617196
20	NC_008531	AATAT	2	10	32522	32531	60 %	40 %	0 %	0 %	116617196
21	NC_008531	ATTCA	2	10	33466	33475	40 %	40 %	0 %	20 %	116617197
22	NC_008531	CAATC	2	10	33884	33893	40 %	20 %	0 %	40 %	116617198
23	NC_008531	TTTTC	2	10	40704	40713	0 %	80 %	0 %	20 %	116617203
24	NC_008531	TGATT	2	10	41792	41801	20 %	60 %	20 %	0 %	116617204
25	NC_008531	GACAA	2	10	41941	41950	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008531	TCCTT	2	10	46419	46428	0 %	60 %	0 %	40 %	116617210
27	NC_008531	TTCTC	2	10	47028	47037	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008531	TGAAT	2	10	50792	50801	40 %	40 %	20 %	0 %	116617214
29	NC_008531	AGTAT	2	10	55165	55174	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008531	TTTGG	2	10	55837	55846	0 %	60 %	40 %	0 %	116617220
31	NC_008531	GCATT	2	10	56398	56407	20 %	40 %	20 %	20 %	116617220
32	NC_008531	ATAAA	2	10	56966	56975	80 %	20 %	0 %	0 %	116617221
33	NC_008531	TGAAA	2	10	57240	57249	60 %	20 %	20 %	0 %	116617221
34	NC_008531	TAATT	2	10	57746	57755	40 %	60 %	0 %	0 %	116617222
35	NC_008531	TAACT	2	10	59083	59092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008531	GCTTG	2	10	61439	61448	0 %	40 %	40 %	20 %	116617227
37	NC_008531	TAGAA	2	10	65570	65579	60 %	20 %	20 %	0 %	116617232
38	NC_008531	GCGTT	2	10	66889	66898	0 %	40 %	40 %	20 %	116617233
39	NC_008531	CTAAA	2	10	67335	67344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008531	AAAAG	2	10	67381	67390	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008531	ATGGG	2	10	70147	70156	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008531	TTTTG	2	10	70587	70596	0 %	80 %	20 %	0 %	116617237
43	NC_008531	TGTGT	2	10	71979	71988	0 %	60 %	40 %	0 %	116617238
44	NC_008531	TGAGT	2	10	72541	72550	20 %	40 %	40 %	0 %	116617238
45	NC_008531	AGGAT	2	10	73273	73282	40 %	20 %	40 %	0 %	116617238
46	NC_008531	TAAGG	2	10	73520	73529	40 %	20 %	40 %	0 %	116617238
47	NC_008531	TTTAT	2	10	73768	73777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008531	TATCA	2	10	74431	74440	40 %	40 %	0 %	20 %	116617241
49	NC_008531	AGAAT	2	10	76652	76661	60 %	20 %	20 %	0 %	116617247
50	NC_008531	AATAA	2	10	78818	78827	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008531	AATTT	2	10	80458	80467	40 %	60 %	0 %	0 %	116617252
52	NC_008531	TAAAT	2	10	81846	81855	60 %	40 %	0 %	0 %	116617252
53	NC_008531	AAAAG	2	10	82069	82078	80 %	0 %	20 %	0 %	116617253
54	NC_008531	GCATT	2	10	82330	82339	20 %	40 %	20 %	20 %	116617253
55	NC_008531	ATTTT	2	10	83299	83308	20 %	80 %	0 %	0 %	116617254
56	NC_008531	TTGTC	2	10	85424	85433	0 %	60 %	20 %	20 %	116617255
57	NC_008531	TCAAA	2	10	85870	85879	60 %	20 %	0 %	20 %	116617255
58	NC_008531	GCGGT	2	10	88910	88919	0 %	20 %	60 %	20 %	116617258
59	NC_008531	AAATA	2	10	89843	89852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008531	AAAGA	2	10	89938	89947	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008531	AAAGA	2	10	90434	90443	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008531	CAATA	2	10	93037	93046	60 %	20 %	0 %	20 %	116617261
63	NC_008531	ATTAC	2	10	93928	93937	40 %	40 %	0 %	20 %	116617263
64	NC_008531	CTTTA	2	10	94308	94317	20 %	60 %	0 %	20 %	116617263
65	NC_008531	TTGCC	2	10	95948	95957	0 %	40 %	20 %	40 %	116617265
66	NC_008531	TTTGG	2	10	96962	96971	0 %	60 %	40 %	0 %	116617266
67	NC_008531	AATAA	2	10	98770	98779	80 %	20 %	0 %	0 %	116617269
68	NC_008531	ATGGT	2	10	98885	98894	20 %	40 %	40 %	0 %	116617269
69	NC_008531	TTTGG	2	10	99622	99631	0 %	60 %	40 %	0 %	116617269
70	NC_008531	TTAAT	2	10	101861	101870	40 %	60 %	0 %	0 %	116617272
71	NC_008531	TTTAT	2	10	102730	102739	20 %	80 %	0 %	0 %	116617273
72	NC_008531	ATCAA	2	10	103243	103252	60 %	20 %	0 %	20 %	116617274
73	NC_008531	TGATT	2	10	104889	104898	20 %	60 %	20 %	0 %	116617276
74	NC_008531	GACTT	2	10	105704	105713	20 %	40 %	20 %	20 %	116617276
75	NC_008531	ATTTA	2	10	107799	107808	40 %	60 %	0 %	0 %	116617279
76	NC_008531	AGAAT	2	10	107865	107874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008531	AAAGC	2	10	110544	110553	60 %	0 %	20 %	20 %	116617282
78	NC_008531	ATTTA	2	10	111263	111272	40 %	60 %	0 %	0 %	116617282
79	NC_008531	ATTAA	2	10	111650	111659	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008531	TTTAC	2	10	113567	113576	20 %	60 %	0 %	20 %	116617284
81	NC_008531	TCAAA	2	10	113922	113931	60 %	20 %	0 %	20 %	116617284
82	NC_008531	ATCAA	2	10	114790	114799	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008531	TAATT	2	10	117357	117366	40 %	60 %	0 %	0 %	116617286
84	NC_008531	AGCGC	2	10	121236	121245	20 %	0 %	40 %	40 %	116617291
85	NC_008531	AATTG	2	10	122326	122335	40 %	40 %	20 %	0 %	116617292
86	NC_008531	TCATA	2	10	122873	122882	40 %	40 %	0 %	20 %	116617292
87	NC_008531	ATGGT	2	10	124300	124309	20 %	40 %	40 %	0 %	116617294
88	NC_008531	AAGGT	2	10	127735	127744	40 %	20 %	40 %	0 %	116617298
89	NC_008531	GCAGT	2	10	130309	130318	20 %	20 %	40 %	20 %	116617299
90	NC_008531	TTGTT	2	10	131598	131607	0 %	80 %	20 %	0 %	116617299
91	NC_008531	CAGTA	2	10	134320	134329	40 %	20 %	20 %	20 %	116617302
92	NC_008531	TGACA	2	10	134372	134381	40 %	20 %	20 %	20 %	116617302
93	NC_008531	AAAGC	2	10	134451	134460	60 %	0 %	20 %	20 %	116617302
94	NC_008531	AGCAA	2	10	134822	134831	60 %	0 %	20 %	20 %	116617302
95	NC_008531	AGATA	2	10	137022	137031	60 %	20 %	20 %	0 %	116617304
96	NC_008531	GAAAC	2	10	137140	137149	60 %	0 %	20 %	20 %	116617304
97	NC_008531	TTTTC	2	10	137749	137758	0 %	80 %	0 %	20 %	116617305
98	NC_008531	CGTAG	2	10	142171	142180	20 %	20 %	40 %	20 %	116617309
99	NC_008531	TTGCT	2	10	143548	143557	0 %	60 %	20 %	20 %	116617311
100	NC_008531	CTTTT	2	10	144009	144018	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008531	AAAAT	2	10	144549	144558	80 %	20 %	0 %	0 %	116617312
102	NC_008531	AGCAA	2	10	145771	145780	60 %	0 %	20 %	20 %	116617313
103	NC_008531	ACATG	2	10	147300	147309	40 %	20 %	20 %	20 %	116617314
104	NC_008531	AGCGA	2	10	148091	148100	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_008531	TACCA	2	10	148892	148901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_008531	TCGTG	2	10	149478	149487	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_008531	GTTAA	2	10	150327	150336	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008531	CTAGT	2	10	152485	152494	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_008531	GAGAT	2	10	153116	153125	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008531	GTGTC	2	10	153339	153348	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_008531	ATTGT	2	10	156244	156253	20 %	60 %	20 %	0 %	116617315
112	NC_008531	CCAAT	2	10	156713	156722	40 %	20 %	0 %	40 %	116617316
113	NC_008531	AAAGC	2	10	158850	158859	60 %	0 %	20 %	20 %	116617316
114	NC_008531	TATAA	2	10	160383	160392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008531	TTGAT	2	10	161627	161636	20 %	60 %	20 %	0 %	116617318
116	NC_008531	TTTAA	2	10	162346	162355	40 %	60 %	0 %	0 %	116617318
117	NC_008531	TCTGT	2	10	163689	163698	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008531	CGTAT	2	10	165309	165318	20 %	40 %	20 %	20 %	116617322
119	NC_008531	ATTCA	2	10	165367	165376	40 %	40 %	0 %	20 %	116617322
120	NC_008531	TCTAG	2	10	167229	167238	20 %	40 %	20 %	20 %	116617323
121	NC_008531	TGGCA	2	10	168113	168122	20 %	20 %	40 %	20 %	116617323
122	NC_008531	TACTT	2	10	168478	168487	20 %	60 %	0 %	20 %	116617324
123	NC_008531	TTTGT	2	10	170341	170350	0 %	80 %	20 %	0 %	116617326
124	NC_008531	GGATG	2	10	170410	170419	20 %	20 %	60 %	0 %	116617326
125	NC_008531	AAATC	2	10	171634	171643	60 %	20 %	0 %	20 %	116617327
126	NC_008531	TTAAA	2	10	172264	172273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008531	CTTGC	2	10	172285	172294	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008531	GGTTG	2	10	176996	177005	0 %	40 %	60 %	0 %	116617336
129	NC_008531	CACAA	2	10	177084	177093	60 %	0 %	0 %	40 %	116617336
130	NC_008531	AAACA	2	10	179517	179526	80 %	0 %	0 %	20 %	116617343
131	NC_008531	AAGGA	2	10	180472	180481	60 %	0 %	40 %	0 %	116617344
132	NC_008531	TACCA	2	10	187550	187559	40 %	20 %	0 %	40 %	116617357
133	NC_008531	CATTT	2	10	190099	190108	20 %	60 %	0 %	20 %	116617358
134	NC_008531	TTTTG	2	10	190357	190366	0 %	80 %	20 %	0 %	116617359
135	NC_008531	TGGTT	2	10	190863	190872	0 %	60 %	40 %	0 %	116617359
136	NC_008531	GTTTT	2	10	191347	191356	0 %	80 %	20 %	0 %	116617360
137	NC_008531	AAGTT	2	10	193377	193386	40 %	40 %	20 %	0 %	116617363
138	NC_008531	CTTTT	2	10	194080	194089	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008531	TACCA	2	10	196206	196215	40 %	20 %	0 %	40 %	116617366
140	NC_008531	GTGAT	2	10	196473	196482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008531	AATCT	2	10	197548	197557	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_008531	ATAGA	2	10	197598	197607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_008531	ATTCA	2	10	216678	216687	40 %	40 %	0 %	20 %	116617385
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174	NC_008531	CAATT	2	10	248055	248064	40 %	40 %	0 %	20 %	116617420
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253	NC_008531	GGATT	2	10	356412	356421	20 %	40 %	40 %	0 %	116617522
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263	NC_008531	TATAA	2	10	370649	370658	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_008531	CTTAT	2	10	374342	374351	20 %	60 %	0 %	20 %	116617537
267	NC_008531	CATTT	2	10	374680	374689	20 %	60 %	0 %	20 %	116617538
268	NC_008531	AATAG	2	10	374978	374987	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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