MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 1910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008526	CAAAC	2	10	660	669	60 %	0 %	0 %	40 %	116493575
2	NC_008526	TATAT	2	10	1567	1576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008526	CAACG	2	10	1773	1782	40 %	0 %	20 %	40 %	116493576
4	NC_008526	ATGAA	2	10	2813	2822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008526	GAAGA	2	10	4921	4930	60 %	0 %	40 %	0 %	116493579
6	NC_008526	GGCAC	2	10	5407	5416	20 %	0 %	40 %	40 %	116493579
7	NC_008526	GACAA	2	10	5681	5690	60 %	0 %	20 %	20 %	116493579
8	NC_008526	GAAAA	2	10	7766	7775	80 %	0 %	20 %	0 %	116493580
9	NC_008526	GACAA	2	10	8892	8901	60 %	0 %	20 %	20 %	116493580
10	NC_008526	CATTT	2	10	10006	10015	20 %	60 %	0 %	20 %	116493581
11	NC_008526	TTTTA	2	10	16553	16562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008526	AGCCA	2	10	18403	18412	40 %	0 %	20 %	40 %	116493592
13	NC_008526	TCTGG	2	10	20102	20111	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008526	GTGAT	2	10	20134	20143	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008526	TGGCT	2	10	20913	20922	0 %	40 %	40 %	20 %	116493594
16	NC_008526	GCTTT	2	10	22465	22474	0 %	60 %	20 %	20 %	116493595
17	NC_008526	CAGCG	2	10	23112	23121	20 %	0 %	40 %	40 %	116493595
18	NC_008526	GTTTT	2	10	25101	25110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008526	TCCTG	2	10	26054	26063	0 %	40 %	20 %	40 %	116493598
20	NC_008526	TTGTT	2	10	26843	26852	0 %	80 %	20 %	0 %	116493599
21	NC_008526	AAGCC	2	10	27629	27638	40 %	0 %	20 %	40 %	116493600
22	NC_008526	CAAAG	2	10	28473	28482	60 %	0 %	20 %	20 %	116493601
23	NC_008526	TTCTT	2	10	28522	28531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008526	AGCGA	2	10	35297	35306	40 %	0 %	40 %	20 %	116493608
25	NC_008526	AGCCA	2	10	37310	37319	40 %	0 %	20 %	40 %	116493611
26	NC_008526	GTCTT	2	10	42326	42335	0 %	60 %	20 %	20 %	116493617
27	NC_008526	TTGGC	2	10	42365	42374	0 %	40 %	40 %	20 %	116493617
28	NC_008526	CGAAC	2	10	42948	42957	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008526	ATAAA	2	10	44234	44243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008526	GAAAA	2	10	45836	45845	80 %	0 %	20 %	0 %	116493622
31	NC_008526	TTGAA	2	10	46261	46270	40 %	40 %	20 %	0 %	116493622
32	NC_008526	ATAAA	2	10	46407	46416	80 %	20 %	0 %	0 %	116493622
33	NC_008526	AATAA	2	10	46653	46662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008526	AGCCA	2	10	47150	47159	40 %	0 %	20 %	40 %	116493623
35	NC_008526	TCAAT	2	10	48326	48335	40 %	40 %	0 %	20 %	116493624
36	NC_008526	AACGC	2	10	48644	48653	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008526	ATGAA	2	10	49077	49086	60 %	20 %	20 %	0 %	116493625
38	NC_008526	ACAAA	2	10	50602	50611	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008526	TTTCT	2	10	51237	51246	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008526	TCGTT	2	10	51634	51643	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008526	TGTTT	2	10	55338	55347	0 %	80 %	20 %	0 %	116493631
42	NC_008526	GCGCC	2	10	56842	56851	0 %	0 %	40 %	60 %	116493632
43	NC_008526	CAGTT	2	10	59314	59323	20 %	40 %	20 %	20 %	116493633
44	NC_008526	TTGAT	2	10	66349	66358	20 %	60 %	20 %	0 %	116493642
45	NC_008526	TTGCT	2	10	66442	66451	0 %	60 %	20 %	20 %	116493642
46	NC_008526	CGTTT	2	10	68342	68351	0 %	60 %	20 %	20 %	116493644
47	NC_008526	TAAGT	2	10	72100	72109	40 %	40 %	20 %	0 %	116493648
48	NC_008526	TCATC	2	10	73649	73658	20 %	40 %	0 %	40 %	116493650
49	NC_008526	GAAGC	2	10	77069	77078	40 %	0 %	40 %	20 %	116493652
50	NC_008526	TGGCA	2	10	77236	77245	20 %	20 %	40 %	20 %	116493652
51	NC_008526	GTTTC	2	10	80018	80027	0 %	60 %	20 %	20 %	116493655
52	NC_008526	AAGAA	2	10	80588	80597	80 %	0 %	20 %	0 %	116493656
53	NC_008526	TACTC	2	10	81196	81205	20 %	40 %	0 %	40 %	116493658
54	NC_008526	TAATA	2	10	82525	82534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008526	TTATT	2	10	83289	83298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008526	TTTCA	2	10	83362	83371	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008526	TGAGA	2	10	84401	84410	40 %	20 %	40 %	0 %	116493662
58	NC_008526	ATTGC	2	10	84795	84804	20 %	40 %	20 %	20 %	116493662
59	NC_008526	TTATT	2	10	85025	85034	20 %	80 %	0 %	0 %	116493663
60	NC_008526	TCAAG	2	10	85435	85444	40 %	20 %	20 %	20 %	116493663
61	NC_008526	TCGAG	2	10	86318	86327	20 %	20 %	40 %	20 %	116493664
62	NC_008526	TCTCT	2	10	86839	86848	0 %	60 %	0 %	40 %	116493665
63	NC_008526	TTTTC	2	10	87026	87035	0 %	80 %	0 %	20 %	116493665
64	NC_008526	AATTA	2	10	87134	87143	60 %	40 %	0 %	0 %	116493665
65	NC_008526	TCCCA	2	10	88382	88391	20 %	20 %	0 %	60 %	116493667
66	NC_008526	CCCAG	2	10	89015	89024	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_008526	GCTTT	2	10	92023	92032	0 %	60 %	20 %	20 %	116493670
68	NC_008526	ATTGA	2	10	95276	95285	40 %	40 %	20 %	0 %	116493672
69	NC_008526	CAAAA	2	10	97950	97959	80 %	0 %	0 %	20 %	116493677
70	NC_008526	ATTTC	2	10	98476	98485	20 %	60 %	0 %	20 %	116493677
71	NC_008526	ATTTA	2	10	101689	101698	40 %	60 %	0 %	0 %	116493679
72	NC_008526	AACCA	2	10	104470	104479	60 %	0 %	0 %	40 %	116493682
73	NC_008526	GCCAT	2	10	104824	104833	20 %	20 %	20 %	40 %	116493683
74	NC_008526	AAGGC	2	10	104871	104880	40 %	0 %	40 %	20 %	116493683
75	NC_008526	TAATT	2	10	107054	107063	40 %	60 %	0 %	0 %	116493686
76	NC_008526	GAAGA	2	10	109993	110002	60 %	0 %	40 %	0 %	116493688
77	NC_008526	GAAAA	2	10	110011	110020	80 %	0 %	20 %	0 %	116493688
78	NC_008526	CAAAG	2	10	110077	110086	60 %	0 %	20 %	20 %	116493688
79	NC_008526	TTGAA	2	10	117895	117904	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008526	CGGCC	2	10	118490	118499	0 %	0 %	40 %	60 %	116493694
81	NC_008526	CTCAA	2	10	119073	119082	40 %	20 %	0 %	40 %	116493694
82	NC_008526	ACCAA	2	10	119344	119353	60 %	0 %	0 %	40 %	116493694
83	NC_008526	CAAGT	2	10	120304	120313	40 %	20 %	20 %	20 %	116493695
84	NC_008526	GACCC	2	10	121752	121761	20 %	0 %	20 %	60 %	116493696
85	NC_008526	ACCAA	2	10	122340	122349	60 %	0 %	0 %	40 %	116493697
86	NC_008526	TTGGC	2	10	123856	123865	0 %	40 %	40 %	20 %	116493697
87	NC_008526	TGTGT	2	10	125393	125402	0 %	60 %	40 %	0 %	116493698
88	NC_008526	TCAAA	2	10	131820	131829	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008526	ATTGC	2	10	133685	133694	20 %	40 %	20 %	20 %	116493705
90	NC_008526	TCAAG	2	10	134429	134438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008526	TCGAG	2	10	135312	135321	20 %	20 %	40 %	20 %	116493706
92	NC_008526	TGATC	2	10	135707	135716	20 %	40 %	20 %	20 %	116493707
93	NC_008526	CATGC	2	10	136837	136846	20 %	20 %	20 %	40 %	116493708
94	NC_008526	GGAAC	2	10	139663	139672	40 %	0 %	40 %	20 %	116493709
95	NC_008526	CGATC	2	10	143590	143599	20 %	20 %	20 %	40 %	116493714
96	NC_008526	AAAGC	2	10	149556	149565	60 %	0 %	20 %	20 %	116493722
97	NC_008526	CATAA	2	10	149625	149634	60 %	20 %	0 %	20 %	116493722
98	NC_008526	GGGAT	2	10	150718	150727	20 %	20 %	60 %	0 %	116493723
99	NC_008526	GCTCA	2	10	151053	151062	20 %	20 %	20 %	40 %	116493723
100	NC_008526	GTCAT	2	10	151876	151885	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_008526	TTTTC	2	10	153914	153923	0 %	80 %	0 %	20 %	116493727
102	NC_008526	CAAGC	2	10	155306	155315	40 %	0 %	20 %	40 %	116493728
103	NC_008526	AATGA	2	10	156606	156615	60 %	20 %	20 %	0 %	116493729
104	NC_008526	CCAAC	2	10	157174	157183	40 %	0 %	0 %	60 %	116493730
105	NC_008526	GCCTT	2	10	159066	159075	0 %	40 %	20 %	40 %	116493732
106	NC_008526	ATTTA	2	10	160631	160640	40 %	60 %	0 %	0 %	116493734
107	NC_008526	GAGGC	2	10	161890	161899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008526	GTAAG	2	10	163202	163211	40 %	20 %	40 %	0 %	116493736
109	NC_008526	CACAA	2	10	164636	164645	60 %	0 %	0 %	40 %	116493737
110	NC_008526	TGAAT	2	10	166625	166634	40 %	40 %	20 %	0 %	116493739
111	NC_008526	ATCAA	2	10	168078	168087	60 %	20 %	0 %	20 %	116493741
112	NC_008526	CCGTT	2	10	172297	172306	0 %	40 %	20 %	40 %	116493743
113	NC_008526	CCAAC	2	10	174706	174715	40 %	0 %	0 %	60 %	116493745
114	NC_008526	GAACC	2	10	175957	175966	40 %	0 %	20 %	40 %	116493745
115	NC_008526	TGAAG	2	10	177356	177365	40 %	20 %	40 %	0 %	116493746
116	NC_008526	CAGCC	2	10	178268	178277	20 %	0 %	20 %	60 %	116493746
117	NC_008526	CAATG	2	10	178635	178644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_008526	TTTGG	2	10	180430	180439	0 %	60 %	40 %	0 %	116493749
119	NC_008526	GCGGT	2	10	182274	182283	0 %	20 %	60 %	20 %	116493751
120	NC_008526	TGAAA	2	10	183903	183912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008526	TAATA	2	10	185210	185219	60 %	40 %	0 %	0 %	116493754
122	NC_008526	GTTGA	2	10	189775	189784	20 %	40 %	40 %	0 %	116493757
123	NC_008526	TCGAT	2	10	191302	191311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008526	CGTTG	2	10	192000	192009	0 %	40 %	40 %	20 %	116493759
125	NC_008526	AGATG	2	10	192976	192985	40 %	20 %	40 %	0 %	116493760
126	NC_008526	AAGGT	2	10	195188	195197	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008526	TTCAT	2	10	195463	195472	20 %	60 %	0 %	20 %	116493764
128	NC_008526	TGAGG	2	10	195664	195673	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008526	AAATG	2	10	196628	196637	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008526	GGCAT	2	10	198369	198378	20 %	20 %	40 %	20 %	116493769
131	NC_008526	TCGTT	2	10	198786	198795	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008526	CGGCA	2	10	198973	198982	20 %	0 %	40 %	40 %	116493770
133	NC_008526	GCCAA	2	10	203836	203845	40 %	0 %	20 %	40 %	116493778
134	NC_008526	CTGGG	2	10	206603	206612	0 %	20 %	60 %	20 %	116493782
135	NC_008526	ACTTC	2	10	208765	208774	20 %	40 %	0 %	40 %	116493784
136	NC_008526	GTAGA	2	10	209212	209221	40 %	20 %	40 %	0 %	116493785
137	NC_008526	GCTTG	2	10	211017	211026	0 %	40 %	40 %	20 %	116493787
138	NC_008526	TCAAT	2	10	215106	215115	40 %	40 %	0 %	20 %	116493791
139	NC_008526	ACTCA	2	10	221999	222008	40 %	20 %	0 %	40 %	116493797
140	NC_008526	ATTTG	2	10	222645	222654	20 %	60 %	20 %	0 %	116493798
141	NC_008526	TTGAC	2	10	226540	226549	20 %	40 %	20 %	20 %	116493800
142	NC_008526	CGTTT	2	10	231428	231437	0 %	60 %	20 %	20 %	116493804
143	NC_008526	ATTTG	2	10	232843	232852	20 %	60 %	20 %	0 %	116493806
144	NC_008526	CTTTT	2	10	232930	232939	0 %	80 %	0 %	20 %	116493806
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149	NC_008526	CTGGA	2	10	239488	239497	20 %	20 %	40 %	20 %	116493810
150	NC_008526	GTTGT	2	10	243436	243445	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008526	AGTTG	2	10	243877	243886	20 %	40 %	40 %	0 %	116493815
152	NC_008526	TGATT	2	10	244656	244665	20 %	60 %	20 %	0 %	116493816
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155	NC_008526	AAAAG	2	10	249822	249831	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008526	AACTT	2	10	250723	250732	40 %	40 %	0 %	20 %	116493820
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158	NC_008526	CAAAC	2	10	254390	254399	60 %	0 %	0 %	40 %	116493824
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164	NC_008526	TCGTG	2	10	260601	260610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
165	NC_008526	TCGCA	2	10	261261	261270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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175	NC_008526	ATCAA	2	10	272864	272873	60 %	20 %	0 %	20 %	116493839
176	NC_008526	AATCG	2	10	276498	276507	40 %	20 %	20 %	20 %	116493844
177	NC_008526	ACCAT	2	10	278245	278254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
178	NC_008526	AGATA	2	10	278312	278321	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_008526	TTTCT	2	10	283789	283798	0 %	80 %	0 %	20 %	116493851
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187	NC_008526	TTGAA	2	10	292882	292891	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_008526	TTGGC	2	10	312103	312112	0 %	40 %	40 %	20 %	116493879
200	NC_008526	AGTTA	2	10	312591	312600	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_008526	ATGCT	2	10	361292	361301	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
236	NC_008526	CAACC	2	10	361654	361663	40 %	0 %	0 %	60 %	116493928
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253	NC_008526	CGCAC	2	10	385435	385444	20 %	0 %	20 %	60 %	116493950
254	NC_008526	AATTT	2	10	386207	386216	40 %	60 %	0 %	0 %	116493950
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256	NC_008526	GGAAC	2	10	389609	389618	40 %	0 %	40 %	20 %	116493952
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261	NC_008526	TAAAC	2	10	394553	394562	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_008526	TGGCA	2	10	394810	394819	20 %	20 %	40 %	20 %	116493955
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265	NC_008526	TCTGG	2	10	407727	407736	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
266	NC_008526	CAAGG	2	10	408823	408832	40 %	0 %	40 %	20 %	116493970
267	NC_008526	GGTAA	2	10	412355	412364	40 %	20 %	40 %	0 %	116493972
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269	NC_008526	GTGCT	2	10	416216	416225	0 %	40 %	40 %	20 %	116493974
270	NC_008526	TCCAG	2	10	417218	417227	20 %	20 %	20 %	40 %	116493974
271	NC_008526	CATTA	2	10	419283	419292	40 %	40 %	0 %	20 %	116493976
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277	NC_008526	TGGCA	2	10	430823	430832	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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282	NC_008526	ATGTC	2	10	441215	441224	20 %	40 %	20 %	20 %	116494000
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391	NC_008526	ATTCA	2	10	581022	581031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
392	NC_008526	TGGCC	2	10	581356	581365	0 %	20 %	40 %	40 %	116494144
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398	NC_008526	AAGCT	2	10	589418	589427	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
399	NC_008526	CGTGA	2	10	591911	591920	20 %	20 %	40 %	20 %	116494154
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