MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008526	TGG	2	6	178827	178832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493747
3502	NC_008526	CTT	2	6	178851	178856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493747
3503	NC_008526	GTT	2	6	178932	178937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493747
3504	NC_008526	TGG	2	6	178950	178955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493747
3505	NC_008526	TGC	2	6	178962	178967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493747
3506	NC_008526	GCT	2	6	178995	179000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493747
3507	NC_008526	T	6	6	179016	179021	0 %	100 %	0 %	0 %	116493747
3508	NC_008526	CGA	2	6	179032	179037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493747
3509	NC_008526	TTG	2	6	179078	179083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493747
3510	NC_008526	AAC	2	6	179149	179154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493747
3511	NC_008526	CGG	2	6	179181	179186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493747
3512	NC_008526	TGG	2	6	179237	179242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493747
3513	NC_008526	ATTAGT	2	12	179461	179472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116493747
3514	NC_008526	AAG	2	6	179517	179522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008526	CTTT	2	8	179571	179578	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3516	NC_008526	GAC	2	6	179622	179627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_008526	ATCG	2	8	179660	179667	25 %	25 %	25 %	25 %	116493748
3518	NC_008526	ATG	2	6	179716	179721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493748
3519	NC_008526	TAA	2	6	179762	179767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493748
3520	NC_008526	T	7	7	179816	179822	0 %	100 %	0 %	0 %	116493748
3521	NC_008526	GTC	2	6	179830	179835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493748
3522	NC_008526	CCG	2	6	179903	179908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493748
3523	NC_008526	TTTA	2	8	179988	179995	25 %	75 %	0 %	0 %	116493748
3524	NC_008526	GTT	2	6	180130	180135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493748
3525	NC_008526	TGA	3	9	180146	180154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493748
3526	NC_008526	TCA	2	6	180262	180267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_008526	ATG	2	6	180366	180371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493749
3528	NC_008526	AGT	2	6	180405	180410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493749
3529	NC_008526	GCT	2	6	180422	180427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493749
3530	NC_008526	TTTGG	2	10	180430	180439	0 %	60 %	40 %	0 %	116493749
3531	NC_008526	TGT	2	6	180445	180450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493749
3532	NC_008526	CAG	2	6	180489	180494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493749
3533	NC_008526	GAT	2	6	180569	180574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493749
3534	NC_008526	T	6	6	180623	180628	0 %	100 %	0 %	0 %	116493749
3535	NC_008526	TGA	2	6	180682	180687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493749
3536	NC_008526	GTC	2	6	180750	180755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493749
3537	NC_008526	TTC	2	6	180784	180789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493749
3538	NC_008526	GCGA	2	8	180834	180841	25 %	0 %	50 %	25 %	116493749
3539	NC_008526	CAG	2	6	180843	180848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493749
3540	NC_008526	TTA	2	6	180849	180854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493749
3541	NC_008526	T	6	6	180907	180912	0 %	100 %	0 %	0 %	116493749
3542	NC_008526	CAG	2	6	180958	180963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493749
3543	NC_008526	TGTC	2	8	180985	180992	0 %	50 %	25 %	25 %	116493749
3544	NC_008526	A	6	6	181004	181009	100 %	0 %	0 %	0 %	116493749
3545	NC_008526	ATC	2	6	181018	181023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493749
3546	NC_008526	TTG	2	6	181104	181109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493749
3547	NC_008526	CTG	2	6	181126	181131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493749
3548	NC_008526	ATT	2	6	181197	181202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493749
3549	NC_008526	GAT	2	6	181323	181328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493749
3550	NC_008526	ATT	2	6	181345	181350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493749
3551	NC_008526	CAT	2	6	181388	181393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493749
3552	NC_008526	CTTG	2	8	181412	181419	0 %	50 %	25 %	25 %	116493749
3553	NC_008526	T	6	6	181457	181462	0 %	100 %	0 %	0 %	116493749
3554	NC_008526	AG	3	6	181476	181481	50 %	0 %	50 %	0 %	116493749
3555	NC_008526	TAGC	2	8	181510	181517	25 %	25 %	25 %	25 %	116493749
3556	NC_008526	GGC	2	6	181569	181574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493749
3557	NC_008526	TAA	2	6	181580	181585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493749
3558	NC_008526	ATGATT	2	12	181652	181663	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116493750
3559	NC_008526	CAG	2	6	181719	181724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493750
3560	NC_008526	CTGC	2	8	181745	181752	0 %	25 %	25 %	50 %	116493750
3561	NC_008526	ATG	2	6	181964	181969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493750
3562	NC_008526	CGAC	2	8	181989	181996	25 %	0 %	25 %	50 %	116493750
3563	NC_008526	ATC	2	6	182068	182073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493750
3564	NC_008526	GCG	2	6	182198	182203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493751
3565	NC_008526	TGCA	2	8	182214	182221	25 %	25 %	25 %	25 %	116493751
3566	NC_008526	GCGGT	2	10	182274	182283	0 %	20 %	60 %	20 %	116493751
3567	NC_008526	CGG	2	6	182298	182303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493751
3568	NC_008526	GCT	2	6	182312	182317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493751
3569	NC_008526	GTG	2	6	182348	182353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493751
3570	NC_008526	TGG	2	6	182361	182366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493751
3571	NC_008526	GAAC	2	8	182396	182403	50 %	0 %	25 %	25 %	116493751
3572	NC_008526	CAA	2	6	182408	182413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493751
3573	NC_008526	TCA	2	6	182415	182420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493751
3574	NC_008526	GGCT	2	8	182455	182462	0 %	25 %	50 %	25 %	116493751
3575	NC_008526	CAT	2	6	182585	182590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493751
3576	NC_008526	AG	3	6	182619	182624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008526	CAT	2	6	182752	182757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_008526	GAC	2	6	182767	182772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493752
3579	NC_008526	GCA	2	6	182785	182790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493752
3580	NC_008526	TGA	2	6	183070	183075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493752
3581	NC_008526	GGCAAC	2	12	183127	183138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493752
3582	NC_008526	GTG	2	6	183270	183275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493752
3583	NC_008526	CAT	2	6	183485	183490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493752
3584	NC_008526	GCTG	2	8	183502	183509	0 %	25 %	50 %	25 %	116493752
3585	NC_008526	TTG	2	6	183537	183542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493752
3586	NC_008526	GAC	2	6	183548	183553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493752
3587	NC_008526	TTG	2	6	183554	183559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493752
3588	NC_008526	ATC	2	6	183611	183616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493752
3589	NC_008526	GAA	2	6	183656	183661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493752
3590	NC_008526	AGC	2	6	183670	183675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493752
3591	NC_008526	CTG	2	6	183836	183841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493752
3592	NC_008526	TGAAA	2	10	183903	183912	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_008526	T	7	7	183935	183941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_008526	TGA	2	6	183955	183960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_008526	TTG	2	6	183979	183984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493753
3596	NC_008526	AAG	2	6	184041	184046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493753
3597	NC_008526	CAT	2	6	184051	184056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493753
3598	NC_008526	T	6	6	184150	184155	0 %	100 %	0 %	0 %	116493754
3599	NC_008526	AGT	2	6	184203	184208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493754
3600	NC_008526	CAG	2	6	184246	184251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493754
3601	NC_008526	GC	4	8	184293	184300	0 %	0 %	50 %	50 %	116493754
3602	NC_008526	CCA	2	6	184323	184328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493754
3603	NC_008526	TGC	2	6	184336	184341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493754
3604	NC_008526	TTG	2	6	184357	184362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493754
3605	NC_008526	AAG	2	6	184389	184394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493754
3606	NC_008526	AGT	2	6	184410	184415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493754
3607	NC_008526	AT	3	6	184470	184475	50 %	50 %	0 %	0 %	116493754
3608	NC_008526	GTC	2	6	184576	184581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493754
3609	NC_008526	GCC	2	6	184643	184648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493754
3610	NC_008526	GAT	2	6	184708	184713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493754
3611	NC_008526	TCT	2	6	184743	184748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493754
3612	NC_008526	TTG	2	6	184765	184770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493754
3613	NC_008526	CCA	2	6	184902	184907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493754
3614	NC_008526	TAA	2	6	184966	184971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493754
3615	NC_008526	AAG	2	6	185003	185008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493754
3616	NC_008526	TGA	2	6	185022	185027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493754
3617	NC_008526	A	6	6	185078	185083	100 %	0 %	0 %	0 %	116493754
3618	NC_008526	ACC	2	6	185093	185098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493754
3619	NC_008526	AGG	2	6	185202	185207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493754
3620	NC_008526	TAATA	2	10	185210	185219	60 %	40 %	0 %	0 %	116493754
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3622	NC_008526	T	6	6	185378	185383	0 %	100 %	0 %	0 %	116493754
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3993	NC_008526	A	6	6	205489	205494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_008526	TGTT	2	8	205580	205587	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_008526	AGGC	2	8	205614	205621	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3996	NC_008526	CAG	2	6	205629	205634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493781
3997	NC_008526	A	6	6	205731	205736	100 %	0 %	0 %	0 %	116493781
3998	NC_008526	A	6	6	206027	206032	100 %	0 %	0 %	0 %	116493781
3999	NC_008526	AATT	2	8	206169	206176	50 %	50 %	0 %	0 %	116493781
4000	NC_008526	GGC	2	6	206204	206209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493781

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