MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008526	GTG	2	6	153714	153719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493727
3002	NC_008526	TG	3	6	153733	153738	0 %	50 %	50 %	0 %	116493727
3003	NC_008526	GGC	2	6	153747	153752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493727
3004	NC_008526	GCT	2	6	153763	153768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493727
3005	NC_008526	CGTT	2	8	153769	153776	0 %	50 %	25 %	25 %	116493727
3006	NC_008526	TGGC	2	8	153779	153786	0 %	25 %	50 %	25 %	116493727
3007	NC_008526	AAG	2	6	153820	153825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493727
3008	NC_008526	TTTTC	2	10	153914	153923	0 %	80 %	0 %	20 %	116493727
3009	NC_008526	GTT	2	6	153996	154001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493727
3010	NC_008526	GC	3	6	154099	154104	0 %	0 %	50 %	50 %	116493727
3011	NC_008526	GTC	2	6	154132	154137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493727
3012	NC_008526	GTGATG	2	12	154211	154222	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_008526	ATT	2	6	154294	154299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_008526	A	6	6	154300	154305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_008526	TG	3	6	154400	154405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_008526	T	6	6	154423	154428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_008526	T	6	6	154430	154435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_008526	A	6	6	154454	154459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_008526	TA	3	6	154481	154486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_008526	AGC	2	6	154523	154528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_008526	T	8	8	154529	154536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_008526	TGT	2	6	154555	154560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493728
3023	NC_008526	CAG	2	6	154704	154709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493728
3024	NC_008526	TCG	2	6	154782	154787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493728
3025	NC_008526	TTC	2	6	154793	154798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493728
3026	NC_008526	GCT	2	6	154806	154811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493728
3027	NC_008526	CGG	2	6	154834	154839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493728
3028	NC_008526	ATC	2	6	154930	154935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493728
3029	NC_008526	CCG	2	6	154954	154959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493728
3030	NC_008526	AAG	2	6	154966	154971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493728
3031	NC_008526	CGAT	2	8	155056	155063	25 %	25 %	25 %	25 %	116493728
3032	NC_008526	ACA	2	6	155089	155094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493728
3033	NC_008526	GTG	2	6	155095	155100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493728
3034	NC_008526	ACT	2	6	155200	155205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493728
3035	NC_008526	ATC	2	6	155247	155252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493728
3036	NC_008526	CAAGC	2	10	155306	155315	40 %	0 %	20 %	40 %	116493728
3037	NC_008526	A	6	6	155358	155363	100 %	0 %	0 %	0 %	116493728
3038	NC_008526	CGA	2	6	155392	155397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493728
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3040	NC_008526	GAA	2	6	155498	155503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493728
3041	NC_008526	GC	3	6	155504	155509	0 %	0 %	50 %	50 %	116493728
3042	NC_008526	GCTC	2	8	155555	155562	0 %	25 %	25 %	50 %	116493728
3043	NC_008526	CAA	2	6	155567	155572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493728
3044	NC_008526	AAC	2	6	155699	155704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493728
3045	NC_008526	A	6	6	155768	155773	100 %	0 %	0 %	0 %	116493728
3046	NC_008526	TTC	2	6	155787	155792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493728
3047	NC_008526	CGA	2	6	155828	155833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493728
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3049	NC_008526	GAT	2	6	155982	155987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493728
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3051	NC_008526	CGG	2	6	156046	156051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493728
3052	NC_008526	GCC	2	6	156131	156136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493728
3053	NC_008526	TGG	2	6	156187	156192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493728
3054	NC_008526	A	6	6	156300	156305	100 %	0 %	0 %	0 %	116493728
3055	NC_008526	TCTG	2	8	156407	156414	0 %	50 %	25 %	25 %	116493728
3056	NC_008526	GAA	2	6	156432	156437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493728
3057	NC_008526	AGTG	2	8	156468	156475	25 %	25 %	50 %	0 %	116493728
3058	NC_008526	CAG	2	6	156491	156496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493728
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3060	NC_008526	AATGA	2	10	156606	156615	60 %	20 %	20 %	0 %	116493729
3061	NC_008526	A	7	7	156615	156621	100 %	0 %	0 %	0 %	116493729
3062	NC_008526	ACTG	2	8	156629	156636	25 %	25 %	25 %	25 %	116493729
3063	NC_008526	A	6	6	156768	156773	100 %	0 %	0 %	0 %	116493729
3064	NC_008526	TGA	2	6	156791	156796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493729
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3066	NC_008526	AAC	2	6	156821	156826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493729
3067	NC_008526	GCA	2	6	156883	156888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493729
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3070	NC_008526	A	7	7	156978	156984	100 %	0 %	0 %	0 %	116493730
3071	NC_008526	CAG	2	6	157028	157033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493730
3072	NC_008526	CCAAC	2	10	157174	157183	40 %	0 %	0 %	60 %	116493730
3073	NC_008526	ACC	2	6	157203	157208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493730
3074	NC_008526	GAT	2	6	157269	157274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493730
3075	NC_008526	GAT	2	6	157422	157427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493730
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3079	NC_008526	AGC	2	6	157790	157795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_008526	TCA	2	6	157828	157833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_008526	ACA	2	6	157837	157842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_008526	A	6	6	157882	157887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_008526	ATG	2	6	157897	157902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493731
3084	NC_008526	A	6	6	157903	157908	100 %	0 %	0 %	0 %	116493731
3085	NC_008526	AGC	2	6	157920	157925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493731
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3089	NC_008526	GTT	2	6	158110	158115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493731
3090	NC_008526	GATT	2	8	158142	158149	25 %	50 %	25 %	0 %	116493731
3091	NC_008526	GCAA	2	8	158171	158178	50 %	0 %	25 %	25 %	116493731
3092	NC_008526	ACTT	2	8	158200	158207	25 %	50 %	0 %	25 %	116493731
3093	NC_008526	GCA	3	9	158209	158217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493731
3094	NC_008526	TGC	2	6	158232	158237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493731
3095	NC_008526	GCA	2	6	158410	158415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493731
3096	NC_008526	TGA	2	6	158468	158473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493731
3097	NC_008526	GCAC	2	8	158498	158505	25 %	0 %	25 %	50 %	116493731
3098	NC_008526	GAT	2	6	158530	158535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493731
3099	NC_008526	ACG	2	6	158572	158577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493731
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3101	NC_008526	ACAT	2	8	158692	158699	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_008526	A	7	7	158771	158777	100 %	0 %	0 %	0 %	116493732
3103	NC_008526	AGC	2	6	158791	158796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493732
3104	NC_008526	TTG	2	6	158799	158804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493732
3105	NC_008526	TGA	2	6	158811	158816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493732
3106	NC_008526	ACG	2	6	159008	159013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493732
3107	NC_008526	GCCTT	2	10	159066	159075	0 %	40 %	20 %	40 %	116493732
3108	NC_008526	GCA	2	6	159129	159134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493732
3109	NC_008526	GGC	2	6	159191	159196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493732
3110	NC_008526	CAA	2	6	159262	159267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493732
3111	NC_008526	CAA	2	6	159299	159304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493732
3112	NC_008526	ATG	2	6	159339	159344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493732
3113	NC_008526	CAA	2	6	159415	159420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493732
3114	NC_008526	AAG	2	6	159483	159488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493732
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3116	NC_008526	A	6	6	159728	159733	100 %	0 %	0 %	0 %	116493732
3117	NC_008526	ATA	2	6	159735	159740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493732
3118	NC_008526	TGT	2	6	159766	159771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493732
3119	NC_008526	AGA	2	6	159825	159830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493732
3120	NC_008526	GAATAA	2	12	159856	159867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_008526	GAAT	2	8	159931	159938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_008526	AAG	2	6	160052	160057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_008526	GAA	2	6	160090	160095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493733
3124	NC_008526	AGC	2	6	160098	160103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493733
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3132	NC_008526	T	7	7	160558	160564	0 %	100 %	0 %	0 %	116493734
3133	NC_008526	TGA	2	6	160603	160608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493734
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3230	NC_008526	A	7	7	164867	164873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3231	NC_008526	GCAG	2	8	164900	164907	25 %	0 %	50 %	25 %	116493738
3232	NC_008526	AAG	2	6	165060	165065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493738
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3239	NC_008526	AGA	2	6	165469	165474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493738
3240	NC_008526	GAT	2	6	165481	165486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493738
3241	NC_008526	AGGCTC	2	12	165499	165510	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116493738
3242	NC_008526	GAA	2	6	165634	165639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493738
3243	NC_008526	AAC	2	6	165680	165685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493738
3244	NC_008526	GAA	2	6	166025	166030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493738
3245	NC_008526	A	6	6	166087	166092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3247	NC_008526	GA	3	6	166110	166115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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