MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008526	TGC	2	6	101896	101901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493679
2002	NC_008526	TGG	2	6	101914	101919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493679
2003	NC_008526	GGAT	2	8	101931	101938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_008526	AGA	2	6	101946	101951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_008526	CAT	2	6	102077	102082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493680
2006	NC_008526	CTG	2	6	102167	102172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493680
2007	NC_008526	TTA	2	6	102186	102191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493680
2008	NC_008526	ATC	2	6	102225	102230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493680
2009	NC_008526	GTT	2	6	102246	102251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493680
2010	NC_008526	AGC	2	6	102254	102259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493680
2011	NC_008526	T	6	6	102371	102376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2012	NC_008526	TGCT	2	8	102388	102395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2013	NC_008526	TTG	2	6	102410	102415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_008526	CTTA	2	8	102431	102438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2015	NC_008526	AT	3	6	102479	102484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_008526	ATT	2	6	102487	102492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_008526	TAA	2	6	102499	102504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_008526	T	6	6	102544	102549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_008526	CAA	2	6	102781	102786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493681
2020	NC_008526	GGT	2	6	102810	102815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493681
2021	NC_008526	ATT	2	6	102890	102895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493681
2022	NC_008526	ATGA	2	8	102955	102962	50 %	25 %	25 %	0 %	116493681
2023	NC_008526	TCA	2	6	103013	103018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493681
2024	NC_008526	TCC	2	6	103067	103072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493681
2025	NC_008526	CAAG	2	8	103078	103085	50 %	0 %	25 %	25 %	116493681
2026	NC_008526	GGCGAT	2	12	103098	103109	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116493681
2027	NC_008526	TTG	2	6	103170	103175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493681
2028	NC_008526	GTG	2	6	103208	103213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493681
2029	NC_008526	CAC	2	6	103381	103386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493681
2030	NC_008526	A	6	6	103701	103706	100 %	0 %	0 %	0 %	116493681
2031	NC_008526	AATTTT	2	12	103905	103916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493681
2032	NC_008526	TAC	2	6	103959	103964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493681
2033	NC_008526	ACT	2	6	104000	104005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_008526	T	6	6	104020	104025	0 %	100 %	0 %	0 %	116493682
2035	NC_008526	TTG	2	6	104080	104085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
2036	NC_008526	TGC	2	6	104134	104139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493682
2037	NC_008526	TGT	2	6	104242	104247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
2038	NC_008526	TGT	2	6	104269	104274	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
2039	NC_008526	GT	3	6	104314	104319	0 %	50 %	50 %	0 %	116493682
2040	NC_008526	GCA	2	6	104426	104431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493682
2041	NC_008526	AACCA	2	10	104470	104479	60 %	0 %	0 %	40 %	116493682
2042	NC_008526	GTT	2	6	104630	104635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493682
2043	NC_008526	TTGG	2	8	104636	104643	0 %	50 %	50 %	0 %	116493682
2044	NC_008526	TCCT	2	8	104669	104676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2045	NC_008526	GTG	2	6	104756	104761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2046	NC_008526	CTT	2	6	104805	104810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493683
2047	NC_008526	T	7	7	104809	104815	0 %	100 %	0 %	0 %	116493683
2048	NC_008526	GCCAT	2	10	104824	104833	20 %	20 %	20 %	40 %	116493683
2049	NC_008526	ATG	2	6	104844	104849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493683
2050	NC_008526	AAGGC	2	10	104871	104880	40 %	0 %	40 %	20 %	116493683
2051	NC_008526	GAAA	2	8	104935	104942	75 %	0 %	25 %	0 %	116493683
2052	NC_008526	T	6	6	104969	104974	0 %	100 %	0 %	0 %	116493683
2053	NC_008526	AAC	2	6	104982	104987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493683
2054	NC_008526	CTTG	2	8	105043	105050	0 %	50 %	25 %	25 %	116493683
2055	NC_008526	ATC	2	6	105069	105074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493683
2056	NC_008526	TGA	2	6	105100	105105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493683
2057	NC_008526	GAC	2	6	105107	105112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493683
2058	NC_008526	CGA	2	6	105172	105177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493683
2059	NC_008526	TAAG	2	8	105224	105231	50 %	25 %	25 %	0 %	116493683
2060	NC_008526	TCA	2	6	105282	105287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493683
2061	NC_008526	CAT	2	6	105317	105322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493683
2062	NC_008526	TCA	2	6	105328	105333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493683
2063	NC_008526	GTT	2	6	105418	105423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493683
2064	NC_008526	TGG	2	6	105445	105450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493683
2065	NC_008526	CGT	2	6	105487	105492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493683
2066	NC_008526	GCA	2	6	105591	105596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493683
2067	NC_008526	GTAG	2	8	105691	105698	25 %	25 %	50 %	0 %	116493683
2068	NC_008526	TAA	2	6	105740	105745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493683
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2070	NC_008526	AAG	2	6	105800	105805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493684
2071	NC_008526	ATG	2	6	105869	105874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493684
2072	NC_008526	A	6	6	105877	105882	100 %	0 %	0 %	0 %	116493684
2073	NC_008526	GCA	2	6	105923	105928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493684
2074	NC_008526	T	7	7	105930	105936	0 %	100 %	0 %	0 %	116493684
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2080	NC_008526	ATG	3	9	106166	106174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493685
2081	NC_008526	ATAA	2	8	106237	106244	75 %	25 %	0 %	0 %	116493685
2082	NC_008526	GAT	2	6	106294	106299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493685
2083	NC_008526	ATC	2	6	106322	106327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493685
2084	NC_008526	ATA	2	6	106339	106344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493685
2085	NC_008526	CAT	2	6	106362	106367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493685
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2087	NC_008526	CCT	2	6	106502	106507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2088	NC_008526	CTT	2	6	106531	106536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2089	NC_008526	TCA	2	6	106601	106606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_008526	GGTTAA	2	12	106676	106687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493686
2091	NC_008526	GTCA	2	8	106724	106731	25 %	25 %	25 %	25 %	116493686
2092	NC_008526	GTTT	2	8	106744	106751	0 %	75 %	25 %	0 %	116493686
2093	NC_008526	CGAG	2	8	106759	106766	25 %	0 %	50 %	25 %	116493686
2094	NC_008526	ATG	3	9	106971	106979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493686
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2096	NC_008526	TAATT	2	10	107054	107063	40 %	60 %	0 %	0 %	116493686
2097	NC_008526	GGTT	2	8	107105	107112	0 %	50 %	50 %	0 %	116493686
2098	NC_008526	TTG	2	6	107394	107399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493686
2099	NC_008526	AAT	2	6	107441	107446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493686
2100	NC_008526	TGG	2	6	107452	107457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493686
2101	NC_008526	GCCT	2	8	107501	107508	0 %	25 %	25 %	50 %	116493686
2102	NC_008526	T	6	6	107537	107542	0 %	100 %	0 %	0 %	116493686
2103	NC_008526	TCA	2	6	107587	107592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493686
2104	NC_008526	T	7	7	107688	107694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2105	NC_008526	TCGC	2	8	107725	107732	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2106	NC_008526	GAA	2	6	107814	107819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493687
2107	NC_008526	ATGCGA	2	12	107860	107871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116493687
2108	NC_008526	TCCG	2	8	107930	107937	0 %	25 %	25 %	50 %	116493687
2109	NC_008526	TGC	2	6	107954	107959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493687
2110	NC_008526	T	6	6	107987	107992	0 %	100 %	0 %	0 %	116493687
2111	NC_008526	GCG	2	6	108059	108064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493687
2112	NC_008526	AAG	2	6	108068	108073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493687
2113	NC_008526	GCA	2	6	108224	108229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493687
2114	NC_008526	AGA	2	6	108357	108362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493687
2115	NC_008526	CA	3	6	108411	108416	50 %	0 %	0 %	50 %	116493687
2116	NC_008526	GAT	2	6	108424	108429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493687
2117	NC_008526	CAAT	2	8	108483	108490	50 %	25 %	0 %	25 %	116493687
2118	NC_008526	CTG	2	6	108532	108537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493687
2119	NC_008526	GAA	2	6	108601	108606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493687
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2121	NC_008526	GGT	3	9	108732	108740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493687
2122	NC_008526	GGC	2	6	108772	108777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493687
2123	NC_008526	TGT	2	6	108870	108875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493687
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2225	NC_008526	A	6	6	113487	113492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2226	NC_008526	T	7	7	113529	113535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2490	NC_008526	TTG	2	6	125899	125904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2491	NC_008526	ATG	2	6	125925	125930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2492	NC_008526	AAC	2	6	126005	126010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2493	NC_008526	GCAA	2	8	126107	126114	50 %	0 %	25 %	25 %	116493699
2494	NC_008526	GTT	2	6	126210	126215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493699
2495	NC_008526	ATG	2	6	126266	126271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493699
2496	NC_008526	AGC	2	6	126280	126285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493699
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2499	NC_008526	TGC	2	6	126404	126409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493699
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