MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008526	TGA	2	6	77880	77885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493652
1502	NC_008526	AGC	2	6	77914	77919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493652
1503	NC_008526	GCC	2	6	77926	77931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493652
1504	NC_008526	GTG	2	6	78107	78112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493652
1505	NC_008526	TG	3	6	78226	78231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008526	GCGA	2	8	78332	78339	25 %	0 %	50 %	25 %	116493653
1507	NC_008526	AAC	2	6	78349	78354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493653
1508	NC_008526	GGC	2	6	78359	78364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493653
1509	NC_008526	TGGT	2	8	78378	78385	0 %	50 %	50 %	0 %	116493653
1510	NC_008526	TTGA	2	8	78393	78400	25 %	50 %	25 %	0 %	116493653
1511	NC_008526	CAG	2	6	78454	78459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493653
1512	NC_008526	AAC	2	6	78596	78601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493653
1513	NC_008526	CTT	2	6	78611	78616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493653
1514	NC_008526	TGG	2	6	78624	78629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493653
1515	NC_008526	CG	3	6	78720	78725	0 %	0 %	50 %	50 %	116493653
1516	NC_008526	CAT	2	6	78773	78778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493653
1517	NC_008526	CTGG	2	8	78818	78825	0 %	25 %	50 %	25 %	116493653
1518	NC_008526	GCTG	2	8	78869	78876	0 %	25 %	50 %	25 %	116493653
1519	NC_008526	TGG	2	6	78902	78907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493653
1520	NC_008526	ATG	2	6	78975	78980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008526	A	6	6	79004	79009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008526	CA	3	6	79010	79015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_008526	CAA	2	6	79030	79035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_008526	TGT	2	6	79095	79100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493654
1525	NC_008526	TTG	2	6	79145	79150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493654
1526	NC_008526	GAGG	2	8	79186	79193	25 %	0 %	75 %	0 %	116493654
1527	NC_008526	AGA	2	6	79200	79205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493654
1528	NC_008526	GGT	2	6	79357	79362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493654
1529	NC_008526	TTA	2	6	79395	79400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493654
1530	NC_008526	ATTG	2	8	79410	79417	25 %	50 %	25 %	0 %	116493654
1531	NC_008526	CTT	2	6	79466	79471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493655
1532	NC_008526	ATCA	2	8	79479	79486	50 %	25 %	0 %	25 %	116493655
1533	NC_008526	ATC	2	6	79519	79524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493655
1534	NC_008526	TTG	2	6	79554	79559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493655
1535	NC_008526	TTG	2	6	79583	79588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493655
1536	NC_008526	GT	3	6	79658	79663	0 %	50 %	50 %	0 %	116493655
1537	NC_008526	GTTG	2	8	79697	79704	0 %	50 %	50 %	0 %	116493655
1538	NC_008526	TAA	2	6	79714	79719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493655
1539	NC_008526	TTG	2	6	79844	79849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493655
1540	NC_008526	CAG	2	6	79898	79903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493655
1541	NC_008526	ATTG	2	8	79907	79914	25 %	50 %	25 %	0 %	116493655
1542	NC_008526	T	6	6	80001	80006	0 %	100 %	0 %	0 %	116493655
1543	NC_008526	GTTTC	2	10	80018	80027	0 %	60 %	20 %	20 %	116493655
1544	NC_008526	TTG	2	6	80055	80060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493655
1545	NC_008526	AGA	2	6	80072	80077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493655
1546	NC_008526	T	6	6	80112	80117	0 %	100 %	0 %	0 %	116493655
1547	NC_008526	CCT	2	6	80129	80134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_008526	AAT	2	6	80218	80223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008526	AGA	2	6	80321	80326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008526	GA	3	6	80325	80330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008526	CGA	2	6	80331	80336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_008526	CTG	2	6	80394	80399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493656
1553	NC_008526	T	6	6	80400	80405	0 %	100 %	0 %	0 %	116493656
1554	NC_008526	T	7	7	80409	80415	0 %	100 %	0 %	0 %	116493656
1555	NC_008526	CA	3	6	80419	80424	50 %	0 %	0 %	50 %	116493656
1556	NC_008526	ATG	2	6	80504	80509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493656
1557	NC_008526	TGC	2	6	80539	80544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493656
1558	NC_008526	AAGAA	2	10	80588	80597	80 %	0 %	20 %	0 %	116493656
1559	NC_008526	TGGT	2	8	80672	80679	0 %	50 %	50 %	0 %	116493656
1560	NC_008526	CTT	2	6	80768	80773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493656
1561	NC_008526	GATT	2	8	80806	80813	25 %	50 %	25 %	0 %	116493656
1562	NC_008526	AAGG	2	8	80831	80838	50 %	0 %	50 %	0 %	116493656
1563	NC_008526	GTA	2	6	80890	80895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008526	TTG	2	6	81037	81042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493657
1565	NC_008526	TA	3	6	81141	81146	50 %	50 %	0 %	0 %	116493658
1566	NC_008526	TACTC	2	10	81196	81205	20 %	40 %	0 %	40 %	116493658
1567	NC_008526	GCT	2	6	81231	81236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493658
1568	NC_008526	A	6	6	81251	81256	100 %	0 %	0 %	0 %	116493658
1569	NC_008526	GCT	2	6	81270	81275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493658
1570	NC_008526	GAT	2	6	81317	81322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493658
1571	NC_008526	TTG	2	6	81357	81362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493658
1572	NC_008526	TAG	2	6	81469	81474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493658
1573	NC_008526	AAGC	2	8	81540	81547	50 %	0 %	25 %	25 %	116493658
1574	NC_008526	GAT	2	6	81551	81556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493658
1575	NC_008526	CAG	2	6	81604	81609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493658
1576	NC_008526	TGA	2	6	81657	81662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008526	TTGA	2	8	81698	81705	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008526	GTA	2	6	81748	81753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_008526	GAA	2	6	81790	81795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008526	TGA	2	6	81820	81825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008526	AAG	2	6	81828	81833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008526	CAA	2	6	81837	81842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_008526	TAG	2	6	82060	82065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_008526	GGA	2	6	82162	82167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_008526	GTA	2	6	82201	82206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493659
1586	NC_008526	ACA	2	6	82222	82227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493659
1587	NC_008526	TGA	2	6	82228	82233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493659
1588	NC_008526	GAA	2	6	82290	82295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493659
1589	NC_008526	T	6	6	82460	82465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_008526	GAA	2	6	82488	82493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008526	ATA	2	6	82517	82522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_008526	TAATA	2	10	82525	82534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_008526	A	6	6	82544	82549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008526	A	7	7	82554	82560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008526	GATT	2	8	82595	82602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008526	GTA	2	6	82603	82608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008526	TCA	2	6	82641	82646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_008526	TGC	2	6	82754	82759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493660
1599	NC_008526	TTA	2	6	82765	82770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493660
1600	NC_008526	GGC	2	6	82806	82811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493660
1601	NC_008526	ATGCAC	2	12	82812	82823	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116493660
1602	NC_008526	CTG	2	6	82834	82839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493660
1603	NC_008526	TGC	2	6	82844	82849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493660
1604	NC_008526	ACC	2	6	82893	82898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493660
1605	NC_008526	TGG	2	6	82964	82969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493660
1606	NC_008526	T	6	6	83115	83120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_008526	TCA	3	9	83126	83134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_008526	TA	3	6	83135	83140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008526	AT	3	6	83256	83261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008526	TTTC	2	8	83281	83288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_008526	TTATT	2	10	83289	83298	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008526	CAT	2	6	83306	83311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_008526	TTTCA	2	10	83362	83371	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1614	NC_008526	GAG	2	6	83476	83481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_008526	GGA	2	6	83509	83514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493661
1616	NC_008526	AT	3	6	83544	83549	50 %	50 %	0 %	0 %	116493661
1617	NC_008526	TCA	2	6	83561	83566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493661
1618	NC_008526	TAT	2	6	83597	83602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493661
1619	NC_008526	ACG	2	6	83766	83771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493661
1620	NC_008526	ACG	2	6	83806	83811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493661
1621	NC_008526	GAT	2	6	83880	83885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493661
1622	NC_008526	ACTC	2	8	83886	83893	25 %	25 %	0 %	50 %	116493661
1623	NC_008526	AT	4	8	83934	83941	50 %	50 %	0 %	0 %	116493661
1624	NC_008526	ATT	2	6	83966	83971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493661
1625	NC_008526	ACT	2	6	83976	83981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493661
1626	NC_008526	T	7	7	84026	84032	0 %	100 %	0 %	0 %	116493661
1627	NC_008526	AGT	2	6	84124	84129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493661
1628	NC_008526	AGTC	2	8	84180	84187	25 %	25 %	25 %	25 %	116493661
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