MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008526	TCA	2	6	53253	53258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493629
1002	NC_008526	AACA	2	8	53339	53346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_008526	A	6	6	53351	53356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_008526	A	7	7	53403	53409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_008526	ATT	2	6	53479	53484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_008526	TGAA	2	8	53518	53525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_008526	TGAA	2	8	53560	53567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_008526	CAT	2	6	53607	53612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_008526	GCT	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1010	NC_008526	CTG	2	6	53654	53659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1011	NC_008526	CCGC	2	8	53662	53669	0 %	0 %	25 %	75 %	116493630
1012	NC_008526	CAA	2	6	53683	53688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493630
1013	NC_008526	GA	3	6	53758	53763	50 %	0 %	50 %	0 %	116493630
1014	NC_008526	TGA	2	6	53779	53784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493630
1015	NC_008526	TGG	2	6	53970	53975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493630
1016	NC_008526	GCC	2	6	54065	54070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493630
1017	NC_008526	CCG	2	6	54082	54087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493630
1018	NC_008526	AAG	2	6	54207	54212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493630
1019	NC_008526	AGC	2	6	54261	54266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1020	NC_008526	CAA	2	6	54301	54306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493630
1021	NC_008526	CAG	2	6	54343	54348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1022	NC_008526	TGAG	2	8	54385	54392	25 %	25 %	50 %	0 %	116493630
1023	NC_008526	AGC	3	9	54408	54416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1024	NC_008526	GTC	2	6	54444	54449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1025	NC_008526	A	6	6	54517	54522	100 %	0 %	0 %	0 %	116493630
1026	NC_008526	ATA	2	6	54539	54544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493630
1027	NC_008526	CAA	2	6	54698	54703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493630
1028	NC_008526	TCG	2	6	54806	54811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1029	NC_008526	A	6	6	54816	54821	100 %	0 %	0 %	0 %	116493630
1030	NC_008526	CTG	2	6	54973	54978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493630
1031	NC_008526	TGCG	2	8	54993	55000	0 %	25 %	50 %	25 %	116493630
1032	NC_008526	CAT	2	6	55065	55070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_008526	GCA	2	6	55071	55076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008526	CTG	2	6	55085	55090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_008526	A	7	7	55105	55111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008526	TAA	2	6	55168	55173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_008526	GTTA	2	8	55201	55208	25 %	50 %	25 %	0 %	116493631
1038	NC_008526	CCA	2	6	55216	55221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493631
1039	NC_008526	ATT	2	6	55280	55285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493631
1040	NC_008526	AATGCC	2	12	55298	55309	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116493631
1041	NC_008526	AAC	2	6	55326	55331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493631
1042	NC_008526	TGTTT	2	10	55338	55347	0 %	80 %	20 %	0 %	116493631
1043	NC_008526	AAG	2	6	55368	55373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493631
1044	NC_008526	CA	3	6	55446	55451	50 %	0 %	0 %	50 %	116493631
1045	NC_008526	A	6	6	55463	55468	100 %	0 %	0 %	0 %	116493631
1046	NC_008526	TAG	2	6	55496	55501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493631
1047	NC_008526	TTTG	2	8	55511	55518	0 %	75 %	25 %	0 %	116493631
1048	NC_008526	CAA	2	6	55603	55608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_008526	GA	3	6	55683	55688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008526	GTGC	2	8	55691	55698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_008526	T	7	7	55709	55715	0 %	100 %	0 %	0 %	116493632
1052	NC_008526	CCG	2	6	55771	55776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493632
1053	NC_008526	GTC	2	6	55850	55855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1054	NC_008526	GAT	2	6	55876	55881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1055	NC_008526	GTCA	2	8	55901	55908	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
1056	NC_008526	TGA	2	6	55912	55917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1057	NC_008526	GAG	2	6	55949	55954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493632
1058	NC_008526	GAT	2	6	55964	55969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1059	NC_008526	ATC	2	6	56013	56018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493632
1060	NC_008526	GAT	2	6	56039	56044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1061	NC_008526	GCC	2	6	56108	56113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493632
1062	NC_008526	ATG	2	6	56181	56186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1063	NC_008526	GAA	2	6	56192	56197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493632
1064	NC_008526	CGATGC	2	12	56341	56352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1065	NC_008526	GCA	2	6	56367	56372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1066	NC_008526	GTTC	2	8	56373	56380	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
1067	NC_008526	CGG	2	6	56410	56415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493632
1068	NC_008526	CCA	2	6	56430	56435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493632
1069	NC_008526	GCG	2	6	56458	56463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493632
1070	NC_008526	GGC	2	6	56513	56518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493632
1071	NC_008526	AAC	2	6	56546	56551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493632
1072	NC_008526	TTG	2	6	56568	56573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493632
1073	NC_008526	CTT	2	6	56645	56650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493632
1074	NC_008526	TGC	2	6	56698	56703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1075	NC_008526	TGG	2	6	56755	56760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493632
1076	NC_008526	GCGCC	2	10	56842	56851	0 %	0 %	40 %	60 %	116493632
1077	NC_008526	TGC	2	6	56873	56878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1078	NC_008526	GTTG	2	8	56902	56909	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
1079	NC_008526	ACT	2	6	56957	56962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493632
1080	NC_008526	TGG	2	6	56967	56972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493632
1081	NC_008526	CAC	2	6	57079	57084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493632
1082	NC_008526	TCT	2	6	57102	57107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493632
1083	NC_008526	TTAA	2	8	57147	57154	50 %	50 %	0 %	0 %	116493632
1084	NC_008526	TGGC	2	8	57195	57202	0 %	25 %	50 %	25 %	116493632
1085	NC_008526	TAGC	2	8	57304	57311	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
1086	NC_008526	GCTG	2	8	57361	57368	0 %	25 %	50 %	25 %	116493632
1087	NC_008526	TTG	2	6	57488	57493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493632
1088	NC_008526	TGC	2	6	57496	57501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1089	NC_008526	CTGT	2	8	57576	57583	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
1090	NC_008526	GCC	2	6	57641	57646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493632
1091	NC_008526	AGGT	2	8	57693	57700	25 %	25 %	50 %	0 %	116493632
1092	NC_008526	TCA	2	6	57708	57713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493632
1093	NC_008526	GTT	2	6	57768	57773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493632
1094	NC_008526	AAT	2	6	57793	57798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493632
1095	NC_008526	GTT	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493632
1096	NC_008526	TTGG	2	8	57875	57882	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
1097	NC_008526	GAT	2	6	57905	57910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1098	NC_008526	TGA	2	6	57928	57933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1099	NC_008526	GAA	2	6	58040	58045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493632
1100	NC_008526	AGC	2	6	58059	58064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1101	NC_008526	CCA	2	6	58188	58193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493632
1102	NC_008526	TCGT	2	8	58219	58226	0 %	50 %	25 %	25 %	116493632
1103	NC_008526	GGC	2	6	58244	58249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493632
1104	NC_008526	GTC	2	6	58256	58261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1105	NC_008526	ATG	3	9	58365	58373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1106	NC_008526	AGC	2	6	58407	58412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1107	NC_008526	ATG	2	6	58446	58451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1108	NC_008526	AATGAA	2	12	58457	58468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116493632
1109	NC_008526	GTC	2	6	58523	58528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493632
1110	NC_008526	TG	3	6	58704	58709	0 %	50 %	50 %	0 %	116493632
1111	NC_008526	TGA	2	6	58758	58763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1112	NC_008526	CAGT	2	8	58783	58790	25 %	25 %	25 %	25 %	116493632
1113	NC_008526	T	6	6	58790	58795	0 %	100 %	0 %	0 %	116493632
1114	NC_008526	TTG	2	6	58803	58808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493632
1115	NC_008526	ATT	2	6	58838	58843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493632
1116	NC_008526	CTTT	2	8	58849	58856	0 %	75 %	0 %	25 %	116493632
1117	NC_008526	CT	3	6	58878	58883	0 %	50 %	0 %	50 %	116493632
1118	NC_008526	ATG	3	9	58956	58964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493632
1119	NC_008526	TGACGA	2	12	58995	59006	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116493632
1120	NC_008526	T	6	6	59060	59065	0 %	100 %	0 %	0 %	116493633
1121	NC_008526	GTT	3	9	59109	59117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493633
1122	NC_008526	TGC	2	6	59148	59153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493633
1123	NC_008526	AGC	2	6	59257	59262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493633
1124	NC_008526	CT	3	6	59267	59272	0 %	50 %	0 %	50 %	116493633
1125	NC_008526	CAGTT	2	10	59314	59323	20 %	40 %	20 %	20 %	116493633
1126	NC_008526	ATG	2	6	59435	59440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493633
1127	NC_008526	GAT	2	6	59584	59589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493633
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