MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008526	AGCC	2	8	24524	24531	25 %	0 %	25 %	50 %	116493596
502	NC_008526	TTG	2	6	24548	24553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493596
503	NC_008526	ATG	2	6	24796	24801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493596
504	NC_008526	AT	3	6	24844	24849	50 %	50 %	0 %	0 %	116493596
505	NC_008526	CCT	2	6	24860	24865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_008526	TG	3	6	24884	24889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_008526	GTTTT	2	10	25101	25110	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008526	ATG	2	6	25131	25136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008526	GGA	2	6	25140	25145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_008526	CGG	2	6	25172	25177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493597
511	NC_008526	TTG	2	6	25211	25216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493597
512	NC_008526	CGA	2	6	25227	25232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493597
513	NC_008526	TTAC	2	8	25297	25304	25 %	50 %	0 %	25 %	116493597
514	NC_008526	TGGT	2	8	25403	25410	0 %	50 %	50 %	0 %	116493597
515	NC_008526	AGC	3	9	25444	25452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493597
516	NC_008526	ATT	2	6	25454	25459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493597
517	NC_008526	AAT	2	6	25463	25468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493597
518	NC_008526	GTG	2	6	25478	25483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493597
519	NC_008526	GAA	2	6	25486	25491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493597
520	NC_008526	A	6	6	25512	25517	100 %	0 %	0 %	0 %	116493597
521	NC_008526	TAC	3	9	25571	25579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493597
522	NC_008526	TTC	2	6	25583	25588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493597
523	NC_008526	GCG	2	6	25658	25663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493597
524	NC_008526	ATA	2	6	25727	25732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_008526	AATT	2	8	25759	25766	50 %	50 %	0 %	0 %	116493598
526	NC_008526	GCC	2	6	25811	25816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493598
527	NC_008526	CGG	2	6	25949	25954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493598
528	NC_008526	TCCTG	2	10	26054	26063	0 %	40 %	20 %	40 %	116493598
529	NC_008526	TG	3	6	26062	26067	0 %	50 %	50 %	0 %	116493598
530	NC_008526	ATTT	2	8	26193	26200	25 %	75 %	0 %	0 %	116493598
531	NC_008526	GTC	2	6	26344	26349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493598
532	NC_008526	ATG	2	6	26373	26378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493598
533	NC_008526	ATGATA	2	12	26392	26403	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116493598
534	NC_008526	GGTT	2	8	26420	26427	0 %	50 %	50 %	0 %	116493598
535	NC_008526	CAT	2	6	26435	26440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493598
536	NC_008526	AAG	2	6	26542	26547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493598
537	NC_008526	TTA	2	6	26608	26613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493599
538	NC_008526	A	6	6	26635	26640	100 %	0 %	0 %	0 %	116493599
539	NC_008526	TGA	2	6	26690	26695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493599
540	NC_008526	ATT	2	6	26704	26709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493599
541	NC_008526	ATTG	2	8	26739	26746	25 %	50 %	25 %	0 %	116493599
542	NC_008526	ATC	2	6	26813	26818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493599
543	NC_008526	CAT	2	6	26820	26825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493599
544	NC_008526	TTGTT	2	10	26843	26852	0 %	80 %	20 %	0 %	116493599
545	NC_008526	GCT	2	6	26962	26967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493600
546	NC_008526	GAT	2	6	26988	26993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493600
547	NC_008526	GGC	2	6	27017	27022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493600
548	NC_008526	ATG	2	6	27028	27033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493600
549	NC_008526	TGG	2	6	27098	27103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493600
550	NC_008526	GGC	2	6	27135	27140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493600
551	NC_008526	TTC	2	6	27154	27159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493600
552	NC_008526	AAGGTT	2	12	27196	27207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493600
553	NC_008526	GCG	2	6	27229	27234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493600
554	NC_008526	CTT	2	6	27287	27292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493600
555	NC_008526	TGCC	2	8	27308	27315	0 %	25 %	25 %	50 %	116493600
556	NC_008526	AGT	2	6	27361	27366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493600
557	NC_008526	ATG	2	6	27382	27387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493600
558	NC_008526	CAA	2	6	27432	27437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493600
559	NC_008526	TAC	2	6	27452	27457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493600
560	NC_008526	GCC	2	6	27479	27484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493600
561	NC_008526	TGC	2	6	27555	27560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493600
562	NC_008526	CGG	2	6	27585	27590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493600
563	NC_008526	GCAA	2	8	27601	27608	50 %	0 %	25 %	25 %	116493600
564	NC_008526	AAGCC	2	10	27629	27638	40 %	0 %	20 %	40 %	116493600
565	NC_008526	CTC	2	6	27712	27717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_008526	GT	3	6	27760	27765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_008526	T	7	7	27798	27804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_008526	GAA	2	6	27872	27877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_008526	GTC	2	6	28026	28031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493601
570	NC_008526	GGT	2	6	28052	28057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493601
571	NC_008526	ACT	2	6	28085	28090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493601
572	NC_008526	T	6	6	28133	28138	0 %	100 %	0 %	0 %	116493601
573	NC_008526	ATT	2	6	28217	28222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493601
574	NC_008526	CAT	2	6	28226	28231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493601
575	NC_008526	ATTT	2	8	28256	28263	25 %	75 %	0 %	0 %	116493601
576	NC_008526	A	6	6	28292	28297	100 %	0 %	0 %	0 %	116493601
577	NC_008526	GGA	2	6	28322	28327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116493601
578	NC_008526	CG	3	6	28332	28337	0 %	0 %	50 %	50 %	116493601
579	NC_008526	TCG	2	6	28354	28359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493601
580	NC_008526	TGG	2	6	28375	28380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493601
581	NC_008526	TGC	3	9	28384	28392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493601
582	NC_008526	TTG	2	6	28405	28410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493601
583	NC_008526	AAT	2	6	28443	28448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493601
584	NC_008526	CAAAG	2	10	28473	28482	60 %	0 %	20 %	20 %	116493601
585	NC_008526	AAT	2	6	28496	28501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008526	TTCTT	2	10	28522	28531	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
587	NC_008526	ATGA	2	8	28536	28543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
588	NC_008526	AGC	2	6	28639	28644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493602
589	NC_008526	GAT	2	6	28674	28679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493602
590	NC_008526	A	6	6	28737	28742	100 %	0 %	0 %	0 %	116493602
591	NC_008526	ATG	2	6	28798	28803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493602
592	NC_008526	TTA	2	6	28813	28818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493602
593	NC_008526	TCA	2	6	28874	28879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493602
594	NC_008526	ATG	2	6	28903	28908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493602
595	NC_008526	TCC	2	6	28912	28917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116493602
596	NC_008526	GTT	2	6	28919	28924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493602
597	NC_008526	TG	3	6	28930	28935	0 %	50 %	50 %	0 %	116493602
598	NC_008526	A	6	6	29011	29016	100 %	0 %	0 %	0 %	116493602
599	NC_008526	CAA	2	6	29046	29051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493602
600	NC_008526	T	6	6	29055	29060	0 %	100 %	0 %	0 %	116493602
601	NC_008526	GT	3	6	29065	29070	0 %	50 %	50 %	0 %	116493602
602	NC_008526	GAC	2	6	29093	29098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493602
603	NC_008526	TGC	2	6	29110	29115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493602
604	NC_008526	AGCA	2	8	29145	29152	50 %	0 %	25 %	25 %	116493602
605	NC_008526	GGC	2	6	29214	29219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493602
606	NC_008526	CAT	2	6	29234	29239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493602
607	NC_008526	TGA	2	6	29252	29257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493602
608	NC_008526	CAG	2	6	29340	29345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493602
609	NC_008526	CT	3	6	29356	29361	0 %	50 %	0 %	50 %	116493602
610	NC_008526	TCG	2	6	29464	29469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493602
611	NC_008526	CG	3	6	29468	29473	0 %	0 %	50 %	50 %	116493602
612	NC_008526	GCG	2	6	29581	29586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493603
613	NC_008526	AAG	2	6	29635	29640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493603
614	NC_008526	CAA	2	6	29702	29707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493603
615	NC_008526	GTG	2	6	29764	29769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493603
616	NC_008526	TGA	2	6	29831	29836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493603
617	NC_008526	A	6	6	29854	29859	100 %	0 %	0 %	0 %	116493603
618	NC_008526	TTA	2	6	29873	29878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493603
619	NC_008526	TGG	2	6	29917	29922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493603
620	NC_008526	TCA	2	6	29947	29952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493603
621	NC_008526	GAT	2	6	29979	29984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493603
622	NC_008526	ATG	3	9	30115	30123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493603
623	NC_008526	TGT	2	6	30173	30178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493603
624	NC_008526	CTG	2	6	30179	30184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493603
625	NC_008526	CAA	2	6	30238	30243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_008526	AAGC	2	8	30302	30309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
627	NC_008526	CA	3	6	30417	30422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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629	NC_008526	A	6	6	30438	30443	100 %	0 %	0 %	0 %	116493604
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