MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008526	TGT	3	9	312704	312712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493880
6002	NC_008526	TGC	2	6	312988	312993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493880
6003	NC_008526	ATC	2	6	313017	313022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493880
6004	NC_008526	CAG	2	6	313051	313056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493880
6005	NC_008526	AGC	2	6	313067	313072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493880
6006	NC_008526	CAG	2	6	313210	313215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493880
6007	NC_008526	CGAA	2	8	313246	313253	50 %	0 %	25 %	25 %	116493880
6008	NC_008526	GGT	2	6	313283	313288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493880
6009	NC_008526	TTA	2	6	313319	313324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493880
6010	NC_008526	ATC	2	6	313350	313355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493880
6011	NC_008526	ACC	2	6	313437	313442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493880
6012	NC_008526	CAGA	2	8	313485	313492	50 %	0 %	25 %	25 %	116493880
6013	NC_008526	GCGG	2	8	313595	313602	0 %	0 %	75 %	25 %	116493880
6014	NC_008526	ACCT	2	8	313652	313659	25 %	25 %	0 %	50 %	116493881
6015	NC_008526	TTC	2	6	313859	313864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493881
6016	NC_008526	TCA	2	6	313888	313893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493881
6017	NC_008526	GTC	2	6	313904	313909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493881
6018	NC_008526	GAC	2	6	313925	313930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493881
6019	NC_008526	GGT	2	6	313963	313968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493881
6020	NC_008526	TGC	2	6	313977	313982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493881
6021	NC_008526	TAA	2	6	314041	314046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493882
6022	NC_008526	CAC	2	6	314076	314081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493882
6023	NC_008526	TCG	2	6	314083	314088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493882
6024	NC_008526	TTGCTT	2	12	314181	314192	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116493882
6025	NC_008526	GCA	2	6	314215	314220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493882
6026	NC_008526	CTG	2	6	314326	314331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493882
6027	NC_008526	TGC	2	6	314368	314373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493882
6028	NC_008526	GCC	2	6	314379	314384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493882
6029	NC_008526	T	6	6	314508	314513	0 %	100 %	0 %	0 %	116493882
6030	NC_008526	GGC	2	6	314652	314657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116493882
6031	NC_008526	TGG	2	6	314729	314734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493882
6032	NC_008526	GTT	2	6	314844	314849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493882
6033	NC_008526	AGT	2	6	314929	314934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493882
6034	NC_008526	T	6	6	315051	315056	0 %	100 %	0 %	0 %	116493882
6035	NC_008526	TGT	2	6	315074	315079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493882
6036	NC_008526	TTGAA	2	10	315087	315096	40 %	40 %	20 %	0 %	116493882
6037	NC_008526	ACC	2	6	315102	315107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493882
6038	NC_008526	GTT	2	6	315122	315127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493882
6039	NC_008526	TCA	2	6	315199	315204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493882
6040	NC_008526	ATC	2	6	315339	315344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493882
6041	NC_008526	GCA	2	6	315403	315408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493882
6042	NC_008526	CCAGC	2	10	315461	315470	20 %	0 %	20 %	60 %	116493882
6043	NC_008526	T	6	6	315487	315492	0 %	100 %	0 %	0 %	116493882
6044	NC_008526	CCAT	2	8	315568	315575	25 %	25 %	0 %	50 %	116493882
6045	NC_008526	CTT	2	6	315723	315728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493882
6046	NC_008526	GC	3	6	315789	315794	0 %	0 %	50 %	50 %	116493882
6047	NC_008526	CGC	2	6	315987	315992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493882
6048	NC_008526	AAT	2	6	316005	316010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493882
6049	NC_008526	TTC	2	6	316024	316029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493882
6050	NC_008526	GAA	2	6	316096	316101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_008526	TGG	2	6	316103	316108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_008526	GCAA	2	8	316160	316167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6053	NC_008526	GTGA	2	8	316198	316205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_008526	TCA	2	6	316228	316233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493883
6055	NC_008526	TTC	2	6	316245	316250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493883
6056	NC_008526	ATT	2	6	316260	316265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493883
6057	NC_008526	TTG	2	6	316276	316281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493883
6058	NC_008526	TTG	2	6	316338	316343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493883
6059	NC_008526	CAC	2	6	316358	316363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493883
6060	NC_008526	TGT	2	6	316378	316383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493883
6061	NC_008526	GCC	2	6	316500	316505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116493883
6062	NC_008526	AGT	2	6	316508	316513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493883
6063	NC_008526	GCAG	2	8	316514	316521	25 %	0 %	50 %	25 %	116493883
6064	NC_008526	GGCC	2	8	316637	316644	0 %	0 %	50 %	50 %	116493883
6065	NC_008526	GT	3	6	316719	316724	0 %	50 %	50 %	0 %	116493883
6066	NC_008526	AC	3	6	316755	316760	50 %	0 %	0 %	50 %	116493883
6067	NC_008526	CTTC	2	8	316796	316803	0 %	50 %	0 %	50 %	116493883
6068	NC_008526	ATTG	2	8	316805	316812	25 %	50 %	25 %	0 %	116493883
6069	NC_008526	GTT	3	9	316823	316831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116493883
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6073	NC_008526	T	7	7	317018	317024	0 %	100 %	0 %	0 %	116493883
6074	NC_008526	GCT	2	6	317027	317032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493883
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6076	NC_008526	TGC	2	6	317221	317226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493883
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6078	NC_008526	CACTT	2	10	317363	317372	20 %	40 %	0 %	40 %	116493883
6079	NC_008526	CAC	2	6	317453	317458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116493883
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6085	NC_008526	TCG	2	6	317798	317803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493884
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6087	NC_008526	ATG	2	6	318012	318017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116493885
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6089	NC_008526	AGC	2	6	318307	318312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493885
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6091	NC_008526	ATT	2	6	318426	318431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116493885
6092	NC_008526	AGC	2	6	318539	318544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116493885
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6094	NC_008526	GAA	2	6	318726	318731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493886
6095	NC_008526	AGC	2	6	318877	318882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_008526	T	6	6	318897	318902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_008526	TG	4	8	318962	318969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_008526	GCA	2	6	318984	318989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6100	NC_008526	TTA	2	6	319032	319037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_008526	AAAT	2	8	319050	319057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_008526	TTGA	2	8	319063	319070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_008526	ACC	2	6	319105	319110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_008526	A	6	6	319122	319127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_008526	AG	3	6	319174	319179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_008526	CGC	2	6	319261	319266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6107	NC_008526	CA	3	6	319482	319487	50 %	0 %	0 %	50 %	116493887
6108	NC_008526	AGCCA	2	10	319527	319536	40 %	0 %	20 %	40 %	116493887
6109	NC_008526	AGA	2	6	319565	319570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116493887
6110	NC_008526	GGT	2	6	319682	319687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493887
6111	NC_008526	GCT	2	6	319700	319705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116493887
6112	NC_008526	TGG	2	6	319803	319808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116493887
6113	NC_008526	CTA	2	6	319966	319971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493887
6114	NC_008526	CAA	2	6	320018	320023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116493887
6115	NC_008526	TAT	2	6	320117	320122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_008526	T	6	6	320157	320162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_008526	TAA	2	6	320181	320186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_008526	ATA	2	6	320187	320192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_008526	TCC	2	6	320209	320214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_008526	TAT	2	6	320250	320255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_008526	A	6	6	320301	320306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6122	NC_008526	TGG	3	9	320392	320400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_008526	TCT	2	6	320419	320424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_008526	AAC	2	6	320434	320439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_008526	ATG	2	6	320445	320450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6127	NC_008526	CAA	2	6	320522	320527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6140	NC_008526	CTG	2	6	321482	321487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6156	NC_008526	GTC	2	6	322467	322472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6497	NC_008526	TCA	2	6	342385	342390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116493908
6498	NC_008526	AAT	2	6	342408	342413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116493908
6499	NC_008526	TTC	2	6	342453	342458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116493908
6500	NC_008526	ATTG	2	8	342495	342502	25 %	50 %	25 %	0 %	116493908

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