MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus casei ATCC 334 chromosome

Total Repeats: 55434

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_008526	GCA	2	6	2872848	2872853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496306
55003	NC_008526	ACA	2	6	2872876	2872881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496306
55004	NC_008526	CCG	3	9	2872950	2872958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496306
55005	NC_008526	ATG	2	6	2872995	2873000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496306
55006	NC_008526	TGT	2	6	2873105	2873110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496306
55007	NC_008526	GTT	2	6	2873216	2873221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496306
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55009	NC_008526	T	7	7	2873396	2873402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55010	NC_008526	CAG	2	6	2873415	2873420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55011	NC_008526	ATA	3	9	2873465	2873473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55012	NC_008526	AATTT	2	10	2873495	2873504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55013	NC_008526	AAT	2	6	2873649	2873654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55014	NC_008526	ACA	2	6	2873658	2873663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55015	NC_008526	CTG	2	6	2873673	2873678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55016	NC_008526	TC	3	6	2873688	2873693	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55017	NC_008526	GGT	2	6	2873720	2873725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496307
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55021	NC_008526	GATTCA	2	12	2873897	2873908	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116496307
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55025	NC_008526	A	7	7	2874213	2874219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55026	NC_008526	TTA	2	6	2874220	2874225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55027	NC_008526	TA	3	6	2874231	2874236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55029	NC_008526	CAA	2	6	2874318	2874323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55030	NC_008526	ATTTT	2	10	2874338	2874347	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55039	NC_008526	T	7	7	2874800	2874806	0 %	100 %	0 %	0 %	116496309
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55044	NC_008526	A	6	6	2874920	2874925	100 %	0 %	0 %	0 %	116496309
55045	NC_008526	TGA	2	6	2875035	2875040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496309
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55053	NC_008526	TTA	2	6	2875457	2875462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116496309
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55109	NC_008526	T	6	6	2877733	2877738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55110	NC_008526	TACTGC	2	12	2877748	2877759	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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55118	NC_008526	CAA	3	9	2878180	2878188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496312
55119	NC_008526	ATG	2	6	2878233	2878238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496312
55120	NC_008526	CAT	2	6	2878297	2878302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496312
55121	NC_008526	T	6	6	2878306	2878311	0 %	100 %	0 %	0 %	116496312
55122	NC_008526	CATT	2	8	2878366	2878373	25 %	50 %	0 %	25 %	116496312
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55126	NC_008526	GAT	2	6	2878729	2878734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496312
55127	NC_008526	CAA	3	9	2878768	2878776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496312
55128	NC_008526	CGT	2	6	2878784	2878789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496312
55129	NC_008526	CG	3	6	2878816	2878821	0 %	0 %	50 %	50 %	116496312
55130	NC_008526	ACG	2	6	2878830	2878835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116496312
55131	NC_008526	CAT	2	6	2878873	2878878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496312
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55134	NC_008526	ATC	2	6	2878955	2878960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496312
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55136	NC_008526	CAT	2	6	2879053	2879058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496312
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55141	NC_008526	CAT	2	6	2879161	2879166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496312
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55146	NC_008526	TGT	2	6	2879280	2879285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496312
55147	NC_008526	CAT	2	6	2879341	2879346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496312
55148	NC_008526	CAA	3	9	2879350	2879358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496312
55149	NC_008526	ATAA	2	8	2879453	2879460	75 %	25 %	0 %	0 %	116496312
55150	NC_008526	TCA	2	6	2879466	2879471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116496312
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55152	NC_008526	TTGATA	2	12	2879600	2879611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116496312
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55169	NC_008526	A	6	6	2880403	2880408	100 %	0 %	0 %	0 %	116496312
55170	NC_008526	ACA	2	6	2880489	2880494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496312
55171	NC_008526	GCC	2	6	2880602	2880607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116496312
55172	NC_008526	AGTTC	2	10	2880610	2880619	20 %	40 %	20 %	20 %	116496312
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55175	NC_008526	GAT	2	6	2881103	2881108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55180	NC_008526	TGT	2	6	2881614	2881619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496313
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55207	NC_008526	TCC	2	6	2883155	2883160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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55211	NC_008526	A	7	7	2883280	2883286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55212	NC_008526	AAT	2	6	2883315	2883320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55215	NC_008526	T	6	6	2883471	2883476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55219	NC_008526	GTTT	2	8	2883637	2883644	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55220	NC_008526	TGT	2	6	2883671	2883676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55221	NC_008526	TGAG	2	8	2883837	2883844	25 %	25 %	50 %	0 %	116496314
55222	NC_008526	A	6	6	2883912	2883917	100 %	0 %	0 %	0 %	116496314
55223	NC_008526	TGC	2	6	2883922	2883927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496314
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55228	NC_008526	TGC	2	6	2884159	2884164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496314
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55230	NC_008526	A	6	6	2884211	2884216	100 %	0 %	0 %	0 %	116496314
55231	NC_008526	TTG	2	6	2884275	2884280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496314
55232	NC_008526	GCCG	2	8	2884442	2884449	0 %	0 %	50 %	50 %	116496314
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55352	NC_008526	CAA	2	6	2890381	2890386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116496320
55353	NC_008526	GGT	2	6	2890390	2890395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496320
55354	NC_008526	T	6	6	2890441	2890446	0 %	100 %	0 %	0 %	116496320
55355	NC_008526	TG	3	6	2890529	2890534	0 %	50 %	50 %	0 %	116496320
55356	NC_008526	CACG	2	8	2890626	2890633	25 %	0 %	25 %	50 %	116496320
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55371	NC_008526	A	7	7	2891824	2891830	100 %	0 %	0 %	0 %	116496321
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55380	NC_008526	GTG	2	6	2892354	2892359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496322
55381	NC_008526	TGG	2	6	2892415	2892420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116496322
55382	NC_008526	T	6	6	2892482	2892487	0 %	100 %	0 %	0 %	116496322
55383	NC_008526	TCG	2	6	2892513	2892518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116496322
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55387	NC_008526	GTT	2	6	2892726	2892731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116496323
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55389	NC_008526	CGCT	2	8	2892760	2892767	0 %	25 %	25 %	50 %	116496323
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55400	NC_008526	TTGA	2	8	2893313	2893320	25 %	50 %	25 %	0 %	116496323
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55402	NC_008526	AAT	2	6	2893369	2893374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496323
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55405	NC_008526	TTTGA	2	10	2893546	2893555	20 %	60 %	20 %	0 %	116496323
55406	NC_008526	CT	3	6	2893576	2893581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55407	NC_008526	T	6	6	2893581	2893586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55408	NC_008526	GCCA	2	8	2893741	2893748	25 %	0 %	25 %	50 %	116496324
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55410	NC_008526	GCCA	2	8	2893780	2893787	25 %	0 %	25 %	50 %	116496324
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55414	NC_008526	T	6	6	2894041	2894046	0 %	100 %	0 %	0 %	116496324
55415	NC_008526	ATG	2	6	2894067	2894072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116496324
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55419	NC_008526	GTTT	2	8	2894353	2894360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55420	NC_008526	A	8	8	2894368	2894375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55421	NC_008526	ATA	2	6	2894404	2894409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116496325
55422	NC_008526	TTGG	2	8	2894509	2894516	0 %	50 %	50 %	0 %	116496325
55423	NC_008526	GAC	2	6	2894538	2894543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55424	NC_008526	CCT	2	6	2894545	2894550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55425	NC_008526	TTA	2	6	2894568	2894573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55426	NC_008526	CAT	2	6	2894594	2894599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55427	NC_008526	T	6	6	2894634	2894639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55428	NC_008526	ATG	3	9	2894659	2894667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55429	NC_008526	GAA	2	6	2894780	2894785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55431	NC_008526	T	6	6	2894952	2894957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55432	NC_008526	GCT	2	6	2895076	2895081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55433	NC_008526	CAG	2	6	2895141	2895146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55434	NC_008526	TGA	2	6	2895195	2895200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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