MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis JB197 chromosome chromosome 2

Total Repeats: 5930

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008511	TTG	2	6	48268	48273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332487
1002	NC_008511	A	7	7	48291	48297	100 %	0 %	0 %	0 %	116332487
1003	NC_008511	TTC	2	6	48304	48309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332487
1004	NC_008511	AAAG	2	8	48317	48324	75 %	0 %	25 %	0 %	116332487
1005	NC_008511	TTC	2	6	48382	48387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332487
1006	NC_008511	GCG	2	6	48480	48485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332487
1007	NC_008511	CTC	2	6	48496	48501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332487
1008	NC_008511	GCTC	2	8	48627	48634	0 %	25 %	25 %	50 %	116332487
1009	NC_008511	TCA	2	6	48649	48654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332487
1010	NC_008511	AGA	2	6	48752	48757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332487
1011	NC_008511	T	6	6	48819	48824	0 %	100 %	0 %	0 %	116332487
1012	NC_008511	GAA	2	6	48840	48845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332487
1013	NC_008511	TCGA	2	8	48864	48871	25 %	25 %	25 %	25 %	116332487
1014	NC_008511	CTC	3	9	48898	48906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332487
1015	NC_008511	T	7	7	48986	48992	0 %	100 %	0 %	0 %	116332487
1016	NC_008511	TA	3	6	49069	49074	50 %	50 %	0 %	0 %	116332488
1017	NC_008511	TAAAA	2	10	49102	49111	80 %	20 %	0 %	0 %	116332488
1018	NC_008511	A	7	7	49108	49114	100 %	0 %	0 %	0 %	116332488
1019	NC_008511	GA	3	6	49139	49144	50 %	0 %	50 %	0 %	116332488
1020	NC_008511	A	7	7	49251	49257	100 %	0 %	0 %	0 %	116332488
1021	NC_008511	GGA	2	6	49258	49263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332488
1022	NC_008511	GCAA	2	8	49315	49322	50 %	0 %	25 %	25 %	116332488
1023	NC_008511	TCC	2	6	49330	49335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332488
1024	NC_008511	AAG	2	6	49356	49361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332488
1025	NC_008511	GAT	2	6	49405	49410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116332488
1026	NC_008511	GACG	2	8	49600	49607	25 %	0 %	50 %	25 %	116332488
1027	NC_008511	CGATCC	2	12	49621	49632	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116332488
1028	NC_008511	GGC	2	6	49663	49668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332488
1029	NC_008511	ACG	2	6	49701	49706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332488
1030	NC_008511	CCG	2	6	49859	49864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332488
1031	NC_008511	TTCT	2	8	49890	49897	0 %	75 %	0 %	25 %	116332488
1032	NC_008511	T	8	8	49974	49981	0 %	100 %	0 %	0 %	116332488
1033	NC_008511	GGA	2	6	50134	50139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332489
1034	NC_008511	TAC	2	6	50164	50169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332489
1035	NC_008511	GGA	2	6	50229	50234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332489
1036	NC_008511	GTG	2	6	50255	50260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116332489
1037	NC_008511	CGG	2	6	50261	50266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332489
1038	NC_008511	CTT	2	6	50330	50335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332489
1039	NC_008511	GGC	2	6	50406	50411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332489
1040	NC_008511	GAA	2	6	50413	50418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332489
1041	NC_008511	TCA	2	6	50420	50425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332489
1042	NC_008511	TGAAGC	2	12	50432	50443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116332489
1043	NC_008511	A	6	6	50463	50468	100 %	0 %	0 %	0 %	116332489
1044	NC_008511	GCC	2	6	50490	50495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332489
1045	NC_008511	TAA	2	6	50532	50537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332489
1046	NC_008511	GTC	2	6	50642	50647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332489
1047	NC_008511	AG	3	6	50728	50733	50 %	0 %	50 %	0 %	116332489
1048	NC_008511	T	6	6	50735	50740	0 %	100 %	0 %	0 %	116332489
1049	NC_008511	T	6	6	50765	50770	0 %	100 %	0 %	0 %	116332490
1050	NC_008511	GCG	2	6	50790	50795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332490
1051	NC_008511	GAA	2	6	50796	50801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332490
1052	NC_008511	ATGGAC	2	12	50865	50876	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116332490
1053	NC_008511	ATC	2	6	50958	50963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332490
1054	NC_008511	AGGAG	2	10	51120	51129	40 %	0 %	60 %	0 %	116332490
1055	NC_008511	T	6	6	51134	51139	0 %	100 %	0 %	0 %	116332490
1056	NC_008511	TTTC	2	8	51146	51153	0 %	75 %	0 %	25 %	116332490
1057	NC_008511	GAA	2	6	51159	51164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332490
1058	NC_008511	A	6	6	51213	51218	100 %	0 %	0 %	0 %	116332490
1059	NC_008511	ATC	2	6	51240	51245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332490
1060	NC_008511	TAT	2	6	51261	51266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332490
1061	NC_008511	ACGT	2	8	51271	51278	25 %	25 %	25 %	25 %	116332490
1062	NC_008511	CGATT	2	10	51305	51314	20 %	40 %	20 %	20 %	116332490
1063	NC_008511	TA	3	6	51409	51414	50 %	50 %	0 %	0 %	116332490
1064	NC_008511	TGC	2	6	51716	51721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332490
1065	NC_008511	AGA	2	6	51728	51733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332490
1066	NC_008511	CGG	2	6	51803	51808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116332490
1067	NC_008511	T	6	6	52035	52040	0 %	100 %	0 %	0 %	116332490
1068	NC_008511	T	6	6	52106	52111	0 %	100 %	0 %	0 %	116332490
1069	NC_008511	GTT	2	6	52279	52284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332490
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1071	NC_008511	GAA	2	6	52395	52400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332491
1072	NC_008511	ATT	2	6	52430	52435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332491
1073	NC_008511	A	6	6	52436	52441	100 %	0 %	0 %	0 %	116332491
1074	NC_008511	A	8	8	52513	52520	100 %	0 %	0 %	0 %	116332491
1075	NC_008511	AGG	2	6	52543	52548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332491
1076	NC_008511	A	6	6	52584	52589	100 %	0 %	0 %	0 %	116332491
1077	NC_008511	CGGAAT	2	12	52612	52623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116332491
1078	NC_008511	AT	3	6	52645	52650	50 %	50 %	0 %	0 %	116332491
1079	NC_008511	A	7	7	52687	52693	100 %	0 %	0 %	0 %	116332491
1080	NC_008511	ATC	2	6	52721	52726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332491
1081	NC_008511	A	6	6	52799	52804	100 %	0 %	0 %	0 %	116332491
1082	NC_008511	TTC	2	6	52858	52863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332491
1083	NC_008511	T	6	6	52969	52974	0 %	100 %	0 %	0 %	116332491
1084	NC_008511	CAA	2	6	53008	53013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116332491
1085	NC_008511	CTC	2	6	53019	53024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332491
1086	NC_008511	TCCGT	2	10	53137	53146	0 %	40 %	20 %	40 %	116332491
1087	NC_008511	TCAA	2	8	53193	53200	50 %	25 %	0 %	25 %	116332491
1088	NC_008511	CGA	2	6	53239	53244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332491
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1090	NC_008511	A	8	8	53377	53384	100 %	0 %	0 %	0 %	116332491
1091	NC_008511	GAG	2	6	53402	53407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332491
1092	NC_008511	GAG	2	6	53420	53425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332491
1093	NC_008511	AGAA	2	8	53432	53439	75 %	0 %	25 %	0 %	116332491
1094	NC_008511	CGA	2	6	53482	53487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332491
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1096	NC_008511	TCGT	2	8	53544	53551	0 %	50 %	25 %	25 %	116332491
1097	NC_008511	ATT	2	6	53559	53564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116332491
1098	NC_008511	GAA	2	6	53581	53586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332491
1099	NC_008511	TCC	2	6	53618	53623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116332491
1100	NC_008511	TA	3	6	53625	53630	50 %	50 %	0 %	0 %	116332491
1101	NC_008511	TTC	3	9	53782	53790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332491
1102	NC_008511	T	6	6	53837	53842	0 %	100 %	0 %	0 %	116332491
1103	NC_008511	GGAC	2	8	53860	53867	25 %	0 %	50 %	25 %	116332491
1104	NC_008511	GTT	2	6	53912	53917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116332491
1105	NC_008511	CTT	2	6	53918	53923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332491
1106	NC_008511	TGAG	2	8	53943	53950	25 %	25 %	50 %	0 %	116332491
1107	NC_008511	GAA	2	6	53989	53994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332491
1108	NC_008511	CGTTC	2	10	54017	54026	0 %	40 %	20 %	40 %	116332491
1109	NC_008511	GAA	2	6	54031	54036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332491
1110	NC_008511	CTT	2	6	54098	54103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332491
1111	NC_008511	TCT	2	6	54104	54109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332491
1112	NC_008511	A	6	6	54186	54191	100 %	0 %	0 %	0 %	116332491
1113	NC_008511	A	6	6	54197	54202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_008511	TTCTTT	2	12	54279	54290	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116332492
1115	NC_008511	GGA	2	6	54343	54348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116332492
1116	NC_008511	CGC	2	6	54373	54378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116332492
1117	NC_008511	AGA	2	6	54491	54496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116332492
1118	NC_008511	AT	3	6	54628	54633	50 %	50 %	0 %	0 %	116332492
1119	NC_008511	TA	3	6	54663	54668	50 %	50 %	0 %	0 %	116332492
1120	NC_008511	T	7	7	54745	54751	0 %	100 %	0 %	0 %	116332492
1121	NC_008511	ATA	2	6	54780	54785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116332493
1122	NC_008511	ATC	2	6	54826	54831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116332493
1123	NC_008511	A	6	6	54865	54870	100 %	0 %	0 %	0 %	116332493
1124	NC_008511	TCG	2	6	55015	55020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116332493
1125	NC_008511	CTT	2	6	55048	55053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116332493
1126	NC_008511	TC	3	6	55111	55116	0 %	50 %	0 %	50 %	116332493
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1128	NC_008511	GAC	2	6	55158	55163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116332493
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