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Hexa-nucleotide Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 1527

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008508	TCCGAC	2	12	281	292	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116326853
2	NC_008508	AATTAG	2	12	9603	9614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116326860
3	NC_008508	AAGTAA	2	12	14428	14439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116326862
4	NC_008508	CGGAAC	2	12	15821	15832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326863
5	NC_008508	TTGGGA	2	12	15876	15887	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116326863
6	NC_008508	AAAGAG	2	12	16943	16954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326864
7	NC_008508	CGGAAT	2	12	17519	17530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116326864
8	NC_008508	CTTTTG	2	12	19889	19900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116326866
9	NC_008508	GAATAT	2	12	19990	20001	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116326867
10	NC_008508	GATTCC	2	12	22538	22549	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116326869
11	NC_008508	TCAAAA	2	12	23014	23025	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116326869
12	NC_008508	TCTTCC	2	12	24695	24706	0 %	50 %	0 %	50 %	116326870
13	NC_008508	CATTTT	2	12	35463	35474	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116326876
14	NC_008508	TCCACT	2	12	36885	36896	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116326877
15	NC_008508	AATTAA	2	12	37967	37978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326877
16	NC_008508	AAATCA	2	12	38090	38101	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008508	AAATCA	2	12	45537	45548	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116326885
18	NC_008508	GAGAAA	2	12	48248	48259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326887
19	NC_008508	AATTCC	2	12	48899	48910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326888
20	NC_008508	TCGACT	2	12	53543	53554	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008508	GATATA	2	12	55498	55509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116326892
22	NC_008508	GAAAAA	2	12	55642	55653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116326892
23	NC_008508	TGAAAT	2	12	56373	56384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116326892
24	NC_008508	GAAAAT	2	12	60785	60796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008508	TCAAAT	2	12	63111	63122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008508	AATATT	2	12	64099	64110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008508	TCGGAT	2	12	65711	65722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116326897
28	NC_008508	CACGAA	2	12	74594	74605	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116326907
29	NC_008508	CGGAAA	2	12	74644	74655	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116326907
30	NC_008508	TTCCGG	2	12	77060	77071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326909
31	NC_008508	CGATTC	2	12	82030	82041	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008508	TTCCTC	2	12	83248	83259	0 %	50 %	0 %	50 %	116326912
33	NC_008508	AAACCC	2	12	85691	85702	50 %	0 %	0 %	50 %	116326913
34	NC_008508	TTTAAA	2	12	86072	86083	50 %	50 %	0 %	0 %	116326913
35	NC_008508	CTTTCT	2	12	87194	87205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326913
36	NC_008508	GGTTCC	2	12	90354	90365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008508	GTCGAT	2	12	92831	92842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116326917
38	NC_008508	AAAAGT	2	12	94291	94302	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008508	GAAAGA	2	12	100264	100275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326922
40	NC_008508	AAGCCA	2	12	101955	101966	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116326926
41	NC_008508	ACCGGA	2	12	104343	104354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326929
42	NC_008508	ATTTTG	2	12	105276	105287	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	116326930
43	NC_008508	CGTAGT	2	12	108582	108593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008508	GGATTT	2	12	112291	112302	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116326934
45	NC_008508	TATGAA	2	12	112450	112461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116326934
46	NC_008508	ATAAGA	2	12	113657	113668	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008508	AAAGTA	2	12	113826	113837	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008508	CGATCA	2	12	117997	118008	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116326938
49	NC_008508	AATACT	2	12	118316	118327	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116326938
50	NC_008508	AAATAG	2	12	121137	121148	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116326942
51	NC_008508	ATTTAG	2	12	122043	122054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008508	CCAAAA	2	12	128425	128436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326947
53	NC_008508	ATAAAA	2	12	128680	128691	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116326947
54	NC_008508	AAATTT	2	12	131968	131979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008508	AAAAGC	2	12	134369	134380	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116326951
56	NC_008508	TAAAAG	2	12	134545	134556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	116326951
57	NC_008508	CAAAAT	2	12	140518	140529	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116326955
58	NC_008508	TTTAAA	2	12	144589	144600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008508	CGGTTT	2	12	146598	146609	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116326959
60	NC_008508	ATTTTC	2	12	148660	148671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008508	TCGGAA	2	12	150242	150253	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116326962
62	NC_008508	TTTGGA	2	12	150378	150389	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116326963
63	NC_008508	TTTCCT	2	12	156508	156519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326969
64	NC_008508	TCAAAG	2	12	157764	157775	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116326970
65	NC_008508	GGAAAT	2	12	158799	158810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008508	TCTTTG	2	12	159222	159233	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008508	TTTCAG	2	12	162010	162021	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116326972
68	NC_008508	GACAAA	2	12	163917	163928	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008508	CTTGAA	2	12	166675	166686	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116326975
70	NC_008508	AAAATC	2	12	167000	167011	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116326976
71	NC_008508	GCGGCT	2	12	171298	171309	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008508	CTTGAA	2	12	175160	175171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116326979
73	NC_008508	TTGGAT	2	12	181518	181529	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116326983
74	NC_008508	CCTTTG	2	12	184603	184614	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116326986
75	NC_008508	ATTTTC	2	12	190080	190091	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116326991
76	NC_008508	ACAGTA	2	12	192025	192036	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116326992
77	NC_008508	ACGCAA	2	12	193973	193984	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116326993
78	NC_008508	AACAAA	2	12	196357	196368	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008508	CGGAAT	2	12	198297	198308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116326997
80	NC_008508	TCGATT	2	12	198481	198492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116326997
81	NC_008508	ATCCAT	2	12	198612	198623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326997
82	NC_008508	TTTTTA	2	12	199586	199597	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116326998
83	NC_008508	GAATAT	2	12	199954	199965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	116326999
84	NC_008508	CTTCCC	2	12	202626	202637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116327001
85	NC_008508	TTCTCC	2	12	206417	206428	0 %	50 %	0 %	50 %	116327004
86	NC_008508	ATTCGG	2	12	208206	208217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116327006
87	NC_008508	TAATTT	2	12	210857	210868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008508	GAATCC	2	12	210894	210905	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008508	TGGACG	2	12	215517	215528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_008508	ATTCCG	2	12	218413	218424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116327015
91	NC_008508	TTTAAA	2	12	219344	219355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008508	TGTTGA	2	12	220190	220201	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116327017
93	NC_008508	ATTTTT	2	12	220296	220307	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	116327017
94	NC_008508	AAGAAA	2	12	224281	224292	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008508	TTTTCG	2	12	233122	233133	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116327025
96	NC_008508	TTAAAA	2	12	237216	237227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116327027
97	NC_008508	GGTAGT	2	12	240159	240170	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116327028
98	NC_008508	GAAAAA	2	12	243437	243448	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116327031
99	NC_008508	AAACAT	2	12	246084	246095	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116327034
100	NC_008508	CGAAAA	2	12	246991	247002	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116327034
101	NC_008508	TTTTTC	2	12	247121	247132	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	116327034
102	NC_008508	ACAAGA	2	12	249598	249609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116327036
103	NC_008508	GAATCG	2	12	250982	250993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116327037
104	NC_008508	TTAAAA	2	12	252725	252736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008508	CGAAGT	2	12	255780	255791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116327040
106	NC_008508	TCTTTC	2	12	257695	257706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327041
107	NC_008508	TTTCGG	2	12	259658	259669	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116327043
108	NC_008508	GGGAAA	2	12	260906	260917	50 %	0 %	50 %	0 %	116327044
109	NC_008508	AAAGAA	2	12	261304	261315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116327044
110	NC_008508	AACTAT	2	12	268650	268661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	116327052
111	NC_008508	GATAAG	2	12	269488	269499	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	116327052
112	NC_008508	GATTCA	2	12	272628	272639	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008508	GACGGC	2	12	272825	272836	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116327054
114	NC_008508	TAATAG	2	12	273513	273524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008508	GTTTCC	2	12	276711	276722	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116327057
116	NC_008508	TGGAAG	2	12	278269	278280	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	116327058
117	NC_008508	AAAATC	2	12	278565	278576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	116327058
118	NC_008508	TAAAAA	2	12	282882	282893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116327062
119	NC_008508	AATTGT	2	12	291699	291710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116327069
120	NC_008508	ATTCTA	2	12	293153	293164	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	116327070
121	NC_008508	CTTGGA	2	12	293621	293632	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116327071
122	NC_008508	GAATAG	2	12	301953	301964	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008508	GTTTCG	2	12	305150	305161	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116327081
124	NC_008508	TCGATT	2	12	310734	310745	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116327086
125	NC_008508	CGGTTT	2	12	312143	312154	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116327088
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130	NC_008508	TTTTTA	2	12	329593	329604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008508	ATTTTT	2	12	330374	330385	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008508	GATTTC	2	12	334601	334612	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116327107
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151	NC_008508	AAAATA	2	12	384897	384908	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008508	ATTTTT	2	12	385930	385941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008508	GAAAAT	2	12	387381	387392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_008508	GTATCA	2	12	389265	389276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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173	NC_008508	GCCATT	2	12	429593	429604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116327188
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180	NC_008508	GATTCC	2	12	451818	451829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116327200
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222	NC_008508	TGTTCT	2	12	559142	559153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116327316
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229	NC_008508	ATTCGA	2	12	576840	576851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116327329
230	NC_008508	CCGTAA	2	12	578585	578596	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116327331
231	NC_008508	TGAACC	2	12	579833	579844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116327333
232	NC_008508	TTCTTT	2	12	585309	585320	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
233	NC_008508	CAGAAT	2	12	587416	587427	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	116327338
234	NC_008508	TCCAAT	2	12	588621	588632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116327339
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236	NC_008508	CGATAT	2	12	589680	589691	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116327340
237	NC_008508	TGCGGA	2	12	591385	591396	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116327341
238	NC_008508	TGAATC	2	12	592552	592563	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
239	NC_008508	GAATCG	2	12	596050	596061	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116327346
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241	NC_008508	GAAAAG	2	12	614221	614232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
242	NC_008508	ACGATT	2	12	614679	614690	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116327359
243	NC_008508	ATCCTG	2	12	619759	619770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116327363
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248	NC_008508	TCTCCC	2	12	633074	633085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116327373
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266	NC_008508	TCGATT	2	12	674130	674141	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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271	NC_008508	GAAGAG	2	12	685192	685203	50 %	0 %	50 %	0 %	116327402
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342	NC_008508	CTGGAA	2	12	849640	849651	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116327521
343	NC_008508	ATTCAA	2	12	849885	849896	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
344	NC_008508	CGTTTT	2	12	850417	850428	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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347	NC_008508	TTCGGG	2	12	861306	861317	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116327530
348	NC_008508	GCATTT	2	12	864413	864424	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116327533
349	NC_008508	GGGATC	2	12	871502	871513	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116327537
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351	NC_008508	GCATCT	2	12	872406	872417	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116327538
352	NC_008508	CGACTC	2	12	872421	872432	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116327538
353	NC_008508	CCTTTC	2	12	876050	876061	0 %	50 %	0 %	50 %	116327540
354	NC_008508	GTAATT	2	12	881606	881617	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_008508	CGAAGT	2	12	1108643	1108654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116327708
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464	NC_008508	ATATAA	2	12	1129070	1129081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_008508	TCCGGT	2	12	1138230	1138241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116327722
466	NC_008508	ACCGGA	2	12	1142332	1142343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116327725
467	NC_008508	ATTTGA	2	12	1144189	1144200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116327728
468	NC_008508	GTTTTT	2	12	1144676	1144687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	116327729
469	NC_008508	GTTCTG	2	12	1146191	1146202	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116327729
470	NC_008508	CGGAAA	2	12	1146980	1146991	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116327730
471	NC_008508	AATCGG	2	12	1148808	1148819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
472	NC_008508	TTACGG	2	12	1152132	1152143	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116327733
473	NC_008508	ATTCGA	2	12	1156580	1156591	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
474	NC_008508	CGAACC	2	12	1160652	1160663	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116327738
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478	NC_008508	GGGGAT	2	12	1168893	1168904	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116327744
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488	NC_008508	AATTGC	2	12	1196647	1196658	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116327766
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490	NC_008508	AGCTTT	2	12	1198877	1198888	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
491	NC_008508	GAAAAA	2	12	1202102	1202113	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116327772
492	NC_008508	GGAATT	2	12	1202602	1202613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116327772
493	NC_008508	CACGAT	2	12	1203307	1203318	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116327772
494	NC_008508	TGGTGC	2	12	1204037	1204048	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	116327773
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496	NC_008508	ATGGAA	2	12	1211670	1211681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
497	NC_008508	AATAAA	2	12	1212555	1212566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	116327778
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499	NC_008508	GGAGCG	2	12	1214060	1214071	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	116327779
500	NC_008508	ATTTTC	2	12	1216976	1216987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	116327782

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