MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 72610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008508	TTCTT	2	10	122111	122120	0 %	80 %	0 %	20 %	116326943
2502	NC_008508	GAT	2	6	122199	122204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326943
2503	NC_008508	TCA	2	6	122378	122383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326943
2504	NC_008508	GATA	2	8	122391	122398	50 %	25 %	25 %	0 %	116326943
2505	NC_008508	TCT	2	6	122463	122468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326944
2506	NC_008508	AATCC	2	10	122473	122482	40 %	20 %	0 %	40 %	116326944
2507	NC_008508	TTA	2	6	122604	122609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326944
2508	NC_008508	TTC	2	6	122660	122665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326944
2509	NC_008508	T	6	6	122672	122677	0 %	100 %	0 %	0 %	116326944
2510	NC_008508	TTC	2	6	122684	122689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326944
2511	NC_008508	T	6	6	122691	122696	0 %	100 %	0 %	0 %	116326944
2512	NC_008508	TGT	2	6	122761	122766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326944
2513	NC_008508	TTC	2	6	122814	122819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326944
2514	NC_008508	TTC	2	6	122831	122836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326944
2515	NC_008508	TTC	2	6	122867	122872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326944
2516	NC_008508	A	6	6	122906	122911	100 %	0 %	0 %	0 %	116326944
2517	NC_008508	GTT	2	6	122941	122946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326944
2518	NC_008508	CGC	2	6	123044	123049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326944
2519	NC_008508	T	6	6	123123	123128	0 %	100 %	0 %	0 %	116326944
2520	NC_008508	TGA	2	6	123163	123168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326944
2521	NC_008508	A	8	8	123188	123195	100 %	0 %	0 %	0 %	116326944
2522	NC_008508	T	6	6	123212	123217	0 %	100 %	0 %	0 %	116326944
2523	NC_008508	CT	3	6	123246	123251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2524	NC_008508	AAAG	2	8	123280	123287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_008508	A	6	6	123349	123354	100 %	0 %	0 %	0 %	116326945
2526	NC_008508	ATC	2	6	123359	123364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326945
2527	NC_008508	ATCT	2	8	123414	123421	25 %	50 %	0 %	25 %	116326945
2528	NC_008508	GAT	2	6	123468	123473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326945
2529	NC_008508	A	6	6	123477	123482	100 %	0 %	0 %	0 %	116326945
2530	NC_008508	AGAA	2	8	123500	123507	75 %	0 %	25 %	0 %	116326945
2531	NC_008508	GGAA	2	8	123626	123633	50 %	0 %	50 %	0 %	116326945
2532	NC_008508	TCC	2	6	123669	123674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326945
2533	NC_008508	TATC	2	8	123706	123713	25 %	50 %	0 %	25 %	116326945
2534	NC_008508	AT	5	10	123752	123761	50 %	50 %	0 %	0 %	116326945
2535	NC_008508	A	6	6	123785	123790	100 %	0 %	0 %	0 %	116326945
2536	NC_008508	TCA	2	6	123845	123850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326945
2537	NC_008508	CTT	2	6	123868	123873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326945
2538	NC_008508	TGA	2	6	123973	123978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326945
2539	NC_008508	TCA	2	6	124051	124056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326945
2540	NC_008508	ATT	2	6	124074	124079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326945
2541	NC_008508	CTT	2	6	124147	124152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326945
2542	NC_008508	T	6	6	124254	124259	0 %	100 %	0 %	0 %	116326945
2543	NC_008508	AGTC	2	8	124286	124293	25 %	25 %	25 %	25 %	116326945
2544	NC_008508	GCTT	2	8	124325	124332	0 %	50 %	25 %	25 %	116326945
2545	NC_008508	ATT	2	6	124335	124340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326945
2546	NC_008508	GGA	2	6	124349	124354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326945
2547	NC_008508	TACT	2	8	124396	124403	25 %	50 %	0 %	25 %	116326945
2548	NC_008508	TTCGT	2	10	124429	124438	0 %	60 %	20 %	20 %	116326945
2549	NC_008508	CGA	2	6	124454	124459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326945
2550	NC_008508	ACC	2	6	124479	124484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326945
2551	NC_008508	CTT	2	6	124608	124613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326945
2552	NC_008508	A	6	6	124627	124632	100 %	0 %	0 %	0 %	116326945
2553	NC_008508	GAA	2	6	124647	124652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326945
2554	NC_008508	TCT	2	6	124670	124675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326945
2555	NC_008508	AAG	2	6	124716	124721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326945
2556	NC_008508	GAT	2	6	124785	124790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326945
2557	NC_008508	ATC	2	6	124827	124832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326945
2558	NC_008508	GCC	2	6	125022	125027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326945
2559	NC_008508	TGG	2	6	125089	125094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326945
2560	NC_008508	GAT	2	6	125150	125155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326945
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2562	NC_008508	TTC	2	6	125218	125223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326945
2563	NC_008508	GGA	2	6	125324	125329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326945
2564	NC_008508	GAG	2	6	125331	125336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326945
2565	NC_008508	AAG	2	6	125352	125357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326945
2566	NC_008508	TCT	2	6	125374	125379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326945
2567	NC_008508	TA	3	6	125395	125400	50 %	50 %	0 %	0 %	116326945
2568	NC_008508	AT	3	6	125432	125437	50 %	50 %	0 %	0 %	116326945
2569	NC_008508	GAA	2	6	125442	125447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326945
2570	NC_008508	TTAA	2	8	125580	125587	50 %	50 %	0 %	0 %	116326945
2571	NC_008508	A	6	6	125604	125609	100 %	0 %	0 %	0 %	116326945
2572	NC_008508	CGA	2	6	125633	125638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326945
2573	NC_008508	AAAG	2	8	125671	125678	75 %	0 %	25 %	0 %	116326945
2574	NC_008508	TGATC	2	10	125720	125729	20 %	40 %	20 %	20 %	116326945
2575	NC_008508	TG	4	8	125746	125753	0 %	50 %	50 %	0 %	116326945
2576	NC_008508	ACG	2	6	125835	125840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_008508	AGA	2	6	125904	125909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2578	NC_008508	GGA	2	6	125976	125981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326946
2579	NC_008508	CCGT	2	8	126121	126128	0 %	25 %	25 %	50 %	116326946
2580	NC_008508	TCTT	2	8	126159	126166	0 %	75 %	0 %	25 %	116326946
2581	NC_008508	A	8	8	126310	126317	100 %	0 %	0 %	0 %	116326946
2582	NC_008508	CTTC	2	8	126380	126387	0 %	50 %	0 %	50 %	116326946
2583	NC_008508	CGG	2	6	126459	126464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116326946
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2588	NC_008508	GAA	2	6	126712	126717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326946
2589	NC_008508	TGC	2	6	126756	126761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326946
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2591	NC_008508	TGA	2	6	126944	126949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326946
2592	NC_008508	GC	3	6	126980	126985	0 %	0 %	50 %	50 %	116326946
2593	NC_008508	GAT	2	6	127035	127040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326946
2594	NC_008508	GAAA	2	8	127110	127117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_008508	CAT	2	6	127169	127174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2597	NC_008508	TCA	2	6	127290	127295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2598	NC_008508	TTG	2	6	127413	127418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_008508	ATA	2	6	127437	127442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_008508	TTA	2	6	127475	127480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_008508	ATT	2	6	127648	127653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_008508	GAT	2	6	127660	127665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_008508	GTT	2	6	127756	127761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_008508	AATT	2	8	127833	127840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_008508	TAT	2	6	127853	127858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_008508	AGC	2	6	127883	127888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326947
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2608	NC_008508	GTT	2	6	128004	128009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326947
2609	NC_008508	T	6	6	128008	128013	0 %	100 %	0 %	0 %	116326947
2610	NC_008508	GAT	2	6	128017	128022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326947
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2612	NC_008508	CTT	2	6	128041	128046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326947
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2614	NC_008508	AG	3	6	128067	128072	50 %	0 %	50 %	0 %	116326947
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2619	NC_008508	T	6	6	128289	128294	0 %	100 %	0 %	0 %	116326947
2620	NC_008508	A	6	6	128303	128308	100 %	0 %	0 %	0 %	116326947
2621	NC_008508	A	6	6	128348	128353	100 %	0 %	0 %	0 %	116326947
2622	NC_008508	AAT	2	6	128377	128382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326947
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2875	NC_008508	A	6	6	140962	140967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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