MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leptospira borgpetersenii serovar Hardjo-bovis str. L550 chromosome 1

Total Repeats: 72610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008508	TTGG	2	8	247768	247775	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_008508	T	6	6	247855	247860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_008508	GAG	2	6	247866	247871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_008508	GTA	2	6	247876	247881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116327035
5005	NC_008508	TCT	2	6	247943	247948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327035
5006	NC_008508	CGAA	2	8	247963	247970	50 %	0 %	25 %	25 %	116327035
5007	NC_008508	AGG	2	6	248162	248167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116327035
5008	NC_008508	TTC	2	6	248195	248200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327035
5009	NC_008508	ATT	2	6	248219	248224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_008508	TTA	2	6	248233	248238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_008508	TAA	2	6	248292	248297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008508	CAAT	2	8	248370	248377	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_008508	TAA	2	6	248389	248394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008508	CT	3	6	248433	248438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_008508	GTT	2	6	248455	248460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_008508	A	6	6	248485	248490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_008508	GAA	2	6	248495	248500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008508	T	7	7	248522	248528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008508	GAG	2	6	248529	248534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008508	T	6	6	248575	248580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008508	A	6	6	248613	248618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008508	T	6	6	248679	248684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008508	AAAG	2	8	248690	248697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_008508	T	6	6	248705	248710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_008508	T	6	6	248731	248736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008508	A	6	6	248753	248758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_008508	A	7	7	248880	248886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_008508	GATGT	2	10	248995	249004	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_008508	A	6	6	249038	249043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008508	AAT	2	6	249049	249054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_008508	TTA	2	6	249068	249073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_008508	TGGA	2	8	249102	249109	25 %	25 %	50 %	0 %	116327036
5033	NC_008508	A	6	6	249198	249203	100 %	0 %	0 %	0 %	116327036
5034	NC_008508	AGA	2	6	249384	249389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116327036
5035	NC_008508	TGT	2	6	249454	249459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116327036
5036	NC_008508	ACAAGA	2	12	249598	249609	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116327036
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5038	NC_008508	GTC	2	6	249660	249665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116327036
5039	NC_008508	A	6	6	249701	249706	100 %	0 %	0 %	0 %	116327036
5040	NC_008508	TGG	2	6	249790	249795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116327036
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5043	NC_008508	GAA	2	6	249871	249876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116327036
5044	NC_008508	A	6	6	249884	249889	100 %	0 %	0 %	0 %	116327036
5045	NC_008508	GAA	2	6	249979	249984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116327036
5046	NC_008508	GCC	2	6	250037	250042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116327036
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5048	NC_008508	GGC	2	6	250220	250225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116327036
5049	NC_008508	ATATT	2	10	250342	250351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_008508	T	6	6	250350	250355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008508	ATTTT	2	10	250370	250379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008508	TAAG	2	8	250381	250388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008508	ATT	2	6	250417	250422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_008508	A	6	6	250515	250520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008508	AAG	2	6	250549	250554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_008508	AAGA	2	8	250563	250570	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_008508	CG	3	6	250627	250632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_008508	TTA	2	6	250703	250708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116327037
5059	NC_008508	TA	3	6	250731	250736	50 %	50 %	0 %	0 %	116327037
5060	NC_008508	GAAA	2	8	250755	250762	75 %	0 %	25 %	0 %	116327037
5061	NC_008508	CTA	2	6	250849	250854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116327037
5062	NC_008508	TA	3	6	250889	250894	50 %	50 %	0 %	0 %	116327037
5063	NC_008508	CCTA	2	8	250924	250931	25 %	25 %	0 %	50 %	116327037
5064	NC_008508	A	6	6	250966	250971	100 %	0 %	0 %	0 %	116327037
5065	NC_008508	GAATCG	2	12	250982	250993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116327037
5066	NC_008508	ATA	2	6	251036	251041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116327037
5067	NC_008508	CAT	2	6	251093	251098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116327037
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5069	NC_008508	TTC	2	6	251145	251150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327037
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5074	NC_008508	AAG	2	6	251619	251624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116327037
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5077	NC_008508	A	6	6	251657	251662	100 %	0 %	0 %	0 %	116327037
5078	NC_008508	TGA	2	6	251770	251775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116327037
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5081	NC_008508	A	6	6	252212	252217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_008508	TAGA	2	8	252259	252266	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_008508	TGC	2	6	252348	252353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_008508	AAG	2	6	252388	252393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_008508	AAG	2	6	252466	252471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_008508	CAC	2	6	252509	252514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_008508	GTA	2	6	252566	252571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_008508	TTAAAA	2	12	252725	252736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5090	NC_008508	A	6	6	252788	252793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008508	TCGGT	2	10	252807	252816	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5092	NC_008508	TGGAT	2	10	252818	252827	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_008508	TTCG	2	8	252853	252860	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5094	NC_008508	CTT	2	6	252864	252869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_008508	AAAAT	2	10	252949	252958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_008508	CGA	2	6	252967	252972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5100	NC_008508	GAA	2	6	253257	253262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116327038
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5103	NC_008508	A	6	6	253353	253358	100 %	0 %	0 %	0 %	116327038
5104	NC_008508	ATTC	2	8	253361	253368	25 %	50 %	0 %	25 %	116327038
5105	NC_008508	GGA	2	6	253379	253384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116327038
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5110	NC_008508	GAT	2	6	253703	253708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116327038
5111	NC_008508	GA	3	6	253712	253717	50 %	0 %	50 %	0 %	116327038
5112	NC_008508	TGC	2	6	253799	253804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116327038
5113	NC_008508	GTA	2	6	253837	253842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116327038
5114	NC_008508	GTC	2	6	253849	253854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116327038
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5118	NC_008508	CGG	2	6	254048	254053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116327038
5119	NC_008508	GA	3	6	254093	254098	50 %	0 %	50 %	0 %	116327038
5120	NC_008508	TC	3	6	254210	254215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_008508	GAG	2	6	254222	254227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_008508	CTTT	2	8	254344	254351	0 %	75 %	0 %	25 %	116327039
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5125	NC_008508	ATC	2	6	254477	254482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116327039
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5128	NC_008508	CTTC	2	8	254549	254556	0 %	50 %	0 %	50 %	116327039
5129	NC_008508	GCG	2	6	254591	254596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116327039
5130	NC_008508	TAT	2	6	254603	254608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116327039
5131	NC_008508	ACG	2	6	254670	254675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116327039
5132	NC_008508	CTT	2	6	254678	254683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327039
5133	NC_008508	ATC	2	6	254700	254705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116327039
5134	NC_008508	TTC	2	6	254743	254748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327039
5135	NC_008508	GAA	2	6	254888	254893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116327039
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5137	NC_008508	TAT	2	6	255044	255049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116327039
5138	NC_008508	TTC	2	6	255123	255128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327039
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5140	NC_008508	GAA	2	6	255185	255190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116327039
5141	NC_008508	TCT	2	6	255193	255198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327039
5142	NC_008508	TCCGA	2	10	255200	255209	20 %	20 %	20 %	40 %	116327039
5143	NC_008508	AAGT	2	8	255367	255374	50 %	25 %	25 %	0 %	116327039
5144	NC_008508	ATC	2	6	255539	255544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116327039
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5152	NC_008508	TTTG	2	8	255890	255897	0 %	75 %	25 %	0 %	116327040
5153	NC_008508	GGT	2	6	255916	255921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116327040
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5161	NC_008508	TC	4	8	256384	256391	0 %	50 %	0 %	50 %	116327041
5162	NC_008508	ACAA	2	8	256429	256436	75 %	0 %	0 %	25 %	116327041
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5165	NC_008508	GGAC	2	8	256514	256521	25 %	0 %	50 %	25 %	116327041
5166	NC_008508	CTT	2	6	256536	256541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327041
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5184	NC_008508	ATC	2	6	257373	257378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116327041
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5200	NC_008508	CAA	2	6	258161	258166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116327041
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5203	NC_008508	A	6	6	258314	258319	100 %	0 %	0 %	0 %	116327042
5204	NC_008508	GAT	2	6	258376	258381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116327042
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5237	NC_008508	CTTT	2	8	259746	259753	0 %	75 %	0 %	25 %	116327043
5238	NC_008508	T	6	6	259757	259762	0 %	100 %	0 %	0 %	116327043
5239	NC_008508	AGG	2	6	259766	259771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116327043
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5241	NC_008508	TTC	2	6	259785	259790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116327043
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5244	NC_008508	AAT	2	6	259977	259982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116327043
5245	NC_008508	ACT	2	6	260058	260063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5246	NC_008508	TTC	2	6	260079	260084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5247	NC_008508	A	8	8	260249	260256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5248	NC_008508	A	6	6	260263	260268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_008508	GC	3	6	260304	260309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5250	NC_008508	CAAA	2	8	260339	260346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5251	NC_008508	ATCG	2	8	260358	260365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5252	NC_008508	TGGT	2	8	260389	260396	0 %	50 %	50 %	0 %	116327044
5253	NC_008508	T	6	6	260420	260425	0 %	100 %	0 %	0 %	116327044
5254	NC_008508	TTG	2	6	260529	260534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116327044
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5259	NC_008508	A	8	8	260718	260725	100 %	0 %	0 %	0 %	116327044
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