MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 5

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008507	ATTT	2	8	101	108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008507	ATTA	2	8	333	340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008507	TTGA	2	8	654	661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008507	TGTT	2	8	1265	1272	0 %	75 %	25 %	0 %	116326646
5	NC_008507	TAAG	2	8	1543	1550	50 %	25 %	25 %	0 %	116326646
6	NC_008507	TATT	2	8	1754	1761	25 %	75 %	0 %	0 %	116326646
7	NC_008507	TAAG	2	8	1787	1794	50 %	25 %	25 %	0 %	116326646
8	NC_008507	GATA	2	8	2100	2107	50 %	25 %	25 %	0 %	116326647
9	NC_008507	AACC	2	8	2169	2176	50 %	0 %	0 %	50 %	116326647
10	NC_008507	TGAG	2	8	2249	2256	25 %	25 %	50 %	0 %	116326647
11	NC_008507	TAGA	2	8	3499	3506	50 %	25 %	25 %	0 %	116326649
12	NC_008507	TAGA	2	8	4300	4307	50 %	25 %	25 %	0 %	116326650
13	NC_008507	TCTT	2	8	4569	4576	0 %	75 %	0 %	25 %	116326650
14	NC_008507	GAAT	2	8	4915	4922	50 %	25 %	25 %	0 %	116326650
15	NC_008507	GATA	2	8	5164	5171	50 %	25 %	25 %	0 %	116326650
16	NC_008507	TACT	2	8	5281	5288	25 %	50 %	0 %	25 %	116326651
17	NC_008507	ATTT	2	8	5878	5885	25 %	75 %	0 %	0 %	116326651
18	NC_008507	TTAA	2	8	5901	5908	50 %	50 %	0 %	0 %	116326651
19	NC_008507	ATTT	2	8	6137	6144	25 %	75 %	0 %	0 %	116326651
20	NC_008507	TTAC	2	8	6234	6241	25 %	50 %	0 %	25 %	116326651
21	NC_008507	CCTT	2	8	6552	6559	0 %	50 %	0 %	50 %	116326651
22	NC_008507	CTAT	2	8	6663	6670	25 %	50 %	0 %	25 %	116326651
23	NC_008507	GTAT	2	8	6794	6801	25 %	50 %	25 %	0 %	116326651
24	NC_008507	GAAT	2	8	7299	7306	50 %	25 %	25 %	0 %	116326651
25	NC_008507	ATCA	2	8	7979	7986	50 %	25 %	0 %	25 %	116326651
26	NC_008507	CATT	2	8	8329	8336	25 %	50 %	0 %	25 %	116326651
27	NC_008507	CGTT	2	8	8606	8613	0 %	50 %	25 %	25 %	116326651
28	NC_008507	GGTT	2	8	9020	9027	0 %	50 %	50 %	0 %	116326651
29	NC_008507	TGTT	2	8	9386	9393	0 %	75 %	25 %	0 %	116326651
30	NC_008507	AATT	2	8	9619	9626	50 %	50 %	0 %	0 %	116326651
31	NC_008507	ATTA	2	8	9878	9885	50 %	50 %	0 %	0 %	116326651
32	NC_008507	GTTT	2	8	9897	9904	0 %	75 %	25 %	0 %	116326651
33	NC_008507	TTCC	2	8	9917	9924	0 %	50 %	0 %	50 %	116326652
34	NC_008507	ATTA	2	8	10961	10968	50 %	50 %	0 %	0 %	116326653
35	NC_008507	TTTC	2	8	11842	11849	0 %	75 %	0 %	25 %	116326653
36	NC_008507	TCGT	2	8	11879	11886	0 %	50 %	25 %	25 %	116326653
37	NC_008507	TGAG	2	8	12723	12730	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008507	TCTT	2	8	13065	13072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008507	AACA	2	8	13152	13159	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008507	GTTC	2	8	13178	13185	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008507	TGTA	2	8	13325	13332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008507	CTTA	2	8	13372	13379	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.