MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4

Total Repeats: 608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008506	TTA	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
2	NC_008506	TGT	2	6	115	120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326610
3	NC_008506	ATC	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326610
4	NC_008506	ACC	2	6	303	308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326610
5	NC_008506	GCC	2	6	313	318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326610
6	NC_008506	CTG	3	9	338	346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326610
7	NC_008506	ATT	2	6	426	431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
8	NC_008506	TGC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326610
9	NC_008506	TCT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326610
10	NC_008506	TTC	3	9	549	557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326610
11	NC_008506	TAA	2	6	592	597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326610
12	NC_008506	CAA	2	6	608	613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
13	NC_008506	CAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
14	NC_008506	AAC	2	6	858	863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
15	NC_008506	TGT	2	6	1000	1005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326610
16	NC_008506	AGC	2	6	1053	1058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326610
17	NC_008506	CAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
18	NC_008506	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
19	NC_008506	AAC	2	6	1248	1253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326610
20	NC_008506	TGG	2	6	1299	1304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326610
21	NC_008506	ATT	2	6	1332	1337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326610
22	NC_008506	AAG	2	6	1423	1428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
23	NC_008506	CCT	2	6	1429	1434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326610
24	NC_008506	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326610
25	NC_008506	GTA	2	6	1558	1563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326610
26	NC_008506	CCA	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326610
27	NC_008506	TCA	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326610
28	NC_008506	CTC	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326611
29	NC_008506	TGA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326611
30	NC_008506	TAA	2	6	1866	1871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326611
31	NC_008506	TCA	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
32	NC_008506	CAT	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
33	NC_008506	TCC	2	6	1927	1932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116326611
34	NC_008506	CTA	2	6	2000	2005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326611
35	NC_008506	CAA	2	6	2090	2095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326611
36	NC_008506	CAA	2	6	2132	2137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326611
37	NC_008506	TCC	2	6	2140	2145	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008506	TCA	2	6	2212	2217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
39	NC_008506	AGT	2	6	2232	2237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326612
40	NC_008506	TGC	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326612
41	NC_008506	CTT	2	6	2267	2272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
42	NC_008506	CTT	3	9	2423	2431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
43	NC_008506	CAG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326612
44	NC_008506	TCA	2	6	2635	2640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
45	NC_008506	AAG	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
46	NC_008506	TTG	2	6	2718	2723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326612
47	NC_008506	CAT	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
48	NC_008506	AAG	3	9	2874	2882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
49	NC_008506	CTT	2	6	2888	2893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
50	NC_008506	TTG	2	6	2906	2911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326612
51	NC_008506	GAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326612
52	NC_008506	TCA	2	6	2965	2970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326612
53	NC_008506	TTC	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326612
54	NC_008506	CAC	2	6	3050	3055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326612
55	NC_008506	TAA	2	6	3254	3259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
56	NC_008506	AAC	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326613
57	NC_008506	TTC	2	6	3467	3472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
58	NC_008506	CTT	2	6	3487	3492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
59	NC_008506	ATT	2	6	3518	3523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326613
60	NC_008506	CGA	2	6	3548	3553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326613
61	NC_008506	GTG	2	6	3571	3576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326613
62	NC_008506	ATA	2	6	3638	3643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
63	NC_008506	TAA	2	6	3700	3705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326613
64	NC_008506	CTT	2	6	3736	3741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326613
65	NC_008506	TTG	2	6	3751	3756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326613
66	NC_008506	ACC	2	6	3893	3898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326613
67	NC_008506	CCA	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326613
68	NC_008506	CAC	2	6	4100	4105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
69	NC_008506	TCT	2	6	4204	4209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326614
70	NC_008506	ATG	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326614
71	NC_008506	AAG	2	6	4257	4262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326614
72	NC_008506	ACC	2	6	4263	4268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
73	NC_008506	CCA	2	6	4279	4284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326614
74	NC_008506	TTC	2	6	4308	4313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326614
75	NC_008506	TAC	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326614
76	NC_008506	TGA	2	6	4652	4657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326615
77	NC_008506	CAT	2	6	4665	4670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326615
78	NC_008506	TCA	2	6	4712	4717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326615
79	NC_008506	CGA	2	6	4719	4724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326615
80	NC_008506	CTG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326615
81	NC_008506	CAA	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326615
82	NC_008506	CTT	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326615
83	NC_008506	CAA	3	9	5028	5036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008506	CCT	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008506	TCA	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008506	ATT	2	6	5234	5239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008506	TCA	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008506	CGA	2	6	5544	5549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326616
89	NC_008506	ATA	2	6	5604	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326616
90	NC_008506	TGG	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326616
91	NC_008506	GAA	2	6	5744	5749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326616
92	NC_008506	CTT	2	6	5958	5963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326616
93	NC_008506	CAA	2	6	6114	6119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326616
94	NC_008506	TTA	2	6	6150	6155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326616
95	NC_008506	CAT	2	6	6221	6226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326616
96	NC_008506	ACT	2	6	6276	6281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326616
97	NC_008506	ACT	2	6	6324	6329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008506	AAT	2	6	6334	6339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008506	ATT	2	6	6429	6434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008506	CTA	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008506	AGT	2	6	6593	6598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008506	ATC	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326617
103	NC_008506	TTC	2	6	6936	6941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326617
104	NC_008506	TAT	2	6	7088	7093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326617
105	NC_008506	CTT	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326617
106	NC_008506	CTT	2	6	7307	7312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326617
107	NC_008506	TAA	2	6	7394	7399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008506	ACG	2	6	7560	7565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326618
109	NC_008506	CAA	2	6	7575	7580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326618
110	NC_008506	GAA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326618
111	NC_008506	TTA	2	6	7818	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008506	TCA	2	6	7935	7940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008506	TCT	2	6	7941	7946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008506	CTA	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008506	TCA	2	6	8071	8076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008506	GCA	2	6	8180	8185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326619
117	NC_008506	AAT	2	6	8190	8195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326619
118	NC_008506	GAA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326619
119	NC_008506	AAC	2	6	8305	8310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326619
120	NC_008506	GCA	2	6	8333	8338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326619
121	NC_008506	TAA	2	6	8372	8377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326619
122	NC_008506	GCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326619
123	NC_008506	ATC	2	6	8611	8616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326619
124	NC_008506	TAA	2	6	8629	8634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326619
125	NC_008506	ATC	2	6	8776	8781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326619
126	NC_008506	TTC	2	6	8866	8871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326619
127	NC_008506	GCT	2	6	8897	8902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326619
128	NC_008506	CTT	2	6	8943	8948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326619
129	NC_008506	TGA	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326619
130	NC_008506	ATT	2	6	9136	9141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326619
131	NC_008506	AGC	2	6	9148	9153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326619
132	NC_008506	GCT	2	6	9275	9280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326619
133	NC_008506	ATC	2	6	9341	9346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326619
134	NC_008506	TCA	2	6	9347	9352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326619
135	NC_008506	CTT	2	6	9558	9563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326619
136	NC_008506	TTG	2	6	9715	9720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326619
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138	NC_008506	TTG	2	6	9864	9869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326619
139	NC_008506	AAT	2	6	9942	9947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008506	TTA	2	6	9967	9972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008506	CTT	2	6	9996	10001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008506	GGA	2	6	10030	10035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008506	TTA	2	6	10067	10072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008506	ATA	2	6	10083	10088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008506	TCA	3	9	10135	10143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008506	CAA	2	6	10203	10208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_008506	AAT	2	6	10262	10267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008506	CAA	2	6	10304	10309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_008506	GTC	2	6	10367	10372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_008506	TCT	2	6	10390	10395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_008506	AAT	2	6	10478	10483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008506	ATT	2	6	10602	10607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326620
153	NC_008506	TTA	2	6	10619	10624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326620
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158	NC_008506	AAG	2	6	11248	11253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008506	CTA	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_008506	TCA	2	6	11445	11450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_008506	CTT	2	6	11489	11494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_008506	ATT	2	6	11523	11528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008506	ATT	2	6	11556	11561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_008506	TAA	2	6	11610	11615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_008506	TCT	2	6	11791	11796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326621
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169	NC_008506	ATT	2	6	12140	12145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326621
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175	NC_008506	ATA	2	6	12723	12728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326621
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205	NC_008506	ATT	2	6	14309	14314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
206	NC_008506	TAT	2	6	14336	14341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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220	NC_008506	AAT	2	6	15697	15702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_008506	TTA	2	6	15853	15858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_008506	ACC	2	6	16016	16021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
224	NC_008506	CTG	2	6	16023	16028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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226	NC_008506	ATT	2	6	16214	16219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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243	NC_008506	CCA	2	6	17274	17279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326623
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246	NC_008506	GAT	2	6	17509	17514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326623
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249	NC_008506	TAA	2	6	17697	17702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326623
250	NC_008506	ATT	2	6	17831	17836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326623
251	NC_008506	TAT	2	6	17935	17940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326623
252	NC_008506	TCA	2	6	18042	18047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326623
253	NC_008506	CAG	2	6	18070	18075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326623
254	NC_008506	ATC	2	6	18122	18127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326623
255	NC_008506	AAG	2	6	18164	18169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_008506	TGG	2	6	18272	18277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326624
257	NC_008506	AGA	2	6	18288	18293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326624
258	NC_008506	AAC	2	6	18393	18398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326624
259	NC_008506	TCT	2	6	18418	18423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326624
260	NC_008506	GCT	2	6	18439	18444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326624
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262	NC_008506	GGA	2	6	18622	18627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326624
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392	NC_008506	TTA	2	6	28117	28122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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