MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	CTGG	2	8	103	110	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008505	GTTT	2	8	135	142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008505	TCTA	2	8	273	280	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
4	NC_008505	CTGG	2	8	494	501	0 %	25 %	50 %	25 %	116326548
5	NC_008505	GAAA	2	8	906	913	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
6	NC_008505	GAAA	2	8	1120	1127	75 %	0 %	25 %	0 %	116326548
7	NC_008505	CATT	2	8	1209	1216	25 %	50 %	0 %	25 %	116326548
8	NC_008505	CTGA	2	8	1280	1287	25 %	25 %	25 %	25 %	116326548
9	NC_008505	AATT	2	8	1654	1661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008505	TTAT	2	8	2242	2249	25 %	75 %	0 %	0 %	116326549
11	NC_008505	ACTT	2	8	2295	2302	25 %	50 %	0 %	25 %	116326549
12	NC_008505	CTTT	2	8	2465	2472	0 %	75 %	0 %	25 %	116326549
13	NC_008505	TTAC	2	8	3233	3240	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
14	NC_008505	AAAC	2	8	3256	3263	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
15	NC_008505	AGCA	2	8	3272	3279	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
16	NC_008505	CAAG	2	8	3540	3547	50 %	0 %	25 %	25 %	116326551
17	NC_008505	ATTC	2	8	3551	3558	25 %	50 %	0 %	25 %	116326551
18	NC_008505	ATGA	2	8	3643	3650	50 %	25 %	25 %	0 %	116326551
19	NC_008505	AAAC	2	8	4070	4077	75 %	0 %	0 %	25 %	116326551
20	NC_008505	TCAA	2	8	4633	4640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008505	ATAA	2	8	4725	4732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008505	TTTA	2	8	4819	4826	25 %	75 %	0 %	0 %	116326552
23	NC_008505	GTCA	2	8	5374	5381	25 %	25 %	25 %	25 %	116326552
24	NC_008505	ATTA	2	8	5924	5931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008505	CTGA	2	8	7017	7024	25 %	25 %	25 %	25 %	116326554
26	NC_008505	GGTT	2	8	7725	7732	0 %	50 %	50 %	0 %	116326554
27	NC_008505	ATTT	2	8	8371	8378	25 %	75 %	0 %	0 %	116326554
28	NC_008505	ATTT	2	8	8693	8700	25 %	75 %	0 %	0 %	116326555
29	NC_008505	ATCA	2	8	9227	9234	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008505	TAAT	2	8	9584	9591	50 %	50 %	0 %	0 %	116326556
31	NC_008505	AACA	2	8	9615	9622	75 %	0 %	0 %	25 %	116326556
32	NC_008505	CTTT	2	8	10503	10510	0 %	75 %	0 %	25 %	116326557
33	NC_008505	AACA	2	8	10757	10764	75 %	0 %	0 %	25 %	116326557
34	NC_008505	TGTC	2	8	11033	11040	0 %	50 %	25 %	25 %	116326557
35	NC_008505	TGAT	2	8	11426	11433	25 %	50 %	25 %	0 %	116326557
36	NC_008505	ATAA	2	8	12130	12137	75 %	25 %	0 %	0 %	116326558
37	NC_008505	TTTC	2	8	12806	12813	0 %	75 %	0 %	25 %	116326559
38	NC_008505	TCAT	2	8	13119	13126	25 %	50 %	0 %	25 %	116326559
39	NC_008505	ACTT	2	8	14529	14536	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008505	TTTA	2	8	14556	14563	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008505	ATAA	2	8	14571	14578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008505	ACTT	2	8	14928	14935	25 %	50 %	0 %	25 %	116326561
43	NC_008505	CTTA	2	8	15475	15482	25 %	50 %	0 %	25 %	116326562
44	NC_008505	TCAA	2	8	15787	15794	50 %	25 %	0 %	25 %	116326562
45	NC_008505	TTAC	2	8	15884	15891	25 %	50 %	0 %	25 %	116326562
46	NC_008505	GGTA	2	8	15943	15950	25 %	25 %	50 %	0 %	116326562
47	NC_008505	AAGT	2	8	16938	16945	50 %	25 %	25 %	0 %	116326562
48	NC_008505	CCAA	2	8	16967	16974	50 %	0 %	0 %	50 %	116326562
49	NC_008505	CAGT	2	8	17931	17938	25 %	25 %	25 %	25 %	116326562
50	NC_008505	CAAA	2	8	18360	18367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008505	ATAA	2	8	18528	18535	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008505	TACA	2	8	18576	18583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008505	TATC	2	8	19391	19398	25 %	50 %	0 %	25 %	116326563
54	NC_008505	AGTA	2	8	20094	20101	50 %	25 %	25 %	0 %	116326563
55	NC_008505	CTAC	2	8	20325	20332	25 %	25 %	0 %	50 %	116326563
56	NC_008505	GCTG	2	8	20385	20392	0 %	25 %	50 %	25 %	116326564
57	NC_008505	AATC	2	8	20758	20765	50 %	25 %	0 %	25 %	116326564
58	NC_008505	ACAG	2	8	20994	21001	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008505	ATAA	2	8	21139	21146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008505	TTTC	2	8	22072	22079	0 %	75 %	0 %	25 %	116326565
61	NC_008505	GTTT	2	8	22394	22401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008505	GGAC	2	8	22477	22484	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008505	TTTC	2	8	22526	22533	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008505	ATTT	2	8	22565	22572	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008505	CGTA	2	8	22674	22681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008505	GTTC	2	8	22711	22718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008505	TCTT	2	8	23301	23308	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
68	NC_008505	AAAT	2	8	23332	23339	75 %	25 %	0 %	0 %	116326566
69	NC_008505	TTCT	2	8	23785	23792	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
70	NC_008505	AAAC	2	8	23827	23834	75 %	0 %	0 %	25 %	116326566
71	NC_008505	AGAT	2	8	23850	23857	50 %	25 %	25 %	0 %	116326566
72	NC_008505	ATAG	2	8	24161	24168	50 %	25 %	25 %	0 %	116326566
73	NC_008505	TTCT	2	8	24496	24503	0 %	75 %	0 %	25 %	116326566
74	NC_008505	CTTT	2	8	24832	24839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008505	TTTC	2	8	25261	25268	0 %	75 %	0 %	25 %	116326567
76	NC_008505	TCAC	2	8	25944	25951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008505	ATTT	2	8	26249	26256	25 %	75 %	0 %	0 %	116326569
78	NC_008505	ATTG	2	8	26306	26313	25 %	50 %	25 %	0 %	116326569
79	NC_008505	TTGA	2	8	26382	26389	25 %	50 %	25 %	0 %	116326569
80	NC_008505	GGTC	2	8	26911	26918	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008505	AAAT	2	8	27053	27060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008505	AATT	2	8	27938	27945	50 %	50 %	0 %	0 %	116326571
83	NC_008505	AATT	2	8	28507	28514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008505	CTTT	2	8	28551	28558	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008505	AATA	2	8	28680	28687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008505	TAAG	2	8	29011	29018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008505	GTTG	2	8	29081	29088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008505	TGAG	2	8	29266	29273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008505	TCTT	2	8	29608	29615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008505	GAAC	2	8	29694	29701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008505	TGTT	2	8	29720	29727	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008505	TTCA	2	8	29758	29765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008505	CATT	2	8	29856	29863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008505	CATG	2	8	30164	30171	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008505	GTTT	2	8	30251	30258	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008505	ATTA	2	8	30907	30914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008505	TATT	2	8	31401	31408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008505	CATA	2	8	32493	32500	50 %	25 %	0 %	25 %	116326574
99	NC_008505	TTCA	2	8	32608	32615	25 %	50 %	0 %	25 %	116326574
100	NC_008505	CTTT	2	8	32874	32881	0 %	75 %	0 %	25 %	116326574
101	NC_008505	TTTC	2	8	32941	32948	0 %	75 %	0 %	25 %	116326574
102	NC_008505	GATA	2	8	33042	33049	50 %	25 %	25 %	0 %	116326574
103	NC_008505	CTTC	2	8	33400	33407	0 %	50 %	0 %	50 %	116326575
104	NC_008505	TTTG	2	8	33728	33735	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008505	TTTG	2	8	33748	33755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008505	TTGG	2	8	34008	34015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008505	GAAT	2	8	34808	34815	50 %	25 %	25 %	0 %	116326576
108	NC_008505	TCGT	2	8	35049	35056	0 %	50 %	25 %	25 %	116326576
109	NC_008505	AATA	2	8	35201	35208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008505	TATG	2	8	35237	35244	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008505	TCTT	2	8	35414	35421	0 %	75 %	0 %	25 %	116326577
112	NC_008505	TTTC	2	8	36038	36045	0 %	75 %	0 %	25 %	116326578
113	NC_008505	ATTT	2	8	37719	37726	25 %	75 %	0 %	0 %	116326579
114	NC_008505	ACTT	2	8	38070	38077	25 %	50 %	0 %	25 %	116326579
115	NC_008505	AAAC	2	8	38282	38289	75 %	0 %	0 %	25 %	116326579
116	NC_008505	TTTG	2	8	38458	38465	0 %	75 %	25 %	0 %	116326580
117	NC_008505	ATTG	2	8	38757	38764	25 %	50 %	25 %	0 %	116326580
118	NC_008505	TAAA	2	8	38809	38816	75 %	25 %	0 %	0 %	116326580
119	NC_008505	ATTT	2	8	38932	38939	25 %	75 %	0 %	0 %	116326580
120	NC_008505	TTTC	2	8	39576	39583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008505	ATAA	2	8	39643	39650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008505	AAGA	2	8	39879	39886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008505	CAAA	2	8	40100	40107	75 %	0 %	0 %	25 %	116326581
124	NC_008505	TGTC	2	8	40250	40257	0 %	50 %	25 %	25 %	116326581
125	NC_008505	CAGA	2	8	40442	40449	50 %	0 %	25 %	25 %	116326581
126	NC_008505	GTAA	2	8	40509	40516	50 %	25 %	25 %	0 %	116326581
127	NC_008505	TATT	2	8	40712	40719	25 %	75 %	0 %	0 %	116326581
128	NC_008505	GAAC	2	8	40795	40802	50 %	0 %	25 %	25 %	116326581
129	NC_008505	AGGA	2	8	40830	40837	50 %	0 %	50 %	0 %	116326581
130	NC_008505	CATC	2	8	41087	41094	25 %	25 %	0 %	50 %	116326581
131	NC_008505	AACT	2	8	41453	41460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008505	GGTT	2	8	43676	43683	0 %	50 %	50 %	0 %	116326585
133	NC_008505	CATT	2	8	43811	43818	25 %	50 %	0 %	25 %	116326585
134	NC_008505	TCAA	2	8	43997	44004	50 %	25 %	0 %	25 %	116326586
135	NC_008505	GAAT	2	8	44399	44406	50 %	25 %	25 %	0 %	116326587
136	NC_008505	GAAA	2	8	44714	44721	75 %	0 %	25 %	0 %	116326587
137	NC_008505	GGCT	2	8	45543	45550	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
138	NC_008505	TGGC	2	8	45688	45695	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
139	NC_008505	GGCT	2	8	45723	45730	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
140	NC_008505	ATTG	2	8	46264	46271	25 %	50 %	25 %	0 %	116326588
141	NC_008505	CTGC	2	8	46453	46460	0 %	25 %	25 %	50 %	116326588
142	NC_008505	TGGC	2	8	46881	46888	0 %	25 %	50 %	25 %	116326588
143	NC_008505	TTTC	2	8	47732	47739	0 %	75 %	0 %	25 %	116326588
144	NC_008505	CATG	2	8	50365	50372	25 %	25 %	25 %	25 %	116326588
145	NC_008505	AGGC	2	8	50905	50912	25 %	0 %	50 %	25 %	116326588
146	NC_008505	GCTT	2	8	51051	51058	0 %	50 %	25 %	25 %	116326588
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227	NC_008505	GAAA	2	8	73287	73294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.