MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 3

Total Repeats: 935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008505	ATA	2	6	148	153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008505	ATA	2	6	193	198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008505	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326548
4	NC_008505	CAA	3	9	297	305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
5	NC_008505	TAA	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326548
6	NC_008505	CAA	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
7	NC_008505	ATT	2	6	416	421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
8	NC_008505	ACT	2	6	425	430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326548
9	NC_008505	CAA	2	6	534	539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
10	NC_008505	AGT	2	6	557	562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
11	NC_008505	ATG	2	6	794	799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
12	NC_008505	GAT	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
13	NC_008505	AGG	2	6	937	942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326548
14	NC_008505	TTA	2	6	963	968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
15	NC_008505	TAA	2	6	979	984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326548
16	NC_008505	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
17	NC_008505	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326548
18	NC_008505	CAA	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
19	NC_008505	ACA	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326548
20	NC_008505	TGA	2	6	1561	1566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
21	NC_008505	ATG	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326548
22	NC_008505	CTA	2	6	1664	1669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008505	ATA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008505	TAA	2	6	1744	1749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008505	ATC	2	6	1869	1874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008505	TCT	2	6	1939	1944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326549
27	NC_008505	TTG	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
28	NC_008505	CTT	2	6	2033	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326549
29	NC_008505	GTT	2	6	2072	2077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
30	NC_008505	AAG	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
31	NC_008505	TAA	2	6	2163	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326549
32	NC_008505	AAT	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326549
33	NC_008505	TGT	2	6	2391	2396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326549
34	NC_008505	AGA	2	6	2448	2453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
35	NC_008505	AGA	2	6	2572	2577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326549
36	NC_008505	TAG	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008505	TTC	2	6	2834	2839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326550
38	NC_008505	TAT	2	6	2896	2901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326550
39	NC_008505	AGA	3	9	2948	2956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326550
40	NC_008505	TCG	2	6	3033	3038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326550
41	NC_008505	ATT	2	6	3169	3174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008505	AGA	2	6	3303	3308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
43	NC_008505	TGA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
44	NC_008505	GTT	2	6	3391	3396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326551
45	NC_008505	GGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116326551
46	NC_008505	AAG	3	9	3589	3597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
47	NC_008505	GAA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
48	NC_008505	GAA	2	6	3766	3771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
49	NC_008505	CAA	2	6	3879	3884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326551
50	NC_008505	GAA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
51	NC_008505	AGA	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
52	NC_008505	CAT	2	6	4133	4138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326551
53	NC_008505	ATG	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
54	NC_008505	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326551
55	NC_008505	ATG	2	6	4228	4233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326551
56	NC_008505	TCA	2	6	4495	4500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008505	ATG	2	6	4516	4521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008505	CAT	2	6	4591	4596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008505	CCG	2	6	5027	5032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326552
60	NC_008505	ATT	2	6	5112	5117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326552
61	NC_008505	GAA	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326552
62	NC_008505	GAT	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326552
63	NC_008505	AAT	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326552
64	NC_008505	TAA	2	6	5710	5715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008505	ATG	2	6	5782	5787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008505	TTG	2	6	5888	5893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008505	GAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008505	AGG	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008505	ATG	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326553
70	NC_008505	AAG	2	6	6219	6224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326553
71	NC_008505	TAG	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326553
72	NC_008505	TGT	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326553
73	NC_008505	TCA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326553
74	NC_008505	GTG	2	6	6602	6607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116326553
75	NC_008505	TAA	2	6	6628	6633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326554
76	NC_008505	GAA	2	6	6681	6686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
77	NC_008505	TAG	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
78	NC_008505	GAA	2	6	6839	6844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
79	NC_008505	ATT	2	6	6887	6892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326554
80	NC_008505	ATG	2	6	6937	6942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
81	NC_008505	GAA	2	6	7029	7034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
82	NC_008505	ACA	2	6	7181	7186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326554
83	NC_008505	TCA	2	6	7260	7265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326554
84	NC_008505	ATG	2	6	7333	7338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
85	NC_008505	TGT	2	6	7388	7393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326554
86	NC_008505	TCA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326554
87	NC_008505	AGA	2	6	7589	7594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
88	NC_008505	ATT	2	6	7674	7679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326554
89	NC_008505	AAC	2	6	7693	7698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326554
90	NC_008505	ATG	2	6	7783	7788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326554
91	NC_008505	CAT	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326554
92	NC_008505	GAA	2	6	8013	8018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116326554
93	NC_008505	GTC	2	6	8141	8146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326554
94	NC_008505	AAT	2	6	8651	8656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326555
95	NC_008505	CTA	2	6	8674	8679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326555
96	NC_008505	ATA	2	6	8777	8782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326555
97	NC_008505	ATC	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326555
98	NC_008505	TGT	2	6	8838	8843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326555
99	NC_008505	CAT	2	6	8969	8974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326555
100	NC_008505	GTT	2	6	9049	9054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326555
101	NC_008505	CAT	2	6	9187	9192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_008505	TAA	2	6	9306	9311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008505	TTC	2	6	9433	9438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326556
104	NC_008505	TGA	2	6	9458	9463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326556
105	NC_008505	ACT	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326556
106	NC_008505	CTT	2	6	9510	9515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326556
107	NC_008505	ATG	2	6	9747	9752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326556
108	NC_008505	TCC	2	6	9784	9789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008505	ATC	2	6	9961	9966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008505	CTA	2	6	10037	10042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008505	ATT	3	9	10181	10189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008505	CAA	2	6	10196	10201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008505	GTT	2	6	10204	10209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008505	AAC	2	6	10210	10215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008505	ATT	2	6	10222	10227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008505	GGA	2	6	10257	10262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008505	TGT	2	6	10287	10292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326557
118	NC_008505	TCT	2	6	10424	10429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326557
119	NC_008505	GCC	2	6	10441	10446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116326557
120	NC_008505	TAT	2	6	10565	10570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
121	NC_008505	CAA	2	6	10631	10636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326557
122	NC_008505	TTA	2	6	10637	10642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
123	NC_008505	TAT	2	6	10683	10688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
124	NC_008505	GCA	2	6	10702	10707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326557
125	NC_008505	TTA	2	6	10793	10798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
126	NC_008505	TGC	2	6	10799	10804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326557
127	NC_008505	ACT	2	6	10849	10854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326557
128	NC_008505	TTG	2	6	11227	11232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326557
129	NC_008505	GCT	2	6	11338	11343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116326557
130	NC_008505	GTT	2	6	11350	11355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326557
131	NC_008505	TAT	2	6	11366	11371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116326557
132	NC_008505	TAA	2	6	11492	11497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326557
133	NC_008505	ATT	2	6	11535	11540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_008505	TAT	2	6	21176	21181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_008505	ATT	2	6	21331	21336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_008505	ATC	3	9	21473	21481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326565
262	NC_008505	ATC	2	6	21590	21595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326565
263	NC_008505	GTT	2	6	21888	21893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116326565
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267	NC_008505	AAT	2	6	22442	22447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_008505	AAT	2	6	22485	22490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_008505	TGA	2	6	22558	22563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_008505	CAC	2	6	22655	22660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
271	NC_008505	ACA	2	6	22770	22775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116326566
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281	NC_008505	TGA	2	6	23995	24000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326566
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391	NC_008505	TCC	2	6	33071	33076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
392	NC_008505	AAT	2	6	33122	33127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_008505	ATT	2	6	33155	33160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_008505	ATT	2	6	33186	33191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_008505	TAC	2	6	33254	33259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_008505	TTA	2	6	33287	33292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_008505	GTA	2	6	33355	33360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116326575
398	NC_008505	CTT	2	6	33413	33418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326575
399	NC_008505	ATA	2	6	33479	33484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326575
400	NC_008505	TTA	2	6	33865	33870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_008505	ATA	2	6	33932	33937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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404	NC_008505	AGC	2	6	34098	34103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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430	NC_008505	ATA	2	6	35610	35615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_008505	TCT	2	6	36166	36171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116326578
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437	NC_008505	AAT	2	6	36314	36319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116326578
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471	NC_008505	GTT	2	6	39664	39669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
472	NC_008505	TCT	2	6	39899	39904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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491	NC_008505	ATT	2	6	41528	41533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_008505	CAT	2	6	41948	41953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116326582
499	NC_008505	ACC	2	6	41966	41971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116326582
500	NC_008505	ACG	2	6	42156	42161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116326582

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