MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 2

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008499	AGTT	2	8	337	344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008499	AGCA	2	8	631	638	50 %	0 %	25 %	25 %	116334880
3	NC_008499	CTTT	2	8	660	667	0 %	75 %	0 %	25 %	116334880
4	NC_008499	AGTT	2	8	731	738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008499	AAAG	2	8	1290	1297	75 %	0 %	25 %	0 %	116334881
6	NC_008499	CTAA	2	8	1567	1574	50 %	25 %	0 %	25 %	116334881
7	NC_008499	GAAC	2	8	2158	2165	50 %	0 %	25 %	25 %	116334881
8	NC_008499	AAGC	2	8	2899	2906	50 %	0 %	25 %	25 %	116334881
9	NC_008499	ATTA	2	8	2929	2936	50 %	50 %	0 %	0 %	116334881
10	NC_008499	ATGT	2	8	4615	4622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008499	ATTA	2	8	5102	5109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008499	ATGG	2	8	5227	5234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008499	AGCC	2	8	5622	5629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008499	ATTA	2	8	6035	6042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008499	TAAT	2	8	6213	6220	50 %	50 %	0 %	0 %	116334882
16	NC_008499	TCAA	2	8	6330	6337	50 %	25 %	0 %	25 %	116334882
17	NC_008499	CAAT	2	8	6600	6607	50 %	25 %	0 %	25 %	116334882
18	NC_008499	ATTT	2	8	6817	6824	25 %	75 %	0 %	0 %	116334882
19	NC_008499	TTCA	2	8	6920	6927	25 %	50 %	0 %	25 %	116334882
20	NC_008499	CAAA	2	8	7057	7064	75 %	0 %	0 %	25 %	116334882
21	NC_008499	TATT	2	8	7190	7197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008499	ATTT	2	8	7780	7787	25 %	75 %	0 %	0 %	116334883
23	NC_008499	GATA	2	8	7993	8000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008499	GAAA	2	8	8715	8722	75 %	0 %	25 %	0 %	116334884
25	NC_008499	TAAA	2	8	8977	8984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008499	AGCA	2	8	9002	9009	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008499	GCAA	2	8	10098	10105	50 %	0 %	25 %	25 %	116334885
28	NC_008499	AGTT	2	8	10187	10194	25 %	50 %	25 %	0 %	116334885
29	NC_008499	TTGC	2	8	10243	10250	0 %	50 %	25 %	25 %	116334885
30	NC_008499	ACCT	2	8	11513	11520	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008499	TCAA	3	12	12355	12366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008499	TTTC	2	8	12813	12820	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008499	CCAG	2	8	12845	12852	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008499	TTTC	2	8	13203	13210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008499	ATTT	2	8	13295	13302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008499	TTGA	2	8	13349	13356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008499	AAAT	2	8	13704	13711	75 %	25 %	0 %	0 %	116334886
38	NC_008499	CCAG	2	8	14749	14756	25 %	0 %	25 %	50 %	116334886
39	NC_008499	ATTA	2	8	15487	15494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008499	ATTA	2	8	15654	15661	50 %	50 %	0 %	0 %	116334887
41	NC_008499	ATGG	2	8	15779	15786	25 %	25 %	50 %	0 %	116334887
42	NC_008499	AGCC	2	8	16174	16181	25 %	0 %	25 %	50 %	116334887
43	NC_008499	TTGG	2	8	16526	16533	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008499	ATTA	2	8	16588	16595	50 %	50 %	0 %	0 %	116334888
45	NC_008499	ATTT	2	8	16713	16720	25 %	75 %	0 %	0 %	116334888
46	NC_008499	ATTG	2	8	17368	17375	25 %	50 %	25 %	0 %	116334888
47	NC_008499	ATCG	2	8	17745	17752	25 %	25 %	25 %	25 %	116334889
48	NC_008499	ACGG	2	8	17959	17966	25 %	0 %	50 %	25 %	116334889
49	NC_008499	CCTT	2	8	18176	18183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008499	TAAG	2	8	18427	18434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008499	GAGC	2	8	18475	18482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008499	TCAA	2	8	18537	18544	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008499	TTGA	2	8	18685	18692	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008499	TCAA	2	8	18941	18948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008499	ATGA	2	8	19413	19420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008499	CAAA	2	8	19875	19882	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008499	CTTC	2	8	20348	20355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008499	TAAG	2	8	20548	20555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008499	ACGC	2	8	21088	21095	25 %	0 %	25 %	50 %	116334890
60	NC_008499	TGTA	2	8	21232	21239	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008499	GGTC	2	8	22203	22210	0 %	25 %	50 %	25 %	116334892
62	NC_008499	TTTA	2	8	22442	22449	25 %	75 %	0 %	0 %	116334892
63	NC_008499	CACC	2	8	22734	22741	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_008499	AACA	2	8	23002	23009	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008499	CGAC	2	8	23128	23135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008499	TACA	2	8	23849	23856	50 %	25 %	0 %	25 %	116334893
67	NC_008499	TTAT	2	8	24027	24034	25 %	75 %	0 %	0 %	116334893
68	NC_008499	TTGA	2	8	24416	24423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008499	AGAA	2	8	24801	24808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008499	GCCG	2	8	25440	25447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008499	GATT	2	8	25692	25699	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008499	AATC	2	8	26783	26790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008499	AGCC	2	8	27143	27150	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008499	CAAG	2	8	27341	27348	50 %	0 %	25 %	25 %	116334895
75	NC_008499	GATT	2	8	27761	27768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008499	AAAG	2	8	27801	27808	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008499	TTAA	2	8	28023	28030	50 %	50 %	0 %	0 %	116334896
78	NC_008499	ATAA	2	8	28479	28486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008499	CTTG	2	8	28744	28751	0 %	50 %	25 %	25 %	116334898
80	NC_008499	GTAC	2	8	29089	29096	25 %	25 %	25 %	25 %	116334898
81	NC_008499	ACTG	2	8	29525	29532	25 %	25 %	25 %	25 %	116334899
82	NC_008499	CAAT	2	8	29537	29544	50 %	25 %	0 %	25 %	116334899
83	NC_008499	TGAT	2	8	29548	29555	25 %	50 %	25 %	0 %	116334899
84	NC_008499	CAAT	2	8	29886	29893	50 %	25 %	0 %	25 %	116334899
85	NC_008499	TGTC	2	8	30201	30208	0 %	50 %	25 %	25 %	116334899
86	NC_008499	AGAA	2	8	30310	30317	75 %	0 %	25 %	0 %	116334899
87	NC_008499	TTCA	2	8	30694	30701	25 %	50 %	0 %	25 %	116334899
88	NC_008499	AAAC	2	8	32673	32680	75 %	0 %	0 %	25 %	116334899
89	NC_008499	ACTG	2	8	33014	33021	25 %	25 %	25 %	25 %	116334899
90	NC_008499	GGAG	2	8	34009	34016	25 %	0 %	75 %	0 %	116334900
91	NC_008499	TGAT	2	8	34090	34097	25 %	50 %	25 %	0 %	116334900
92	NC_008499	CTTG	2	8	34470	34477	0 %	50 %	25 %	25 %	116334901
93	NC_008499	CTTT	2	8	34669	34676	0 %	75 %	0 %	25 %	116334901
94	NC_008499	TTTC	2	8	34733	34740	0 %	75 %	0 %	25 %	116334901
95	NC_008499	AACA	2	8	35075	35082	75 %	0 %	0 %	25 %	116334901

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.