MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus brevis ATCC 367 plasmid 1

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008498	TTTC	2	8	521	528	0 %	75 %	0 %	25 %	116334868
2	NC_008498	TTCT	2	8	625	632	0 %	75 %	0 %	25 %	116334868
3	NC_008498	TCAT	2	8	941	948	25 %	50 %	0 %	25 %	116334868
4	NC_008498	TTTA	2	8	1048	1055	25 %	75 %	0 %	0 %	116334868
5	NC_008498	TTAA	2	8	1346	1353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008498	GTCC	2	8	1557	1564	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008498	TTAT	2	8	1809	1816	25 %	75 %	0 %	0 %	116334869
8	NC_008498	GTCC	2	8	1931	1938	0 %	25 %	25 %	50 %	116334869
9	NC_008498	AATA	2	8	2215	2222	75 %	25 %	0 %	0 %	116334869
10	NC_008498	ATTT	2	8	3021	3028	25 %	75 %	0 %	0 %	116334870
11	NC_008498	TGAT	2	8	3441	3448	25 %	50 %	25 %	0 %	116334871
12	NC_008498	CTAT	2	8	3480	3487	25 %	50 %	0 %	25 %	116334871
13	NC_008498	TAAT	2	8	4317	4324	50 %	50 %	0 %	0 %	116334871
14	NC_008498	CGCT	2	8	5585	5592	0 %	25 %	25 %	50 %	116334873
15	NC_008498	GTAA	2	8	5838	5845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008498	TTGC	2	8	6206	6213	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008498	GAAC	2	8	6321	6328	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008498	CAAA	2	8	6381	6388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008498	GTGA	2	8	6400	6407	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008498	TCAA	2	8	7460	7467	50 %	25 %	0 %	25 %	116334874
21	NC_008498	TCAG	2	8	7697	7704	25 %	25 %	25 %	25 %	116334874
22	NC_008498	AATC	2	8	8123	8130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008498	CAAC	2	8	8202	8209	50 %	0 %	0 %	50 %	116334875
24	NC_008498	TTCT	2	8	9030	9037	0 %	75 %	0 %	25 %	116334875
25	NC_008498	TCTT	2	8	9456	9463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008498	GCTA	2	8	9530	9537	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008498	AAGC	2	8	10066	10073	50 %	0 %	25 %	25 %	116334876
28	NC_008498	TGCT	2	8	10125	10132	0 %	50 %	25 %	25 %	116334876
29	NC_008498	CAAG	2	8	10198	10205	50 %	0 %	25 %	25 %	116334876
30	NC_008498	CAAG	2	8	10471	10478	50 %	0 %	25 %	25 %	116334876
31	NC_008498	ATTT	2	8	10583	10590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008498	ATTA	2	8	10596	10603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008498	TTCC	2	8	10652	10659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008498	TAAA	2	8	10851	10858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008498	TAGC	2	8	10912	10919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008498	AGAT	2	8	11436	11443	50 %	25 %	25 %	0 %	116334877
37	NC_008498	GAAT	2	8	11695	11702	50 %	25 %	25 %	0 %	116334877
38	NC_008498	TTGC	2	8	12044	12051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008498	TTAA	2	8	12239	12246	50 %	50 %	0 %	0 %	116334878
40	NC_008498	AAAG	2	8	12319	12326	75 %	0 %	25 %	0 %	116334878
41	NC_008498	ATCT	2	8	12543	12550	25 %	50 %	0 %	25 %	116334878
42	NC_008498	TTAT	2	8	12805	12812	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008498	TGAC	2	8	13077	13084	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.