MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293 plasmid pLEUM1

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008496	AAAT	2	8	62	69	75 %	25 %	0 %	0 %	116326494
2	NC_008496	TGAT	2	8	83	90	25 %	50 %	25 %	0 %	116326494
3	NC_008496	AGTT	2	8	161	168	25 %	50 %	25 %	0 %	116326494
4	NC_008496	GTTA	2	8	240	247	25 %	50 %	25 %	0 %	116326494
5	NC_008496	ATAG	2	8	255	262	50 %	25 %	25 %	0 %	116326494
6	NC_008496	AGAA	2	8	655	662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008496	AACC	2	8	982	989	50 %	0 %	0 %	50 %	116326495
8	NC_008496	CAGT	2	8	1312	1319	25 %	25 %	25 %	25 %	116326495
9	NC_008496	GGCT	2	8	1689	1696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008496	AAAG	2	8	2413	2420	75 %	0 %	25 %	0 %	116326496
11	NC_008496	AAAT	2	8	2947	2954	75 %	25 %	0 %	0 %	116326496
12	NC_008496	AGAA	2	8	3118	3125	75 %	0 %	25 %	0 %	116326496
13	NC_008496	CAAG	2	8	3346	3353	50 %	0 %	25 %	25 %	116326496
14	NC_008496	AGGT	2	8	3441	3448	25 %	25 %	50 %	0 %	116326496
15	NC_008496	GATA	2	8	3787	3794	50 %	25 %	25 %	0 %	116326497
16	NC_008496	AAGG	2	8	4016	4023	50 %	0 %	50 %	0 %	116326497
17	NC_008496	ATTA	2	8	4579	4586	50 %	50 %	0 %	0 %	116326498
18	NC_008496	AAAC	2	8	5032	5039	75 %	0 %	0 %	25 %	116326499
19	NC_008496	CAAT	2	8	5581	5588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008496	CTGG	2	8	5773	5780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008496	TCGG	2	8	6113	6120	0 %	25 %	50 %	25 %	116326500
22	NC_008496	CAAT	2	8	6226	6233	50 %	25 %	0 %	25 %	116326500
23	NC_008496	CATT	2	8	6267	6274	25 %	50 %	0 %	25 %	116326500
24	NC_008496	ACAA	2	8	6990	6997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008496	AAAC	2	8	7102	7109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008496	CTTG	2	8	7371	7378	0 %	50 %	25 %	25 %	116326501
27	NC_008496	TAAG	2	8	7392	7399	50 %	25 %	25 %	0 %	116326501
28	NC_008496	TCAC	2	8	7782	7789	25 %	25 %	0 %	50 %	116326501
29	NC_008496	CGAA	2	8	7993	8000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008496	ACAA	2	8	8146	8153	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008496	CCAA	2	8	8286	8293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008496	GACT	2	8	8621	8628	25 %	25 %	25 %	25 %	116326502
33	NC_008496	TGGT	2	8	8654	8661	0 %	50 %	50 %	0 %	116326502
34	NC_008496	CACG	2	8	8684	8691	25 %	0 %	25 %	50 %	116326502
35	NC_008496	AGCC	2	8	8787	8794	25 %	0 %	25 %	50 %	116326502
36	NC_008496	GTTC	2	8	9474	9481	0 %	50 %	25 %	25 %	116326503
37	NC_008496	GATC	2	8	10066	10073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008496	AATT	2	8	10298	10305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008496	AATT	2	8	10562	10569	50 %	50 %	0 %	0 %	116326504
40	NC_008496	AATT	2	8	10991	10998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008496	TGTT	2	8	11330	11337	0 %	75 %	25 %	0 %	116326505
42	NC_008496	AATA	2	8	11579	11586	75 %	25 %	0 %	0 %	116326505
43	NC_008496	TATC	2	8	11612	11619	25 %	50 %	0 %	25 %	116326505
44	NC_008496	TATT	2	8	11750	11757	25 %	75 %	0 %	0 %	116326505
45	NC_008496	ACAA	2	8	11843	11850	75 %	0 %	0 %	25 %	116326505
46	NC_008496	TTGC	2	8	12068	12075	0 %	50 %	25 %	25 %	116326505
47	NC_008496	GTTA	2	8	12361	12368	25 %	50 %	25 %	0 %	116326506
48	NC_008496	TGGG	2	8	12851	12858	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008496	ATTA	2	8	12956	12963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008496	AACT	2	8	13403	13410	50 %	25 %	0 %	25 %	116326507
51	NC_008496	TAAA	2	8	13983	13990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008496	TTTC	2	8	14588	14595	0 %	75 %	0 %	25 %	116326508
53	NC_008496	CAAT	2	8	15765	15772	50 %	25 %	0 %	25 %	116326509
54	NC_008496	TAAT	2	8	15848	15855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008496	ACCA	2	8	16169	16176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008496	TGAA	2	8	16242	16249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008496	TGAA	2	8	16364	16371	50 %	25 %	25 %	0 %	116326510
58	NC_008496	TAAT	2	8	16372	16379	50 %	50 %	0 %	0 %	116326510
59	NC_008496	TGAC	2	8	17057	17064	25 %	25 %	25 %	25 %	116326511
60	NC_008496	AGTT	2	8	17319	17326	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008496	TAAT	2	8	17354	17361	50 %	50 %	0 %	0 %	116326512
62	NC_008496	ATTA	2	8	17447	17454	50 %	50 %	0 %	0 %	116326512
63	NC_008496	GTCA	2	8	17678	17685	25 %	25 %	25 %	25 %	116326512
64	NC_008496	TAAT	2	8	18807	18814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008496	ACAA	2	8	19102	19109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008496	GACG	2	8	19325	19332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008496	TCAA	2	8	19426	19433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008496	AATG	2	8	20104	20111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008496	AGAA	2	8	20215	20222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008496	CAAT	2	8	21408	21415	50 %	25 %	0 %	25 %	116326515
71	NC_008496	TAAA	2	8	21480	21487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008496	ACCA	2	8	21716	21723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008496	TGAA	2	8	21789	21796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008496	CGCT	2	8	22510	22517	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008496	TGAC	2	8	22607	22614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008496	GCAA	2	8	23708	23715	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008496	TTTA	2	8	24109	24116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008496	TTTG	2	8	24433	24440	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008496	ATTA	2	8	25002	25009	50 %	50 %	0 %	0 %	116326517
80	NC_008496	ATAC	2	8	25479	25486	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008496	AATC	2	8	26046	26053	50 %	25 %	0 %	25 %	116326518
82	NC_008496	TTTG	2	8	26219	26226	0 %	75 %	25 %	0 %	116326518
83	NC_008496	TAAA	2	8	27129	27136	75 %	25 %	0 %	0 %	116326518
84	NC_008496	TGAG	2	8	27311	27318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008496	TTTG	2	8	28165	28172	0 %	75 %	25 %	0 %	116326519
86	NC_008496	TTCT	2	8	28318	28325	0 %	75 %	0 %	25 %	116326519
87	NC_008496	GGCA	2	8	28498	28505	25 %	0 %	50 %	25 %	116326519
88	NC_008496	GTCA	2	8	29171	29178	25 %	25 %	25 %	25 %	116326520
89	NC_008496	ATTA	2	8	29856	29863	50 %	50 %	0 %	0 %	116326521
90	NC_008496	TTCA	2	8	29864	29871	25 %	50 %	0 %	25 %	116326521
91	NC_008496	TTCA	2	8	29986	29993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008496	TTGG	2	8	30058	30065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008496	CAAA	2	8	30827	30834	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008496	TCAT	2	8	32332	32339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008496	AGTA	2	8	32360	32367	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008496	TCCA	2	8	32852	32859	25 %	25 %	0 %	50 %	116326524
97	NC_008496	TAAT	2	8	33382	33389	50 %	50 %	0 %	0 %	116326524
98	NC_008496	ATCA	2	8	33965	33972	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008496	GTCA	2	8	34275	34282	25 %	25 %	25 %	25 %	116326525
100	NC_008496	ATTA	2	8	34960	34967	50 %	50 %	0 %	0 %	116326526
101	NC_008496	TTCA	2	8	34968	34975	25 %	50 %	0 %	25 %	116326526
102	NC_008496	TTCA	2	8	35091	35098	25 %	50 %	0 %	25 %	116326526
103	NC_008496	TTGG	2	8	35163	35170	0 %	50 %	50 %	0 %	116326526
104	NC_008496	AAGA	2	8	35280	35287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008496	GCCA	2	8	35568	35575	25 %	0 %	25 %	50 %	116326527
106	NC_008496	AATT	2	8	35873	35880	50 %	50 %	0 %	0 %	116326528
107	NC_008496	TCAA	2	8	36075	36082	50 %	25 %	0 %	25 %	116326528
108	NC_008496	ATAA	2	8	36337	36344	75 %	25 %	0 %	0 %	116326528
109	NC_008496	TTTA	2	8	36362	36369	25 %	75 %	0 %	0 %	116326528
110	NC_008496	ATTA	2	8	37131	37138	50 %	50 %	0 %	0 %	116326528

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.