MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008014	AT	3	6	83	88	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008014	TA	4	8	92	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008014	AT	3	6	402	407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008014	AT	3	6	422	427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008014	TA	3	6	1619	1624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008014	AT	3	6	1983	1988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008014	TA	8	16	2528	2543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008014	TA	3	6	2611	2616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008014	CA	3	6	2771	2776	50 %	0 %	0 %	50 %	94972400
10	NC_008014	AT	3	6	2993	2998	50 %	50 %	0 %	0 %	94972400
11	NC_008014	AT	3	6	3077	3082	50 %	50 %	0 %	0 %	94972400
12	NC_008014	TA	3	6	3201	3206	50 %	50 %	0 %	0 %	94972400
13	NC_008014	TG	3	6	3533	3538	0 %	50 %	50 %	0 %	94972400
14	NC_008014	TA	3	6	3623	3628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008014	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008014	TG	3	6	4081	4086	0 %	50 %	50 %	0 %	94972401
17	NC_008014	CT	3	6	4516	4521	0 %	50 %	0 %	50 %	94972401
18	NC_008014	GT	3	6	4589	4594	0 %	50 %	50 %	0 %	94972401
19	NC_008014	CA	3	6	5602	5607	50 %	0 %	0 %	50 %	94972402
20	NC_008014	TG	3	6	6210	6215	0 %	50 %	50 %	0 %	94972403
21	NC_008014	TA	3	6	6483	6488	50 %	50 %	0 %	0 %	94972403
22	NC_008014	AT	3	6	6553	6558	50 %	50 %	0 %	0 %	94972403
23	NC_008014	TA	4	8	6596	6603	50 %	50 %	0 %	0 %	94972403
24	NC_008014	AG	3	6	6654	6659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008014	TA	3	6	7094	7099	50 %	50 %	0 %	0 %	94972404
26	NC_008014	TG	3	6	7555	7560	0 %	50 %	50 %	0 %	94972404
27	NC_008014	TA	3	6	7613	7618	50 %	50 %	0 %	0 %	94972404
28	NC_008014	TA	3	6	7629	7634	50 %	50 %	0 %	0 %	94972404
29	NC_008014	AT	3	6	7832	7837	50 %	50 %	0 %	0 %	94972405
30	NC_008014	TA	3	6	7842	7847	50 %	50 %	0 %	0 %	94972405
31	NC_008014	TA	4	8	7871	7878	50 %	50 %	0 %	0 %	94972405
32	NC_008014	AT	3	6	8477	8482	50 %	50 %	0 %	0 %	94972405
33	NC_008014	AT	3	6	9239	9244	50 %	50 %	0 %	0 %	94972405
34	NC_008014	TA	3	6	9361	9366	50 %	50 %	0 %	0 %	94972405
35	NC_008014	TA	3	6	11476	11481	50 %	50 %	0 %	0 %	94972407
36	NC_008014	TA	3	6	12021	12026	50 %	50 %	0 %	0 %	94972407
37	NC_008014	TA	3	6	12393	12398	50 %	50 %	0 %	0 %	94972407
38	NC_008014	TA	3	6	12726	12731	50 %	50 %	0 %	0 %	94972407
39	NC_008014	AT	3	6	13384	13389	50 %	50 %	0 %	0 %	94972407
40	NC_008014	AT	3	6	13949	13954	50 %	50 %	0 %	0 %	94972407
41	NC_008014	AC	3	6	14198	14203	50 %	0 %	0 %	50 %	94972407
42	NC_008014	TA	3	6	14460	14465	50 %	50 %	0 %	0 %	94972407
43	NC_008014	TA	3	6	14698	14703	50 %	50 %	0 %	0 %	94972408
44	NC_008014	AG	3	6	14708	14713	50 %	0 %	50 %	0 %	94972408
45	NC_008014	TA	3	6	14777	14782	50 %	50 %	0 %	0 %	94972408
46	NC_008014	TG	4	8	15221	15228	0 %	50 %	50 %	0 %	94972408
47	NC_008014	AT	3	6	15809	15814	50 %	50 %	0 %	0 %	94972409
48	NC_008014	GA	4	8	16099	16106	50 %	0 %	50 %	0 %	94972409
49	NC_008014	TA	3	6	16352	16357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008014	AT	3	6	18332	18337	50 %	50 %	0 %	0 %	94972411
51	NC_008014	GA	3	6	18769	18774	50 %	0 %	50 %	0 %	94972412
52	NC_008014	TA	6	12	18786	18797	50 %	50 %	0 %	0 %	94972412
53	NC_008014	GT	3	6	18859	18864	0 %	50 %	50 %	0 %	94972412
54	NC_008014	GT	3	6	19196	19201	0 %	50 %	50 %	0 %	94972412
55	NC_008014	AG	3	6	20166	20171	50 %	0 %	50 %	0 %	94972413
56	NC_008014	CA	3	6	20218	20223	50 %	0 %	0 %	50 %	94972413
57	NC_008014	AT	3	6	20406	20411	50 %	50 %	0 %	0 %	94972413
58	NC_008014	AG	3	6	20525	20530	50 %	0 %	50 %	0 %	94972413
59	NC_008014	AG	4	8	20721	20728	50 %	0 %	50 %	0 %	94972413
60	NC_008014	TA	3	6	21768	21773	50 %	50 %	0 %	0 %	94972415
61	NC_008014	TA	3	6	22925	22930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008014	TA	3	6	23135	23140	50 %	50 %	0 %	0 %	94972417
63	NC_008014	GT	3	6	23393	23398	0 %	50 %	50 %	0 %	94972417
64	NC_008014	AT	3	6	23806	23811	50 %	50 %	0 %	0 %	94972417
65	NC_008014	GA	3	6	24439	24444	50 %	0 %	50 %	0 %	94972417
66	NC_008014	AT	3	6	25528	25533	50 %	50 %	0 %	0 %	94972417
67	NC_008014	TA	3	6	25637	25642	50 %	50 %	0 %	0 %	94972417
68	NC_008014	AT	3	6	25835	25840	50 %	50 %	0 %	0 %	94972417
69	NC_008014	AG	3	6	25996	26001	50 %	0 %	50 %	0 %	94972417
70	NC_008014	TA	3	6	26092	26097	50 %	50 %	0 %	0 %	94972417
71	NC_008014	TA	3	6	26424	26429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008014	CT	3	6	26492	26497	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008014	TA	3	6	26551	26556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008014	AT	3	6	26665	26670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008014	AT	3	6	26760	26765	50 %	50 %	0 %	0 %	94972418
76	NC_008014	CT	3	6	26851	26856	0 %	50 %	0 %	50 %	94972418
77	NC_008014	TA	3	6	26973	26978	50 %	50 %	0 %	0 %	94972418
78	NC_008014	AT	3	6	27684	27689	50 %	50 %	0 %	0 %	94972418
79	NC_008014	TA	3	6	27984	27989	50 %	50 %	0 %	0 %	94972418
80	NC_008014	AG	3	6	28071	28076	50 %	0 %	50 %	0 %	94972418
81	NC_008014	AG	3	6	28337	28342	50 %	0 %	50 %	0 %	94972419
82	NC_008014	TA	6	12	29228	29239	50 %	50 %	0 %	0 %	94972420
83	NC_008014	TA	3	6	29316	29321	50 %	50 %	0 %	0 %	94972420
84	NC_008014	TA	3	6	29495	29500	50 %	50 %	0 %	0 %	94972420
85	NC_008014	AG	3	6	29943	29948	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008014	GT	4	8	30577	30584	0 %	50 %	50 %	0 %	94972421
87	NC_008014	TG	4	8	30819	30826	0 %	50 %	50 %	0 %	94972421
88	NC_008014	TC	3	6	31125	31130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008014	GA	3	6	31252	31257	50 %	0 %	50 %	0 %	94972422
90	NC_008014	GA	3	6	32012	32017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008014	TA	3	6	32034	32039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008014	TA	3	6	32084	32089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008014	TA	3	6	32150	32155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008014	TA	3	6	32161	32166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008014	TA	3	6	32184	32189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008014	TA	3	6	32205	32210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008014	GT	3	6	34176	34181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008014	AT	3	6	34570	34575	50 %	50 %	0 %	0 %	94972425
99	NC_008014	AT	3	6	35422	35427	50 %	50 %	0 %	0 %	94972425
100	NC_008014	TA	7	14	35467	35480	50 %	50 %	0 %	0 %	94972425
101	NC_008014	AT	3	6	35574	35579	50 %	50 %	0 %	0 %	94972425
102	NC_008014	GT	3	6	35604	35609	0 %	50 %	50 %	0 %	94972425
103	NC_008014	TA	3	6	35694	35699	50 %	50 %	0 %	0 %	94972425
104	NC_008014	TA	3	6	35867	35872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008014	TA	3	6	36063	36068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008014	TA	4	8	36157	36164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008014	AC	3	6	36313	36318	50 %	0 %	0 %	50 %	94972426
108	NC_008014	CT	3	6	36391	36396	0 %	50 %	0 %	50 %	94972426
109	NC_008014	AC	4	8	37337	37344	50 %	0 %	0 %	50 %	94972426
110	NC_008014	TA	7	14	37380	37393	50 %	50 %	0 %	0 %	94972426
111	NC_008014	AT	3	6	37536	37541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008014	AC	3	6	38157	38162	50 %	0 %	0 %	50 %	94972427
113	NC_008014	AT	3	6	38346	38351	50 %	50 %	0 %	0 %	94972427
114	NC_008014	AT	3	6	38507	38512	50 %	50 %	0 %	0 %	94972427
115	NC_008014	AT	3	6	39131	39136	50 %	50 %	0 %	0 %	94972427
116	NC_008014	AG	3	6	39552	39557	50 %	0 %	50 %	0 %	94972427
117	NC_008014	TA	3	6	40014	40019	50 %	50 %	0 %	0 %	94972428
118	NC_008014	TA	3	6	41260	41265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008014	AC	3	6	41321	41326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008014	TA	3	6	41455	41460	50 %	50 %	0 %	0 %	94972429
121	NC_008014	TA	3	6	41655	41660	50 %	50 %	0 %	0 %	94972429
122	NC_008014	TA	3	6	41742	41747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008014	TA	3	6	41798	41803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008014	TA	3	6	42763	42768	50 %	50 %	0 %	0 %	94972430
125	NC_008014	TC	3	6	42839	42844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008014	AT	3	6	43345	43350	50 %	50 %	0 %	0 %	94972431
127	NC_008014	TG	3	6	43796	43801	0 %	50 %	50 %	0 %	94972432
128	NC_008014	AT	4	8	44216	44223	50 %	50 %	0 %	0 %	94972432
129	NC_008014	TA	3	6	44276	44281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008014	TG	3	6	44608	44613	0 %	50 %	50 %	0 %	94972433
131	NC_008014	AT	3	6	46180	46185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008014	TA	3	6	46648	46653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008014	TA	3	6	46886	46891	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
134	NC_008014	TA	3	6	46903	46908	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
135	NC_008014	CT	3	6	47044	47049	0 %	50 %	0 %	50 %	94972435
136	NC_008014	AT	3	6	47243	47248	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
137	NC_008014	TA	3	6	48016	48021	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
138	NC_008014	AC	3	6	48825	48830	50 %	0 %	0 %	50 %	94972435
139	NC_008014	TC	3	6	49989	49994	0 %	50 %	0 %	50 %	94972435
140	NC_008014	AT	3	6	51366	51371	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
141	NC_008014	AT	3	6	51582	51587	50 %	50 %	0 %	0 %	94972435
142	NC_008014	AC	3	6	51724	51729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008014	AT	3	6	51815	51820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008014	AT	3	6	52529	52534	50 %	50 %	0 %	0 %	94972436
145	NC_008014	CA	4	8	53174	53181	50 %	0 %	0 %	50 %	94972436
146	NC_008014	AC	3	6	53514	53519	50 %	0 %	0 %	50 %	94972437
147	NC_008014	CT	3	6	54774	54779	0 %	50 %	0 %	50 %	94972437
148	NC_008014	TA	3	6	55686	55691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008014	TA	3	6	55796	55801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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