MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 3333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008014	ACA	2	6	100	105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008014	CCT	2	6	130	135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008014	AGG	2	6	168	173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008014	ATT	2	6	189	194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008014	GAA	2	6	305	310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008014	ATT	2	6	532	537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972399
7	NC_008014	TTC	2	6	539	544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972399
8	NC_008014	TCA	2	6	576	581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972399
9	NC_008014	AAG	2	6	607	612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972399
10	NC_008014	AAG	2	6	709	714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972399
11	NC_008014	TTA	2	6	717	722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972399
12	NC_008014	ATG	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972399
13	NC_008014	CTA	2	6	778	783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972399
14	NC_008014	TCA	2	6	839	844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972399
15	NC_008014	TAT	2	6	920	925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972399
16	NC_008014	TAG	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972399
17	NC_008014	GAT	2	6	1088	1093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972399
18	NC_008014	CAT	2	6	1105	1110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972399
19	NC_008014	GTT	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972399
20	NC_008014	AGA	2	6	1160	1165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972399
21	NC_008014	CTG	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972399
22	NC_008014	ATA	2	6	1615	1620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008014	AAT	2	6	1648	1653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008014	AAT	2	6	1746	1751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008014	CTT	2	6	1773	1778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008014	TGA	2	6	1786	1791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008014	AAT	2	6	1802	1807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008014	TCC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008014	CAG	3	9	1843	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008014	AGC	2	6	2057	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008014	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008014	CTC	2	6	2389	2394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008014	CTT	2	6	2397	2402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008014	TAT	2	6	2415	2420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008014	TGT	2	6	2509	2514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008014	ATA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008014	AGA	2	6	2683	2688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972400
38	NC_008014	TCT	2	6	2729	2734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972400
39	NC_008014	CAT	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972400
40	NC_008014	AAG	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972400
41	NC_008014	ACA	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972400
42	NC_008014	ACA	3	9	3004	3012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972400
43	NC_008014	GGA	2	6	3065	3070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972400
44	NC_008014	ATT	2	6	3085	3090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972400
45	NC_008014	CAC	2	6	3120	3125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972400
46	NC_008014	TGA	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972400
47	NC_008014	ACA	2	6	3319	3324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972400
48	NC_008014	AGA	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972400
49	NC_008014	TAT	2	6	3661	3666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008014	CTG	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008014	TAA	2	6	3713	3718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008014	CTC	2	6	3732	3737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008014	GGA	3	9	3739	3747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008014	TGG	3	9	3804	3812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972401
55	NC_008014	TTG	2	6	3866	3871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972401
56	NC_008014	TCA	2	6	3989	3994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972401
57	NC_008014	TTA	2	6	4054	4059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972401
58	NC_008014	CAG	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972401
59	NC_008014	TTG	2	6	4187	4192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972401
60	NC_008014	GTT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972401
61	NC_008014	ATT	2	6	4321	4326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972401
62	NC_008014	AGA	2	6	4392	4397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972401
63	NC_008014	ACA	2	6	4398	4403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972401
64	NC_008014	GAA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972401
65	NC_008014	GAA	2	6	4666	4671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972401
66	NC_008014	AAT	2	6	4693	4698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972401
67	NC_008014	GCT	2	6	4768	4773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972401
68	NC_008014	ACA	2	6	4803	4808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972401
69	NC_008014	CTT	2	6	4828	4833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972401
70	NC_008014	ATG	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972401
71	NC_008014	ACA	2	6	4851	4856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972401
72	NC_008014	ATT	2	6	4878	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008014	TCT	2	6	4917	4922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008014	TAT	2	6	4939	4944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008014	CCT	2	6	4952	4957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008014	AAC	2	6	5209	5214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972402
77	NC_008014	TTC	3	9	5261	5269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972402
78	NC_008014	CAA	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972402
79	NC_008014	AGA	2	6	5422	5427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972402
80	NC_008014	CCA	2	6	5448	5453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972402
81	NC_008014	TAT	2	6	5520	5525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972402
82	NC_008014	TCT	2	6	5658	5663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008014	TCC	2	6	6014	6019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972403
84	NC_008014	GTG	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972403
85	NC_008014	TGT	2	6	6044	6049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972403
86	NC_008014	TTC	2	6	6169	6174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972403
87	NC_008014	TAT	2	6	6176	6181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972403
88	NC_008014	GCT	2	6	6189	6194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972403
89	NC_008014	ATC	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972403
90	NC_008014	TAT	3	9	6383	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972403
91	NC_008014	CTT	2	6	6445	6450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972403
92	NC_008014	AAC	2	6	6517	6522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972403
93	NC_008014	AGA	2	6	6545	6550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972403
94	NC_008014	TCT	2	6	6669	6674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008014	ATA	2	6	6726	6731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008014	ACA	2	6	6736	6741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008014	TCT	2	6	6749	6754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008014	ATT	2	6	6809	6814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008014	ATT	2	6	6826	6831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008014	TAT	2	6	6850	6855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972404
101	NC_008014	ATT	2	6	6938	6943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972404
102	NC_008014	GAC	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972404
103	NC_008014	ACA	2	6	7021	7026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972404
104	NC_008014	CAA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972404
105	NC_008014	TGA	2	6	7114	7119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972404
106	NC_008014	TGT	2	6	7180	7185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972404
107	NC_008014	TTC	2	6	7347	7352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972404
108	NC_008014	ACC	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972404
109	NC_008014	ATT	2	6	7410	7415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972404
110	NC_008014	GTA	2	6	7717	7722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972404
111	NC_008014	AAT	2	6	7780	7785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008014	AGC	3	9	7895	7903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972405
113	NC_008014	TAC	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972405
114	NC_008014	TCA	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972405
115	NC_008014	ATG	2	6	8068	8073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972405
116	NC_008014	TGG	2	6	8076	8081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972405
117	NC_008014	ACA	2	6	8228	8233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972405
118	NC_008014	TCA	2	6	8255	8260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972405
119	NC_008014	AGA	2	6	8423	8428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972405
120	NC_008014	CAT	2	6	8521	8526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972405
121	NC_008014	GAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972405
122	NC_008014	TGC	2	6	8654	8659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972405
123	NC_008014	TCC	2	6	8669	8674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972405
124	NC_008014	GAA	2	6	8740	8745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972405
125	NC_008014	TGT	2	6	8774	8779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972405
126	NC_008014	TAC	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972405
127	NC_008014	ATA	2	6	8833	8838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972405
128	NC_008014	CCT	2	6	9072	9077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972405
129	NC_008014	CAG	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972405
130	NC_008014	TAG	3	9	9109	9117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972405
131	NC_008014	ATG	2	6	9121	9126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972405
132	NC_008014	ATT	2	6	9149	9154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972405
133	NC_008014	CTT	2	6	9204	9209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972405
134	NC_008014	TTA	2	6	9228	9233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972405
135	NC_008014	CAG	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972405
136	NC_008014	AGA	2	6	9299	9304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972405
137	NC_008014	TTC	2	6	9374	9379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972405
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