MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 5697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008014	T	7	7	120852	120858	0 %	100 %	0 %	0 %	94972463
3502	NC_008014	TGTA	2	8	120868	120875	25 %	50 %	25 %	0 %	94972463
3503	NC_008014	TA	4	8	120900	120907	50 %	50 %	0 %	0 %	94972463
3504	NC_008014	ATA	2	6	120950	120955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972463
3505	NC_008014	GT	3	6	121011	121016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_008014	ATTTT	2	10	121024	121033	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_008014	T	6	6	121030	121035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_008014	AT	3	6	121037	121042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_008014	ATATT	2	10	121051	121060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_008014	TTTA	2	8	121064	121071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_008014	TAA	2	6	121090	121095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_008014	T	6	6	121127	121132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_008014	GATA	2	8	121152	121159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_008014	A	6	6	121159	121164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_008014	GAA	2	6	121165	121170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_008014	GTA	2	6	121196	121201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_008014	T	6	6	121208	121213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_008014	A	6	6	121217	121222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_008014	ATA	2	6	121272	121277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_008014	TCTA	2	8	121288	121295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_008014	ATA	2	6	121297	121302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008014	AGT	2	6	121362	121367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008014	AGG	2	6	121371	121376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008014	T	6	6	121377	121382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008014	TTG	2	6	121412	121417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008014	AAT	2	6	121420	121425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008014	AT	3	6	121442	121447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008014	TAT	2	6	121454	121459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008014	AT	3	6	121464	121469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_008014	AGA	2	6	121500	121505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_008014	ATG	2	6	121542	121547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_008014	AT	3	6	121555	121560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_008014	ATA	2	6	121568	121573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_008014	TTAT	2	8	121604	121611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_008014	TAT	2	6	121615	121620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_008014	T	6	6	121622	121627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_008014	T	6	6	121640	121645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_008014	ACA	2	6	121668	121673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_008014	TAT	2	6	121692	121697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_008014	TA	3	6	121719	121724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_008014	A	6	6	121736	121741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_008014	CTTTAT	2	12	121769	121780	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3543	NC_008014	T	7	7	121783	121789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_008014	TTC	2	6	121803	121808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_008014	T	6	6	121813	121818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_008014	ATT	2	6	121938	121943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_008014	GAAA	2	8	121944	121951	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008014	G	6	6	121974	121979	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008014	AGA	2	6	122033	122038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
3550	NC_008014	CCT	2	6	122094	122099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972464
3551	NC_008014	AGG	2	6	122152	122157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972464
3552	NC_008014	ACG	2	6	122162	122167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972464
3553	NC_008014	TGAT	2	8	122194	122201	25 %	50 %	25 %	0 %	94972464
3554	NC_008014	CTG	3	9	122248	122256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972464
3555	NC_008014	CTT	2	6	122274	122279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972464
3556	NC_008014	GAATG	2	10	122285	122294	40 %	20 %	40 %	0 %	94972464
3557	NC_008014	ATAC	2	8	122330	122337	50 %	25 %	0 %	25 %	94972464
3558	NC_008014	AATATA	2	12	122347	122358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972464
3559	NC_008014	CAA	2	6	122383	122388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972464
3560	NC_008014	GCA	2	6	122415	122420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972464
3561	NC_008014	ATGGA	2	10	122443	122452	40 %	20 %	40 %	0 %	94972464
3562	NC_008014	TAC	2	6	122474	122479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972464
3563	NC_008014	AAG	2	6	122493	122498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
3564	NC_008014	TCT	2	6	122607	122612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972464
3565	NC_008014	A	8	8	122648	122655	100 %	0 %	0 %	0 %	94972464
3566	NC_008014	ACA	2	6	122663	122668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972464
3567	NC_008014	AAG	2	6	122776	122781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
3568	NC_008014	GAA	2	6	122823	122828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
3569	NC_008014	CGTG	2	8	122904	122911	0 %	25 %	50 %	25 %	94972464
3570	NC_008014	AGG	2	6	123049	123054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972464
3571	NC_008014	TTA	2	6	123094	123099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972464
3572	NC_008014	AAG	2	6	123105	123110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972464
3573	NC_008014	AAT	2	6	123118	123123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972464
3574	NC_008014	GAA	2	6	123182	123187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008014	GCA	2	6	123221	123226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972465
3576	NC_008014	TGGC	2	8	123262	123269	0 %	25 %	50 %	25 %	94972465
3577	NC_008014	AGTA	2	8	123370	123377	50 %	25 %	25 %	0 %	94972465
3578	NC_008014	GAT	2	6	123398	123403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972465
3579	NC_008014	TA	3	6	123414	123419	50 %	50 %	0 %	0 %	94972465
3580	NC_008014	GCA	2	6	123446	123451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972465
3581	NC_008014	TGA	2	6	123463	123468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972465
3582	NC_008014	CTT	2	6	123482	123487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972465
3583	NC_008014	ACA	2	6	123500	123505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972465
3584	NC_008014	T	7	7	123526	123532	0 %	100 %	0 %	0 %	94972465
3585	NC_008014	AAC	2	6	123580	123585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972465
3586	NC_008014	TGT	5	15	123628	123642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972465
3587	NC_008014	TTG	2	6	123665	123670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972465
3588	NC_008014	GTTC	2	8	123833	123840	0 %	50 %	25 %	25 %	94972465
3589	NC_008014	GGA	2	6	123908	123913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972465
3590	NC_008014	CTTGGT	2	12	123920	123931	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	94972465
3591	NC_008014	AAG	2	6	123942	123947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972465
3592	NC_008014	GTT	2	6	123959	123964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972465
3593	NC_008014	CAA	2	6	124050	124055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972465
3594	NC_008014	ATTG	2	8	124058	124065	25 %	50 %	25 %	0 %	94972465
3595	NC_008014	TTGG	2	8	124069	124076	0 %	50 %	50 %	0 %	94972465
3596	NC_008014	TGA	2	6	124149	124154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972466
3597	NC_008014	ATCA	2	8	124192	124199	50 %	25 %	0 %	25 %	94972466
3598	NC_008014	ACC	2	6	124260	124265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972466
3599	NC_008014	TTC	2	6	124268	124273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972466
3600	NC_008014	TAG	2	6	124280	124285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972466
3601	NC_008014	CGT	2	6	124331	124336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972466
3602	NC_008014	GTC	2	6	124438	124443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972466
3603	NC_008014	AGCAT	2	10	124533	124542	40 %	20 %	20 %	20 %	94972466
3604	NC_008014	AT	3	6	124541	124546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_008014	TGT	2	6	124557	124562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972467
3606	NC_008014	AGA	2	6	124570	124575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972467
3607	NC_008014	TGG	2	6	124636	124641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972467
3608	NC_008014	TGT	2	6	124666	124671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972467
3609	NC_008014	GA	3	6	124707	124712	50 %	0 %	50 %	0 %	94972467
3610	NC_008014	TTG	2	6	124769	124774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972467
3611	NC_008014	AGC	2	6	124780	124785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972467
3612	NC_008014	ACA	2	6	124928	124933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972467
3613	NC_008014	ACA	2	6	124957	124962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972467
3614	NC_008014	TAT	2	6	125135	125140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972467
3615	NC_008014	CTT	2	6	125174	125179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972467
3616	NC_008014	ACA	2	6	125201	125206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_008014	A	6	6	125263	125268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_008014	TTA	2	6	125399	125404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972468
3619	NC_008014	TTA	2	6	125470	125475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972468
3620	NC_008014	TTTGGT	2	12	125476	125487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972468
3621	NC_008014	CATG	2	8	125517	125524	25 %	25 %	25 %	25 %	94972468
3622	NC_008014	CAG	2	6	125588	125593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972468
3623	NC_008014	GAT	2	6	125680	125685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972468
3624	NC_008014	TTG	2	6	125729	125734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972468
3625	NC_008014	TCT	2	6	125836	125841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972468
3626	NC_008014	GTG	2	6	125876	125881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94972468
3627	NC_008014	AGC	2	6	125904	125909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972468
3628	NC_008014	ACA	2	6	125956	125961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972468
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