MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 5697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008014	TGT	2	6	57391	57396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972438
1502	NC_008014	AATT	2	8	57399	57406	50 %	50 %	0 %	0 %	94972438
1503	NC_008014	CTTGTT	2	12	57407	57418	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	94972438
1504	NC_008014	TGTA	2	8	57421	57428	25 %	50 %	25 %	0 %	94972438
1505	NC_008014	TTG	2	6	57429	57434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972438
1506	NC_008014	ATA	2	6	57482	57487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972438
1507	NC_008014	TTA	2	6	57511	57516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972438
1508	NC_008014	ATA	2	6	57553	57558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972438
1509	NC_008014	AAAT	2	8	57578	57585	75 %	25 %	0 %	0 %	94972438
1510	NC_008014	AAT	2	6	57588	57593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972438
1511	NC_008014	TAG	2	6	57611	57616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972438
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1513	NC_008014	A	7	7	57632	57638	100 %	0 %	0 %	0 %	94972438
1514	NC_008014	T	6	6	57653	57658	0 %	100 %	0 %	0 %	94972438
1515	NC_008014	AT	7	14	57666	57679	50 %	50 %	0 %	0 %	94972438
1516	NC_008014	AT	3	6	57690	57695	50 %	50 %	0 %	0 %	94972438
1517	NC_008014	ATA	2	6	57707	57712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972438
1518	NC_008014	TA	3	6	57711	57716	50 %	50 %	0 %	0 %	94972438
1519	NC_008014	ATT	2	6	57750	57755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_008014	TAAA	2	8	57771	57778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008014	A	7	7	57776	57782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_008014	ATA	2	6	57794	57799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008014	AAT	2	6	57829	57834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_008014	TTA	2	6	57838	57843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008014	TAA	2	6	57863	57868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008014	TAA	2	6	57877	57882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008014	AAAGAA	2	12	57921	57932	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1529	NC_008014	CTA	2	6	57949	57954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_008014	ATAA	2	8	57998	58005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_008014	TA	3	6	58047	58052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008014	ATA	2	6	58070	58075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008014	GAAAA	2	10	58076	58085	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_008014	ATAG	2	8	58088	58095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1537	NC_008014	TTA	2	6	58155	58160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_008014	TTA	2	6	58203	58208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_008014	A	6	6	58237	58242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1542	NC_008014	ATT	2	6	58263	58268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008014	ATATT	2	10	58295	58304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_008014	TGA	2	6	58313	58318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_008014	TGT	2	6	58383	58388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1550	NC_008014	T	6	6	58641	58646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008014	AT	3	6	58672	58677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008014	TA	3	6	58703	58708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008014	TAA	2	6	58734	58739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008014	A	6	6	58756	58761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008014	AAC	2	6	58806	58811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_008014	ATA	2	6	58836	58841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1558	NC_008014	TAT	2	6	58915	58920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_008014	T	7	7	58979	58985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_008014	TTTCT	2	10	59031	59040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1564	NC_008014	TGA	2	6	59076	59081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008014	GTA	2	6	59129	59134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_008014	TTA	2	6	60185	60190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1603	NC_008014	AAT	2	6	60249	60254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1610	NC_008014	CA	3	6	60647	60652	50 %	0 %	0 %	50 %	94972439
1611	NC_008014	TG	3	6	60702	60707	0 %	50 %	50 %	0 %	94972439
1612	NC_008014	AT	3	6	60714	60719	50 %	50 %	0 %	0 %	94972439
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1618	NC_008014	T	6	6	61223	61228	0 %	100 %	0 %	0 %	94972439
1619	NC_008014	CTTT	2	8	61230	61237	0 %	75 %	0 %	25 %	94972439
1620	NC_008014	T	7	7	61255	61261	0 %	100 %	0 %	0 %	94972439
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1628	NC_008014	GATG	2	8	61617	61624	25 %	25 %	50 %	0 %	94972439
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1635	NC_008014	TTG	5	15	61823	61837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972439
1636	NC_008014	ATAC	2	8	61870	61877	50 %	25 %	0 %	25 %	94972439
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1638	NC_008014	GGC	2	6	61914	61919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94972439
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1762	NC_008014	ATA	3	9	65197	65205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1766	NC_008014	A	6	6	65391	65396	100 %	0 %	0 %	0 %	94972441
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