MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 5697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008014	TTG	2	6	39179	39184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972427
1002	NC_008014	AAG	2	6	39205	39210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972427
1003	NC_008014	AAT	2	6	39218	39223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972427
1004	NC_008014	ATT	2	6	39225	39230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972427
1005	NC_008014	TTC	3	9	39233	39241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972427
1006	NC_008014	TAT	2	6	39345	39350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972427
1007	NC_008014	TAAA	2	8	39373	39380	75 %	25 %	0 %	0 %	94972427
1008	NC_008014	ACAT	2	8	39539	39546	50 %	25 %	0 %	25 %	94972427
1009	NC_008014	AG	3	6	39552	39557	50 %	0 %	50 %	0 %	94972427
1010	NC_008014	GTTT	2	8	39583	39590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_008014	T	7	7	39594	39600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008014	TTA	2	6	39612	39617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008014	TTA	3	9	39623	39631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_008014	TTA	2	6	39683	39688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972428
1015	NC_008014	TAT	2	6	39697	39702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972428
1016	NC_008014	TAG	2	6	39796	39801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972428
1017	NC_008014	T	6	6	39878	39883	0 %	100 %	0 %	0 %	94972428
1018	NC_008014	CTA	2	6	39902	39907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972428
1019	NC_008014	AATT	2	8	39928	39935	50 %	50 %	0 %	0 %	94972428
1020	NC_008014	TA	3	6	40014	40019	50 %	50 %	0 %	0 %	94972428
1021	NC_008014	TAT	2	6	40183	40188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972428
1022	NC_008014	A	6	6	40199	40204	100 %	0 %	0 %	0 %	94972428
1023	NC_008014	CTT	2	6	40205	40210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972428
1024	NC_008014	TGC	2	6	40279	40284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972428
1025	NC_008014	ATT	2	6	40295	40300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972428
1026	NC_008014	TAT	2	6	40319	40324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972428
1027	NC_008014	CGT	2	6	40436	40441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972428
1028	NC_008014	AGG	2	6	40492	40497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972428
1029	NC_008014	TCT	2	6	40531	40536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972428
1030	NC_008014	GTT	2	6	40608	40613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972428
1031	NC_008014	T	6	6	40630	40635	0 %	100 %	0 %	0 %	94972428
1032	NC_008014	ACA	2	6	40669	40674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972428
1033	NC_008014	TTG	2	6	40689	40694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972428
1034	NC_008014	GGAT	2	8	40703	40710	25 %	25 %	50 %	0 %	94972428
1035	NC_008014	T	7	7	40710	40716	0 %	100 %	0 %	0 %	94972428
1036	NC_008014	TCC	2	6	40774	40779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972428
1037	NC_008014	A	6	6	40882	40887	100 %	0 %	0 %	0 %	94972428
1038	NC_008014	A	6	6	40914	40919	100 %	0 %	0 %	0 %	94972428
1039	NC_008014	T	7	7	40951	40957	0 %	100 %	0 %	0 %	94972428
1040	NC_008014	TAT	2	6	40968	40973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972428
1041	NC_008014	T	6	6	40973	40978	0 %	100 %	0 %	0 %	94972428
1042	NC_008014	ATTT	2	8	41017	41024	25 %	75 %	0 %	0 %	94972428
1043	NC_008014	AGG	2	6	41079	41084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_008014	TTAT	2	8	41112	41119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008014	TAT	2	6	41123	41128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008014	A	8	8	41147	41154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008014	ATGTT	2	10	41160	41169	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008014	TA	3	6	41260	41265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008014	TTA	2	6	41282	41287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_008014	ATT	2	6	41296	41301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008014	TTTA	2	8	41302	41309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_008014	AC	3	6	41321	41326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_008014	TTA	2	6	41357	41362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008014	CAA	2	6	41375	41380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972429
1055	NC_008014	TAA	2	6	41393	41398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972429
1056	NC_008014	A	7	7	41397	41403	100 %	0 %	0 %	0 %	94972429
1057	NC_008014	TTA	2	6	41414	41419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972429
1058	NC_008014	AGA	2	6	41433	41438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972429
1059	NC_008014	TA	3	6	41455	41460	50 %	50 %	0 %	0 %	94972429
1060	NC_008014	AAAG	2	8	41467	41474	75 %	0 %	25 %	0 %	94972429
1061	NC_008014	TTC	2	6	41484	41489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972429
1062	NC_008014	AGA	2	6	41505	41510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972429
1063	NC_008014	GCA	2	6	41572	41577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972429
1064	NC_008014	TAT	2	6	41580	41585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972429
1065	NC_008014	GCTA	2	8	41625	41632	25 %	25 %	25 %	25 %	94972429
1066	NC_008014	AAC	2	6	41640	41645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972429
1067	NC_008014	TA	3	6	41655	41660	50 %	50 %	0 %	0 %	94972429
1068	NC_008014	CTT	2	6	41664	41669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008014	CATA	2	8	41705	41712	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_008014	TA	3	6	41742	41747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_008014	TAA	2	6	41774	41779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_008014	A	6	6	41778	41783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008014	CAC	2	6	41788	41793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_008014	TA	3	6	41798	41803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_008014	CATA	2	8	41868	41875	50 %	25 %	0 %	25 %	94972430
1076	NC_008014	TGA	2	6	41893	41898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972430
1077	NC_008014	GATA	2	8	41923	41930	50 %	25 %	25 %	0 %	94972430
1078	NC_008014	AGA	2	6	41932	41937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972430
1079	NC_008014	CAT	3	9	41976	41984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972430
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1081	NC_008014	A	6	6	42172	42177	100 %	0 %	0 %	0 %	94972430
1082	NC_008014	AAT	2	6	42238	42243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972430
1083	NC_008014	AAT	2	6	42250	42255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972430
1084	NC_008014	TCC	2	6	42322	42327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972430
1085	NC_008014	A	7	7	42391	42397	100 %	0 %	0 %	0 %	94972430
1086	NC_008014	CAT	2	6	42450	42455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972430
1087	NC_008014	CAC	2	6	42456	42461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972430
1088	NC_008014	GCA	2	6	42494	42499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972430
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1090	NC_008014	ACTT	2	8	42553	42560	25 %	50 %	0 %	25 %	94972430
1091	NC_008014	TCT	2	6	42578	42583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972430
1092	NC_008014	CTT	2	6	42609	42614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972430
1093	NC_008014	AGAA	2	8	42628	42635	75 %	0 %	25 %	0 %	94972430
1094	NC_008014	GAA	2	6	42678	42683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972430
1095	NC_008014	T	8	8	42697	42704	0 %	100 %	0 %	0 %	94972430
1096	NC_008014	TA	3	6	42763	42768	50 %	50 %	0 %	0 %	94972430
1097	NC_008014	ATC	2	6	42784	42789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972430
1098	NC_008014	T	6	6	42813	42818	0 %	100 %	0 %	0 %	94972430
1099	NC_008014	TC	3	6	42839	42844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_008014	TCA	2	6	42866	42871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008014	ATC	2	6	42880	42885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972431
1102	NC_008014	TAA	2	6	42976	42981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972431
1103	NC_008014	TTG	2	6	43031	43036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972431
1104	NC_008014	AAGT	2	8	43051	43058	50 %	25 %	25 %	0 %	94972431
1105	NC_008014	TAAG	2	8	43111	43118	50 %	25 %	25 %	0 %	94972431
1106	NC_008014	T	6	6	43127	43132	0 %	100 %	0 %	0 %	94972431
1107	NC_008014	TTA	2	6	43138	43143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972431
1108	NC_008014	A	6	6	43157	43162	100 %	0 %	0 %	0 %	94972431
1109	NC_008014	CAC	2	6	43189	43194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972431
1110	NC_008014	TGC	2	6	43199	43204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972431
1111	NC_008014	TTA	2	6	43230	43235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972431
1112	NC_008014	TCA	2	6	43254	43259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972431
1113	NC_008014	ATG	2	6	43304	43309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972431
1114	NC_008014	GTA	2	6	43314	43319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972431
1115	NC_008014	AT	3	6	43345	43350	50 %	50 %	0 %	0 %	94972431
1116	NC_008014	ACA	2	6	43383	43388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972431
1117	NC_008014	TAA	2	6	43423	43428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972431
1118	NC_008014	CTA	2	6	43446	43451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972431
1119	NC_008014	GAA	2	6	43455	43460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972431
1120	NC_008014	TGA	2	6	43493	43498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972431
1121	NC_008014	A	7	7	43562	43568	100 %	0 %	0 %	0 %	94972431
1122	NC_008014	T	8	8	43597	43604	0 %	100 %	0 %	0 %	94972431
1123	NC_008014	GTT	2	6	43638	43643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94972431
1124	NC_008014	TAA	2	6	43728	43733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972432
1125	NC_008014	TG	3	6	43796	43801	0 %	50 %	50 %	0 %	94972432
1126	NC_008014	GCTT	2	8	43870	43877	0 %	50 %	25 %	25 %	94972432
1127	NC_008014	TAG	2	6	43926	43931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972432
1128	NC_008014	TCT	2	6	43949	43954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972432
1129	NC_008014	T	7	7	43971	43977	0 %	100 %	0 %	0 %	94972432
1130	NC_008014	A	7	7	44041	44047	100 %	0 %	0 %	0 %	94972432
1131	NC_008014	ATC	2	6	44068	44073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972432
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