MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 3

Total Repeats: 5697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008014	AGA	2	6	157127	157132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4502	NC_008014	AG	3	6	157157	157162	50 %	0 %	50 %	0 %	94972489
4503	NC_008014	ATT	2	6	157247	157252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972489
4504	NC_008014	CTG	2	6	157300	157305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972489
4505	NC_008014	AGA	2	6	157354	157359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4506	NC_008014	A	6	6	157359	157364	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
4507	NC_008014	AAG	2	6	157396	157401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4508	NC_008014	GAA	3	9	157404	157412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4509	NC_008014	AGA	2	6	157413	157418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4510	NC_008014	GAA	2	6	157425	157430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4511	NC_008014	AAAAGA	2	12	157463	157474	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	94972489
4512	NC_008014	TGA	2	6	157478	157483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
4513	NC_008014	T	6	6	157513	157518	0 %	100 %	0 %	0 %	94972489
4514	NC_008014	ACTT	2	8	157520	157527	25 %	50 %	0 %	25 %	94972489
4515	NC_008014	T	7	7	157526	157532	0 %	100 %	0 %	0 %	94972489
4516	NC_008014	TCC	2	6	157535	157540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972489
4517	NC_008014	CA	3	6	157541	157546	50 %	0 %	0 %	50 %	94972489
4518	NC_008014	TGA	2	6	157550	157555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94972489
4519	NC_008014	TAA	2	6	157556	157561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94972489
4520	NC_008014	CAC	2	6	157567	157572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94972489
4521	NC_008014	TCC	2	6	157586	157591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972489
4522	NC_008014	AATCCA	2	12	157632	157643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	94972489
4523	NC_008014	TTC	2	6	157649	157654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
4524	NC_008014	CAG	2	6	157656	157661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94972489
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4527	NC_008014	TGAAGA	2	12	157706	157717	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94972489
4528	NC_008014	AAGC	2	8	157746	157753	50 %	0 %	25 %	25 %	94972489
4529	NC_008014	CAA	2	6	157771	157776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
4530	NC_008014	AAC	3	9	157778	157786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
4531	NC_008014	TAC	2	6	157787	157792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972489
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4533	NC_008014	GAA	2	6	157836	157841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4534	NC_008014	GAA	3	9	157914	157922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4535	NC_008014	GGA	2	6	157925	157930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972489
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4539	NC_008014	GGA	2	6	158112	158117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94972489
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4541	NC_008014	TTC	2	6	158198	158203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94972489
4542	NC_008014	GAA	2	6	158247	158252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4543	NC_008014	CAA	2	6	158262	158267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94972489
4544	NC_008014	TTA	2	6	158277	158282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94972489
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4546	NC_008014	TCC	2	6	158336	158341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94972489
4547	NC_008014	CTTC	2	8	158346	158353	0 %	50 %	0 %	50 %	94972489
4548	NC_008014	A	6	6	158358	158363	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
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4552	NC_008014	GAA	2	6	158472	158477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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4555	NC_008014	AGA	2	6	158540	158545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
4556	NC_008014	AGA	2	6	158555	158560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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4574	NC_008014	A	6	6	158966	158971	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
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4602	NC_008014	CGT	2	6	159867	159872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94972489
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4606	NC_008014	T	6	6	159942	159947	0 %	100 %	0 %	0 %	94972489
4607	NC_008014	AAGAT	2	10	159949	159958	60 %	20 %	20 %	0 %	94972489
4608	NC_008014	AGAA	2	8	159977	159984	75 %	0 %	25 %	0 %	94972489
4609	NC_008014	A	7	7	159983	159989	100 %	0 %	0 %	0 %	94972489
4610	NC_008014	GAA	2	6	159996	160001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94972489
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4622	NC_008014	AGATGA	2	12	160256	160267	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	94972489
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5000	NC_008014	TCA	2	6	170358	170363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94972489

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