MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 plasmid 2

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008013	A	6	6	73	78	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008013	A	7	7	255	261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008013	A	6	6	1017	1022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008013	T	6	6	1040	1045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008013	A	6	6	1119	1124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008013	A	7	7	1302	1308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008013	A	6	6	1351	1356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008013	A	7	7	1601	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008013	A	6	6	1882	1887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008013	A	8	8	1977	1984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008013	A	6	6	2081	2086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008013	A	6	6	2225	2230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008013	A	6	6	2496	2501	100 %	0 %	0 %	0 %	94972375
14	NC_008013	T	6	6	2502	2507	0 %	100 %	0 %	0 %	94972375
15	NC_008013	T	6	6	2716	2721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008013	A	7	7	3412	3418	100 %	0 %	0 %	0 %	94972376
17	NC_008013	T	6	6	3630	3635	0 %	100 %	0 %	0 %	94972376
18	NC_008013	A	8	8	3678	3685	100 %	0 %	0 %	0 %	94972376
19	NC_008013	T	7	7	3866	3872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008013	T	6	6	3917	3922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008013	A	6	6	3961	3966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008013	A	6	6	3983	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008013	A	6	6	4005	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008013	A	6	6	4027	4032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008013	A	6	6	4047	4052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008013	T	6	6	4091	4096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008013	T	6	6	4110	4115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008013	A	6	6	4196	4201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008013	A	6	6	4315	4320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008013	T	8	8	4429	4436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008013	T	6	6	5647	5652	0 %	100 %	0 %	0 %	94972377
32	NC_008013	T	7	7	7200	7206	0 %	100 %	0 %	0 %	94972377
33	NC_008013	A	7	7	7707	7713	100 %	0 %	0 %	0 %	94972377
34	NC_008013	A	6	6	7761	7766	100 %	0 %	0 %	0 %	94972377
35	NC_008013	T	6	6	7784	7789	0 %	100 %	0 %	0 %	94972377
36	NC_008013	A	6	6	7806	7811	100 %	0 %	0 %	0 %	94972377
37	NC_008013	T	6	6	7888	7893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008013	T	6	6	7948	7953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008013	T	9	9	7979	7987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008013	A	6	6	8246	8251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008013	T	6	6	8380	8385	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
42	NC_008013	T	6	6	8766	8771	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
43	NC_008013	T	6	6	8843	8848	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
44	NC_008013	A	6	6	9080	9085	100 %	0 %	0 %	0 %	94972378
45	NC_008013	T	8	8	9272	9279	0 %	100 %	0 %	0 %	94972378
46	NC_008013	C	6	6	9305	9310	0 %	0 %	0 %	100 %	94972378
47	NC_008013	A	7	7	9403	9409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008013	T	7	7	9443	9449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008013	A	8	8	9452	9459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008013	A	6	6	9564	9569	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008013	A	6	6	9580	9585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008013	T	7	7	9637	9643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008013	T	6	6	9930	9935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008013	A	7	7	10000	10006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008013	A	7	7	10034	10040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008013	A	6	6	10085	10090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008013	T	7	7	10314	10320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008013	T	6	6	10410	10415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008013	T	6	6	10817	10822	0 %	100 %	0 %	0 %	94972379
60	NC_008013	A	6	6	10921	10926	100 %	0 %	0 %	0 %	94972379
61	NC_008013	A	6	6	10958	10963	100 %	0 %	0 %	0 %	94972379
62	NC_008013	T	6	6	11208	11213	0 %	100 %	0 %	0 %	94972379
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65	NC_008013	T	7	7	12684	12690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_008013	T	7	7	13065	13071	0 %	100 %	0 %	0 %	94972380
68	NC_008013	G	7	7	14713	14719	0 %	0 %	100 %	0 %	94972381
69	NC_008013	A	6	6	15062	15067	100 %	0 %	0 %	0 %	94972381
70	NC_008013	A	6	6	15204	15209	100 %	0 %	0 %	0 %	94972381
71	NC_008013	T	7	7	15220	15226	0 %	100 %	0 %	0 %	94972381
72	NC_008013	T	8	8	15288	15295	0 %	100 %	0 %	0 %	94972381
73	NC_008013	A	7	7	15319	15325	100 %	0 %	0 %	0 %	94972381
74	NC_008013	A	7	7	15659	15665	100 %	0 %	0 %	0 %	94972382
75	NC_008013	T	7	7	15857	15863	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
76	NC_008013	A	6	6	15875	15880	100 %	0 %	0 %	0 %	94972382
77	NC_008013	T	8	8	16244	16251	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
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79	NC_008013	T	6	6	16411	16416	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
80	NC_008013	A	6	6	16417	16422	100 %	0 %	0 %	0 %	94972382
81	NC_008013	T	8	8	16432	16439	0 %	100 %	0 %	0 %	94972382
82	NC_008013	T	6	6	16957	16962	0 %	100 %	0 %	0 %	94972383
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84	NC_008013	T	7	7	17175	17181	0 %	100 %	0 %	0 %	94972383
85	NC_008013	T	8	8	17554	17561	0 %	100 %	0 %	0 %	94972383
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88	NC_008013	A	6	6	19035	19040	100 %	0 %	0 %	0 %	94972385
89	NC_008013	T	6	6	19292	19297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008013	A	7	7	19707	19713	100 %	0 %	0 %	0 %	94972386
91	NC_008013	A	7	7	19952	19958	100 %	0 %	0 %	0 %	94972386
92	NC_008013	A	6	6	20022	20027	100 %	0 %	0 %	0 %	94972386
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96	NC_008013	T	6	6	20590	20595	0 %	100 %	0 %	0 %	94972386
97	NC_008013	T	6	6	21188	21193	0 %	100 %	0 %	0 %	94972387
98	NC_008013	G	13	13	21209	21221	0 %	0 %	100 %	0 %	94972387
99	NC_008013	A	6	6	22470	22475	100 %	0 %	0 %	0 %	94972388
100	NC_008013	G	10	10	22770	22779	0 %	0 %	100 %	0 %	94972389
101	NC_008013	A	8	8	22916	22923	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
102	NC_008013	A	6	6	23140	23145	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
103	NC_008013	A	6	6	23354	23359	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
104	NC_008013	A	6	6	23422	23427	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
105	NC_008013	A	6	6	23465	23470	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
106	NC_008013	A	6	6	23581	23586	100 %	0 %	0 %	0 %	94972389
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108	NC_008013	A	6	6	24892	24897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008013	A	6	6	24959	24964	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
110	NC_008013	A	6	6	25122	25127	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
111	NC_008013	A	6	6	25192	25197	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
112	NC_008013	A	6	6	25632	25637	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
113	NC_008013	A	7	7	25803	25809	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
114	NC_008013	A	6	6	26019	26024	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
115	NC_008013	A	6	6	26120	26125	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
116	NC_008013	A	7	7	26159	26165	100 %	0 %	0 %	0 %	94972391
117	NC_008013	T	6	6	26560	26565	0 %	100 %	0 %	0 %	94972392
118	NC_008013	T	7	7	26586	26592	0 %	100 %	0 %	0 %	94972392
119	NC_008013	T	7	7	26861	26867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008013	A	7	7	27138	27144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008013	G	6	6	27205	27210	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008013	A	6	6	27531	27536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008013	T	6	6	27571	27576	0 %	100 %	0 %	0 %	94972393
124	NC_008013	A	6	6	27790	27795	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
125	NC_008013	A	6	6	28126	28131	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
126	NC_008013	A	6	6	28214	28219	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
127	NC_008013	A	6	6	28470	28475	100 %	0 %	0 %	0 %	94972393
128	NC_008013	A	8	8	28821	28828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008013	A	9	9	28935	28943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_008013	A	6	6	29144	29149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008013	A	6	6	29176	29181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008013	A	6	6	29217	29222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008013	A	6	6	29250	29255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008013	T	6	6	29256	29261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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137	NC_008013	A	6	6	29718	29723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008013	A	6	6	30267	30272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_008013	A	7	7	30826	30832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008013	T	8	8	30937	30944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_008013	T	6	6	31963	31968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_008013	T	7	7	32118	32124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008013	A	13	13	32255	32267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008013	A	8	8	33105	33112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.