MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 3506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008011	AT	3	6	70	75	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008011	AT	4	8	151	158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008011	AT	3	6	203	208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008011	AT	3	6	259	264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008011	AT	3	6	363	368	50 %	50 %	0 %	0 %	94986446
6	NC_008011	AT	3	6	704	709	50 %	50 %	0 %	0 %	94986446
7	NC_008011	TA	3	6	1806	1811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008011	AG	3	6	2091	2096	50 %	0 %	50 %	0 %	94986447
9	NC_008011	TA	3	6	2396	2401	50 %	50 %	0 %	0 %	94986447
10	NC_008011	GT	3	6	2960	2965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008011	TA	3	6	3066	3071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008011	TA	3	6	3418	3423	50 %	50 %	0 %	0 %	94986448
13	NC_008011	TA	3	6	4247	4252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008011	AG	3	6	4831	4836	50 %	0 %	50 %	0 %	94986450
15	NC_008011	AT	3	6	5172	5177	50 %	50 %	0 %	0 %	94986451
16	NC_008011	TA	3	6	5480	5485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008011	TA	3	6	5625	5630	50 %	50 %	0 %	0 %	94986452
18	NC_008011	TA	3	6	7651	7656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008011	AG	3	6	7745	7750	50 %	0 %	50 %	0 %	94986453
20	NC_008011	AG	3	6	8765	8770	50 %	0 %	50 %	0 %	94986455
21	NC_008011	AG	3	6	8881	8886	50 %	0 %	50 %	0 %	94986455
22	NC_008011	TA	3	6	9648	9653	50 %	50 %	0 %	0 %	94986456
23	NC_008011	AT	3	6	10307	10312	50 %	50 %	0 %	0 %	94986456
24	NC_008011	AT	3	6	10591	10596	50 %	50 %	0 %	0 %	94986457
25	NC_008011	TA	4	8	11226	11233	50 %	50 %	0 %	0 %	94986457
26	NC_008011	AT	3	6	12158	12163	50 %	50 %	0 %	0 %	94986457
27	NC_008011	TA	3	6	13656	13661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008011	AT	3	6	13772	13777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008011	TA	3	6	13846	13851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008011	TA	3	6	14671	14676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008011	AG	3	6	15080	15085	50 %	0 %	50 %	0 %	94986458
32	NC_008011	GA	3	6	15562	15567	50 %	0 %	50 %	0 %	94986458
33	NC_008011	CT	3	6	15583	15588	0 %	50 %	0 %	50 %	94986459
34	NC_008011	AT	3	6	16201	16206	50 %	50 %	0 %	0 %	94986459
35	NC_008011	AT	4	8	16238	16245	50 %	50 %	0 %	0 %	94986459
36	NC_008011	TA	3	6	16929	16934	50 %	50 %	0 %	0 %	94986460
37	NC_008011	TA	3	6	17051	17056	50 %	50 %	0 %	0 %	94986460
38	NC_008011	TA	3	6	17286	17291	50 %	50 %	0 %	0 %	94986460
39	NC_008011	AT	3	6	17505	17510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008011	GA	3	6	17640	17645	50 %	0 %	50 %	0 %	94986461
41	NC_008011	TA	3	6	17708	17713	50 %	50 %	0 %	0 %	94986461
42	NC_008011	TC	3	6	17845	17850	0 %	50 %	0 %	50 %	94986461
43	NC_008011	TA	3	6	18615	18620	50 %	50 %	0 %	0 %	94986462
44	NC_008011	TG	3	6	19594	19599	0 %	50 %	50 %	0 %	94986463
45	NC_008011	AT	3	6	19713	19718	50 %	50 %	0 %	0 %	94986463
46	NC_008011	TG	3	6	20041	20046	0 %	50 %	50 %	0 %	94986463
47	NC_008011	AT	3	6	20659	20664	50 %	50 %	0 %	0 %	94986463
48	NC_008011	TA	3	6	20932	20937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008011	AC	3	6	21104	21109	50 %	0 %	0 %	50 %	94986464
50	NC_008011	AT	3	6	22314	22319	50 %	50 %	0 %	0 %	94986465
51	NC_008011	AT	3	6	22590	22595	50 %	50 %	0 %	0 %	94986466
52	NC_008011	AT	3	6	22656	22661	50 %	50 %	0 %	0 %	94986466
53	NC_008011	TA	3	6	24452	24457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008011	AT	3	6	24525	24530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008011	TA	6	12	24551	24562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008011	AT	3	6	25044	25049	50 %	50 %	0 %	0 %	94986468
57	NC_008011	AT	3	6	25083	25088	50 %	50 %	0 %	0 %	94986468
58	NC_008011	TG	3	6	26527	26532	0 %	50 %	50 %	0 %	94986470
59	NC_008011	AG	3	6	26677	26682	50 %	0 %	50 %	0 %	94986470
60	NC_008011	AG	3	6	27675	27680	50 %	0 %	50 %	0 %	94986470
61	NC_008011	GT	3	6	29865	29870	0 %	50 %	50 %	0 %	94986470
62	NC_008011	TA	3	6	29952	29957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008011	TA	4	8	30016	30023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008011	TA	3	6	31152	31157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008011	AT	3	6	32397	32402	50 %	50 %	0 %	0 %	94986473
66	NC_008011	AT	3	6	33829	33834	50 %	50 %	0 %	0 %	94986474
67	NC_008011	AT	4	8	34033	34040	50 %	50 %	0 %	0 %	94986474
68	NC_008011	TA	3	6	34522	34527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008011	TA	3	6	34548	34553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008011	AG	3	6	34957	34962	50 %	0 %	50 %	0 %	94986475
71	NC_008011	AC	4	8	35028	35035	50 %	0 %	0 %	50 %	94986475
72	NC_008011	TG	3	6	35272	35277	0 %	50 %	50 %	0 %	94986475
73	NC_008011	AG	3	6	36037	36042	50 %	0 %	50 %	0 %	94986476
74	NC_008011	AT	3	6	36419	36424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008011	TA	3	6	36438	36443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008011	AT	6	12	36569	36580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008011	TA	3	6	36590	36595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008011	TA	3	6	37074	37079	50 %	50 %	0 %	0 %	94986477
79	NC_008011	AT	3	6	37578	37583	50 %	50 %	0 %	0 %	94986477
80	NC_008011	AT	3	6	37638	37643	50 %	50 %	0 %	0 %	94986477
81	NC_008011	TA	4	8	38162	38169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008011	TA	3	6	38234	38239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008011	TA	3	6	38246	38251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008011	TA	4	8	38311	38318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008011	AT	4	8	38328	38335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008011	TA	3	6	38857	38862	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
87	NC_008011	TG	4	8	39379	39386	0 %	50 %	50 %	0 %	94986478
88	NC_008011	AT	3	6	39867	39872	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
89	NC_008011	TG	3	6	40047	40052	0 %	50 %	50 %	0 %	94986478
90	NC_008011	TA	3	6	40804	40809	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
91	NC_008011	AT	3	6	40810	40815	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
92	NC_008011	AT	3	6	40856	40861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008011	AT	3	6	40935	40940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008011	TA	3	6	41415	41420	50 %	50 %	0 %	0 %	94986479
95	NC_008011	TA	3	6	41628	41633	50 %	50 %	0 %	0 %	94986479
96	NC_008011	AG	3	6	42414	42419	50 %	0 %	50 %	0 %	94986480
97	NC_008011	AG	3	6	42603	42608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008011	GA	3	6	42654	42659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008011	TC	3	6	43199	43204	0 %	50 %	0 %	50 %	94986481
100	NC_008011	AT	3	6	43501	43506	50 %	50 %	0 %	0 %	94986481
101	NC_008011	TA	3	6	43603	43608	50 %	50 %	0 %	0 %	94986481
102	NC_008011	TA	3	6	44130	44135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008011	AT	3	6	44189	44194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008011	TA	3	6	44670	44675	50 %	50 %	0 %	0 %	94986483
105	NC_008011	AT	3	6	44840	44845	50 %	50 %	0 %	0 %	94986483
106	NC_008011	AT	3	6	45121	45126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008011	AT	3	6	45143	45148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008011	TG	4	8	45492	45499	0 %	50 %	50 %	0 %	94986484
109	NC_008011	AT	3	6	47372	47377	50 %	50 %	0 %	0 %	94986485
110	NC_008011	AG	3	6	47806	47811	50 %	0 %	50 %	0 %	94986486
111	NC_008011	AT	4	8	48134	48141	50 %	50 %	0 %	0 %	94986486
112	NC_008011	AG	3	6	48550	48555	50 %	0 %	50 %	0 %	94986486
113	NC_008011	TA	3	6	48754	48759	50 %	50 %	0 %	0 %	94986486
114	NC_008011	AT	3	6	49616	49621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008011	AG	3	6	49647	49652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008011	TA	3	6	49678	49683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008011	TA	3	6	49691	49696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008011	TA	3	6	53177	53182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008011	TA	3	6	53537	53542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008011	TA	3	6	53668	53673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008011	TA	3	6	53679	53684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008011	TA	3	6	53751	53756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008011	GT	3	6	53802	53807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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125	NC_008011	AT	3	6	55216	55221	50 %	50 %	0 %	0 %	94986489
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128	NC_008011	TA	3	6	55412	55417	50 %	50 %	0 %	0 %	94986489
129	NC_008011	AT	3	6	55769	55774	50 %	50 %	0 %	0 %	94986489
130	NC_008011	TA	4	8	55968	55975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008011	AT	7	14	56124	56137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008011	TA	3	6	56140	56145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008011	TA	3	6	56410	56415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008011	GT	3	6	56495	56500	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008011	TA	3	6	56612	56617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_008011	GA	3	6	59455	59460	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008011	TC	3	6	59472	59477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008011	AT	3	6	59655	59660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_008011	AT	3	6	64219	64224	50 %	50 %	0 %	0 %	94986493
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