MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008011	TAA	2	6	143182	143187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986558
4002	NC_008011	TTC	2	6	143189	143194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986558
4003	NC_008011	AAT	2	6	143264	143269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986558
4004	NC_008011	TGA	2	6	143282	143287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986558
4005	NC_008011	TTC	2	6	143336	143341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986558
4006	NC_008011	T	7	7	143372	143378	0 %	100 %	0 %	0 %	94986558
4007	NC_008011	TAA	2	6	143398	143403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986558
4008	NC_008011	GAA	2	6	143404	143409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986558
4009	NC_008011	ATCA	2	8	143480	143487	50 %	25 %	0 %	25 %	94986558
4010	NC_008011	ACG	2	6	143573	143578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986558
4011	NC_008011	CTG	2	6	143584	143589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986558
4012	NC_008011	GTT	2	6	143649	143654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986558
4013	NC_008011	ATT	2	6	143691	143696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986558
4014	NC_008011	ATT	2	6	143736	143741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986558
4015	NC_008011	ATT	2	6	143789	143794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986558
4016	NC_008011	TAA	3	9	143798	143806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986558
4017	NC_008011	GAA	2	6	143965	143970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986558
4018	NC_008011	TCA	2	6	143985	143990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986558
4019	NC_008011	TAA	2	6	143996	144001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986558
4020	NC_008011	TTC	2	6	144041	144046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986558
4021	NC_008011	TTG	2	6	144062	144067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986558
4022	NC_008011	TCA	2	6	144096	144101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986558
4023	NC_008011	TAG	2	6	144112	144117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986558
4024	NC_008011	AAT	2	6	144118	144123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986558
4025	NC_008011	CTC	2	6	144139	144144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986558
4026	NC_008011	ATG	2	6	144163	144168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986558
4027	NC_008011	CTA	2	6	144295	144300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986558
4028	NC_008011	T	6	6	144330	144335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008011	ATA	3	9	144358	144366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_008011	AGAA	2	8	144367	144374	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_008011	TAT	2	6	144378	144383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008011	TA	3	6	144385	144390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008011	AT	3	6	144442	144447	50 %	50 %	0 %	0 %	94986559
4034	NC_008011	T	6	6	144456	144461	0 %	100 %	0 %	0 %	94986559
4035	NC_008011	TTG	2	6	144486	144491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986559
4036	NC_008011	CAA	2	6	144509	144514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986559
4037	NC_008011	T	6	6	144566	144571	0 %	100 %	0 %	0 %	94986559
4038	NC_008011	AGA	2	6	144576	144581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986559
4039	NC_008011	TCG	2	6	144603	144608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986559
4040	NC_008011	GAA	2	6	144700	144705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986559
4041	NC_008011	AAC	2	6	144729	144734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986559
4042	NC_008011	GTT	2	6	144755	144760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986559
4043	NC_008011	AAT	2	6	144763	144768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986559
4044	NC_008011	TCA	2	6	144952	144957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986559
4045	NC_008011	A	6	6	145009	145014	100 %	0 %	0 %	0 %	94986559
4046	NC_008011	A	7	7	145146	145152	100 %	0 %	0 %	0 %	94986559
4047	NC_008011	TTAA	2	8	145153	145160	50 %	50 %	0 %	0 %	94986559
4048	NC_008011	TA	3	6	145313	145318	50 %	50 %	0 %	0 %	94986559
4049	NC_008011	TAT	2	6	145325	145330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986559
4050	NC_008011	AGCA	2	8	145380	145387	50 %	0 %	25 %	25 %	94986559
4051	NC_008011	T	6	6	145405	145410	0 %	100 %	0 %	0 %	94986559
4052	NC_008011	ACA	2	6	145435	145440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986559
4053	NC_008011	AAT	2	6	145470	145475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986559
4054	NC_008011	GTATTT	2	12	145477	145488	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	94986559
4055	NC_008011	AGAA	2	8	145560	145567	75 %	0 %	25 %	0 %	94986559
4056	NC_008011	T	8	8	145656	145663	0 %	100 %	0 %	0 %	94986559
4057	NC_008011	AAC	2	6	145681	145686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986559
4058	NC_008011	TAT	2	6	145724	145729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_008011	AGT	2	6	145731	145736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008011	AAAGAA	2	12	145753	145764	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008011	TTATA	2	10	145774	145783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_008011	AAAG	2	8	145802	145809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_008011	T	6	6	145853	145858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_008011	ACCAT	2	10	145860	145869	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4065	NC_008011	AGA	2	6	145875	145880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008011	ATA	2	6	145905	145910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008011	CTA	2	6	145947	145952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986560
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4070	NC_008011	AT	3	6	146045	146050	50 %	50 %	0 %	0 %	94986560
4071	NC_008011	TCCT	2	8	146067	146074	0 %	50 %	0 %	50 %	94986560
4072	NC_008011	AGT	2	6	146092	146097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986560
4073	NC_008011	TAT	2	6	146103	146108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986560
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4075	NC_008011	TA	3	6	146285	146290	50 %	50 %	0 %	0 %	94986560
4076	NC_008011	GAA	2	6	146324	146329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986560
4077	NC_008011	CTG	2	6	146346	146351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986560
4078	NC_008011	ATA	2	6	146379	146384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986560
4079	NC_008011	AAGA	2	8	146421	146428	75 %	0 %	25 %	0 %	94986560
4080	NC_008011	TCT	2	6	146485	146490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986560
4081	NC_008011	ATTC	2	8	146510	146517	25 %	50 %	0 %	25 %	94986560
4082	NC_008011	CAT	2	6	146540	146545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008011	ATGA	2	8	146548	146555	50 %	25 %	25 %	0 %	94986561
4084	NC_008011	AGA	2	6	146571	146576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986561
4085	NC_008011	T	8	8	146641	146648	0 %	100 %	0 %	0 %	94986561
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4087	NC_008011	CAA	2	6	146845	146850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986561
4088	NC_008011	TTAGCA	2	12	146851	146862	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	94986561
4089	NC_008011	TA	3	6	146868	146873	50 %	50 %	0 %	0 %	94986561
4090	NC_008011	GA	3	6	146890	146895	50 %	0 %	50 %	0 %	94986561
4091	NC_008011	TCA	2	6	146944	146949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986561
4092	NC_008011	A	6	6	146951	146956	100 %	0 %	0 %	0 %	94986561
4093	NC_008011	ATT	2	6	146979	146984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986561
4094	NC_008011	ATC	2	6	146996	147001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986561
4095	NC_008011	AT	3	6	147039	147044	50 %	50 %	0 %	0 %	94986561
4096	NC_008011	CTT	2	6	147061	147066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986561
4097	NC_008011	ATG	2	6	147110	147115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986561
4098	NC_008011	GTT	2	6	147168	147173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986561
4099	NC_008011	TAT	2	6	147272	147277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986561
4100	NC_008011	AAT	2	6	147358	147363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986561
4101	NC_008011	TA	3	6	147380	147385	50 %	50 %	0 %	0 %	94986561
4102	NC_008011	TGG	2	6	147478	147483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986561
4103	NC_008011	TTG	2	6	147506	147511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986561
4104	NC_008011	TG	3	6	147530	147535	0 %	50 %	50 %	0 %	94986561
4105	NC_008011	A	7	7	147633	147639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_008011	TAA	2	6	147654	147659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008011	GTTA	2	8	147681	147688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008011	TTAC	2	8	147741	147748	25 %	50 %	0 %	25 %	94986562
4109	NC_008011	TTA	2	6	147784	147789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986562
4110	NC_008011	T	6	6	147797	147802	0 %	100 %	0 %	0 %	94986562
4111	NC_008011	ATT	2	6	147846	147851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986562
4112	NC_008011	A	6	6	147861	147866	100 %	0 %	0 %	0 %	94986562
4113	NC_008011	TCA	2	6	147873	147878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986562
4114	NC_008011	ACCTC	2	10	147882	147891	20 %	20 %	0 %	60 %	94986562
4115	NC_008011	AAG	2	6	147928	147933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986562
4116	NC_008011	ATA	2	6	147939	147944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986562
4117	NC_008011	AGG	2	6	147956	147961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986562
4118	NC_008011	AT	3	6	147968	147973	50 %	50 %	0 %	0 %	94986562
4119	NC_008011	GAA	2	6	147990	147995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986562
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4121	NC_008011	TGC	2	6	148058	148063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986562
4122	NC_008011	TTA	2	6	148120	148125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986562
4123	NC_008011	GATT	2	8	148148	148155	25 %	50 %	25 %	0 %	94986562
4124	NC_008011	A	6	6	148238	148243	100 %	0 %	0 %	0 %	94986562
4125	NC_008011	CAG	2	6	148276	148281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986562
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4127	NC_008011	AAC	2	6	148298	148303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986562
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4282	NC_008011	T	6	6	153881	153886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4292	NC_008011	TA	3	6	154132	154137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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