MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008011	TCTT	2	8	124543	124550	0 %	75 %	0 %	25 %	94986542
3502	NC_008011	TTG	2	6	124571	124576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986542
3503	NC_008011	GT	3	6	124601	124606	0 %	50 %	50 %	0 %	94986542
3504	NC_008011	CTT	2	6	124611	124616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986542
3505	NC_008011	T	7	7	124679	124685	0 %	100 %	0 %	0 %	94986542
3506	NC_008011	TGT	2	6	124689	124694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986542
3507	NC_008011	AAC	2	6	124790	124795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986542
3508	NC_008011	TTC	2	6	124823	124828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986542
3509	NC_008011	AGT	2	6	124829	124834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986542
3510	NC_008011	AGC	2	6	124852	124857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986542
3511	NC_008011	T	7	7	124935	124941	0 %	100 %	0 %	0 %	94986542
3512	NC_008011	AAG	2	6	124964	124969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986542
3513	NC_008011	A	6	6	125089	125094	100 %	0 %	0 %	0 %	94986542
3514	NC_008011	GGTT	2	8	125112	125119	0 %	50 %	50 %	0 %	94986542
3515	NC_008011	TAC	2	6	125188	125193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986542
3516	NC_008011	T	6	6	125215	125220	0 %	100 %	0 %	0 %	94986542
3517	NC_008011	T	7	7	125233	125239	0 %	100 %	0 %	0 %	94986542
3518	NC_008011	T	7	7	125269	125275	0 %	100 %	0 %	0 %	94986542
3519	NC_008011	AT	3	6	125277	125282	50 %	50 %	0 %	0 %	94986542
3520	NC_008011	TA	3	6	125294	125299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_008011	AGAT	2	8	125305	125312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_008011	T	11	11	125324	125334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_008011	A	7	7	125338	125344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_008011	TAA	2	6	125372	125377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_008011	TAT	2	6	125387	125392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_008011	TA	3	6	125420	125425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_008011	AT	3	6	125445	125450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_008011	TAT	2	6	125468	125473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_008011	T	9	9	125488	125496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_008011	ATG	2	6	125634	125639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986543
3531	NC_008011	TGAT	2	8	125664	125671	25 %	50 %	25 %	0 %	94986543
3532	NC_008011	AGT	2	6	125744	125749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986543
3533	NC_008011	A	6	6	125752	125757	100 %	0 %	0 %	0 %	94986543
3534	NC_008011	A	6	6	125783	125788	100 %	0 %	0 %	0 %	94986543
3535	NC_008011	ACA	3	9	125801	125809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986543
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3537	NC_008011	AAG	2	6	125892	125897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986543
3538	NC_008011	ATC	2	6	125970	125975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986543
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3540	NC_008011	TAG	2	6	126074	126079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986543
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3542	NC_008011	TGT	2	6	126110	126115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986544
3543	NC_008011	ATTTGC	2	12	126137	126148	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	94986544
3544	NC_008011	CTA	3	9	126223	126231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986544
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3549	NC_008011	AAC	2	6	126673	126678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986544
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3554	NC_008011	A	6	6	126952	126957	100 %	0 %	0 %	0 %	94986544
3555	NC_008011	GAAA	2	8	126981	126988	75 %	0 %	25 %	0 %	94986544
3556	NC_008011	T	6	6	127007	127012	0 %	100 %	0 %	0 %	94986544
3557	NC_008011	CT	3	6	127022	127027	0 %	50 %	0 %	50 %	94986544
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3559	NC_008011	TGC	2	6	127115	127120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986544
3560	NC_008011	T	6	6	127126	127131	0 %	100 %	0 %	0 %	94986544
3561	NC_008011	T	8	8	127149	127156	0 %	100 %	0 %	0 %	94986545
3562	NC_008011	TCA	2	6	127209	127214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986545
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3564	NC_008011	TGA	2	6	127343	127348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986545
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3566	NC_008011	GTA	2	6	127404	127409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986545
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3569	NC_008011	TCT	2	6	127467	127472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986545
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3572	NC_008011	TTA	3	9	127545	127553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_008011	TATT	2	8	127606	127613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_008011	TAA	2	6	127625	127630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_008011	TGT	3	9	127656	127664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_008011	ATA	2	6	127670	127675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_008011	CAT	2	6	127679	127684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3579	NC_008011	TGA	2	6	127837	127842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986546
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3582	NC_008011	TAG	2	6	127946	127951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986546
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3596	NC_008011	GGC	2	6	128464	128469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	94986547
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3598	NC_008011	TAG	2	6	128536	128541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986547
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3600	NC_008011	T	7	7	128630	128636	0 %	100 %	0 %	0 %	94986547
3601	NC_008011	TGT	2	6	128648	128653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986547
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3603	NC_008011	TCT	2	6	128723	128728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986547
3604	NC_008011	CTT	2	6	128743	128748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986547
3605	NC_008011	T	6	6	128755	128760	0 %	100 %	0 %	0 %	94986547
3606	NC_008011	AAG	2	6	128765	128770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986547
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3608	NC_008011	AGT	2	6	128869	128874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986547
3609	NC_008011	CAG	2	6	128875	128880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986547
3610	NC_008011	GAA	2	6	128976	128981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986547
3611	NC_008011	CTGTAG	2	12	128989	129000	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	94986547
3612	NC_008011	TGT	2	6	129014	129019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986547
3613	NC_008011	CTT	2	6	129148	129153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986547
3614	NC_008011	C	6	6	129170	129175	0 %	0 %	0 %	100 %	94986547
3615	NC_008011	T	7	7	129181	129187	0 %	100 %	0 %	0 %	94986547
3616	NC_008011	TTGA	2	8	129206	129213	25 %	50 %	25 %	0 %	94986547
3617	NC_008011	GCTGA	2	10	129232	129241	20 %	20 %	40 %	20 %	94986547
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3623	NC_008011	CAA	2	6	129520	129525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986547
3624	NC_008011	TCTT	2	8	129545	129552	0 %	75 %	0 %	25 %	94986547
3625	NC_008011	AAG	2	6	129560	129565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986547
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