MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
39001	NC_008011	AGA	2	6	1453388	1453393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39002	NC_008011	TAT	2	6	1453444	1453449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39003	NC_008011	AT	3	6	1453455	1453460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39004	NC_008011	TAA	2	6	1453543	1453548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39005	NC_008011	TAAA	2	8	1453553	1453560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39006	NC_008011	AATA	2	8	1453605	1453612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39007	NC_008011	TAT	2	6	1453615	1453620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39008	NC_008011	A	6	6	1453621	1453626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39009	NC_008011	TCCC	2	8	1453736	1453743	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39010	NC_008011	TATT	2	8	1453783	1453790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39011	NC_008011	GAT	2	6	1453812	1453817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39012	NC_008011	TAT	2	6	1453831	1453836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39013	NC_008011	AGG	2	6	1453870	1453875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39014	NC_008011	GAG	2	6	1453906	1453911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39015	NC_008011	AT	3	6	1453928	1453933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39016	NC_008011	TTA	2	6	1453987	1453992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39017	NC_008011	CTA	2	6	1453999	1454004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39018	NC_008011	TATT	2	8	1454034	1454041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39019	NC_008011	TTA	2	6	1454064	1454069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39020	NC_008011	TAT	2	6	1454073	1454078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39021	NC_008011	T	7	7	1454137	1454143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39022	NC_008011	T	6	6	1454163	1454168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39023	NC_008011	AGC	2	6	1454189	1454194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39024	NC_008011	TA	4	8	1454199	1454206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39025	NC_008011	AAT	2	6	1454215	1454220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39026	NC_008011	T	6	6	1454234	1454239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39027	NC_008011	GTT	2	6	1454259	1454264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39028	NC_008011	T	7	7	1454263	1454269	0 %	100 %	0 %	0 %	94987627
39029	NC_008011	T	7	7	1454278	1454284	0 %	100 %	0 %	0 %	94987627
39030	NC_008011	T	8	8	1454291	1454298	0 %	100 %	0 %	0 %	94987627
39031	NC_008011	TAG	2	6	1454333	1454338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987627
39032	NC_008011	CTT	2	6	1454396	1454401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94987627
39033	NC_008011	A	6	6	1454403	1454408	100 %	0 %	0 %	0 %	94987627
39034	NC_008011	ATT	2	6	1454449	1454454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987627
39035	NC_008011	AAG	2	6	1454469	1454474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987627
39036	NC_008011	AAC	2	6	1454499	1454504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94987627
39037	NC_008011	AGC	2	6	1454505	1454510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94987627
39038	NC_008011	ACC	2	6	1454514	1454519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94987627
39039	NC_008011	TTG	2	6	1454522	1454527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987627
39040	NC_008011	GTT	2	6	1454573	1454578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987627
39041	NC_008011	AAG	2	6	1454664	1454669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987627
39042	NC_008011	ACT	2	6	1454700	1454705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987627
39043	NC_008011	TA	3	6	1454712	1454717	50 %	50 %	0 %	0 %	94987627
39044	NC_008011	T	6	6	1454728	1454733	0 %	100 %	0 %	0 %	94987627
39045	NC_008011	TAA	2	6	1454768	1454773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987627
39046	NC_008011	GTAAT	2	10	1454780	1454789	40 %	40 %	20 %	0 %	94987627
39047	NC_008011	TGG	2	6	1454814	1454819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987627
39048	NC_008011	AT	3	6	1454884	1454889	50 %	50 %	0 %	0 %	94987627
39049	NC_008011	ACT	2	6	1454912	1454917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39050	NC_008011	TA	3	6	1454926	1454931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39051	NC_008011	TTAT	2	8	1454939	1454946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39052	NC_008011	ATA	2	6	1454953	1454958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39053	NC_008011	AATGTT	2	12	1454970	1454981	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39054	NC_008011	AT	3	6	1455010	1455015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39055	NC_008011	TCTA	2	8	1455030	1455037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39056	NC_008011	TAAGC	2	10	1455088	1455097	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39057	NC_008011	ACA	2	6	1455106	1455111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39058	NC_008011	AGA	3	9	1455124	1455132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39059	NC_008011	AT	3	6	1455173	1455178	50 %	50 %	0 %	0 %	94987628
39060	NC_008011	TGT	2	6	1455203	1455208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987628
39061	NC_008011	T	7	7	1455238	1455244	0 %	100 %	0 %	0 %	94987628
39062	NC_008011	CTACAC	2	12	1455247	1455258	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	94987628
39063	NC_008011	TAA	2	6	1455272	1455277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94987628
39064	NC_008011	AGA	3	9	1455464	1455472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987628
39065	NC_008011	AGA	2	6	1455508	1455513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987628
39066	NC_008011	TAC	2	6	1455569	1455574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987628
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39069	NC_008011	AT	3	6	1455613	1455618	50 %	50 %	0 %	0 %	94987628
39070	NC_008011	AGA	2	6	1455650	1455655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94987628
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39074	NC_008011	TGA	2	6	1455784	1455789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987629
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39093	NC_008011	A	6	6	1456367	1456372	100 %	0 %	0 %	0 %	94987629
39094	NC_008011	TTA	2	6	1456427	1456432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94987629
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39096	NC_008011	CTTAT	2	10	1456659	1456668	20 %	60 %	0 %	20 %	94987629
39097	NC_008011	C	6	6	1456692	1456697	0 %	0 %	0 %	100 %	94987629
39098	NC_008011	ATTTAA	2	12	1456731	1456742	50 %	50 %	0 %	0 %	94987629
39099	NC_008011	AT	3	6	1456763	1456768	50 %	50 %	0 %	0 %	94987630
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39102	NC_008011	CAT	2	6	1456834	1456839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94987630
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39106	NC_008011	CATT	2	8	1456932	1456939	25 %	50 %	0 %	25 %	94987630
39107	NC_008011	GTG	2	6	1456996	1457001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94987630
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39110	NC_008011	AT	3	6	1457093	1457098	50 %	50 %	0 %	0 %	94987630
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39112	NC_008011	GA	3	6	1457157	1457162	50 %	0 %	50 %	0 %	94987630
39113	NC_008011	AG	3	6	1457178	1457183	50 %	0 %	50 %	0 %	94987630
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39119	NC_008011	T	6	6	1457307	1457312	0 %	100 %	0 %	0 %	94987630
39120	NC_008011	TGT	2	6	1457322	1457327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94987630
39121	NC_008011	ATG	2	6	1457364	1457369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94987630
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