MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_008011	CCA	2	6	89409	89414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986511
2502	NC_008011	GCA	2	6	89445	89450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986511
2503	NC_008011	A	6	6	89480	89485	100 %	0 %	0 %	0 %	94986511
2504	NC_008011	CCA	2	6	89498	89503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986511
2505	NC_008011	AGT	2	6	89519	89524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986511
2506	NC_008011	TGGC	2	8	89554	89561	0 %	25 %	50 %	25 %	94986511
2507	NC_008011	AT	3	6	89584	89589	50 %	50 %	0 %	0 %	94986511
2508	NC_008011	AT	3	6	89607	89612	50 %	50 %	0 %	0 %	94986511
2509	NC_008011	TTAC	2	8	89652	89659	25 %	50 %	0 %	25 %	94986511
2510	NC_008011	ATT	2	6	89768	89773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986511
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2512	NC_008011	ATT	2	6	89792	89797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986511
2513	NC_008011	AGAT	2	8	89816	89823	50 %	25 %	25 %	0 %	94986511
2514	NC_008011	ATTT	2	8	89833	89840	25 %	75 %	0 %	0 %	94986511
2515	NC_008011	AT	3	6	89852	89857	50 %	50 %	0 %	0 %	94986511
2516	NC_008011	TAG	2	6	89920	89925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_008011	AT	3	6	89950	89955	50 %	50 %	0 %	0 %	94986512
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2520	NC_008011	TTAC	2	8	90055	90062	25 %	50 %	0 %	25 %	94986512
2521	NC_008011	CTGTTT	2	12	90080	90091	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	94986512
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2525	NC_008011	TCT	2	6	90208	90213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986512
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2529	NC_008011	AGT	2	6	90480	90485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986512
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2531	NC_008011	ATT	2	6	90539	90544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_008011	TGTT	2	8	90578	90585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2535	NC_008011	TTA	2	6	90599	90604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_008011	AT	7	14	90626	90639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_008011	T	6	6	90645	90650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2539	NC_008011	T	6	6	90702	90707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_008011	AAT	2	6	90714	90719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_008011	ATG	2	6	90801	90806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986513
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2545	NC_008011	ATC	2	6	90932	90937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986513
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2549	NC_008011	ACA	2	6	91094	91099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986513
2550	NC_008011	TAT	2	6	91119	91124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986513
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2552	NC_008011	GTA	2	6	91135	91140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986513
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2556	NC_008011	A	6	6	91346	91351	100 %	0 %	0 %	0 %	94986513
2557	NC_008011	ACA	2	6	91364	91369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986513
2558	NC_008011	TGT	2	6	91443	91448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2561	NC_008011	AATA	2	8	91519	91526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_008011	TA	3	6	91550	91555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_008011	T	7	7	91571	91577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2565	NC_008011	TAA	2	6	91588	91593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_008011	TAT	2	6	91647	91652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_008011	TAC	2	6	91655	91660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2569	NC_008011	TAT	2	6	91680	91685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_008011	TAT	2	6	91700	91705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_008011	TA	3	6	92375	92380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_008011	A	6	6	92399	92404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_008011	TATT	2	8	92429	92436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_008011	TTA	2	6	92451	92456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_008011	T	7	7	92470	92476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2603	NC_008011	T	7	7	92580	92586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2606	NC_008011	GT	3	6	92810	92815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_008011	TA	3	6	92864	92869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_008011	AT	7	14	92881	92894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_008011	CTA	2	6	92897	92902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2614	NC_008011	CAAAC	2	10	93048	93057	60 %	0 %	0 %	40 %	94986514
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