MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008011	TTGT	2	8	37312	37319	0 %	75 %	25 %	0 %	94986477
1002	NC_008011	TTTTCC	2	12	37404	37415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986477
1003	NC_008011	CTA	2	6	37503	37508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986477
1004	NC_008011	CTG	2	6	37525	37530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986477
1005	NC_008011	TAT	2	6	37552	37557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986477
1006	NC_008011	AT	3	6	37578	37583	50 %	50 %	0 %	0 %	94986477
1007	NC_008011	T	8	8	37625	37632	0 %	100 %	0 %	0 %	94986477
1008	NC_008011	AT	3	6	37638	37643	50 %	50 %	0 %	0 %	94986477
1009	NC_008011	AGC	2	6	37679	37684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986477
1010	NC_008011	TTC	2	6	37688	37693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986477
1011	NC_008011	TTG	2	6	37796	37801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986477
1012	NC_008011	AGA	3	9	37853	37861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986477
1013	NC_008011	TAA	2	6	37951	37956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986477
1014	NC_008011	A	6	6	37989	37994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008011	AGTA	2	8	38017	38024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008011	TAA	2	6	38040	38045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_008011	AGT	2	6	38081	38086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008011	TAA	2	6	38113	38118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008011	AAG	2	6	38123	38128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_008011	TA	4	8	38162	38169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008011	TA	3	6	38234	38239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008011	TA	3	6	38246	38251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008011	GTTT	2	8	38257	38264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008011	AAG	2	6	38274	38279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008011	TA	4	8	38311	38318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_008011	AT	4	8	38328	38335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_008011	TGT	2	6	38336	38341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_008011	GTT	2	6	38357	38362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008011	AAT	2	6	38441	38446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986478
1030	NC_008011	AAT	2	6	38506	38511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986478
1031	NC_008011	GTTT	2	8	38554	38561	0 %	75 %	25 %	0 %	94986478
1032	NC_008011	TCT	2	6	38597	38602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986478
1033	NC_008011	CTA	2	6	38663	38668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986478
1034	NC_008011	ATA	3	9	38672	38680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986478
1035	NC_008011	TCTG	2	8	38761	38768	0 %	50 %	25 %	25 %	94986478
1036	NC_008011	AAAT	2	8	38820	38827	75 %	25 %	0 %	0 %	94986478
1037	NC_008011	TA	3	6	38857	38862	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
1038	NC_008011	TTC	3	9	38932	38940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986478
1039	NC_008011	AGA	2	6	38972	38977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986478
1040	NC_008011	TAG	2	6	38981	38986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986478
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1042	NC_008011	TAT	2	6	39012	39017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986478
1043	NC_008011	ATT	6	18	39019	39036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986478
1044	NC_008011	T	6	6	39059	39064	0 %	100 %	0 %	0 %	94986478
1045	NC_008011	TAAG	2	8	39086	39093	50 %	25 %	25 %	0 %	94986478
1046	NC_008011	T	7	7	39137	39143	0 %	100 %	0 %	0 %	94986478
1047	NC_008011	T	7	7	39249	39255	0 %	100 %	0 %	0 %	94986478
1048	NC_008011	TAC	2	6	39288	39293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986478
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1050	NC_008011	TG	4	8	39379	39386	0 %	50 %	50 %	0 %	94986478
1051	NC_008011	GTT	2	6	39428	39433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986478
1052	NC_008011	GTTCT	2	10	39483	39492	0 %	60 %	20 %	20 %	94986478
1053	NC_008011	AATG	2	8	39537	39544	50 %	25 %	25 %	0 %	94986478
1054	NC_008011	TAG	2	6	39633	39638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986478
1055	NC_008011	GAT	2	6	39639	39644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986478
1056	NC_008011	CTA	2	6	39687	39692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986478
1057	NC_008011	TAA	2	6	39717	39722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986478
1058	NC_008011	TCT	2	6	39749	39754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986478
1059	NC_008011	AT	3	6	39867	39872	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
1060	NC_008011	TTA	2	6	39935	39940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986478
1061	NC_008011	ATT	2	6	39991	39996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986478
1062	NC_008011	AGC	2	6	40015	40020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986478
1063	NC_008011	T	6	6	40029	40034	0 %	100 %	0 %	0 %	94986478
1064	NC_008011	TG	3	6	40047	40052	0 %	50 %	50 %	0 %	94986478
1065	NC_008011	TCA	2	6	40089	40094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986478
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1067	NC_008011	TAA	2	6	40154	40159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986478
1068	NC_008011	CTGA	2	8	40171	40178	25 %	25 %	25 %	25 %	94986478
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1070	NC_008011	TTGT	2	8	40212	40219	0 %	75 %	25 %	0 %	94986478
1071	NC_008011	TACAT	2	10	40247	40256	40 %	40 %	0 %	20 %	94986478
1072	NC_008011	TTTTAA	2	12	40263	40274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986478
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1080	NC_008011	AAATT	2	10	40493	40502	60 %	40 %	0 %	0 %	94986478
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1085	NC_008011	TAT	2	6	40659	40664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986478
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1087	NC_008011	AAT	2	6	40798	40803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986478
1088	NC_008011	TA	3	6	40804	40809	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
1089	NC_008011	AT	3	6	40810	40815	50 %	50 %	0 %	0 %	94986478
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1091	NC_008011	A	7	7	40838	40844	100 %	0 %	0 %	0 %	94986478
1092	NC_008011	AT	3	6	40856	40861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008011	AATA	3	12	40876	40887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008011	AT	3	6	40935	40940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008011	A	8	8	40950	40957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008011	AATT	2	8	40963	40970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_008011	CTAT	2	8	40983	40990	25 %	50 %	0 %	25 %	94986479
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1101	NC_008011	TTA	2	6	41187	41192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986479
1102	NC_008011	AAG	2	6	41197	41202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986479
1103	NC_008011	TCA	2	6	41204	41209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986479
1104	NC_008011	T	6	6	41213	41218	0 %	100 %	0 %	0 %	94986479
1105	NC_008011	GAA	2	6	41244	41249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986479
1106	NC_008011	GTA	2	6	41265	41270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986479
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1109	NC_008011	TAG	2	6	41327	41332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986479
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1112	NC_008011	TA	3	6	41415	41420	50 %	50 %	0 %	0 %	94986479
1113	NC_008011	TTA	2	6	41433	41438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986479
1114	NC_008011	TAT	3	9	41467	41475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986479
1115	NC_008011	AAG	2	6	41563	41568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986479
1116	NC_008011	CTT	2	6	41587	41592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986479
1117	NC_008011	TA	3	6	41628	41633	50 %	50 %	0 %	0 %	94986479
1118	NC_008011	T	6	6	41714	41719	0 %	100 %	0 %	0 %	94986479
1119	NC_008011	CTG	2	6	41767	41772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986479
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1123	NC_008011	TTG	2	6	41914	41919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986479
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1127	NC_008011	TGG	2	6	42048	42053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	94986479
1128	NC_008011	TGT	2	6	42075	42080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986479
1129	NC_008011	TCA	2	6	42090	42095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986479
1130	NC_008011	CAA	2	6	42105	42110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986479
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