MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008011	T	7	7	217195	217201	0 %	100 %	0 %	0 %	94986616
6002	NC_008011	GAT	2	6	217208	217213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986616
6003	NC_008011	CCA	2	6	217285	217290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986616
6004	NC_008011	GAG	2	6	217309	217314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	94986616
6005	NC_008011	AAAT	2	8	217335	217342	75 %	25 %	0 %	0 %	94986616
6006	NC_008011	AAG	2	6	217348	217353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986616
6007	NC_008011	TTC	2	6	217404	217409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986616
6008	NC_008011	TTG	2	6	217479	217484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986616
6009	NC_008011	ATTT	2	8	217485	217492	25 %	75 %	0 %	0 %	94986616
6010	NC_008011	CCA	2	6	217513	217518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986616
6011	NC_008011	TA	3	6	217672	217677	50 %	50 %	0 %	0 %	94986616
6012	NC_008011	TCATTT	2	12	217736	217747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	94986616
6013	NC_008011	T	6	6	217745	217750	0 %	100 %	0 %	0 %	94986616
6014	NC_008011	ATT	2	6	217765	217770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986616
6015	NC_008011	A	7	7	217909	217915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_008011	ACA	2	6	217969	217974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_008011	TAA	2	6	217989	217994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008011	TTAT	2	8	218030	218037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008011	TAT	3	9	218052	218060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008011	AGA	2	6	218127	218132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008011	TA	3	6	218190	218195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_008011	TTA	2	6	218209	218214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_008011	AATAA	2	10	218245	218254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_008011	AGA	2	6	218259	218264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_008011	AAGT	2	8	218290	218297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_008011	TTA	2	6	218310	218315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_008011	T	7	7	218349	218355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_008011	T	7	7	218405	218411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_008011	T	6	6	218423	218428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_008011	T	6	6	218433	218438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_008011	GTT	2	6	218443	218448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_008011	TTA	2	6	218466	218471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_008011	AGTT	2	8	218473	218480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_008011	ATTA	2	8	218481	218488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_008011	TAT	2	6	218490	218495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_008011	T	12	12	218498	218509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_008011	ATT	2	6	218583	218588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_008011	TCA	2	6	218600	218605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_008011	TAT	2	6	218611	218616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008011	ATT	2	6	218633	218638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_008011	CT	3	6	218645	218650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_008011	TTAT	2	8	218672	218679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_008011	A	7	7	218709	218715	100 %	0 %	0 %	0 %	94986617
6044	NC_008011	GCC	2	6	218730	218735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	94986617
6045	NC_008011	AACAA	2	10	218745	218754	80 %	0 %	0 %	20 %	94986617
6046	NC_008011	TTC	2	6	218769	218774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986617
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6048	NC_008011	A	6	6	218782	218787	100 %	0 %	0 %	0 %	94986617
6049	NC_008011	CTA	2	6	218816	218821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986617
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6051	NC_008011	GAA	2	6	218853	218858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986617
6052	NC_008011	GAC	2	6	218866	218871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986617
6053	NC_008011	CGA	2	6	218879	218884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986617
6054	NC_008011	A	6	6	218946	218951	100 %	0 %	0 %	0 %	94986617
6055	NC_008011	AGA	2	6	218960	218965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986617
6056	NC_008011	TGC	2	6	218972	218977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986617
6057	NC_008011	A	6	6	218987	218992	100 %	0 %	0 %	0 %	94986617
6058	NC_008011	AT	3	6	219085	219090	50 %	50 %	0 %	0 %	94986617
6059	NC_008011	GAA	2	6	219108	219113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986617
6060	NC_008011	CAA	2	6	219118	219123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986617
6061	NC_008011	ATG	2	6	219124	219129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986617
6062	NC_008011	TTGCT	2	10	219193	219202	0 %	60 %	20 %	20 %	94986617
6063	NC_008011	TCG	2	6	219203	219208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986617
6064	NC_008011	A	7	7	219226	219232	100 %	0 %	0 %	0 %	94986617
6065	NC_008011	ATA	2	6	219289	219294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986617
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6073	NC_008011	TGA	2	6	219824	219829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986617
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6079	NC_008011	GAATT	2	10	220000	220009	40 %	40 %	20 %	0 %	94986618
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6088	NC_008011	TA	3	6	220169	220174	50 %	50 %	0 %	0 %	94986618
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6093	NC_008011	ACT	2	6	220291	220296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986618
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6099	NC_008011	ATA	2	6	220586	220591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986618
6100	NC_008011	AAATT	2	10	220618	220627	60 %	40 %	0 %	0 %	94986618
6101	NC_008011	ATA	2	6	220658	220663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986618
6102	NC_008011	AAG	2	6	220696	220701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986618
6103	NC_008011	A	7	7	220747	220753	100 %	0 %	0 %	0 %	94986618
6104	NC_008011	A	7	7	220798	220804	100 %	0 %	0 %	0 %	94986618
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6107	NC_008011	GAG	2	6	220959	220964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_008011	AGC	2	6	221043	221048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_008011	ATG	2	6	221109	221114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_008011	GGA	2	6	221200	221205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_008011	TGA	2	6	221260	221265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986619
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6114	NC_008011	ATT	2	6	221424	221429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986619
6115	NC_008011	TGC	2	6	221523	221528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986619
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6119	NC_008011	A	7	7	221685	221691	100 %	0 %	0 %	0 %	94986619
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6124	NC_008011	GCA	2	6	221817	221822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986619
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6127	NC_008011	T	6	6	221918	221923	0 %	100 %	0 %	0 %	94986619
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6255	NC_008011	TGGA	2	8	226964	226971	25 %	25 %	50 %	0 %	94986623
6256	NC_008011	TC	3	6	226999	227004	0 %	50 %	0 %	50 %	94986623
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6262	NC_008011	TGAT	2	8	227273	227280	25 %	50 %	25 %	0 %	94986623
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