MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008011	ATT	2	6	197398	197403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_008011	AATT	2	8	197422	197429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_008011	T	8	8	197451	197458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_008011	TAG	2	6	197493	197498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_008011	TAA	2	6	197511	197516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_008011	ATT	2	6	197566	197571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_008011	AGC	2	6	197590	197595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_008011	ATA	3	9	197600	197608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_008011	ACCT	2	8	197683	197690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5510	NC_008011	CTT	2	6	197744	197749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_008011	T	6	6	197773	197778	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_008011	AGT	2	6	197826	197831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_008011	A	7	7	197879	197885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_008011	GAA	2	6	197889	197894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_008011	TTC	2	6	197916	197921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_008011	CTT	2	6	197967	197972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986603
5517	NC_008011	TATT	2	8	197973	197980	25 %	75 %	0 %	0 %	94986603
5518	NC_008011	ATT	2	6	198007	198012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986603
5519	NC_008011	GTT	2	6	198071	198076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
5520	NC_008011	TTTA	2	8	198145	198152	25 %	75 %	0 %	0 %	94986603
5521	NC_008011	T	7	7	198201	198207	0 %	100 %	0 %	0 %	94986603
5522	NC_008011	AGA	2	6	198227	198232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986603
5523	NC_008011	TCC	2	6	198244	198249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986603
5524	NC_008011	GTT	2	6	198279	198284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
5525	NC_008011	AGCT	2	8	198333	198340	25 %	25 %	25 %	25 %	94986603
5526	NC_008011	TGC	2	6	198370	198375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986603
5527	NC_008011	TCT	2	6	198443	198448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986603
5528	NC_008011	AGAA	2	8	198451	198458	75 %	0 %	25 %	0 %	94986603
5529	NC_008011	ACC	2	6	198463	198468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986603
5530	NC_008011	GTA	2	6	198494	198499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986603
5531	NC_008011	GTT	3	9	198500	198508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
5532	NC_008011	AAG	2	6	198580	198585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986603
5533	NC_008011	AAT	2	6	198631	198636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986603
5534	NC_008011	CTT	2	6	198702	198707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986603
5535	NC_008011	TTG	2	6	198731	198736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
5536	NC_008011	TCC	2	6	198802	198807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	94986603
5537	NC_008011	ACC	2	6	198976	198981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986603
5538	NC_008011	ATA	2	6	198982	198987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986603
5539	NC_008011	ATTT	2	8	199014	199021	25 %	75 %	0 %	0 %	94986603
5540	NC_008011	TTG	2	6	199029	199034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986603
5541	NC_008011	TAT	2	6	199150	199155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986603
5542	NC_008011	A	6	6	199186	199191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_008011	GTT	2	6	199197	199202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_008011	TAAT	2	8	199217	199224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_008011	T	7	7	199245	199251	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
5546	NC_008011	ACC	2	6	199272	199277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
5547	NC_008011	GTA	2	6	199366	199371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986604
5548	NC_008011	TA	3	6	199400	199405	50 %	50 %	0 %	0 %	94986604
5549	NC_008011	ACC	2	6	199434	199439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
5550	NC_008011	AGC	2	6	199440	199445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986604
5551	NC_008011	TAC	2	6	199475	199480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986604
5552	NC_008011	TGT	2	6	199490	199495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986604
5553	NC_008011	T	7	7	199514	199520	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
5554	NC_008011	CATA	2	8	199535	199542	50 %	25 %	0 %	25 %	94986604
5555	NC_008011	T	6	6	199586	199591	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
5556	NC_008011	T	6	6	199609	199614	0 %	100 %	0 %	0 %	94986604
5557	NC_008011	TCT	2	6	199651	199656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986604
5558	NC_008011	CAT	2	6	199679	199684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986604
5559	NC_008011	TTC	2	6	199749	199754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986604
5560	NC_008011	CAA	2	6	199784	199789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986604
5561	NC_008011	GA	3	6	199852	199857	50 %	0 %	50 %	0 %	94986604
5562	NC_008011	TTG	2	6	199898	199903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986604
5563	NC_008011	ACC	2	6	199911	199916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
5564	NC_008011	GCAA	2	8	199923	199930	50 %	0 %	25 %	25 %	94986604
5565	NC_008011	AAGCAC	2	12	199985	199996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	94986604
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5568	NC_008011	ACC	2	6	200148	200153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986604
5569	NC_008011	AAT	2	6	200169	200174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986604
5570	NC_008011	CACTAG	2	12	200231	200242	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	94986604
5571	NC_008011	CTTT	2	8	200413	200420	0 %	75 %	0 %	25 %	94986604
5572	NC_008011	ATT	2	6	200424	200429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986604
5573	NC_008011	TAC	2	6	200460	200465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986604
5574	NC_008011	GA	3	6	200522	200527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5575	NC_008011	ACACA	2	10	200535	200544	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5576	NC_008011	T	6	6	200617	200622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_008011	TCA	2	6	200631	200636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_008011	CTT	2	6	200656	200661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_008011	AG	3	6	200691	200696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008011	TCT	2	6	200709	200714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_008011	CAG	2	6	200743	200748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_008011	GTT	2	6	200758	200763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_008011	ATT	2	6	200769	200774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_008011	T	7	7	200773	200779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_008011	TTC	2	6	200786	200791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5586	NC_008011	TCC	2	6	200809	200814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5587	NC_008011	T	6	6	200862	200867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_008011	TAA	2	6	200874	200879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_008011	CAA	2	6	200904	200909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	94986605
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5591	NC_008011	A	7	7	200970	200976	100 %	0 %	0 %	0 %	94986605
5592	NC_008011	CAT	2	6	201049	201054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986605
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5594	NC_008011	AGCC	2	8	201163	201170	25 %	0 %	25 %	50 %	94986605
5595	NC_008011	TGC	3	9	201173	201181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986605
5596	NC_008011	ACCTG	2	10	201189	201198	20 %	20 %	20 %	40 %	94986605
5597	NC_008011	GTT	2	6	201250	201255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	94986605
5598	NC_008011	ATT	2	6	201261	201266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986605
5599	NC_008011	GCT	2	6	201270	201275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986605
5600	NC_008011	CATA	2	8	201281	201288	50 %	25 %	0 %	25 %	94986605
5601	NC_008011	TAA	2	6	201347	201352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986605
5602	NC_008011	TTA	2	6	201378	201383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986605
5603	NC_008011	A	6	6	201425	201430	100 %	0 %	0 %	0 %	94986605
5604	NC_008011	ATC	2	6	201440	201445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986605
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5606	NC_008011	TAA	2	6	201544	201549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986605
5607	NC_008011	CTT	2	6	201660	201665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_008011	CAA	2	6	201699	201704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_008011	T	6	6	201709	201714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008011	T	6	6	201716	201721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_008011	T	6	6	201731	201736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008011	TAA	2	6	201756	201761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986606
5613	NC_008011	CCA	2	6	201795	201800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	94986606
5614	NC_008011	CTGA	2	8	201826	201833	25 %	25 %	25 %	25 %	94986606
5615	NC_008011	GCA	2	6	201879	201884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	94986606
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5621	NC_008011	TAA	2	6	202096	202101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986606
5622	NC_008011	A	6	6	202100	202105	100 %	0 %	0 %	0 %	94986606
5623	NC_008011	GTC	2	6	202109	202114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	94986606
5624	NC_008011	CTT	2	6	202136	202141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986606
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5626	NC_008011	AGTA	2	8	202160	202167	50 %	25 %	25 %	0 %	94986606
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