MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lawsonia intracellularis PHE/MN1-00 chromosome

Total Repeats: 39125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_008011	CA	3	6	178512	178517	50 %	0 %	0 %	50 %	94986587
5003	NC_008011	TTC	2	6	178534	178539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	94986587
5004	NC_008011	TGA	2	6	178541	178546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986587
5005	NC_008011	TAACA	2	10	178547	178556	60 %	20 %	0 %	20 %	94986587
5006	NC_008011	ATA	2	6	178561	178566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	94986587
5007	NC_008011	TA	3	6	178565	178570	50 %	50 %	0 %	0 %	94986587
5008	NC_008011	TAG	2	6	178639	178644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986587
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5012	NC_008011	CAT	2	6	178780	178785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	94986587
5013	NC_008011	ATG	2	6	178792	178797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	94986587
5014	NC_008011	GAA	2	6	178842	178847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986587
5015	NC_008011	TA	3	6	178942	178947	50 %	50 %	0 %	0 %	94986587
5016	NC_008011	ATT	2	6	178985	178990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986587
5017	NC_008011	AAAT	2	8	179038	179045	75 %	25 %	0 %	0 %	94986587
5018	NC_008011	ATGG	2	8	179057	179064	25 %	25 %	50 %	0 %	94986587
5019	NC_008011	AGGT	2	8	179068	179075	25 %	25 %	50 %	0 %	94986587
5020	NC_008011	AAG	2	6	179104	179109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986587
5021	NC_008011	TTG	2	6	179149	179154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_008011	AAT	2	6	179182	179187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008011	TAC	2	6	179222	179227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_008011	A	7	7	179237	179243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_008011	TA	3	6	179354	179359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008011	TGC	2	6	179364	179369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5028	NC_008011	TAC	2	6	179409	179414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_008011	TAT	2	6	179418	179423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008011	TTG	2	6	179452	179457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5032	NC_008011	TGA	2	6	179583	179588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_008011	AAT	2	6	179589	179594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5035	NC_008011	A	6	6	179606	179611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_008011	ATA	2	6	179618	179623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_008011	ATA	2	6	179628	179633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_008011	AG	3	6	179642	179647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_008011	GATA	2	8	179673	179680	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_008011	TAGA	2	8	179700	179707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_008011	TTA	2	6	179708	179713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008011	AGTA	2	8	179715	179722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008011	A	7	7	179749	179755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008011	A	6	6	179807	179812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_008011	T	6	6	179823	179828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_008011	TAT	2	6	179888	179893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5050	NC_008011	TTA	2	6	179933	179938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_008011	AGA	2	6	179974	179979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5054	NC_008011	AGAT	2	8	180077	180084	50 %	25 %	25 %	0 %	94986588
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5060	NC_008011	T	7	7	180249	180255	0 %	100 %	0 %	0 %	94986588
5061	NC_008011	TTA	2	6	180262	180267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986588
5062	NC_008011	GAA	3	9	180289	180297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	94986588
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5064	NC_008011	TA	3	6	180411	180416	50 %	50 %	0 %	0 %	94986588
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5066	NC_008011	TA	4	8	180487	180494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5071	NC_008011	AGA	2	6	180653	180658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_008011	AT	3	6	181232	181237	50 %	50 %	0 %	0 %	94986589
5093	NC_008011	TTA	2	6	181244	181249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	94986589
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5100	NC_008011	TTG	2	6	181597	181602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_008011	ATTA	2	8	181622	181629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_008011	A	7	7	181633	181639	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008011	AGG	2	6	181653	181658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5105	NC_008011	GATA	2	8	181708	181715	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008011	A	7	7	181726	181732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_008011	T	7	7	181891	181897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_008011	TAT	3	9	181930	181938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_008011	ATTA	2	8	181941	181948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_008011	AAT	2	6	181950	181955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_008011	TA	3	6	181957	181962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_008011	T	6	6	181972	181977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_008011	T	6	6	181979	181984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_008011	TA	3	6	182023	182028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008011	ATT	2	6	182062	182067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_008011	T	6	6	182066	182071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_008011	TTCA	2	8	187793	187800	25 %	50 %	0 %	25 %	94986593
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