MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007576	GCG	2	6	24787	24792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_007576	A	7	7	24794	24800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007576	GCG	2	6	24949	24954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_007576	CGG	2	6	24992	24997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_007576	GGC	2	6	24999	25004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007576	ACC	2	6	25011	25016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_007576	CAT	2	6	25083	25088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_007576	TTA	2	6	25141	25146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007576	CAGT	2	8	25160	25167	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_007576	GCA	2	6	25201	25206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_007576	CTTG	2	8	25207	25214	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_007576	TCC	2	6	25226	25231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_007576	GAA	2	6	25270	25275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_007576	ATT	2	6	25309	25314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007576	GTT	2	6	25378	25383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007576	A	7	7	25425	25431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007576	T	7	7	25467	25473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_007576	TAA	2	6	25477	25482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427641
519	NC_007576	TGA	2	6	25487	25492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427641
520	NC_007576	TGG	2	6	25498	25503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427641
521	NC_007576	TGT	2	6	25528	25533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427641
522	NC_007576	TTG	2	6	25545	25550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427641
523	NC_007576	CCAT	2	8	25618	25625	25 %	25 %	0 %	50 %	81427641
524	NC_007576	TTG	2	6	25643	25648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427641
525	NC_007576	TG	3	6	25858	25863	0 %	50 %	50 %	0 %	81427641
526	NC_007576	CCG	2	6	25954	25959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81427641
527	NC_007576	CCG	2	6	25966	25971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81427641
528	NC_007576	GATC	2	8	25991	25998	25 %	25 %	25 %	25 %	81427641
529	NC_007576	AG	3	6	26028	26033	50 %	0 %	50 %	0 %	81427641
530	NC_007576	TTG	2	6	26118	26123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427642
531	NC_007576	TGA	2	6	26141	26146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427642
532	NC_007576	T	7	7	26154	26160	0 %	100 %	0 %	0 %	81427642
533	NC_007576	ATT	2	6	26178	26183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427642
534	NC_007576	TAG	2	6	26200	26205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427642
535	NC_007576	TGA	2	6	26209	26214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427642
536	NC_007576	GAC	2	6	26220	26225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427642
537	NC_007576	TTG	2	6	26232	26237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427642
538	NC_007576	TTG	2	6	26322	26327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427642
539	NC_007576	ACC	2	6	26370	26375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427642
540	NC_007576	AGT	2	6	26482	26487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427642
541	NC_007576	TGAT	2	8	26524	26531	25 %	50 %	25 %	0 %	81427642
542	NC_007576	A	6	6	26549	26554	100 %	0 %	0 %	0 %	81427642
543	NC_007576	CCT	2	6	26566	26571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_007576	GATA	2	8	26573	26580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007576	CACT	2	8	26602	26609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_007576	TGG	2	6	26639	26644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007576	GAT	2	6	26665	26670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007576	CAG	3	9	26691	26699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427643
549	NC_007576	AGA	2	6	26706	26711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427643
550	NC_007576	GAC	2	6	26725	26730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427643
551	NC_007576	ATT	2	6	26740	26745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427643
552	NC_007576	GGTT	2	8	26782	26789	0 %	50 %	50 %	0 %	81427643
553	NC_007576	TTA	2	6	26816	26821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427643
554	NC_007576	ATG	2	6	26832	26837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427643
555	NC_007576	TAA	2	6	26971	26976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427643
556	NC_007576	A	6	6	27024	27029	100 %	0 %	0 %	0 %	81427643
557	NC_007576	TGCT	2	8	27083	27090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
558	NC_007576	AATCA	2	10	27210	27219	60 %	20 %	0 %	20 %	81427644
559	NC_007576	CAA	2	6	27249	27254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427644
560	NC_007576	A	6	6	27298	27303	100 %	0 %	0 %	0 %	81427644
561	NC_007576	CAC	2	6	27308	27313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427644
562	NC_007576	AGC	2	6	27539	27544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427644
563	NC_007576	CAT	2	6	27578	27583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427644
564	NC_007576	GCT	2	6	27594	27599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427644
565	NC_007576	TCG	3	9	27625	27633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427644
566	NC_007576	GCC	2	6	27678	27683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81427644
567	NC_007576	TTA	2	6	27696	27701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427644
568	NC_007576	TTG	2	6	27742	27747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427644
569	NC_007576	A	6	6	27768	27773	100 %	0 %	0 %	0 %	81427644
570	NC_007576	AGC	2	6	27806	27811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427644
571	NC_007576	CGTG	2	8	27837	27844	0 %	25 %	50 %	25 %	81427644
572	NC_007576	AGA	2	6	27866	27871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427644
573	NC_007576	GAC	2	6	27896	27901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427644
574	NC_007576	GTT	2	6	27945	27950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427644
575	NC_007576	ATT	2	6	27981	27986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427644
576	NC_007576	T	6	6	28047	28052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007576	CAAT	2	8	28104	28111	50 %	25 %	0 %	25 %	81427645
578	NC_007576	AAC	2	6	28160	28165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427645
579	NC_007576	GAA	2	6	28256	28261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427645
580	NC_007576	GTT	2	6	28281	28286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427645
581	NC_007576	TCT	2	6	28314	28319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427645
582	NC_007576	TGA	2	6	28321	28326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427645
583	NC_007576	AAT	2	6	28371	28376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427645
584	NC_007576	CAA	2	6	28429	28434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427645
585	NC_007576	GTTT	2	8	28449	28456	0 %	75 %	25 %	0 %	81427645
586	NC_007576	TAA	2	6	28472	28477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427645
587	NC_007576	GTT	2	6	28491	28496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427645
588	NC_007576	GAT	2	6	28508	28513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427645
589	NC_007576	ATC	2	6	28544	28549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427645
590	NC_007576	TTTATC	2	12	28598	28609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	81427645
591	NC_007576	TTG	2	6	28643	28648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427645
592	NC_007576	AAC	2	6	28661	28666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427645
593	NC_007576	CGA	2	6	28690	28695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427645
594	NC_007576	CAC	2	6	28792	28797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427645
595	NC_007576	TGA	2	6	28822	28827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427645
596	NC_007576	CAG	2	6	28861	28866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427645
597	NC_007576	AAC	2	6	28886	28891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427645
598	NC_007576	ATG	2	6	28935	28940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427645
599	NC_007576	TTC	2	6	29004	29009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427645
600	NC_007576	TAA	2	6	29114	29119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427645
601	NC_007576	T	6	6	29249	29254	0 %	100 %	0 %	0 %	81427645
602	NC_007576	GAAT	2	8	29271	29278	50 %	25 %	25 %	0 %	81427645
603	NC_007576	TCT	2	6	29283	29288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427645
604	NC_007576	GCA	2	6	29325	29330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427645
605	NC_007576	A	6	6	29334	29339	100 %	0 %	0 %	0 %	81427645
606	NC_007576	GCT	2	6	29340	29345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427645
607	NC_007576	AGAA	2	8	29346	29353	75 %	0 %	25 %	0 %	81427645
608	NC_007576	AT	3	6	29493	29498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007576	TAAT	2	8	29515	29522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_007576	T	6	6	29554	29559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007576	ACG	2	6	29590	29595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_007576	GCT	2	6	29610	29615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_007576	AG	4	8	29620	29627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_007576	CAA	2	6	29668	29673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427646
615	NC_007576	TGGTAA	2	12	29771	29782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427646
616	NC_007576	GCGAT	2	10	29806	29815	20 %	20 %	40 %	20 %	81427646
617	NC_007576	AGC	2	6	29840	29845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427646
618	NC_007576	TAA	2	6	29906	29911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427646
619	NC_007576	AAG	2	6	29967	29972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427646
620	NC_007576	GTG	2	6	30023	30028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427646
621	NC_007576	TTC	2	6	30080	30085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427646
622	NC_007576	AAT	2	6	30159	30164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427646
623	NC_007576	TTC	2	6	30200	30205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427646
624	NC_007576	GTT	2	6	30255	30260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427646
625	NC_007576	CAC	2	6	30283	30288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427646
626	NC_007576	TGC	2	6	30368	30373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427646
627	NC_007576	GTT	3	9	30465	30473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427646
628	NC_007576	GTC	2	6	30477	30482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427646
629	NC_007576	CTT	2	6	30498	30503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_007576	TAA	2	6	30601	30606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427647
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632	NC_007576	GAT	2	6	30688	30693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427647
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