MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 39667

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007576	GAAA	2	8	234197	234204	75 %	0 %	25 %	0 %	81427851
5002	NC_007576	AAGT	2	8	234236	234243	50 %	25 %	25 %	0 %	81427851
5003	NC_007576	CTA	2	6	234271	234276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427851
5004	NC_007576	ATT	2	6	234316	234321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427851
5005	NC_007576	GGCG	2	8	234400	234407	0 %	0 %	75 %	25 %	81427851
5006	NC_007576	TA	3	6	234418	234423	50 %	50 %	0 %	0 %	81427851
5007	NC_007576	CAT	2	6	234468	234473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427851
5008	NC_007576	CTG	2	6	234493	234498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427851
5009	NC_007576	CAC	2	6	234601	234606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427851
5010	NC_007576	CGA	2	6	234652	234657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427851
5011	NC_007576	CAG	2	6	234670	234675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427851
5012	NC_007576	CAA	2	6	234702	234707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427851
5013	NC_007576	GT	3	6	234709	234714	0 %	50 %	50 %	0 %	81427851
5014	NC_007576	AAGG	2	8	234872	234879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_007576	TAT	2	6	234945	234950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427852
5016	NC_007576	GAA	2	6	234951	234956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427852
5017	NC_007576	TTA	2	6	234973	234978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427852
5018	NC_007576	A	7	7	235050	235056	100 %	0 %	0 %	0 %	81427852
5019	NC_007576	AT	3	6	235085	235090	50 %	50 %	0 %	0 %	81427852
5020	NC_007576	CAA	2	6	235143	235148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427852
5021	NC_007576	TCA	2	6	235295	235300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427852
5022	NC_007576	AGT	2	6	235306	235311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427852
5023	NC_007576	GTGTT	2	10	235483	235492	0 %	60 %	40 %	0 %	81427853
5024	NC_007576	TG	3	6	235561	235566	0 %	50 %	50 %	0 %	81427853
5025	NC_007576	AGGATT	2	12	235626	235637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427853
5026	NC_007576	TTTAA	2	10	235660	235669	40 %	60 %	0 %	0 %	81427853
5027	NC_007576	TAA	2	6	235697	235702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427853
5028	NC_007576	TTGT	2	8	235835	235842	0 %	75 %	25 %	0 %	81427853
5029	NC_007576	GTT	2	6	235853	235858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427853
5030	NC_007576	T	6	6	235924	235929	0 %	100 %	0 %	0 %	81427854
5031	NC_007576	CGG	2	6	235944	235949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427854
5032	NC_007576	TGT	2	6	236002	236007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427854
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5034	NC_007576	TCA	2	6	236117	236122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427854
5035	NC_007576	GAGGTA	2	12	236248	236259	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	81427854
5036	NC_007576	GAT	2	6	236323	236328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427854
5037	NC_007576	AAT	2	6	236356	236361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_007576	CCTC	2	8	236363	236370	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5039	NC_007576	TTG	2	6	236371	236376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_007576	TAG	2	6	236379	236384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_007576	ATT	2	6	236428	236433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_007576	TGG	2	6	236443	236448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_007576	AAT	2	6	236459	236464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_007576	T	6	6	236479	236484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_007576	T	7	7	236503	236509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_007576	GATA	2	8	236531	236538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_007576	TA	3	6	236608	236613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_007576	ATA	2	6	236643	236648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_007576	AAAAT	2	10	236653	236662	80 %	20 %	0 %	0 %	81427855
5050	NC_007576	A	6	6	236670	236675	100 %	0 %	0 %	0 %	81427855
5051	NC_007576	ATT	2	6	236679	236684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427855
5052	NC_007576	AAG	2	6	236764	236769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427855
5053	NC_007576	A	7	7	236776	236782	100 %	0 %	0 %	0 %	81427855
5054	NC_007576	TGC	2	6	236816	236821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427855
5055	NC_007576	CAA	2	6	236850	236855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427855
5056	NC_007576	AAG	2	6	236887	236892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427855
5057	NC_007576	AAG	2	6	236902	236907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427855
5058	NC_007576	TGA	2	6	236912	236917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427855
5059	NC_007576	GAA	2	6	236955	236960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427855
5060	NC_007576	TGG	2	6	237082	237087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427855
5061	NC_007576	TAA	2	6	237104	237109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427855
5062	NC_007576	AAG	2	6	237127	237132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427855
5063	NC_007576	AGCTAA	2	12	237194	237205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	81427855
5064	NC_007576	A	6	6	237238	237243	100 %	0 %	0 %	0 %	81427855
5065	NC_007576	A	7	7	237297	237303	100 %	0 %	0 %	0 %	81427855
5066	NC_007576	ATA	2	6	237310	237315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427855
5067	NC_007576	A	6	6	237315	237320	100 %	0 %	0 %	0 %	81427855
5068	NC_007576	GCT	2	6	237402	237407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427855
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5070	NC_007576	ATGCTT	2	12	237472	237483	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	81427855
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5072	NC_007576	TGC	2	6	237626	237631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427855
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5075	NC_007576	CTG	2	6	237754	237759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427855
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5077	NC_007576	A	7	7	237825	237831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_007576	TAT	2	6	237844	237849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_007576	CGG	2	6	237850	237855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_007576	ATC	2	6	237856	237861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_007576	TAA	2	6	237900	237905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_007576	GAA	2	6	237916	237921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_007576	TAA	3	9	237950	237958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_007576	AGT	2	6	237980	237985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_007576	CTG	2	6	238409	238414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427856
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5091	NC_007576	TAAA	2	8	238455	238462	75 %	25 %	0 %	0 %	81427856
5092	NC_007576	CAT	2	6	238522	238527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427856
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5094	NC_007576	A	6	6	238598	238603	100 %	0 %	0 %	0 %	81427856
5095	NC_007576	ACG	2	6	238640	238645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427856
5096	NC_007576	ATTA	2	8	238666	238673	50 %	50 %	0 %	0 %	81427856
5097	NC_007576	GCAATT	2	12	238688	238699	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	81427856
5098	NC_007576	ACT	2	6	238723	238728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427856
5099	NC_007576	TCAG	2	8	238818	238825	25 %	25 %	25 %	25 %	81427856
5100	NC_007576	TGA	2	6	238848	238853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427856
5101	NC_007576	CAGG	2	8	238874	238881	25 %	0 %	50 %	25 %	81427856
5102	NC_007576	TTG	2	6	238970	238975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427856
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5104	NC_007576	TGA	2	6	239068	239073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427856
5105	NC_007576	A	6	6	239109	239114	100 %	0 %	0 %	0 %	81427856
5106	NC_007576	ATC	2	6	239166	239171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427856
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5108	NC_007576	GAA	2	6	239201	239206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427856
5109	NC_007576	CTG	2	6	239319	239324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427856
5110	NC_007576	ATT	2	6	239344	239349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427856
5111	NC_007576	GAT	2	6	239386	239391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427856
5112	NC_007576	GAA	2	6	239479	239484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427856
5113	NC_007576	CGA	2	6	239571	239576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427856
5114	NC_007576	ATCA	2	8	239594	239601	50 %	25 %	0 %	25 %	81427856
5115	NC_007576	ACTG	2	8	239671	239678	25 %	25 %	25 %	25 %	81427856
5116	NC_007576	GTT	2	6	239723	239728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427856
5117	NC_007576	ATC	2	6	239742	239747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427856
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5119	NC_007576	GTG	2	6	239799	239804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427856
5120	NC_007576	T	6	6	239858	239863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_007576	GA	3	6	239864	239869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_007576	TTTTG	2	10	239887	239896	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_007576	TGAA	2	8	239903	239910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_007576	GTA	2	6	239911	239916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5126	NC_007576	GAG	2	6	239963	239968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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