MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 2063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006814	AG	3	6	361	366	50 %	0 %	50 %	0 %	58336355
2	NC_006814	TA	3	6	761	766	50 %	50 %	0 %	0 %	58336355
3	NC_006814	AG	3	6	828	833	50 %	0 %	50 %	0 %	58336355
4	NC_006814	AT	3	6	1526	1531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006814	GT	3	6	2817	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006814	TA	3	6	2906	2911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006814	CA	3	6	3306	3311	50 %	0 %	0 %	50 %	58336358
8	NC_006814	CA	3	6	5232	5237	50 %	0 %	0 %	50 %	58336359
9	NC_006814	GA	3	6	9401	9406	50 %	0 %	50 %	0 %	58336362
10	NC_006814	AG	3	6	10012	10017	50 %	0 %	50 %	0 %	58336363
11	NC_006814	AC	3	6	10605	10610	50 %	0 %	0 %	50 %	58336364
12	NC_006814	TA	3	6	14206	14211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006814	AT	3	6	15657	15662	50 %	50 %	0 %	0 %	58336368
14	NC_006814	AC	3	6	17364	17369	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_006814	GA	3	6	18450	18455	50 %	0 %	50 %	0 %	58336372
16	NC_006814	GT	3	6	19150	19155	0 %	50 %	50 %	0 %	58336372
17	NC_006814	TA	3	6	19971	19976	50 %	50 %	0 %	0 %	58336373
18	NC_006814	AT	3	6	20691	20696	50 %	50 %	0 %	0 %	58336374
19	NC_006814	TA	3	6	21954	21959	50 %	50 %	0 %	0 %	58336375
20	NC_006814	CT	3	6	22050	22055	0 %	50 %	0 %	50 %	58336375
21	NC_006814	GC	3	6	22176	22181	0 %	0 %	50 %	50 %	58336375
22	NC_006814	TA	3	6	23226	23231	50 %	50 %	0 %	0 %	58336377
23	NC_006814	AT	3	6	23373	23378	50 %	50 %	0 %	0 %	58336377
24	NC_006814	CA	3	6	24106	24111	50 %	0 %	0 %	50 %	58336378
25	NC_006814	CT	3	6	25901	25906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006814	AG	3	6	25915	25920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006814	AT	3	6	27219	27224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006814	GA	3	6	27288	27293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006814	CT	3	6	30104	30109	0 %	50 %	0 %	50 %	58336385
30	NC_006814	AT	3	6	30344	30349	50 %	50 %	0 %	0 %	58336386
31	NC_006814	AC	3	6	31220	31225	50 %	0 %	0 %	50 %	58336386
32	NC_006814	AT	3	6	32233	32238	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
33	NC_006814	AT	3	6	32295	32300	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
34	NC_006814	AT	3	6	32665	32670	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
35	NC_006814	AG	3	6	32822	32827	50 %	0 %	50 %	0 %	58336387
36	NC_006814	TA	3	6	33224	33229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006814	TC	3	6	33266	33271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006814	AT	3	6	33562	33567	50 %	50 %	0 %	0 %	58336388
39	NC_006814	AT	3	6	34245	34250	50 %	50 %	0 %	0 %	58336389
40	NC_006814	TA	3	6	34746	34751	50 %	50 %	0 %	0 %	58336390
41	NC_006814	CA	4	8	35158	35165	50 %	0 %	0 %	50 %	58336390
42	NC_006814	GT	3	6	35850	35855	0 %	50 %	50 %	0 %	58336392
43	NC_006814	GT	3	6	36228	36233	0 %	50 %	50 %	0 %	58336392
44	NC_006814	TA	3	6	36295	36300	50 %	50 %	0 %	0 %	58336392
45	NC_006814	CT	3	6	36514	36519	0 %	50 %	0 %	50 %	58336392
46	NC_006814	AT	3	6	38465	38470	50 %	50 %	0 %	0 %	58336393
47	NC_006814	CA	3	6	39219	39224	50 %	0 %	0 %	50 %	58336394
48	NC_006814	TA	3	6	39727	39732	50 %	50 %	0 %	0 %	58336394
49	NC_006814	TG	3	6	42335	42340	0 %	50 %	50 %	0 %	58336397
50	NC_006814	AT	3	6	42710	42715	50 %	50 %	0 %	0 %	58336397
51	NC_006814	AG	3	6	43296	43301	50 %	0 %	50 %	0 %	58336398
52	NC_006814	CT	3	6	43896	43901	0 %	50 %	0 %	50 %	58336399
53	NC_006814	TA	3	6	46046	46051	50 %	50 %	0 %	0 %	58336401
54	NC_006814	GT	3	6	46244	46249	0 %	50 %	50 %	0 %	58336401
55	NC_006814	AT	3	6	46573	46578	50 %	50 %	0 %	0 %	58336401
56	NC_006814	CA	3	6	46689	46694	50 %	0 %	0 %	50 %	58336401
57	NC_006814	TA	3	6	47147	47152	50 %	50 %	0 %	0 %	58336401
58	NC_006814	GT	3	6	50200	50205	0 %	50 %	50 %	0 %	58336405
59	NC_006814	AT	3	6	51286	51291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006814	TA	3	6	51958	51963	50 %	50 %	0 %	0 %	58336406
61	NC_006814	TG	3	6	53958	53963	0 %	50 %	50 %	0 %	58336407
62	NC_006814	TA	3	6	54219	54224	50 %	50 %	0 %	0 %	58336408
63	NC_006814	TA	4	8	54855	54862	50 %	50 %	0 %	0 %	58336408
64	NC_006814	AT	3	6	55546	55551	50 %	50 %	0 %	0 %	58336408
65	NC_006814	AG	3	6	55787	55792	50 %	0 %	50 %	0 %	58336408
66	NC_006814	AT	3	6	57359	57364	50 %	50 %	0 %	0 %	58336409
67	NC_006814	GT	4	8	57649	57656	0 %	50 %	50 %	0 %	58336409
68	NC_006814	TC	3	6	58102	58107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006814	TA	3	6	58438	58443	50 %	50 %	0 %	0 %	58336410
70	NC_006814	GA	3	6	58910	58915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006814	GA	3	6	59572	59577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006814	AT	3	6	59979	59984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006814	AC	3	6	60500	60505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_006814	AC	3	6	60669	60674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006814	AG	3	6	61372	61377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006814	GC	3	6	61406	61411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_006814	GT	3	6	61572	61577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006814	TC	3	6	61866	61871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_006814	AT	3	6	61978	61983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006814	AG	3	6	62639	62644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006814	GA	3	6	62702	62707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006814	GA	3	6	63030	63035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006814	GA	3	6	63381	63386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006814	GA	3	6	63956	63961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006814	AT	4	8	65073	65080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006814	TA	3	6	65129	65134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006814	TA	3	6	67328	67333	50 %	50 %	0 %	0 %	58336414
88	NC_006814	TA	3	6	68227	68232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_006814	AT	3	6	69630	69635	50 %	50 %	0 %	0 %	58336417
91	NC_006814	GT	3	6	71041	71046	0 %	50 %	50 %	0 %	58336418
92	NC_006814	TA	3	6	71963	71968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006814	AT	3	6	72017	72022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006814	TA	3	6	72605	72610	50 %	50 %	0 %	0 %	58336421
95	NC_006814	AT	3	6	74521	74526	50 %	50 %	0 %	0 %	58336423
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99	NC_006814	AT	3	6	81888	81893	50 %	50 %	0 %	0 %	58336427
100	NC_006814	TA	3	6	83367	83372	50 %	50 %	0 %	0 %	58336428
101	NC_006814	AT	4	8	83946	83953	50 %	50 %	0 %	0 %	58336429
102	NC_006814	AG	3	6	84461	84466	50 %	0 %	50 %	0 %	58336429
103	NC_006814	AG	3	6	84657	84662	50 %	0 %	50 %	0 %	58336429
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108	NC_006814	TA	3	6	90071	90076	50 %	50 %	0 %	0 %	58336435
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110	NC_006814	AT	3	6	92024	92029	50 %	50 %	0 %	0 %	58336439
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112	NC_006814	AT	3	6	93266	93271	50 %	50 %	0 %	0 %	58336440
113	NC_006814	CT	3	6	93537	93542	0 %	50 %	0 %	50 %	58336441
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115	NC_006814	AT	3	6	96098	96103	50 %	50 %	0 %	0 %	58336443
116	NC_006814	TA	3	6	97506	97511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_006814	AG	3	6	101268	101273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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122	NC_006814	AT	3	6	104705	104710	50 %	50 %	0 %	0 %	58336454
123	NC_006814	TA	3	6	105677	105682	50 %	50 %	0 %	0 %	58336456
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125	NC_006814	AT	4	8	110214	110221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_006814	TA	3	6	111827	111832	50 %	50 %	0 %	0 %	58336462
129	NC_006814	GA	3	6	112509	112514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006814	TA	3	6	113018	113023	50 %	50 %	0 %	0 %	58336464
131	NC_006814	AT	3	6	113511	113516	50 %	50 %	0 %	0 %	58336465
132	NC_006814	AT	3	6	113917	113922	50 %	50 %	0 %	0 %	58336465
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141	NC_006814	TA	3	6	119965	119970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006814	AT	3	6	121481	121486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_006814	AT	3	6	122227	122232	50 %	50 %	0 %	0 %	58336474
145	NC_006814	AT	3	6	122661	122666	50 %	50 %	0 %	0 %	58336474
146	NC_006814	TA	3	6	124171	124176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006814	TA	3	6	126978	126983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006814	TA	4	8	132568	132575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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