MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 1557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006814	CTTTT	2	10	1842	1851	0 %	80 %	0 %	20 %	58336356
2	NC_006814	CTGAT	2	10	2159	2168	20 %	40 %	20 %	20 %	58336356
3	NC_006814	AAAGG	2	10	3659	3668	60 %	0 %	40 %	0 %	58336358
4	NC_006814	ATGAA	2	10	4785	4794	60 %	20 %	20 %	0 %	58336359
5	NC_006814	AGAAT	2	10	4899	4908	60 %	20 %	20 %	0 %	58336359
6	NC_006814	AAGGT	2	10	5955	5964	40 %	20 %	40 %	0 %	58336359
7	NC_006814	ATTTT	2	10	10143	10152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006814	TAACT	2	10	16095	16104	40 %	40 %	0 %	20 %	58336368
9	NC_006814	AGAAA	2	10	16488	16497	80 %	0 %	20 %	0 %	58336369
10	NC_006814	TCCAT	2	10	17004	17013	20 %	40 %	0 %	40 %	58336369
11	NC_006814	TCAAT	2	10	20442	20451	40 %	40 %	0 %	20 %	58336373
12	NC_006814	TTTTA	2	10	21060	21069	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006814	TTTCA	2	10	22116	22125	20 %	60 %	0 %	20 %	58336375
14	NC_006814	AAATT	2	10	22640	22649	60 %	40 %	0 %	0 %	58336376
15	NC_006814	ATGTG	2	10	23243	23252	20 %	40 %	40 %	0 %	58336377
16	NC_006814	TGTGT	2	10	24405	24414	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006814	GACAT	2	10	24923	24932	40 %	20 %	20 %	20 %	58336379
18	NC_006814	AAAAC	2	10	25141	25150	80 %	0 %	0 %	20 %	58336379
19	NC_006814	AAGAA	2	10	26232	26241	80 %	0 %	20 %	0 %	58336381
20	NC_006814	CTTTT	2	10	26382	26391	0 %	80 %	0 %	20 %	58336381
21	NC_006814	AAAAT	2	10	27402	27411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006814	TCAAG	2	10	27555	27564	40 %	20 %	20 %	20 %	58336382
23	NC_006814	GAAGA	2	10	28366	28375	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006814	AAGCA	2	10	31551	31560	60 %	0 %	20 %	20 %	58336386
25	NC_006814	TAATT	2	10	32581	32590	40 %	60 %	0 %	0 %	58336387
26	NC_006814	ACATG	2	10	32968	32977	40 %	20 %	20 %	20 %	58336387
27	NC_006814	ACTTT	2	10	34164	34173	20 %	60 %	0 %	20 %	58336389
28	NC_006814	ATAAG	2	10	34811	34820	60 %	20 %	20 %	0 %	58336390
29	NC_006814	TTGGT	2	10	41074	41083	0 %	60 %	40 %	0 %	58336395
30	NC_006814	GTAAA	2	10	41548	41557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006814	CAAAA	2	10	44898	44907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_006814	AAGGA	2	10	45181	45190	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006814	TTTGC	2	10	45266	45275	0 %	60 %	20 %	20 %	58336400
34	NC_006814	TTACT	2	10	46184	46193	20 %	60 %	0 %	20 %	58336401
35	NC_006814	TGCCA	2	10	47732	47741	20 %	20 %	20 %	40 %	58336401
36	NC_006814	GTAAA	2	10	48419	48428	60 %	20 %	20 %	0 %	58336402
37	NC_006814	CATTA	2	10	49219	49228	40 %	40 %	0 %	20 %	58336404
38	NC_006814	GTGAA	2	10	50475	50484	40 %	20 %	40 %	0 %	58336405
39	NC_006814	TATTT	2	10	52731	52740	20 %	80 %	0 %	0 %	58336407
40	NC_006814	CACTA	2	10	53206	53215	40 %	20 %	0 %	40 %	58336407
41	NC_006814	ATGCA	2	10	54093	54102	40 %	20 %	20 %	20 %	58336408
42	NC_006814	ATCCT	2	10	54133	54142	20 %	40 %	0 %	40 %	58336408
43	NC_006814	GATCA	2	10	55871	55880	40 %	20 %	20 %	20 %	58336408
44	NC_006814	TGGTG	2	10	57267	57276	0 %	40 %	60 %	0 %	58336409
45	NC_006814	TACCA	2	10	57851	57860	40 %	20 %	0 %	40 %	58336409
46	NC_006814	AGAGA	2	10	58795	58804	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006814	TCGTG	2	10	60346	60355	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_006814	GGCAG	2	10	60745	60754	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_006814	GAGAA	2	10	61001	61010	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006814	AAGGC	2	10	62401	62410	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006814	TTTAA	2	10	64604	64613	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006814	TAATT	2	10	64869	64878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006814	ATACA	2	10	66384	66393	60 %	20 %	0 %	20 %	58336413
54	NC_006814	ATTAT	2	10	66575	66584	40 %	60 %	0 %	0 %	58336413
55	NC_006814	AATAA	2	10	67142	67151	80 %	20 %	0 %	0 %	58336413
56	NC_006814	TAGGC	2	10	67722	67731	20 %	20 %	40 %	20 %	58336414
57	NC_006814	CTTAA	2	10	68240	68249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_006814	AAAGA	2	10	69395	69404	80 %	0 %	20 %	0 %	58336417
59	NC_006814	ATCTT	2	10	70449	70458	20 %	60 %	0 %	20 %	58336418
60	NC_006814	ATTGA	2	10	71017	71026	40 %	40 %	20 %	0 %	58336418
61	NC_006814	TAAAT	2	10	74513	74522	60 %	40 %	0 %	0 %	58336423
62	NC_006814	TTGCT	2	10	76391	76400	0 %	60 %	20 %	20 %	58336424
63	NC_006814	GAATT	2	10	77308	77317	40 %	40 %	20 %	0 %	58336424
64	NC_006814	GTATG	2	10	78953	78962	20 %	40 %	40 %	0 %	58336425
65	NC_006814	GGAAT	2	10	79139	79148	40 %	20 %	40 %	0 %	58336425
66	NC_006814	TTTTG	2	10	79268	79277	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006814	ATTTA	2	10	79969	79978	40 %	60 %	0 %	0 %	58336426
68	NC_006814	CCTTA	2	10	82505	82514	20 %	40 %	0 %	40 %	58336427
69	NC_006814	TTCGT	2	10	83136	83145	0 %	60 %	20 %	20 %	58336428
70	NC_006814	GAAAT	2	10	84035	84044	60 %	20 %	20 %	0 %	58336429
71	NC_006814	AATCA	2	10	84410	84419	60 %	20 %	0 %	20 %	58336429
72	NC_006814	TACGA	2	10	85234	85243	40 %	20 %	20 %	20 %	58336430
73	NC_006814	ATAAA	2	10	88027	88036	80 %	20 %	0 %	0 %	58336433
74	NC_006814	AATGC	2	10	88314	88323	40 %	20 %	20 %	20 %	58336433
75	NC_006814	GAGTA	2	10	89061	89070	40 %	20 %	40 %	0 %	58336434
76	NC_006814	TCATT	2	10	89675	89684	20 %	60 %	0 %	20 %	58336435
77	NC_006814	TTTTA	2	10	92170	92179	20 %	80 %	0 %	0 %	58336439
78	NC_006814	CAATC	2	10	92930	92939	40 %	20 %	0 %	40 %	58336440
79	NC_006814	TAGTT	2	10	93824	93833	20 %	60 %	20 %	0 %	58336441
80	NC_006814	TAACT	2	10	94562	94571	40 %	40 %	0 %	20 %	58336441
81	NC_006814	TTGTT	2	10	94963	94972	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006814	TTCTT	2	10	96942	96951	0 %	80 %	0 %	20 %	58336444
83	NC_006814	ATTTT	2	10	97080	97089	20 %	80 %	0 %	0 %	58336444
84	NC_006814	TAAAA	2	10	99723	99732	80 %	20 %	0 %	0 %	58336448
85	NC_006814	AACCA	2	10	101138	101147	60 %	0 %	0 %	40 %	58336449
86	NC_006814	TCTGA	2	10	102117	102126	20 %	40 %	20 %	20 %	58336450
87	NC_006814	GATGC	2	10	102774	102783	20 %	20 %	40 %	20 %	58336452
88	NC_006814	AAGAT	2	10	105452	105461	60 %	20 %	20 %	0 %	58336455
89	NC_006814	ACTTT	2	10	107028	107037	20 %	60 %	0 %	20 %	58336457
90	NC_006814	GCTGA	2	10	107040	107049	20 %	20 %	40 %	20 %	58336457
91	NC_006814	TAAAC	2	10	107479	107488	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_006814	CAATA	2	10	109931	109940	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_006814	AAATT	2	10	110932	110941	60 %	40 %	0 %	0 %	58336461
94	NC_006814	TTAAT	2	10	111528	111537	40 %	60 %	0 %	0 %	58336462
95	NC_006814	ATAGA	2	10	111817	111826	60 %	20 %	20 %	0 %	58336462
96	NC_006814	TTTAA	2	10	113410	113419	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006814	TTCAT	2	10	117652	117661	20 %	60 %	0 %	20 %	58336469
98	NC_006814	TTGAT	2	10	119836	119845	20 %	60 %	20 %	0 %	58336471
99	NC_006814	AAATG	2	10	119859	119868	60 %	20 %	20 %	0 %	58336471
100	NC_006814	TTTTA	2	10	121319	121328	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006814	CTCTG	2	10	121660	121669	0 %	40 %	20 %	40 %	58336474
102	NC_006814	ATTAA	2	10	122649	122658	60 %	40 %	0 %	0 %	58336474
103	NC_006814	AAATT	2	10	122964	122973	60 %	40 %	0 %	0 %	58336475
104	NC_006814	TTCTA	2	10	123288	123297	20 %	60 %	0 %	20 %	58336476
105	NC_006814	TAAAA	2	10	125197	125206	80 %	20 %	0 %	0 %	58336478
106	NC_006814	ATGGA	2	10	125433	125442	40 %	20 %	40 %	0 %	58336479
107	NC_006814	ACCCA	2	10	126329	126338	40 %	0 %	0 %	60 %	58336480
108	NC_006814	GAAAA	2	10	127772	127781	80 %	0 %	20 %	0 %	58336481
109	NC_006814	ATTTT	2	10	129400	129409	20 %	80 %	0 %	0 %	58336483
110	NC_006814	CAAAA	2	10	132143	132152	80 %	0 %	0 %	20 %	58336485
111	NC_006814	TGAAA	2	10	133275	133284	60 %	20 %	20 %	0 %	58336486
112	NC_006814	CAATT	2	10	135105	135114	40 %	40 %	0 %	20 %	58336488
113	NC_006814	AATGG	2	10	135270	135279	40 %	20 %	40 %	0 %	58336488
114	NC_006814	AATTT	2	10	136506	136515	40 %	60 %	0 %	0 %	58336490
115	NC_006814	GCGTT	2	10	137937	137946	0 %	40 %	40 %	20 %	58336490
116	NC_006814	GTTTT	2	10	140803	140812	0 %	80 %	20 %	0 %	58336492
117	NC_006814	TTTAC	2	10	144009	144018	20 %	60 %	0 %	20 %	58336498
118	NC_006814	TTGGT	2	10	146489	146498	0 %	60 %	40 %	0 %	58336501
119	NC_006814	GATTG	2	10	148486	148495	20 %	40 %	40 %	0 %	58336504
120	NC_006814	TGGTT	2	10	148509	148518	0 %	60 %	40 %	0 %	58336504
121	NC_006814	TAATT	2	10	151387	151396	40 %	60 %	0 %	0 %	58336505
122	NC_006814	TATGG	2	10	151487	151496	20 %	40 %	40 %	0 %	58336506
123	NC_006814	GTAAA	2	10	154585	154594	60 %	20 %	20 %	0 %	58336507
124	NC_006814	ATACT	2	10	154613	154622	40 %	40 %	0 %	20 %	58336507
125	NC_006814	TAAAA	2	10	155795	155804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006814	GATCA	2	10	155862	155871	40 %	20 %	20 %	20 %	58336509
127	NC_006814	AGAAA	2	10	156830	156839	80 %	0 %	20 %	0 %	58336510
128	NC_006814	TAAAA	2	10	158943	158952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006814	ATTTT	2	10	158974	158983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006814	TGGTG	2	10	161392	161401	0 %	40 %	60 %	0 %	58336513
131	NC_006814	CATAA	2	10	163061	163070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_006814	TATAA	2	10	163464	163473	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006814	TTCTT	2	10	164062	164071	0 %	80 %	0 %	20 %	58336514
134	NC_006814	AGTTA	2	10	165786	165795	40 %	40 %	20 %	0 %	58336516
135	NC_006814	CATTG	2	10	167146	167155	20 %	40 %	20 %	20 %	58336518
136	NC_006814	AATTG	2	10	169456	169465	40 %	40 %	20 %	0 %	58336519
137	NC_006814	AAAAG	2	10	169527	169536	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006814	ATAAA	2	10	171283	171292	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006814	TAAAG	2	10	172865	172874	60 %	20 %	20 %	0 %	58336522
140	NC_006814	ATTTA	2	10	173921	173930	40 %	60 %	0 %	0 %	58336523
141	NC_006814	CAATG	2	10	174998	175007	40 %	20 %	20 %	20 %	58336523
142	NC_006814	AAACA	2	10	178281	178290	80 %	0 %	0 %	20 %	58336526
143	NC_006814	GGTTG	2	10	178548	178557	0 %	40 %	60 %	0 %	58336527
144	NC_006814	TAATT	2	10	179306	179315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006814	TATAT	2	10	179336	179345	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006814	ATGGA	2	10	185787	185796	40 %	20 %	40 %	0 %	58336533
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156	NC_006814	ATTTA	2	10	196260	196269	40 %	60 %	0 %	0 %	58336541
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241	NC_006814	GTATT	2	10	304648	304657	20 %	60 %	20 %	0 %	58336657
242	NC_006814	TTGGA	2	10	304711	304720	20 %	40 %	40 %	0 %	58336657
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245	NC_006814	TGATT	2	10	306794	306803	20 %	60 %	20 %	0 %	58336659
246	NC_006814	TAGTA	2	10	307680	307689	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
247	NC_006814	CATTC	2	10	308327	308336	20 %	40 %	0 %	40 %	58336662
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249	NC_006814	AGCAA	2	10	315256	315265	60 %	0 %	20 %	20 %	58336670
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251	NC_006814	AAATG	2	10	316511	316520	60 %	20 %	20 %	0 %	58336670
252	NC_006814	TTTTA	2	10	318346	318355	20 %	80 %	0 %	0 %	58336673
253	NC_006814	ATCTT	2	10	319153	319162	20 %	60 %	0 %	20 %	58336675
254	NC_006814	TTCAT	2	10	319486	319495	20 %	60 %	0 %	20 %	58336675
255	NC_006814	AGGAA	2	10	319797	319806	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
256	NC_006814	TCACG	2	10	320396	320405	20 %	20 %	20 %	40 %	58336676
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261	NC_006814	AAAAG	2	10	324161	324170	80 %	0 %	20 %	0 %	58336680
262	NC_006814	TTGGA	2	10	324258	324267	20 %	40 %	40 %	0 %	58336681
263	NC_006814	AACCA	2	10	324608	324617	60 %	0 %	0 %	40 %	58336681
264	NC_006814	TTTCA	2	10	324657	324666	20 %	60 %	0 %	20 %	58336681
265	NC_006814	GATAG	2	10	325720	325729	40 %	20 %	40 %	0 %	58336682
266	NC_006814	AAAAG	2	10	326031	326040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_006814	ATTCA	2	10	327135	327144	40 %	40 %	0 %	20 %	58336684
268	NC_006814	GTAGA	2	10	327825	327834	40 %	20 %	40 %	0 %	58336684
269	NC_006814	TTTAA	2	10	329561	329570	40 %	60 %	0 %	0 %	58336685
270	NC_006814	TAAAA	2	10	329627	329636	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_006814	AAATG	2	10	332404	332413	60 %	20 %	20 %	0 %	58336689
272	NC_006814	AATTC	2	10	332501	332510	40 %	40 %	0 %	20 %	58336689
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