MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 5789

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006814	TCTT	2	8	207	214	0 %	75 %	0 %	25 %	58336355
2	NC_006814	AAAT	2	8	429	436	75 %	25 %	0 %	0 %	58336355
3	NC_006814	TATT	2	8	494	501	25 %	75 %	0 %	0 %	58336355
4	NC_006814	TCAA	2	8	628	635	50 %	25 %	0 %	25 %	58336355
5	NC_006814	ATGC	2	8	1306	1313	25 %	25 %	25 %	25 %	58336355
6	NC_006814	AAGA	2	8	2656	2663	75 %	0 %	25 %	0 %	58336356
7	NC_006814	AATT	2	8	2678	2685	50 %	50 %	0 %	0 %	58336356
8	NC_006814	ATTT	2	8	3281	3288	25 %	75 %	0 %	0 %	58336358
9	NC_006814	TTAA	2	8	3521	3528	50 %	50 %	0 %	0 %	58336358
10	NC_006814	AAAT	2	8	3576	3583	75 %	25 %	0 %	0 %	58336358
11	NC_006814	TTCT	2	8	3693	3700	0 %	75 %	0 %	25 %	58336358
12	NC_006814	TGAT	2	8	5901	5908	25 %	50 %	25 %	0 %	58336359
13	NC_006814	TTCT	2	8	6323	6330	0 %	75 %	0 %	25 %	58336360
14	NC_006814	CCAC	2	8	6497	6504	25 %	0 %	0 %	75 %	58336360
15	NC_006814	ATTT	2	8	6519	6526	25 %	75 %	0 %	0 %	58336360
16	NC_006814	TTGA	2	8	7761	7768	25 %	50 %	25 %	0 %	58336360
17	NC_006814	AGGA	2	8	10224	10231	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006814	CTTT	2	8	10321	10328	0 %	75 %	0 %	25 %	58336364
19	NC_006814	AACT	2	8	10446	10453	50 %	25 %	0 %	25 %	58336364
20	NC_006814	ATTT	2	8	10741	10748	25 %	75 %	0 %	0 %	58336364
21	NC_006814	ACTT	2	8	11058	11065	25 %	50 %	0 %	25 %	58336364
22	NC_006814	TGAT	2	8	11603	11610	25 %	50 %	25 %	0 %	58336364
23	NC_006814	CTTA	2	8	11650	11657	25 %	50 %	0 %	25 %	58336364
24	NC_006814	AATT	2	8	12125	12132	50 %	50 %	0 %	0 %	58336364
25	NC_006814	GGGC	2	8	12150	12157	0 %	0 %	75 %	25 %	58336364
26	NC_006814	GTTT	2	8	12539	12546	0 %	75 %	25 %	0 %	58336365
27	NC_006814	CAAG	2	8	12557	12564	50 %	0 %	25 %	25 %	58336365
28	NC_006814	TGAT	2	8	12746	12753	25 %	50 %	25 %	0 %	58336366
29	NC_006814	ATGA	2	8	13136	13143	50 %	25 %	25 %	0 %	58336366
30	NC_006814	TAAC	2	8	13155	13162	50 %	25 %	0 %	25 %	58336366
31	NC_006814	TACC	2	8	13305	13312	25 %	25 %	0 %	50 %	58336366
32	NC_006814	AATT	2	8	13359	13366	50 %	50 %	0 %	0 %	58336366
33	NC_006814	GATT	2	8	13515	13522	25 %	50 %	25 %	0 %	58336366
34	NC_006814	CAAA	2	8	14530	14537	75 %	0 %	0 %	25 %	58336367
35	NC_006814	AAAT	2	8	15330	15337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006814	CATG	2	8	15864	15871	25 %	25 %	25 %	25 %	58336368
37	NC_006814	GATG	2	8	15894	15901	25 %	25 %	50 %	0 %	58336368
38	NC_006814	AAAG	2	8	16045	16052	75 %	0 %	25 %	0 %	58336368
39	NC_006814	ACAA	2	8	16053	16060	75 %	0 %	0 %	25 %	58336368
40	NC_006814	GTAA	2	8	16359	16366	50 %	25 %	25 %	0 %	58336368
41	NC_006814	AATT	2	8	17279	17286	50 %	50 %	0 %	0 %	58336369
42	NC_006814	AAGA	2	8	17408	17415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006814	AAAT	2	8	17679	17686	75 %	25 %	0 %	0 %	58336370
44	NC_006814	TTAG	2	8	17724	17731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006814	TATT	2	8	18058	18065	25 %	75 %	0 %	0 %	58336372
46	NC_006814	GAAG	2	8	19111	19118	50 %	0 %	50 %	0 %	58336372
47	NC_006814	GATA	2	8	19181	19188	50 %	25 %	25 %	0 %	58336372
48	NC_006814	GATT	2	8	19564	19571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006814	TAGT	2	8	20008	20015	25 %	50 %	25 %	0 %	58336373
50	NC_006814	TAAT	2	8	20455	20462	50 %	50 %	0 %	0 %	58336373
51	NC_006814	TGAG	2	8	20475	20482	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006814	ATTG	2	8	20652	20659	25 %	50 %	25 %	0 %	58336374
53	NC_006814	TAAT	2	8	20850	20857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006814	TGTA	2	8	20953	20960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006814	TAAA	2	8	21426	21433	75 %	25 %	0 %	0 %	58336375
56	NC_006814	ATTG	2	8	21468	21475	25 %	50 %	25 %	0 %	58336375
57	NC_006814	TTAT	2	8	22165	22172	25 %	75 %	0 %	0 %	58336375
58	NC_006814	AAAT	2	8	22378	22385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006814	CTTT	2	8	22835	22842	0 %	75 %	0 %	25 %	58336377
60	NC_006814	TATC	2	8	23107	23114	25 %	50 %	0 %	25 %	58336377
61	NC_006814	TTAC	2	8	23187	23194	25 %	50 %	0 %	25 %	58336377
62	NC_006814	TTTA	2	8	23200	23207	25 %	75 %	0 %	0 %	58336377
63	NC_006814	TTAA	2	8	23999	24006	50 %	50 %	0 %	0 %	58336378
64	NC_006814	AAAC	2	8	24226	24233	75 %	0 %	0 %	25 %	58336378
65	NC_006814	TAAT	2	8	25250	25257	50 %	50 %	0 %	0 %	58336379
66	NC_006814	TTAC	2	8	25291	25298	25 %	50 %	0 %	25 %	58336379
67	NC_006814	TTGA	2	8	25796	25803	25 %	50 %	25 %	0 %	58336380
68	NC_006814	GTTA	2	8	25969	25976	25 %	50 %	25 %	0 %	58336381
69	NC_006814	AGAC	2	8	26725	26732	50 %	0 %	25 %	25 %	58336381
70	NC_006814	TTAA	2	8	26786	26793	50 %	50 %	0 %	0 %	58336381
71	NC_006814	TTTA	2	8	27012	27019	25 %	75 %	0 %	0 %	58336381
72	NC_006814	TTTC	2	8	27095	27102	0 %	75 %	0 %	25 %	58336381
73	NC_006814	GTTA	2	8	27159	27166	25 %	50 %	25 %	0 %	58336381
74	NC_006814	AAAT	2	8	27336	27343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006814	TTAA	2	8	27832	27839	50 %	50 %	0 %	0 %	58336383
76	NC_006814	GTCG	2	8	29766	29773	0 %	25 %	50 %	25 %	58336385
77	NC_006814	GTTT	2	8	30266	30273	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006814	TACT	2	8	31174	31181	25 %	50 %	0 %	25 %	58336386
79	NC_006814	TGAT	2	8	32022	32029	25 %	50 %	25 %	0 %	58336387
80	NC_006814	GGTA	2	8	32641	32648	25 %	25 %	50 %	0 %	58336387
81	NC_006814	AGTT	2	8	32686	32693	25 %	50 %	25 %	0 %	58336387
82	NC_006814	ATTA	2	8	32863	32870	50 %	50 %	0 %	0 %	58336387
83	NC_006814	TGGC	2	8	33373	33380	0 %	25 %	50 %	25 %	58336388
84	NC_006814	ATTT	2	8	33712	33719	25 %	75 %	0 %	0 %	58336388
85	NC_006814	CAAA	2	8	34095	34102	75 %	0 %	0 %	25 %	58336388
86	NC_006814	AAAG	2	8	34948	34955	75 %	0 %	25 %	0 %	58336390
87	NC_006814	TAAA	2	8	35017	35024	75 %	25 %	0 %	0 %	58336390
88	NC_006814	TCTT	2	8	35759	35766	0 %	75 %	0 %	25 %	58336392
89	NC_006814	CAAA	2	8	36595	36602	75 %	0 %	0 %	25 %	58336392
90	NC_006814	TTGA	2	8	37275	37282	25 %	50 %	25 %	0 %	58336392
91	NC_006814	AATC	2	8	37324	37331	50 %	25 %	0 %	25 %	58336392
92	NC_006814	TATG	2	8	37919	37926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006814	TTGT	2	8	38198	38205	0 %	75 %	25 %	0 %	58336393
94	NC_006814	GCGA	2	8	38213	38220	25 %	0 %	50 %	25 %	58336393
95	NC_006814	ATTT	2	8	39430	39437	25 %	75 %	0 %	0 %	58336394
96	NC_006814	TTAA	2	8	39533	39540	50 %	50 %	0 %	0 %	58336394
97	NC_006814	ACCA	2	8	39856	39863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006814	GTAG	2	8	40493	40500	25 %	25 %	50 %	0 %	58336395
99	NC_006814	AAAG	2	8	40918	40925	75 %	0 %	25 %	0 %	58336395
100	NC_006814	TTTC	2	8	40974	40981	0 %	75 %	0 %	25 %	58336395
101	NC_006814	CAAT	2	8	41099	41106	50 %	25 %	0 %	25 %	58336395
102	NC_006814	TTCA	2	8	41220	41227	25 %	50 %	0 %	25 %	58336395
103	NC_006814	GTTT	2	8	41346	41353	0 %	75 %	25 %	0 %	58336395
104	NC_006814	AATT	2	8	41528	41535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006814	ATTT	2	8	41972	41979	25 %	75 %	0 %	0 %	58336396
106	NC_006814	AGAT	2	8	42505	42512	50 %	25 %	25 %	0 %	58336397
107	NC_006814	GATA	2	8	43115	43122	50 %	25 %	25 %	0 %	58336398
108	NC_006814	GAGC	2	8	43345	43352	25 %	0 %	50 %	25 %	58336398
109	NC_006814	CTTT	2	8	43870	43877	0 %	75 %	0 %	25 %	58336399
110	NC_006814	TACA	2	8	44177	44184	50 %	25 %	0 %	25 %	58336399
111	NC_006814	GGAC	2	8	44253	44260	25 %	0 %	50 %	25 %	58336399
112	NC_006814	TTGT	2	8	44368	44375	0 %	75 %	25 %	0 %	58336399
113	NC_006814	ACCG	2	8	44393	44400	25 %	0 %	25 %	50 %	58336399
114	NC_006814	TGTC	2	8	44403	44410	0 %	50 %	25 %	25 %	58336399
115	NC_006814	TACC	2	8	44737	44744	25 %	25 %	0 %	50 %	58336399
116	NC_006814	TTTA	2	8	44771	44778	25 %	75 %	0 %	0 %	58336399
117	NC_006814	GATT	2	8	45036	45043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006814	TTCA	2	8	45075	45082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_006814	TCAA	2	8	45125	45132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_006814	TAAT	2	8	45161	45168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006814	GATG	2	8	45460	45467	25 %	25 %	50 %	0 %	58336400
122	NC_006814	TATT	2	8	46343	46350	25 %	75 %	0 %	0 %	58336401
123	NC_006814	CATG	2	8	46966	46973	25 %	25 %	25 %	25 %	58336401
124	NC_006814	AAAT	2	8	47490	47497	75 %	25 %	0 %	0 %	58336401
125	NC_006814	ATGA	2	8	47563	47570	50 %	25 %	25 %	0 %	58336401
126	NC_006814	GAAA	2	8	47933	47940	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006814	TTTG	2	8	47947	47954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006814	ATGG	2	8	48052	48059	25 %	25 %	50 %	0 %	58336402
129	NC_006814	ACAA	2	8	48127	48134	75 %	0 %	0 %	25 %	58336402
130	NC_006814	AATT	2	8	48164	48171	50 %	50 %	0 %	0 %	58336402
131	NC_006814	TATT	2	8	48866	48873	25 %	75 %	0 %	0 %	58336403
132	NC_006814	GTTG	2	8	48932	48939	0 %	50 %	50 %	0 %	58336403
133	NC_006814	TAAT	2	8	48990	48997	50 %	50 %	0 %	0 %	58336403
134	NC_006814	GAAC	2	8	49023	49030	50 %	0 %	25 %	25 %	58336403
135	NC_006814	AAAT	2	8	49371	49378	75 %	25 %	0 %	0 %	58336404
136	NC_006814	AGCA	2	8	49908	49915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006814	GATT	2	8	50427	50434	25 %	50 %	25 %	0 %	58336405
138	NC_006814	GCTT	2	8	50494	50501	0 %	50 %	25 %	25 %	58336405
139	NC_006814	CTTC	2	8	51026	51033	0 %	50 %	0 %	50 %	58336405
140	NC_006814	TAAA	2	8	51251	51258	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006814	TAAT	2	8	51661	51668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006814	GATT	2	8	52217	52224	25 %	50 %	25 %	0 %	58336406
143	NC_006814	TGGA	2	8	52400	52407	25 %	25 %	50 %	0 %	58336406
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145	NC_006814	TGGA	2	8	52864	52871	25 %	25 %	50 %	0 %	58336407
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