MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_006814	CCTT	2	8	151305	151312	0 %	50 %	0 %	50 %	58336505
3502	NC_006814	GTT	2	6	151324	151329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336505
3503	NC_006814	AAG	2	6	151355	151360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336505
3504	NC_006814	TAATT	2	10	151387	151396	40 %	60 %	0 %	0 %	58336505
3505	NC_006814	ATT	2	6	151426	151431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_006814	TATGG	2	10	151487	151496	20 %	40 %	40 %	0 %	58336506
3507	NC_006814	TGC	2	6	151555	151560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336506
3508	NC_006814	TTG	2	6	151578	151583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336506
3509	NC_006814	TCA	2	6	151594	151599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336506
3510	NC_006814	AAG	2	6	151640	151645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336506
3511	NC_006814	CTT	2	6	151712	151717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336506
3512	NC_006814	CTTG	2	8	151774	151781	0 %	50 %	25 %	25 %	58336506
3513	NC_006814	AAGG	2	8	151796	151803	50 %	0 %	50 %	0 %	58336506
3514	NC_006814	GAA	2	6	151820	151825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336506
3515	NC_006814	CTAAGA	2	12	151842	151853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58336506
3516	NC_006814	GAT	2	6	151865	151870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336506
3517	NC_006814	AGA	2	6	151927	151932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336506
3518	NC_006814	AAG	2	6	151970	151975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336506
3519	NC_006814	ATG	2	6	151989	151994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336506
3520	NC_006814	GAT	2	6	152078	152083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336506
3521	NC_006814	ATG	2	6	152135	152140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336506
3522	NC_006814	CAAT	2	8	152177	152184	50 %	25 %	0 %	25 %	58336506
3523	NC_006814	TTC	2	6	152321	152326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336506
3524	NC_006814	TGA	2	6	152401	152406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336506
3525	NC_006814	TAA	2	6	152449	152454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336506
3526	NC_006814	ATGG	2	8	152476	152483	25 %	25 %	50 %	0 %	58336506
3527	NC_006814	AGA	2	6	152542	152547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336506
3528	NC_006814	T	6	6	152580	152585	0 %	100 %	0 %	0 %	58336506
3529	NC_006814	TGA	2	6	152619	152624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336506
3530	NC_006814	AAG	2	6	152657	152662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336506
3531	NC_006814	AAG	2	6	152693	152698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336506
3532	NC_006814	ATA	2	6	152704	152709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336506
3533	NC_006814	TTTC	2	8	152740	152747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_006814	T	7	7	152753	152759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_006814	TGT	2	6	152836	152841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_006814	GAG	2	6	152872	152877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_006814	AAG	2	6	152896	152901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3538	NC_006814	ATT	2	6	152966	152971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336507
3539	NC_006814	GAT	2	6	153006	153011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3540	NC_006814	TGA	2	6	153050	153055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3541	NC_006814	A	6	6	153055	153060	100 %	0 %	0 %	0 %	58336507
3542	NC_006814	GCT	2	6	153126	153131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336507
3543	NC_006814	A	7	7	153163	153169	100 %	0 %	0 %	0 %	58336507
3544	NC_006814	TAA	2	6	153248	153253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336507
3545	NC_006814	CA	3	6	153272	153277	50 %	0 %	0 %	50 %	58336507
3546	NC_006814	CTG	2	6	153289	153294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336507
3547	NC_006814	ATG	2	6	153324	153329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3548	NC_006814	AC	3	6	153388	153393	50 %	0 %	0 %	50 %	58336507
3549	NC_006814	ATT	2	6	153522	153527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336507
3550	NC_006814	GTT	2	6	153556	153561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336507
3551	NC_006814	GAT	2	6	153645	153650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3552	NC_006814	GAA	2	6	153651	153656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3553	NC_006814	AAG	2	6	153675	153680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3554	NC_006814	A	6	6	153687	153692	100 %	0 %	0 %	0 %	58336507
3555	NC_006814	ATG	2	6	153700	153705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3556	NC_006814	CAT	2	6	153793	153798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336507
3557	NC_006814	AGAATT	2	12	153831	153842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	58336507
3558	NC_006814	TTA	2	6	153885	153890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336507
3559	NC_006814	A	6	6	153900	153905	100 %	0 %	0 %	0 %	58336507
3560	NC_006814	ATG	2	6	153937	153942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3561	NC_006814	AGC	2	6	153946	153951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336507
3562	NC_006814	AAG	2	6	154011	154016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3563	NC_006814	AAG	2	6	154087	154092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3564	NC_006814	AGA	2	6	154310	154315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3565	NC_006814	TA	3	6	154368	154373	50 %	50 %	0 %	0 %	58336507
3566	NC_006814	ACA	2	6	154420	154425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336507
3567	NC_006814	AAG	2	6	154458	154463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3568	NC_006814	GAT	2	6	154494	154499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3569	NC_006814	GTAAA	2	10	154585	154594	60 %	20 %	20 %	0 %	58336507
3570	NC_006814	ATACT	2	10	154613	154622	40 %	40 %	0 %	20 %	58336507
3571	NC_006814	ATTC	2	8	154624	154631	25 %	50 %	0 %	25 %	58336507
3572	NC_006814	ATG	2	6	154636	154641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336507
3573	NC_006814	GGT	2	6	154707	154712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336507
3574	NC_006814	CTG	2	6	154753	154758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336507
3575	NC_006814	GGTT	2	8	154793	154800	0 %	50 %	50 %	0 %	58336507
3576	NC_006814	AC	3	6	154813	154818	50 %	0 %	0 %	50 %	58336507
3577	NC_006814	ACGT	2	8	154931	154938	25 %	25 %	25 %	25 %	58336507
3578	NC_006814	GTC	2	6	154981	154986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336507
3579	NC_006814	GAA	2	6	154989	154994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3580	NC_006814	GAA	2	6	155037	155042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3581	NC_006814	GAA	2	6	155058	155063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336507
3582	NC_006814	AAAG	2	8	155070	155077	75 %	0 %	25 %	0 %	58336507
3583	NC_006814	AAG	2	6	155090	155095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336508
3584	NC_006814	AGT	2	6	155110	155115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336508
3585	NC_006814	ACT	2	6	155196	155201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336508
3586	NC_006814	TTG	2	6	155297	155302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336508
3587	NC_006814	TGTT	2	8	155341	155348	0 %	75 %	25 %	0 %	58336508
3588	NC_006814	TAG	2	6	155372	155377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336508
3589	NC_006814	GGC	2	6	155476	155481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	58336508
3590	NC_006814	TGGTCT	2	12	155560	155571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58336508
3591	NC_006814	A	6	6	155611	155616	100 %	0 %	0 %	0 %	58336508
3592	NC_006814	TGT	2	6	155621	155626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336508
3593	NC_006814	ATT	2	6	155713	155718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336508
3594	NC_006814	TAA	2	6	155742	155747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336508
3595	NC_006814	AGT	2	6	155748	155753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336508
3596	NC_006814	TAAAA	2	10	155795	155804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_006814	T	6	6	155817	155822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_006814	GATCA	2	10	155862	155871	40 %	20 %	20 %	20 %	58336509
3599	NC_006814	TGAT	2	8	155890	155897	25 %	50 %	25 %	0 %	58336509
3600	NC_006814	ATTGAT	2	12	155943	155954	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58336509
3601	NC_006814	ATT	2	6	156010	156015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336509
3602	NC_006814	TG	3	6	156092	156097	0 %	50 %	50 %	0 %	58336509
3603	NC_006814	AGC	2	6	156119	156124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336509
3604	NC_006814	AAGA	2	8	156145	156152	75 %	0 %	25 %	0 %	58336509
3605	NC_006814	AGA	2	6	156164	156169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336509
3606	NC_006814	TATG	2	8	156242	156249	25 %	50 %	25 %	0 %	58336509
3607	NC_006814	GAA	2	6	156369	156374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336509
3608	NC_006814	GGT	2	6	156386	156391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336509
3609	NC_006814	AAT	2	6	156394	156399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336509
3610	NC_006814	AAAG	2	8	156413	156420	75 %	0 %	25 %	0 %	58336510
3611	NC_006814	ACA	2	6	156421	156426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336510
3612	NC_006814	TGG	2	6	156460	156465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336510
3613	NC_006814	AATT	2	8	156546	156553	50 %	50 %	0 %	0 %	58336510
3614	NC_006814	AC	3	6	156675	156680	50 %	0 %	0 %	50 %	58336510
3615	NC_006814	CAAG	2	8	156682	156689	50 %	0 %	25 %	25 %	58336510
3616	NC_006814	TTA	2	6	156699	156704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336510
3617	NC_006814	A	6	6	156740	156745	100 %	0 %	0 %	0 %	58336510
3618	NC_006814	AGAAA	2	10	156830	156839	80 %	0 %	20 %	0 %	58336510
3619	NC_006814	CAT	2	6	156840	156845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336510
3620	NC_006814	TGA	2	6	156855	156860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336510
3621	NC_006814	CAC	2	6	156879	156884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336510
3622	NC_006814	GAC	2	6	156918	156923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336510
3623	NC_006814	TAA	2	6	156937	156942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336510
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3625	NC_006814	TGA	2	6	156991	156996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336510
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