MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006814	CAT	2	6	23409	23414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336377
502	NC_006814	TGA	2	6	23441	23446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336377
503	NC_006814	A	8	8	23474	23481	100 %	0 %	0 %	0 %	58336377
504	NC_006814	T	6	6	23492	23497	0 %	100 %	0 %	0 %	58336377
505	NC_006814	TCT	2	6	23519	23524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336377
506	NC_006814	ATG	2	6	23575	23580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336377
507	NC_006814	ACA	2	6	23646	23651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336377
508	NC_006814	AGG	2	6	23783	23788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58336377
509	NC_006814	ATG	2	6	23849	23854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336378
510	NC_006814	TAT	2	6	23944	23949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336378
511	NC_006814	TTAA	2	8	23999	24006	50 %	50 %	0 %	0 %	58336378
512	NC_006814	CAG	2	6	24060	24065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336378
513	NC_006814	CA	3	6	24106	24111	50 %	0 %	0 %	50 %	58336378
514	NC_006814	ATA	2	6	24156	24161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336378
515	NC_006814	TGC	2	6	24196	24201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336378
516	NC_006814	TTG	2	6	24209	24214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336378
517	NC_006814	AAAC	2	8	24226	24233	75 %	0 %	0 %	25 %	58336378
518	NC_006814	TAT	2	6	24296	24301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336378
519	NC_006814	TGTGT	2	10	24405	24414	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
520	NC_006814	A	6	6	24491	24496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006814	TTC	2	6	24632	24637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336379
522	NC_006814	ATT	2	6	24735	24740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336379
523	NC_006814	CAA	3	9	24748	24756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336379
524	NC_006814	TAA	2	6	24783	24788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336379
525	NC_006814	CAT	2	6	24835	24840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336379
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528	NC_006814	GACAT	2	10	24923	24932	40 %	20 %	20 %	20 %	58336379
529	NC_006814	TGA	2	6	24945	24950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336379
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531	NC_006814	A	6	6	24989	24994	100 %	0 %	0 %	0 %	58336379
532	NC_006814	GTT	2	6	25026	25031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336379
533	NC_006814	A	6	6	25060	25065	100 %	0 %	0 %	0 %	58336379
534	NC_006814	TCT	2	6	25126	25131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336379
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538	NC_006814	TAT	2	6	25191	25196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336379
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540	NC_006814	TTAC	2	8	25291	25298	25 %	50 %	0 %	25 %	58336379
541	NC_006814	AGT	2	6	25434	25439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336379
542	NC_006814	AGA	2	6	25462	25467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_006814	A	6	6	25509	25514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_006814	GAA	2	6	25531	25536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_006814	A	7	7	25568	25574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_006814	AAT	2	6	25669	25674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336380
547	NC_006814	ATC	2	6	25764	25769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336380
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549	NC_006814	A	6	6	25822	25827	100 %	0 %	0 %	0 %	58336380
550	NC_006814	ATC	2	6	25836	25841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336380
551	NC_006814	ATT	2	6	25892	25897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_006814	CT	3	6	25901	25906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
553	NC_006814	T	6	6	25906	25911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_006814	AG	3	6	25915	25920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_006814	GTTA	2	8	25969	25976	25 %	50 %	25 %	0 %	58336381
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559	NC_006814	AAGAA	2	10	26232	26241	80 %	0 %	20 %	0 %	58336381
560	NC_006814	AAG	2	6	26330	26335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336381
561	NC_006814	CTTTT	2	10	26382	26391	0 %	80 %	0 %	20 %	58336381
562	NC_006814	ATT	2	6	26440	26445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336381
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565	NC_006814	TAG	2	6	26643	26648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336381
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571	NC_006814	A	6	6	26811	26816	100 %	0 %	0 %	0 %	58336381
572	NC_006814	A	6	6	26839	26844	100 %	0 %	0 %	0 %	58336381
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576	NC_006814	TTA	2	6	27203	27208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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580	NC_006814	GA	3	6	27288	27293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_006814	T	7	7	27301	27307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_006814	AAAT	2	8	27336	27343	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_006814	ATT	2	6	27368	27373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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590	NC_006814	GTA	2	6	27448	27453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336382
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599	NC_006814	TTAA	2	8	27832	27839	50 %	50 %	0 %	0 %	58336383
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604	NC_006814	A	7	7	28035	28041	100 %	0 %	0 %	0 %	58336383
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607	NC_006814	ATA	2	6	28220	28225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006814	GCA	2	6	28229	28234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_006814	ATT	2	6	28235	28240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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611	NC_006814	CAT	2	6	28383	28388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_006814	ATT	2	6	28414	28419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006814	TAA	2	6	28482	28487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_006814	AAG	2	6	28526	28531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_006814	GCT	2	6	28587	28592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_006814	AGA	2	6	28601	28606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006814	CCA	2	6	28656	28661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58336384
618	NC_006814	CAT	2	6	28681	28686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336384
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620	NC_006814	ATC	2	6	28761	28766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336384
621	NC_006814	CAT	2	6	28767	28772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336384
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628	NC_006814	ATA	2	6	29014	29019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_006814	A	6	6	29019	29024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_006814	T	6	6	29048	29053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_006814	CAA	2	6	29167	29172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_006814	TAC	2	6	29184	29189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_006814	ATA	2	6	29191	29196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_006814	T	6	6	29287	29292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_006814	AGC	2	6	29315	29320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_006814	A	6	6	29326	29331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_006814	TGC	2	6	29337	29342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_006814	TCA	2	6	29479	29484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336385
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