MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus acidophilus NCFM chromosome

Total Repeats: 46148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006814	CTA	2	6	216241	216246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336560
5002	NC_006814	TAA	2	6	216299	216304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336560
5003	NC_006814	A	6	6	216335	216340	100 %	0 %	0 %	0 %	58336560
5004	NC_006814	TTA	2	6	216357	216362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_006814	T	6	6	216382	216387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_006814	T	7	7	216399	216405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_006814	AT	3	6	216424	216429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_006814	CTAT	2	8	216455	216462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_006814	TAAA	2	8	216485	216492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_006814	AGA	2	6	216553	216558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_006814	ATT	2	6	216588	216593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336561
5012	NC_006814	AAT	2	6	216611	216616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336561
5013	NC_006814	ATT	2	6	216630	216635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336561
5014	NC_006814	GTT	2	6	216714	216719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336561
5015	NC_006814	AAT	2	6	216738	216743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336561
5016	NC_006814	GGT	2	6	216777	216782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336561
5017	NC_006814	ACAA	2	8	216959	216966	75 %	0 %	0 %	25 %	58336561
5018	NC_006814	ATA	2	6	216967	216972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336561
5019	NC_006814	TA	3	6	217006	217011	50 %	50 %	0 %	0 %	58336561
5020	NC_006814	TAA	2	6	217031	217036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336561
5021	NC_006814	ATT	2	6	217081	217086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336561
5022	NC_006814	ATT	3	9	217114	217122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336562
5023	NC_006814	TGGA	2	8	217156	217163	25 %	25 %	50 %	0 %	58336562
5024	NC_006814	AACTTT	2	12	217238	217249	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	58336562
5025	NC_006814	TAA	2	6	217292	217297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336562
5026	NC_006814	A	6	6	217320	217325	100 %	0 %	0 %	0 %	58336562
5027	NC_006814	GA	3	6	217353	217358	50 %	0 %	50 %	0 %	58336562
5028	NC_006814	ATT	3	9	217372	217380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336562
5029	NC_006814	TAA	2	6	217427	217432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336562
5030	NC_006814	GCA	2	6	217440	217445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336562
5031	NC_006814	CA	3	6	217444	217449	50 %	0 %	0 %	50 %	58336562
5032	NC_006814	ATA	2	6	217450	217455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336562
5033	NC_006814	TAAA	2	8	217465	217472	75 %	25 %	0 %	0 %	58336562
5034	NC_006814	TA	3	6	217530	217535	50 %	50 %	0 %	0 %	58336562
5035	NC_006814	ATT	2	6	217555	217560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336562
5036	NC_006814	TAT	2	6	217593	217598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336562
5037	NC_006814	CGC	2	6	217622	217627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	58336562
5038	NC_006814	TATT	2	8	217686	217693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_006814	TG	3	6	217704	217709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_006814	TAAA	2	8	217730	217737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_006814	AGGT	2	8	217751	217758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_006814	ATT	2	6	217759	217764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_006814	CAG	2	6	217797	217802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336563
5044	NC_006814	GTTAA	2	10	217919	217928	40 %	40 %	20 %	0 %	58336563
5045	NC_006814	TTG	2	6	217944	217949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58336563
5046	NC_006814	AAG	2	6	217961	217966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336563
5047	NC_006814	GGT	2	6	217988	217993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58336563
5048	NC_006814	GCA	2	6	218142	218147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336563
5049	NC_006814	ACT	2	6	218156	218161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336563
5050	NC_006814	TCA	2	6	218165	218170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336563
5051	NC_006814	ACT	2	6	218204	218209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336563
5052	NC_006814	TCA	2	6	218213	218218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336563
5053	NC_006814	AAG	2	6	218240	218245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336563
5054	NC_006814	TCAACT	2	12	218273	218284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336563
5055	NC_006814	AAG	2	6	218288	218293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336563
5056	NC_006814	AGA	2	6	218334	218339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336563
5057	NC_006814	TCA	2	6	218363	218368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336563
5058	NC_006814	ACT	2	6	218384	218389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336563
5059	NC_006814	AAG	2	6	218393	218398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336563
5060	NC_006814	GAA	2	6	218431	218436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336563
5061	NC_006814	AT	3	6	218618	218623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_006814	T	7	7	218657	218663	0 %	100 %	0 %	0 %	58336564
5063	NC_006814	TAT	2	6	218736	218741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336564
5064	NC_006814	CAG	2	6	218775	218780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336564
5065	NC_006814	GCT	2	6	218831	218836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336564
5066	NC_006814	ACT	2	6	218837	218842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5067	NC_006814	ATC	2	6	218845	218850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5068	NC_006814	ACT	2	6	218858	218863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5069	NC_006814	AAG	2	6	218867	218872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336564
5070	NC_006814	ACT	2	6	218873	218878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5071	NC_006814	AGACTA	2	12	218889	218900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58336564
5072	NC_006814	TCA	2	6	218906	218911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5073	NC_006814	AAG	2	6	218912	218917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336564
5074	NC_006814	CTA	2	6	218919	218924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5075	NC_006814	AAG	2	6	218942	218947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336564
5076	NC_006814	CAA	2	6	218955	218960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336564
5077	NC_006814	ACT	2	6	218975	218980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5078	NC_006814	AAG	2	6	219011	219016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336564
5079	NC_006814	AGTT	2	8	219036	219043	25 %	50 %	25 %	0 %	58336564
5080	NC_006814	ACT	2	6	219110	219115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5081	NC_006814	TAC	2	6	219173	219178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5082	NC_006814	TAA	2	6	219187	219192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336564
5083	NC_006814	GCTTCA	2	12	219230	219241	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58336564
5084	NC_006814	ACT	2	6	219245	219250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5085	NC_006814	AAG	2	6	219251	219256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336564
5086	NC_006814	CTT	2	6	219270	219275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58336564
5087	NC_006814	CTG	2	6	219285	219290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336564
5088	NC_006814	ATG	2	6	219324	219329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336564
5089	NC_006814	TAC	2	6	219382	219387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5090	NC_006814	TAC	2	6	219428	219433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5091	NC_006814	TAA	2	6	219439	219444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336564
5092	NC_006814	CTA	2	6	219495	219500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5093	NC_006814	AGA	2	6	219510	219515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336564
5094	NC_006814	ATG	2	6	219528	219533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336564
5095	NC_006814	AAGAAA	2	12	219548	219559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	58336564
5096	NC_006814	AAG	2	6	219563	219568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58336564
5097	NC_006814	TAC	2	6	219617	219622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5098	NC_006814	TGA	2	6	219631	219636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336564
5099	NC_006814	GCT	2	6	219650	219655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336564
5100	NC_006814	TGA	2	6	219721	219726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58336564
5101	NC_006814	GAC	2	6	219812	219817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336564
5102	NC_006814	ATT	2	6	219823	219828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58336564
5103	NC_006814	CAA	2	6	219845	219850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336564
5104	NC_006814	AT	3	6	219865	219870	50 %	50 %	0 %	0 %	58336564
5105	NC_006814	GCA	2	6	220022	220027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336564
5106	NC_006814	TAA	2	6	220054	220059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336564
5107	NC_006814	CTA	2	6	220080	220085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5108	NC_006814	TCA	3	9	220097	220105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5109	NC_006814	CTG	2	6	220146	220151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58336564
5110	NC_006814	TAA	2	6	220153	220158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58336564
5111	NC_006814	A	6	6	220236	220241	100 %	0 %	0 %	0 %	58336564
5112	NC_006814	CCAA	2	8	220281	220288	50 %	0 %	0 %	50 %	58336564
5113	NC_006814	AGTT	2	8	220296	220303	25 %	50 %	25 %	0 %	58336564
5114	NC_006814	AAC	2	6	220349	220354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336564
5115	NC_006814	ACT	2	6	220355	220360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5116	NC_006814	TCA	2	6	220373	220378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58336564
5117	NC_006814	CAA	2	6	220418	220423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58336564
5118	NC_006814	T	6	6	220477	220482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_006814	AT	3	6	220513	220518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_006814	T	6	6	220525	220530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_006814	TAGT	2	8	220540	220547	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_006814	T	6	6	220559	220564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_006814	CA	3	6	220576	220581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5125	NC_006814	TAG	2	6	220643	220648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_006814	GAC	2	6	236261	236266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336580
5500	NC_006814	CGA	2	6	236439	236444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58336580

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