MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus salivarius UCC118 plasmid pSF118-44

Total Repeats: 625

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006530	CAA	2	6	9	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_006530	CAT	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_006530	TCA	2	6	286	291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006530	GCT	2	6	352	357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006530	CCG	2	6	382	387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_006530	GGC	2	6	414	419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_006530	CGC	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_006530	TCG	2	6	497	502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_006530	ATG	2	6	523	528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006530	AAT	2	6	582	587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006530	ACC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_006530	CGG	2	6	799	804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006530	GTA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006530	GCA	2	6	997	1002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006530	ATG	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006530	TGG	2	6	1042	1047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707136
17	NC_006530	GGC	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56707136
18	NC_006530	CTT	2	6	1080	1085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707136
19	NC_006530	GGT	2	6	1092	1097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707136
20	NC_006530	GAA	2	6	1206	1211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707136
21	NC_006530	GTA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707136
22	NC_006530	CGG	2	6	1293	1298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56707136
23	NC_006530	GTT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707136
24	NC_006530	AAT	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707136
25	NC_006530	CTC	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_006530	CGT	2	6	1996	2001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707137
27	NC_006530	AAG	2	6	2087	2092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707137
28	NC_006530	CTT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707137
29	NC_006530	CCG	2	6	2218	2223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56707137
30	NC_006530	TAA	2	6	2284	2289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006530	TTA	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006530	CAG	2	6	2342	2347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006530	TGA	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006530	CAT	2	6	2537	2542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006530	AAG	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006530	GAC	2	6	2720	2725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006530	TGT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006530	GTC	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006530	TAA	2	6	2898	2903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006530	CGT	2	6	2913	2918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006530	ACT	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006530	GCT	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_006530	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006530	TGC	2	6	3154	3159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006530	ATA	2	6	3206	3211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006530	TTA	2	6	3256	3261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
47	NC_006530	TAT	2	6	3275	3280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
48	NC_006530	AAC	2	6	3351	3356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707139
49	NC_006530	ATT	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
50	NC_006530	TGC	2	6	3501	3506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707139
51	NC_006530	ATT	2	6	3551	3556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
52	NC_006530	ATG	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707139
53	NC_006530	GCA	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707139
54	NC_006530	AAC	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707139
55	NC_006530	ACA	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707139
56	NC_006530	TTA	2	6	3971	3976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
57	NC_006530	CTG	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707139
58	NC_006530	TGG	2	6	4015	4020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707139
59	NC_006530	TCA	2	6	4035	4040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707139
60	NC_006530	TGG	2	6	4059	4064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56707139
61	NC_006530	GAT	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707139
62	NC_006530	TAA	2	6	4077	4082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707139
63	NC_006530	ATT	2	6	4109	4114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707139
64	NC_006530	TAA	2	6	4115	4120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707139
65	NC_006530	ATT	2	6	4325	4330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707140
66	NC_006530	AAG	2	6	4412	4417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707140
67	NC_006530	AAG	2	6	4440	4445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707140
68	NC_006530	AAG	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707140
69	NC_006530	ATT	2	6	4547	4552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707140
70	NC_006530	TAT	2	6	4553	4558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707140
71	NC_006530	TGA	2	6	4563	4568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707140
72	NC_006530	AAT	2	6	4609	4614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707140
73	NC_006530	AGA	2	6	4796	4801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006530	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006530	CAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006530	AAG	2	6	5142	5147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006530	GAC	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_006530	TGT	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006530	GTC	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006530	TAG	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006530	CGT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006530	ACT	2	6	5458	5463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006530	GCT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006530	AGA	2	6	5548	5553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006530	TAT	2	6	5796	5801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006530	TAG	3	9	5809	5817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006530	ATA	2	6	5829	5834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006530	TTA	2	6	5871	5876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707142
89	NC_006530	ACT	2	6	5922	5927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707142
90	NC_006530	ATG	2	6	5940	5945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707142
91	NC_006530	AGC	3	9	5983	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707142
92	NC_006530	AAC	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707142
93	NC_006530	CTT	2	6	6020	6025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707142
94	NC_006530	AGA	2	6	6043	6048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707142
95	NC_006530	TGA	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707142
96	NC_006530	ATT	2	6	6132	6137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707142
97	NC_006530	ATT	2	6	6244	6249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707143
98	NC_006530	GAT	2	6	6301	6306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707143
99	NC_006530	GCA	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707143
100	NC_006530	AAT	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707143
101	NC_006530	ATT	2	6	6474	6479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707143
102	NC_006530	AAG	2	6	6496	6501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707143
103	NC_006530	TAA	2	6	6675	6680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707144
104	NC_006530	TAT	2	6	6906	6911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707145
105	NC_006530	CAT	2	6	6924	6929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707145
106	NC_006530	AAT	2	6	6934	6939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707145
107	NC_006530	GCC	2	6	6959	6964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56707145
108	NC_006530	TCT	2	6	7026	7031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707145
109	NC_006530	GCC	2	6	7052	7057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56707145
110	NC_006530	GTT	2	6	7142	7147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707145
111	NC_006530	CAT	2	6	7244	7249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006530	AGG	2	6	7276	7281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006530	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707146
114	NC_006530	TGC	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707146
115	NC_006530	AGG	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56707146
116	NC_006530	ACA	2	6	7333	7338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707146
117	NC_006530	ACC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56707146
118	NC_006530	ATT	2	6	7495	7500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707146
119	NC_006530	GTT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707146
120	NC_006530	GAA	2	6	7629	7634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707146
121	NC_006530	GTC	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56707146
122	NC_006530	ACA	2	6	7865	7870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707146
123	NC_006530	AAC	2	6	7956	7961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707146
124	NC_006530	GAA	3	9	7990	7998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56707146
125	NC_006530	AAT	2	6	7999	8004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707146
126	NC_006530	ATA	2	6	8076	8081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006530	ATG	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006530	GAT	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006530	ATA	2	6	8514	8519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006530	TCT	2	6	8597	8602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006530	AAC	2	6	8696	8701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006530	GTT	2	6	8969	8974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006530	CAC	2	6	9040	9045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_006530	TAT	2	6	9161	9166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707148
135	NC_006530	CAA	2	6	9175	9180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
136	NC_006530	CAA	2	6	9332	9337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
137	NC_006530	TGA	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
138	NC_006530	AGT	2	6	9419	9424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
139	NC_006530	AAC	2	6	9469	9474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707148
140	NC_006530	TGA	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
141	NC_006530	ATA	2	6	9769	9774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56707148
142	NC_006530	TGA	2	6	9881	9886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
143	NC_006530	TCT	2	6	9919	9924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707148
144	NC_006530	ACT	2	6	9944	9949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56707148
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146	NC_006530	GCG	2	6	9980	9985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56707148
147	NC_006530	TGA	2	6	10084	10089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56707148
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153	NC_006530	GAC	2	6	10391	10396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_006530	TTG	2	6	10468	10473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56707149
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162	NC_006530	CAA	2	6	11406	11411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56707150
163	NC_006530	TTA	2	6	11550	11555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56707151
164	NC_006530	TTC	2	6	11621	11626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56707151
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169	NC_006530	AAT	2	6	12081	12086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_006530	TGT	2	6	12235	12240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_006530	CAA	2	6	14477	14482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
199	NC_006530	GAA	2	6	14564	14569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_006530	AAG	2	6	17924	17929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_006530	GCA	2	6	19143	19148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56707160
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399	NC_006530	TGA	2	6	27854	27859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_006530	TAT	2	6	27919	27924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_006530	TCC	2	6	28014	28019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
403	NC_006530	ATT	2	6	28031	28036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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